一种用于主要发生于后颅窝的成人室管膜瘤的患者来源类器官平台：组织病理学保留、培养相关的转录组重塑及体内成瘤性

《Journal of Neuro-Oncology》：A patient-derived organoid platform for predominantly posterior fossa adult ependymoma: histopathologic preservation, culture-associated transcriptomic remodeling, and in vivo tumorigenicity

摘要

目的

目前，表征完善的成人室管膜瘤（EPN）患者来源模型仍然有限。本研究建立了成人EPN患者来源类器官（PDO）平台，并评估了其组织病理学及免疫表型特征、与亲本肿瘤的转录组学关系以及体内致瘤性。

方法

对22例成人EPN患者的新鲜手术标本进行处理以建立PDO。通过组织学染色和免疫荧光评估肿瘤-PDO保真度。对三对匹配的肿瘤-PDO样本进行RNA测序，随后进行配对差异表达、基因集富集、微环境特征及ESTIMATE分析。选取部分PDO模型进一步通过皮下及颅内异种移植进行评估。

结果

22个标本中有20个成功建立了PDO（90.9%）。已建立的PDO总体保留了亲本肿瘤的形态学特征以及主要室管膜瘤相关和神经/前体细胞标志物的表达。在长期培养过程中，部分形态学和免疫表型特征仍可被检测到。对三对匹配肿瘤-PDO样本的转录组学分析显示，全局表达具有高度相似性（Pearson r = 0.84–0.88），同时存在显著的培养相关重塑。内皮细胞特征和ESTIMATE衍生的基质评分在三个PDO中均降低，而其他免疫和基质特征则表现出患者特异性的变化。配对转录组学分析进一步发现，PDO中核糖体/翻译和氧化磷酸化程序富集，而纤毛及轴丝相关程序下调。部分PDO衍生模型在皮下和颅内环境中表现出致瘤能力。

结论

成人EPN可以作为PDO被高效扩增，其在体外培养过程中发生了可测量的转录和微环境相关的适应性改变，同时保留了部分肿瘤相关特征。部分模型在体内仍保留了致瘤能力。这些模型为研究成人EPN生物学提供了互补性的实验平台。