• Genome Biology：单细胞数据整合新方法

  北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）、生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心（ICG）、生命科学联合中心（CLS）张泽民实验室联合百奥智汇在期刊《Genome Biology》上发表了题为 “iMAP: integration of multiple single-cell datasets by adversarial paired transfer networks”的生物信息方法学论文，提出了基于深度自编码器和生成式对抗神经网络的单细胞数据整合的新方法iMAP。 利用单细胞RNA测序技术产生可靠新发现的重要途径是整合多来源的数据集。然而，不同批次实验产生的数据集之

  来源：北京大学前沿交叉学科研究院

  时间：2021-04-30

• Cell 亮点| 孔道春实验室突破性揭示 DNA 同源重组的关键..

  2021 年 2 月 23 日，北京大学生命科学学院、生命科学联合中心孔道春实验室在Cell在线发表了题为RNA polymerase III is required for the repair of DNA double-strand breaks by homologous recombination 的研究论文。该研究发现了DNA同源重组过程的一个必需中间体—RNA-DNA hybrid，及一个必需因子—RNA 聚合酶III，解决了真核细胞DNA同源重组领域里一个长期悬而未决的核心问题，并推动DNA同源重组事件分子机制的理解到一个新的层次。作为三大DNA代谢途径（DNA 复制

  来源：北京大学前沿交叉学科研究院

  时间：2021-04-30

• Annu. Rev. Immunol. ｜张泽民组综述单细胞技术解析肿瘤浸润免疫细胞新发现

    Annu. Rev. Immunol. ｜张泽民组综述单细胞技术解析肿瘤浸润免疫细胞新发现 肿瘤微环境具有高度异质性，深入理解肿瘤微环境特别是肿瘤浸润免疫细胞的特征，对探究肿瘤发生发展和免疫疗法的关键调控分子至关重要。近年来，单细胞转录组技术成为解析肿瘤微环境的有力武器，在相关研究中取得了一系列突破进展，包括揭示肿瘤浸润免疫细胞的异质性、动态变化关系以及这些免疫细胞在不同肿瘤免疫治疗中的潜在功能。 近日，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）、北京大学生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心（ICG）、生命科学联合中心

  来源：生命科学联合中心

  时间：2021-04-30

• 新兴DNA测序技术

        图片:Dr. Moon Kim, the Louis Beecherl Jr. Distinguished Professor in the Erik Jonsson School of Engineering and Computer Science, and fellow researchers developed a nanopore sequencing platform that…图片来源:德克萨斯大学达拉斯分校纳米孔技术有望使开发小型、便携、廉价的实时DNA测序设备成为可能。然而，其中一个挑战是如何让这项技术更加精确。德州大学达拉斯分校

  来源：Electropheresis

  时间：2021-04-30

• 最容易感染HIV的血细胞——新技术追踪感染者血液中的艾滋病毒

        图片:格莱斯顿研究所的科学家已经确定了最容易感染艾滋病毒的血细胞。在艾滋病毒/艾滋病开始流行的40多年里，科学家们对这种病毒、疾病以及治疗方法有了很多了解。但有一件事他们仍然不完全了解，那就是到底哪些细胞最容易感染艾滋病毒。如果没有这方面的知识，很难想象以这些细胞为目标来保护每年数百万第一次接触病毒的人，或者那些一旦停止治疗，感染可能会反弹的感染者。科学家们很早就知道，这种病毒会锁定所谓的记忆CD4+ T细胞，这是一种帮助人体建立对抗病原体的持久免疫力的细胞。但这仍然是一个过于宽泛的类别，不能作为治疗的目标。“CD4+ T细胞协调免疫反应对抗所有种

  来源：Cell Reports

  时间：2021-04-29

• 新方法可同时改善前列腺癌和高胆固醇的治疗

  哥本哈根大学的研究人员与瑞士伯尔尼大学医院的同事合作，破解了控制一组影响我们新陈代谢的酶的密码。研究人员的发现可以帮助我们避免各种疾病，包括高胆固醇、不孕症和某些类型的癌症，这些疾病都是由荷尔蒙失衡引起的。他们已经找到了一种方法来影响一种叫做细胞色素P450还原酶(POR)的特殊蛋白质。POR通常被认为是人体蛋白质管弦乐队的“指挥”，它有助于调节我们的激素，并使其在肝脏中分解药品成为可能。“我们已经开发了一种方法来控制这种导体，使用能够与POR蛋白结合的小分子，从而提高或降低某些激素的形成，或帮助肝脏中某些药物的降解。这些过程对几种类型的疾病都很重要，”哥本哈根大学化学系的博士后研究员Simo

  来源：Nature Communications

  时间：2021-04-29

• Chemical Science：沙门氏菌中的衣康酸修饰组学鉴定新方法

  衣康酸是近些年来被发现具有显著抗炎抗菌活性的代谢物分子，它在病原菌侵染或者脂多糖刺激的炎症巨噬细胞中会大量产生，浓度可达到毫摩级别，并广泛参与到抗炎信号通路中。由于衣康酸具有共轭不饱和双键结构，它可以通过迈克尔加成反应共价修饰蛋白质中的半胱氨酸残基，通过影响底物蛋白的活性和功能从而调节宿主炎症反应过程。因此衣康酸修饰蛋白的大规模鉴定对理解其炎症和抗菌调节机理具有重要的意义。北京大学化学与分子工程学院、生命科学联合中心王初课题组在Chemical Science上杂志上发表了题为“Chemoproteomicprofiling of itaconations in Salmonella”的论文，

  来源：北京大学

  时间：2021-04-28

• 长寿之道：三种吃辣椒的方法可以延长你的寿命

  研究继续深入到促进长寿的最有益的饮食项目。正是因为这个原因，辣椒引起了科学界的兴趣。研究发现，吃辣椒有消炎、抗氧化、抗癌和调节血糖的作用。这是由于辣椒素，这种化合物使辣椒在食用时具有温和到强烈的辣味。去年在美国心脏协会科学会议上提出的初步研究试图确定食用辣椒对长寿的具体益处。分析辣椒对全因和非全因疾病的影响心血管疾病死亡率，研究人员采用了五个主要的全球健康数据库（Ovid，Cochrane，Medline，Embase和Scopus）。他们的最终分析包括四项大型研究，其中包括参与者的健康结果以及辣椒消费数据。在美国、意大利、中国和伊朗，超过570000人的健康和饮食记录被用来比较那些食用辣椒的

  来源：today news post

  时间：2021-04-27

• PNAS：无创技术帮助癫痫患者

  卡内基梅隆大学（Carnegie Mellon University）的何斌教授团队与梅奥诊所（Mayo Clinic）合作，发现头皮记录的脑电图中的快速振荡可以精确定位导致癫痫发作的脑组织。这项合作研究最近发表在《美国国家科学院院刊》（PNAS）上，它利用了无创脑电图技术，同时开发了一种新的机器学习算法来自动识别和描绘并发的高频振荡和癫痫样棘波，与癫痫有关的关键环节。在不久的将来，这些发现可能会被用来重新考虑癫痫患者的成像和治疗选择。全球有7000多万人受到癫痫的影响，癫痫是最常见的神经系统疾病之一。对于癫痫患者来说，大脑活动变得异常，引起癫痫发作或不寻常的行为、感觉，有时甚至失去知觉。这种

  来源：College of Engineering, Carnegie Mellon University

  时间：2021-04-27

• 基因组研究为晚期小细胞肺癌指明了新的治疗方法

  俄亥俄州立大学综合癌症中心Arthur G. James癌症医院和Richard J. Solove研究所(OSUCCC - James)的研究人员对晚期小细胞肺癌(SCLC)进行了一项新的研究，确定了与患者对某些疗法产生耐药性有关的分子模式。这项研究发表在《JTO临床与研究报告》(JTO Clinical and Research Reports)杂志上，研究了5名患者的60多个肿瘤。OSUCCC - James研究人员在4种SCLC亚型中发现了不同的突变和分子变化。这些发现为治疗耐药性模式提供了新的见解，并可能为发展更有效的免疫疗法和其他治疗晚期SCLC的治疗提供新靶点，这种疾病进展迅速，

  来源：JTO Clinical and Research Reports

  时间：2021-04-27

• 嗅觉训练，而不是类固醇，是治疗COVID-19嗅觉丧失的最佳方法

  包括东英吉利大学卡尔·菲尔波特教授在内的一个国际嗅觉专家小组表示，不应使用类固醇治疗Covid-19导致的嗅觉丧失。嗅觉丧失是Covid-19的一个突出症状，大流行使许多人长期嗅觉丧失。但今天发表的一项新研究显示，不建议使用皮质类固醇(一种降低体内炎症的药物)治疗Covid-19导致的嗅觉丧失。研究小组建议进行“嗅觉训练”，即连续几个月，每天至少闻两次四种不同的气味。东英吉利大学诺维奇医学院嗅觉丧失专家卡尔·菲尔波特教授说:“Covid-19导致的嗅觉丧失大幅增加，在全球范围内创造了前所未有的治疗需求。“约有五分之一因Covid-19而嗅觉丧失的人报告称，他们的嗅觉在患病8周后没有恢复正常。皮

  来源：International Forum of Allergy and Rhinology

  时间：2021-04-27

• 一种快速计数和识别病毒的新方法

  兰开斯特大学的一名教授提出了一种新的概念，用于快速分析从感冒到冠状病毒的病毒存在。基于对化学元素的分析，该方法改编自用于识别金属纳米颗粒的分析技术，能够在20秒内检测到病毒的存在。虽然测试需要在实验室进行，但它可以用于快速确定入院的人是否感染了病毒——使临床医生能够决定治疗方法，以及是否让病人进入隔离病房。该技术被称为“单病毒诱导耦合等离子体质谱”(SV ICP-MS)分析，可用于快速确定病毒科。然而，尽管这一概念可以确定某人患有某种冠状病毒，但它不能确定冠状病毒的类型或变体。仍然需要额外的测试来找出某人感染的特定病毒。虽然SV ICP-MS不是专为识别新型冠状病毒感染类型而开发的检测方法的替

  来源：Talanta

  时间：2021-04-27

• 遗传学大牛公布新RNA检测方法，深入探究细胞RNA的真实情况

      图片:研究人员将BOLORAMIS方法与RNA定位研究的通用标准smFISH分析方法进行了比较来源:哈佛大学Wyss研究所一般来说，人类细胞通常会将大约2万个基因中的一半转录成RNA分子。就像蛋白质一样，这些RNA的功能不仅取决于它们的数量，还取决于它们在每个细胞三维空间中的精确定位。许多RNA分子将基因信息从细胞核传递到分布在细胞质中的蛋白质合成分子(信使RNA或mRNAs)中，其他RNA分子是蛋白质合成机器本身的组成部分，但仍有不同的RNA调节基因及其表达具有有待发现的功能。重要的是，包括癌症和神经系统疾病在内的许多疾病的特征表现为RNA的丰度和分布的变化。G

  来源：生物通

  时间：2021-04-26

• 一种对抗“冷”肿瘤的新方法

  不是所有的癌症肿瘤都是一样的。一些肿瘤，被称为“热”肿瘤，表现出炎症的迹象，这意味着它们被T细胞浸润，以对抗癌症。这些肿瘤更容易治疗，因为免疫治疗药物可以增强免疫反应。另一方面，“冷”肿瘤没有t细胞浸润，这意味着免疫系统没有介入帮助。对于这些肿瘤，免疫治疗没什么用。科罗拉多大学癌症中心成员、放射肿瘤学家Michael Knitz和医学博士Sana Karam本周在《癌症免疫治疗杂志》上发表的一项新研究中指出，这是后一种肿瘤。Knitz和Karam研究了T细胞在肿瘤治疗中的作用。卡拉姆说:“我们发现，通常告诉T细胞‘嘿，这里有一个肿瘤——来攻击它’的细胞被沉默了。”她和她的团队发现调节性T细胞(

  来源：Journal of Immunotherapy of Cancer

  时间：2021-04-23

• 对“突破性”病例的研究表明，COVID - 19检测可能会持续下去

        图片:洛克菲勒临床基因组实验室的Teresa Rozza为整个大学社区进行COVID唾液检测。资料来源:Matthew Septimus/洛克菲勒大学在极少数情况下，完全接种过COVID - 19疫苗并对病毒具有免疫力的人仍可能发展为该疾病。来自洛克菲勒大学的新发现现在表明，这些所谓的突破性病例可能是由病毒的快速进化驱动的，并且正在进行的对免疫个体的测试对于帮助减轻未来的疫情将是重要的。本周发表在《新英格兰医学杂志》(New England Journal of Medicine)上的这项研究报告了对洛克菲勒大学(Rockefeller Unive

  来源：New England Journal of Medicine

  时间：2021-04-23

• 新型液体活检技术能检测早期T1期结直肠癌淋巴结转移

        图片:Ajay Goel博士，M.S博士，Hope市分子诊断和实验治疗学系主任，和他的同事开发了一种新的，非侵入性液体活检检测技术世界著名的癌症和糖尿病独立研究和治疗中心(City of Hope)的科学家们开发了一种新型的非侵入性液体活检检测方法，用于检测高危T1期结直肠癌患者的淋巴结转移。美国胃肠病学协会杂志《胃肠病学》上发表的一项新研究报告了血液测试的进展情况。这种以血液为基础的检测是希望之城的theranostic(一种结合了“治疗”和“诊断”的术语)方法的一个例子，其目标是帮助每一位患者接受适合其特定疾病的个性化治疗。发展以血液为基础的活

  来源：Gastroenterology

  时间：2021-04-23

• 革命性技术：不用原位杂交，绘制体内基因空间表达的简单方法

  随着我们积累越来越多的基因测序信息，细胞类型数据库的规模和复杂性都在增长。有必要了解不同类型的细胞在体内的位置，并将它们的基因表达模式映射到组织和器官的特定位置。例如，一个基因可以在一个细胞中活跃表达，而在另一个细胞中被抑制。将基因定位到组织的一种方法是原位杂交技术。简单地说，在目标基因所在的组织切片(“原位”部分)中，用荧光标记标记目标基因(“杂交”)。然后在一个专门的显微镜下观察这些切片，看看基因在哪里“发光”。然后将每个切片的连续照片组合在一起，生成一个基因在组织内位置的“空间”地图。使用原位杂交的方法的问题是,随着目标基因数量的增长,他们开始变得复杂,需要专门的设备,并迫使科学家事先选

  来源：Nature Biotechnology

  时间：2021-04-21

• SIS-seq：测量细胞的新“时间机器”技术

  利用一种新的单细胞技术，WEHI研究人员发现了一种理解干细胞如何生成特定细胞类型背后的程序的方法。研究发现了30种新的基因，这些基因对干细胞进行编程，使树突状细胞启动免疫反应。通过揭示这个过程，研究人员希望他们能够找到新的癌症免疫治疗方法，并计划将这项技术扩展到其他领域，如发现肿瘤起始的新药物靶点，Sara Tomei女士和Jaring Schreuder先生发表在《免疫》杂志上，这项研究概述了启动由激素Flt3配体驱动的树突状细胞生成的过程，用于免疫治疗。研究小组开发了一种新技术，将单个细胞的基因表达与其所形成的细胞类型联系起来。“我们发明了一种称为‘SIS-seq’的技术，以研究从‘母’干

  来源：Walter and Eliza Hall Institute

  时间：2021-04-19

• 让癌细胞自毁的创新技术

  《药剂学》杂志的一项新研究报道，一种鼓励肾脏癌细胞自毁的创新新技术可能会彻底改变这种疾病的治疗方法。在这项独特的研究中，萨里大学和俄罗斯第一莫斯科国立医科大学的研究人员进行了调查体内某些天然存在的蛋白质是否可用于治疗癌症。关注组织蛋白酶S，一种已知影响癌症进展的溶酶体组织蛋白酶蛋白质，以及p21 BAX，一种可刺激细胞破坏的蛋白质，研究人员发现，这两种药物都可以同时用于对抗癌细胞的双管齐下的“攻击”。它们首先通过阻止使某些疾病治疗无效的机制发挥作用，其次，通过有效地鼓励癌细胞自我毁灭，这一革命性的方法针对两条有时会对化疗产生耐药性的聚合调节途径，并导致了一种潜在的突破性治疗方法的开发，使用一种

  来源：University of Surrey

  时间：2021-04-16

• 新方法可促进前列腺癌免疫治疗

        图片:Leigh Ellis博士洛杉矶(2021年4月15日)——研究人员发现了一种改变前列腺肿瘤周围组织的新方法，以帮助身体的免疫细胞对抗癌症。这项在人类、小鼠细胞和实验室小鼠上的发现，可能会导致前列腺癌免疫疗法的改进。前列腺癌是美国第二大男性常见癌症。利用一种被称为表观遗传重编程的技术，研究人员通过抑制zeste同源增强子(enhancer of zeste homolog2，简称EZH2)的蛋白的表达，改变了肿瘤和肿瘤微环境。EZH2在前列腺癌中含量很高。这种蛋白质帮助肿瘤抵抗检查点抑制剂免疫疗法，这种疗法旨在阻止某些其他可以阻止免疫细胞杀死

  来源：Nature Cancer

  时间：2021-04-16

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