区域中心产前诊断中CMA、外显子组测序及靶向检测的增量贡献与NIPT确认率及妊娠结局的回顾性队列研究

《BMC Medical Genomics》：Multimodal genomic testing in prenatal diagnosis: incremental diagnostic contribution of chromosomal microarray and exome sequencing, real-world NIPT confirmation rates and pregnancy outcomes in 120 consecutive amniocenteses from northeastern Türkiye — a retrospective cohort study

摘要

背景

关于产前诊断中染色体微阵列分析（CMA）和外显子组测序（ES）的多数证据来自高容量中心。我们在土耳其一家区域中心评估了额外检测方式的增量诊断贡献、无创产前检测（NIPT）的确认率以及妊娠结局。

方法

对2022年3月至2025年6月间120例连续羊膜穿刺病例进行回顾性队列研究。检测路径为回顾性观察，并非统一实施：原定的一线检测组合（定量荧光PCR、G显带染色体分析、CMA）在94例妊娠中完成（78.3%），CMA在101例中完成（84.2%）；ES（n = 13）和靶向检测（n = 25）为选择性实施。在分析前将结果分类为胎儿致病性发现或偶发/非诊断性发现。累积检出率以整个队列为分母。

结果

120例妊娠中有36例出现异常发现（30.0%）：27例（22.5%）为致病性，9例（7.5%）为偶发/非诊断性——包括3例常染色体隐性基因的杂合致病或可能致病变异（2.5%）和6例意义不明变异（VUS；5.0%）。致病性检出率从16.7%升至22.5%：27例诊断中有7例首次由CMA、ES或靶向检测识别，这是一项队列特异性贡献，并非诊断检出率，因为这些检测方式并未统一应用。超声异常与遗传学异常发现相关（31/83 vs. 5/37；未校正OR 3.82，95% CI 1.35–10.82）；单独看致病性发现则无统计学显著性。在本转诊队列中，14例高风险NIPT转诊的确认结果为：21三体综合征和18三体综合征为6/6，性染色体和罕见常染色体非整倍体为0/4，拷贝数变异为1/4；这些结果不应被解读为人群水平的阳性预测值。仅在发现异常后才追踪妊娠结局，36例中有30例有记录；22例终止妊娠（18三体综合征4/4；孤立性VUS 1/6）。

结论

在检测路径未统一实施的情况下（完整一线检测组合完成率为78.3%），CMA、ES和靶向检测增加了诊断数。这些发现强调了在进行不可逆临床决定前，对高风险NIPT结果进行诊断确认的重要性，特别是对于那些在本转诊队列中经常无法被确认的不常见目标。终止妊娠的频率在不同诊断类别间存在差异；在提供咨询时，这些描述性差异应结合胎儿基础表型、诊断确定性和家长意愿来考虑。