睾丸混合生殖细胞肿瘤单细胞转录组图谱揭示细胞生态、转录组驱动因素及潜在治疗靶点

《Cellular Oncology》：Single-cell transcriptomic analysis uncovers metabolic reprogramming and tumor–immune–stroma interactions in testicular mixed germ cell tumors

摘要

睾丸混合生殖细胞肿瘤（TMGCTs）是睾丸生殖细胞肿瘤中一种罕见但日益增多的亚型，然而其异质性和微环境仍然知之甚少。本研究提供了TMGCTs的综合单细胞转录组图谱，鉴定出13种主要细胞类型、显著的免疫浸润以及生精谱系的丧失。恶性细胞被细分为三个具有独特转录程序的独立亚群，拟时间轨迹分析提示存在一种发育层级结构，该结构得到了POU5F1等多能性因子动态表达的支持。我们进一步发现，肿瘤细胞中N6-甲基腺苷（m6A）RNA修饰机制显著上调，其中METTL16和POU5F1具有预后相关性。在肿瘤微环境中，我们发现以促血管生成功能为特征的MRC1⁺巨噬细胞占主导地位，并存在不同的T细胞亚群，包括更多的效应T细胞（Teff）、初始T细胞（Tnai）和调节性T细胞（Treg）。值得注意的是，调节性T细胞标志物FOXP3的高表达与较差的总生存期显著相关。此外，肿瘤内皮细胞富集于Tip_cells和静脉，并表现出高表达血管生成相关基因和参与胶原蛋白形成的基因。特别的是，COL4A1的高表达与较差的总生存期和复发-free生存期显著相关。总之，这一综合单细胞转录组图谱揭示了TMGCTs中的细胞生态、转录组驱动因素以及潜在的生物标志物和治疗靶点。