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Science重磅：张锋开拓新型检测方法！2小时内现场判断病毒种类，有望用于2019-nCoV的检测
基于核酸的检测方法，确实具有足够的敏感性，检测速度也够快，但往往需要大量的样本和昂贵的设备；抗原检测倒是对设备要求不高，但是特异性差了些，过程更是漫长。无论是不是这些传播极快、疫情严重的疾病，理想的检测方法都应该兼顾敏感性和特异性，速度要快，费用要低，最好能够同时比对多个对象，同时对设备、技术、资源的要求也要尽可能低。2019年12月，中国湖北省武汉市发生了一系列急性呼吸道疾病，现在称为新型冠状病毒感染的肺炎。该疾病已从武汉迅速传播到其他地区。截至2020年1月31日，中国共确诊9692例NCP【新型冠状病毒感染的肺炎】病例。国际上已在24个国家和5大洲报告了病例。2020年1月3日，在武汉市
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印度香米为什么特别香？纳米孔测序技术来解释一下
水稻是一种重要的农作物，原产于中国和印度。水稻通常分为两种主要品种：籼稻和粳稻，但近期的研究又发现了两个遗传上不同的品种：aus（一种主要产于孟加拉国的水稻）和basmati（香稻，包括印度香米和泰国香米）。印度香米产于印度北部地区，以细长的形状和浓郁的香味而闻名，其米粒长度至少有7.1毫米。纽约大学的研究人员近日利用Oxford纳米孔测序技术，生成了两种basmati水稻地方品种的基因组，包括巴基斯坦的耐旱品种Basmati 334和伊朗的昂贵品种Dom Sufid。通过分析这些基因组，他们鉴定出粳稻中从未发现的变异，发现了basmati稻和aus稻混合的证据，并揭开了basmati稻的三大
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使用RNA测序技术首次了解人类精子的微生物组
Wayne州立大学医学院，CReATe生育力中心和马萨诸塞州Amherst大学的研究团队发表的一项新的合作研究首次深入研究了利用RNA测序技术对人类精子微生物组进行分析，识别其中的致病细菌定植和污染。该研究旨在评估人类精子RNA-seq数据评估射精内相关微生物组多样性的能力。方法收集精液样本，并在收集时评估精液参数。分离出精子RNA并进行RNA-seq。通过将未映射到人类基因组的测序读数与RNA-Seq之后的NCBI RefSeq细菌，病毒和古细菌基因组进行比对来确定微生物的组成。结果根据微生物相关RNA来表征每个样品中的微生物组成。已知与男性生殖道有关的细菌以相似的水平存在，一个例外异常值与
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PNAS首次证明碳13超极化成像技术可监测乳腺癌
由英国科学家完成的一项最新研究指出，一种涉及磁化分子的新型扫描可帮助医生实时查看乳腺肿瘤的哪些部位活跃。这一成果公布在1月20日的PNAS杂志上。这是研究人员首次证明这种称为carbon-13 hyperpolarised imaging（碳13超极化成像，生物通注）的扫描技术可用于监测乳腺癌。由英国剑桥大学癌症研究中心和剑桥大学放射学系组成的团队在来自Addenbrooke医院的七名患有各种类型和等级乳腺癌的患者接受任何治疗之前，对他们进行了这项技术的测试。他们使用扫描仪来测量患者的肿瘤代谢丙酮酸这一天然分子的速度，能够检测出肿瘤大小，类型和等级的差异，从而衡量癌症的发展速度或侵略性。扫描还
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Cryo-SR/EM领衔技术风潮，最新Science报道细胞3D超新结构
2014年，Nature Methods指出，低温电子显微镜（cryo-EM）虽然是结构生物学研究中的重要工具，但其潜力还未充分发挥出来。近期的技术进步大大提高了cryo-EM的分辨率，正在重振这一领域。多年来，科学家一直在探索细胞内部的微观世界，开发出新的工具观察这些基本的生命单位。但是每种工具都有利弊：光学显微镜可以通过容易看见的荧光分子标记特定的细胞结构，来轻松识别它们。随着超分辨率（SR）荧光显微镜的发展，可以更加清晰地查看这些结构。但是荧光只能在给定的时间内揭示出细胞中10,000多种蛋白质中的几种，因此很难理解这几种蛋白质与其他物质之间的关系。另一方面，电子显微镜（EM）可以显示高
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教育部拟提名2020年度国家科学技术奖项目公示
根据《国家科学技术奖励工作办公室关于2020年度国家科学技术奖提名工作的通知》（国科奖字〔2019〕38号）相关要求，现将教育部拟提名2020年度国家科学技术奖的129项通用项目予以公示（专用项目在适当范围内公示）。其中，最高科技奖5项，自然科学奖59项，技术发明奖28项，科技进步奖37项。公示期为2020年1月13-19日。任何单位或者个人对公示项目和项目主要完成人、主要完成单位持有异议的，可以书面形式向我司提出，并提供必要的证明材料。为便于核实查证，确保客观公正处理异议，提出异议的单位或者个人应当表明真实身份，并提供有效联系电话和地址。以单位名义提出异议的，须由单位法定代表人在书面异议材
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进化机器人技术！PNAS利用青蛙活细胞制成生物机器人
一组研究人员报告称通过从青蛙胚胎中提取的细胞，塑造新的生物，这种生物在不完全有机体和不完全机械的结构中发挥独特的功能。这一有趣的成果公布在1月13日的PNAS上。文章作者，佛蒙特大学Joshua Bongard表示：“它既不是传统的机器人、也不是已知的动物物种，而是一类全新的人工制品、一种活的可编程生物”。进化机器人技术（Evolutionary robotics）是一种新策略，一些科学家用来探索有关生物系统功能的问题，而另一些科学家则用来设计和测试可能的机器人结构的能力。Bongard是佛蒙特大学研究进化机器人技术的合著者和计算机科学家，他的团队与塔夫茨大学发育生物学家Michael Lev
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Nature新发现突破大脑屏障，攻击肿瘤！
大脑是一座堡垒，还配备有阻挡危险病原体入侵的屏障。但是这个保护屏障也会带来问题：当面临诸如胶质母细胞瘤这样的可怕威胁时，这些屏障会干扰免疫系统。胶质母细胞瘤是一种致命的脑肿瘤，目前尚无有效的治疗方法。近日，耶鲁大学的研究人员报道称，他们发现了一种新颖的方法，可以通过使免疫系统“溜过”要塞的排水系统，避免大脑的自然防御。这一发现公布在1月15日的Nature杂志上。文章的通讯作者Akiko Iwasaki解释说，“人们认为只有很少的免疫系统能对抗脑肿瘤。胶质母细胞瘤患者无法通过免疫系统治疗疾病。”虽然大脑本身没有直接的方法可以处理细胞废物，但排布在颅骨内部的细小血管会收集组织废物，并通过人体的淋
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Illumina发布NextSeq1000和2000全新测序系统以及全新测序解读软件
方案，宣布与罗氏公司建立合作伙伴关系，加速普及基因组学技术的应用
美国圣迭戈——Illumina公司（纳斯达克股票代码：ILMN）于2020年1月13日在JP摩根健康大会（JPM）上公布了一系列技术革新和新建立的商业合作伙伴关系，进一步履行以基因的力量改善人类健康的承诺。在旧金山举办的第三十八届JP摩根健康大会上，Illumina公司全球总裁Francis deSouza公布了一项与全球领先的诊断公司罗氏的非排他合作协议，该项合作旨在加速推动基于Illumina诊断测序系统的NGS体外诊断检测的临床可及度。双方将实现优势互补，罗氏公司将与Illumina共同开发新的伴随诊断方法，作为 TruSight Oncology 500 （TSO 500）泛癌种基因检
来源：Illumina
时间：2020-01-16
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高彩霞、李家洋Nature Biotechnology合作发文报道作物基因组编辑育种技术
遗传与变异是物种进化的基础。通过物理、化学方法(如辐射诱变、EMS诱变)产生全基因组的随机突变已经成为农作物育种的常规手段，但其中具有新型农艺性状突变体的筛选较为费时、费力。定向进化(Directed Evolution)则通过创制目标基因的突变文库，在施加一定选择压力下能够快速获得目的突变体。目前，植物基因的定向进化通常先通过易错PCR、DNA合成或DNA重组等方法在体外产生目标基因的突变文库，再转化到大肠杆菌或酵母中进行功能筛选。然而，由于离开原始的基因组和细胞环境，筛选出来的基因突变可能并不能完全反映出它在植物中的真实功能。更重要的是，大多数重要农艺性状无法在大肠杆菌或酵母中进行筛选。因
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Nature子刊：整合空间转录组学和单细胞测序的新方法
纽约大学的研究人员近日开发出一种方法，能够整合空间转录组学和单细胞转录组学的数据，揭示组织中的细胞空间结构。这项成果于本周发表在《Nature Biotechnology》杂志上。研究人员表示，他们的方法使用了一种名为多模式交叉分析（MIA）的新过程，与瑞典生命科学实验室和卡罗林斯卡研究所先前开发的空间转录组学方法相比具有更高的分辨率和灵敏度。文章通讯作者、纽约大学朗格尼医疗中心（NYU Langone Health）的Itai Yanai表示，空间转录组学和单细胞RNA测序的缺点互补。利用两种方法分析样本，并将每个部分的结果相结合，“你就可以两全其美”。Yanai的团队发现，这种方法可帮助他
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黄旭华、曾庆存两位院士荣获2019年度国家最高科学技术奖
中新网北京1月10日电 (记者 孙自法)2019年度国家科学技术奖励大会10日在北京人民大会堂举行，中国工程院院士、著名核潜艇专家黄旭华，中国科学院院士、著名大气科学家曾庆存，共同荣获本年度国家最高科学技术奖，每人奖金800万元人民币。黄旭华院士是中国船舶集团有限公司第七一九所名誉所长，他毕生致力于中国核潜艇事业的开拓与发展，是中国核潜艇事业的先驱者和开创人之一，先后担任中国第一代核潜艇工程副总设计师和总设计师，成功研制出中国第一代核潜艇，为中国海基核力量实现从无到有的历史性跨越做出卓越贡献。曾庆存院士是中国科学院大气物理研究所研究员，国际数值天气预报奠基人之一，为现代大气科学和气象事业的两
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Abcam宣布成功收购Expedeon的蛋白质组学和免疫学业务，
进一步增强蛋白偶联技术
• 包括领先的蛋白质偶联技术和行业品牌 Lightning-Link®和CaptSureTM• 有机会通过整合 Expedeon 和 Abcam 的技术开发新产品，为研究和诊断开发提供支持英国剑桥 – 2020 年 1 月 6 日：生命科学试剂和工具领域的全球创新者 Abcam plc 欣喜地宣布，截至 2020 年 1 月 1 日，Abcam 已成功完成对 Expedeon 蛋白质组学和免疫学业务的收购，其中包括 Innova 和 TGR Biosciences。Abcam 和 Expedeon 将继续致力于提供 Expedeon 蛋白质
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印度眼镜蛇为什么这么毒？多种测序技术揭谜底
美国和印度的一组研究人员近日在《Nature Genetics》杂志上发表了印度眼镜蛇（Naja naja）的高质量参考基因组和转录组，这不仅能推动进化研究，也有助于新型抗蛇毒血清的开发。印度眼镜蛇是印度四大毒蛇中的一种，在印度被称为圣蛇。我们在电影中经常会看到这种眼镜蛇，随着笛声而翩翩起舞。它的毒液是强烈的神经毒素，会阻隔器官与神经系统的联系，导致肌肉麻痹、呼吸衰竭、心搏停止。研究人员利用长读长测序、短读长测序、光学图谱、Hi-C作图以及染色体测序等方法，测序并组装了印度眼镜蛇的基因组。他们还同时获取了毒腺及其他十几个器官的RNA序列数据，发现19种基因在眼镜蛇毒腺中特异性表达，促进了致命毒
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茶叶也能“寻根” - Fluidigm微流控技术助力乌龙茶种质鉴定
近日，福建农林大学联合福建省出入境检验检疫局的研究小组在《Tree Genetics & Genomes》发表最新论文《Genetic diversity of oolong tea (Camellia sinensis) germplasms based on the nanofluidic array of single-nucleotide polymorphism (SNP) markers》。该研究首次利用EST-SNP引物结合纳升级微流控芯片的SNP分子标记技术展示了100种乌龙茶的遗传多样性，并开发了一套完整、可靠的中国乌龙茶种质鉴定工具。乌龙茶亦称青茶、半发酵茶及全发酵
来源：Fluidigm
时间：2020-01-06
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Nature新突破：改变免疫途径，大大提高结核疫苗的作用
结核病（TB）是一种古老的疾病，是全球导致死亡的主要传染病原因，然而，世界上唯一获得许可的结核病疫苗：卡介苗Bacille Calmette-Guerin（BCG）却是一个世纪前开发的。卡介苗通过皮内注射婴儿，可以防止婴儿患上传染性结核病，但在预防无论是青少年还是成年人的肺结核方面却效果不佳。近期，来自美国国立卫生研究院过敏与传染病研究所（NIAID）的研究人员及其同事发现，只需将剂量和给药方式从皮内（ID）更改为静脉内（IV），可以大大提高疫苗保护已经接触结核分枝杆菌（Mtb）后的猕猴免受感染的效果。这些发现为了解结核感染和针对疾病的疫苗保护机制提供了新的认识。此
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中国学者最新Science子刊：ctDNA新技术可以找到癌症患者
据一项涉及来自数千个受试者的样本的研究披露，一种新的机器学习平台可以识别罹患结肠直肠癌的患者，并能帮助预测他们疾病的严重程度和存活率。这种非侵入性的方法为分析循环肿瘤DNA（ctDNA）技术的最新进展做出了贡献，它可以在高风险患者中帮助发现处于早期阶段的结肠直肠癌。像其它许多恶性肿瘤一样，结肠直肠癌如果在转移到其它组织之前被发现，它们大多数是可治疗的。结肠镜检查是诊断的“黄金标准”，但它们会令人不舒服且具有侵入性并可能导致并发症，这使得患者不太愿意接受筛检。Huiyan Luo和同事利用机器学习技术研发了一种侵入性较小的诊断方法，它可在高风险患者中检测到结肠直肠癌。他们的技术是通过筛检甲基化标
来源：EurekAlert中文
时间：2020-01-02
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全球变暖如何影响海洋微生物分布？华大IBT蛋白定量技术助力发文！
全球变暖，不利于海洋微生物繁殖。最近的研究发现，海水温度升高会损害海洋聚球藻生长，影响海洋微生物的分布。该论文由厦门大学王大志教授团队发表，其中蛋白质组研究采用了华大科技独家技术——IBT定量蛋白质组学技术。IBT蛋白定量技术，是华大首推的蛋白定量领域十标新产品。它通过深入优化实验步骤和信息分析流程，结合高分辨率质谱仪高效快速的扫描速率，具有更高的标记效率和更低的试剂干扰，应用于蛋白质组和修饰蛋白质组定量，是一种性价比更高的蛋白组定量分析新选择。 文章标题：《Protoemic response to rising temperature in the marine Cyanobacteriu
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PNAS新突破：新抗体组合显著改善癌症免疫治疗
基于两种不同作用机制的抗体同时使用能带来更有效的治疗疗效，巴塞尔大学的科学家进行的动物模型研究证明了这一点，这将有助于针对对当前免疫疗法无反应的患者开发新疗法。这一研究已发表在PNAS杂志上。近年来，针对癌症的免疫疗法带来了很大的希望。这些新颖的疗法可招募人体的免疫系统来破坏癌组织。在临床前研究中，激活免疫细胞表面CD40受体，刺激自然杀伤性T细胞产生的抗体显示出令人鼓舞的效果。但是，在随后的临床试验中，CD40抗体的成功远远低于预期——不到20％的患者对此有反应。巴塞尔大学的癌症免疫学研究小组现已在动物模型中表明，通过将抗CD40抗体与附着在肿瘤血管上的其他两种抗体结合，可以显著提高抗CD4
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利用FACS－seq高通量分析技术研究关键感受器tnaC动态分子机制
清华大学在Nature Chemical Biology发表文章，将流式分选－测序（FACS-seq）方法引入前导肽类调控元件的高通量表征和机制研究中，首次利用该方法采集深度突变扫描数据用于动力学过程的解析，从而发现了细菌吲哚合成关键感受器tnaC响应过程的关键中间态，并由此建立了描述tnaC响应完整动力学过程的数学模型。该发现对于深入理解吲哚信号分子合成调控的分子机制，以及指导对于这一类生物传感器的工程改造具有重要意义。近年来，一类以动力学过程为主导的基因表达调控元件引起人们的关注。此类元件对下游报告基因的表达调控主要由动力学过程实现，其对目标配体的响应过程通常在几秒内发生。响应过程中没有明
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