-
Nature子刊：想知道肠道细菌在你体内做什么？试试这个方法
生物通报道：数以百计的不同细菌类型生活在我们人类肠道中，帮助我们消化食物。这些细菌的代谢过程不仅对我们的健康非常重要，而且由于它们本身也十分复杂，因此会带来许多出乎人意料的影响。想知道它们在我们体内做什么吗？在这一方面，来自卢森堡大学系统生物医学中心 (LCSB)的研究人员走出了重要的一步：他们在计算机上模拟了人类肠道细菌群落，也就是微生物组的复杂性。研究人员收集了773种菌株代谢已知数据，由此研发出了针对每一种菌株的计算机模型—— AGORA ，利用这一模型，研究人员能模拟微生物代谢过程，分析它们对其它微生物和宿主代谢的影响。这一研究成果公布在Nature Biotechnology杂志上，
-
又一篇技术突破论文，Nature Methods公布最大人类蛋白互作网络
生物通报道：一个国际研究小组公布了迄今为止最大的蛋白互作数据库资源，这将有助于解析众多疾病相关的基因如何促发疾病发生和进程的。这项研究由麻省总医院MGH和Broad研究院领衔完成，相关数据库： InWeb_InBioMap (InWeb_IM) 在线公布在11月28日Nature Methods杂志上。“现代遗传学技术能帮助我们对癌症或者精神疾病患者的基因组进行常规测序，但是科学家们依然不是很了解受到疾病相关遗传突变影响的细胞系统，”文章作者之一，Broad研究院项目负责人之一Kasper Lage博士说，如果有更完整的人体蛋白物理相互作用图谱，将能帮助我们探索细胞进程，更高分辨分析疾病的影响
-
林金星教授Cell子刊文章：TALEN技术构建有效诱导新系统
生物通报道：中国科学院植物研究所，北京林业大学等处的研究人员发表了题为“An Effective and Inducible System of TAL Effector-Mediated Transcriptional Repression in Arabidopsis”的文章，利用TALEN技术建立了过表达和诱导表达2套系统，通过瞬时和稳定表达针对靶基因序列设计的TALEs，表明TALE可对拟南芥中的靶基因转录产生不同程度的抑制作用。这一研究成果公布在国际学术期刊Molecular Plant上，文章的通讯作者是中科院植物所特聘研究员、北京林业大学林金星教授，第一作者为植物研究所邓馨研究组
-
两位华人教授最新Cell介绍新技术：胚胎干细胞中的核小体
生物通报道：高等生物的细胞核负责储存基因组DNA，这些DNA环绕着由四种组蛋白组成的八聚体，形成碟状的核小体结构。核小体的组织影响了基因活性，因此也是科学家们关注的研究领域之一。近日，来自美国西北大学的研究人员的研究人员介绍了一种新研发的化学生物学方法，为研究哺乳动物细胞中核小体如何介导基因调控提供了一个宝贵的资源。这一研究成果在线公布在11月23日的Cell杂志上，领导这一研究的分别是西北大学分子生物学系的王孝忠（Xiaozhong Wang，音译）教授与西北大学统计学系的王吉平（Ji-Ping Wang，音译）教授。在我们的细胞中，DNA被折叠成数百万个小数据包，就像一根线上的珠子，使我们
-
中国学者Nature发表突破性宏基因组研究 改写病毒学教科书
生物通报道：中国疾病控制中心与悉尼大学合作十一月二十四日在Nature杂志上发表了一项突破性的宏基因组研究。研究人员深入无脊椎动物的病毒世界，从中发现了1445种病毒，包括不少新病毒家族。文章通讯作者是中国疾病控制中心的张永振（Yong-Zhen Zhang）研究员。从这项研究来看，过去人们了解的只是病毒世界的皮毛。幸运的是，研究人员发现的病毒绝大多数不会引起人类疾病。悉尼团队的领导者Edward Holmes教授表示，虽然人类每天都被病毒包围着，但这些病毒并不会轻易转移到人体内。“这项突破性研究改写了病毒学教科书，无脊椎动物携带着数量惊人的病毒，远远超出了我们的想象，”Holmes教授指出。
-
Nature子刊发表新检测技术 不用再和HIV“捉迷藏”
生物通报道：近十年来HIV的治疗和预防已经取得了巨大的进步，HIV携带者的寿命大大延长，新HIV感染者已经从2002年的三百三十万减少到了2012年的两百三十万。但人们仍未找到治愈这种疾病的有效途径，也没有开发出相应的疫苗。HIV片段会潜伏在细胞基因组中，逃避免疫系统的侦测。这对患者来说是一个很大的威胁，因为病毒日后还会苏醒并重启感染循环。现在有不少药物希望通过激活潜伏的HIV来彻底清除病毒。不幸的是，这些药物还未能有效治愈HIV感染者。Pompeu Fabra大学的研究人员开发了一种能够检测潜伏HIV的新技术，B-HIVE。他们在Nature Structural and Molecular
-
著名学者庄小威发表研究新成果 新方法助力单细胞RNA分析
生物通报道：系统性分析单细胞的RNA丰度和空间定位，有助于我们理解细胞和发育生物学的许多方面。单分子荧光原位杂交（smFISH）是在单细胞中研究RNA拷贝数和空间定位的有力武器。去年四月，哈佛大学著名学者庄小威（Xiaowei Zhuang）教授在Science杂志发布了高度多重化的smFISH成像技术——MERFISH。这种突破性技术能在单细胞水平上实现空间分辨的高度多重化RNA分析。（更多详细信息参见：著名学者庄小威Science再发突破性技术）现在，庄小威团队找到了提高MERFISH性能的好办法。他们在美国国家科学院院刊PNAS杂志上发表文章，详细介绍了一种特殊的样本处理方法。文章指出，
-
Cell公布表观遗传学重大突破：上千万美元，40多篇论文的成果
——国际人类表观基因组协会（International Human Epigenome Consortium, IHEC）公布了一系列研究成果，包括表观遗传对免疫力、细胞系确定和细胞分化的影响。 生物通报道：2011年，欧盟委员会启动了有史以来规模最大的投资项目，投资3000万欧元（约合4100万美元）进行人类表观基因组学的研究，他们希望能通过这个叫做“蓝图”（BLUEPRINT）的项目找出所有影响基因表达的DNA修饰位点，了解表观基因影响健康及疾病的机理。11月17日，国际人类表观基因组协会IHEC在Cell等期刊中公布了41篇论文，报道了BLUEPRINT项目的多项成果，这为全面分析表观遗
-
袁隆平华南双季超级稻年亩产三千斤技术再创纪录
原标题 袁隆平“华南双季超级稻年亩产３０００斤技术”再创新纪录 年亩产达１５３７．７８公斤新华社广州１１月１９日电（记者吴涛、毛鑫）１９日中午，在广东省梅州兴宁市龙田镇环陂村，“华南双季超级稻年亩产３０００斤全程机械化绿色高效模式攻关”项目测产验收组测产后宣布：该项目年亩产量达到１５３７．７８公斤，项目实验获得成功，并创造了水稻亩产量新的世界纪录。１１月的广东正值秋收季节，测产验收在秋阴里展开。经过现场收割、称重和测算，袁隆平主持的“华南双季超级稻年亩产３０００斤全程机械化绿色高效模式攻关”项目晚造实割亩产７０５．６８公斤（干谷），加上早造的亩产８３２．１公斤，最终年亩产量达到１５３７．７８公
-
科学家在同源靶向纳米载药领域获得新突破
近日，中科院深圳先进技术研究院的纳米医学小组在“以癌治癌”的同源靶向纳米载药可视化精准治疗癌症方面取得了新突破，这种充分利用癌细胞之间互相亲和作用的“以癌治癌”疗法让更多人了解到了纳米医学治疗癌症的优势。研究成果在线发表在纳米领域顶尖期刊ACS Nano上。深圳先进院博士郑明彬告诉记者，“以癌治癌”方法顾名思义是一种来源于肿瘤的方法，其纳米颗粒外层磷脂的材料实际上是一层癌细胞膜，这层膜是从肿瘤组织中的癌细胞提取出来的。据项目成员之一的深圳先进院博士陈泽介绍，细胞粘附分子将癌细胞互相粘附在一起，它们如同锚把船固定一样发挥着锚定的作用，使同源癌细胞聚集生长成肿块。“之后我们给纳米颗粒‘穿’上癌细胞
-
Cell综述探讨表观遗传检测：一张图解析四种方法
生物通报道：11月17日Cell杂志SnapShot专栏介绍了表观遗传研究的检测方法，这四种方法包括：亚硫酸氢钠测序法（bisulfite sequencing）、染色质免疫沉淀测序技术（chromatin immunoprecipiation sequencing）、开放染色质测定（determination of open chromatin），以及3D染色质捕获分析（3D chromatin capture）。染色质免疫沉淀测序技术新突破ChIP-Seq方法是现代测序技术用于阐述转录调控和表观遗传学研究的重要手段。通过有针对性地俘获和富集特定蛋白，可以获取与这些蛋白结合的DNA片段，将其
-
北京生命科学研究院方赵庆课题组发布新的基因预测方法
生物通报道：当缺乏密切相关的参考基因组时，大多数的基因预测方法检测的是来自转录组组件的编码序列。这些方法的应用有限，因为高的转录本片段和广泛的组装错误，可能会导致多余的或错误的编码序列预测。11月17日在国际学术期刊《Genome Biology》发表的一项研究中，来自中科院北京生命科学研究院的研究人员，提出了一种方法——inGAP-CDG，可以利用基于密码子的de Bruijn图表，构建来自未组装转录组的完整长度的和非冗余的编码序列，从而简化了组装过程。这项研究的通讯作者是中科院北京生命科学研究院的赵庆方研究员。延伸阅读：山大泰山学者李国君教授再发转录组组装新法。对于有参考基因组的物种来说，
-
当下最流行的表观遗传研究检测技术是什么？看看这里……
生物通报道：11月17日Cell杂志SnapShot专栏介绍了表观遗传研究的检测方法，这四种方法包括：亚硫酸氢钠测序法（bisulfite sequencing）、染色质免疫沉淀测序技术（chromatin immunoprecipiation sequencing）、开放染色质测定（determination of open chromatin），以及3D染色质捕获分析（3D chromatin capture）。3D染色质捕获分析虽然十年前我们就获得了人类基因组序列的线性图谱，但是对于其空间组织的破译，还才刚刚起步。最近的研究表明，远程基因组元件，如增强子和启动子，能通过染色质相互作用被带
-
2016年度海洋科学技术奖拟获奖项目公示
2016年度海洋科学技术奖拟获奖项目公示 2016年海洋科学技术奖奖励办公室组织召开了2016年度海洋科学技术奖评审委员会评审会议，经过专家认真评审，海洋科学技术研究类共有19项成果拟获奖，其中一等奖5项、二等奖14项；海洋科技转化类共有17项成果拟获奖，其中特等奖1项、一等奖4项、二等奖12项、海洋科技图书共有12项成果拟获优。现将拟获奖项目予以公示。 自本公告发布之日起1个月内，任何单位和个人若对所公布的获奖项目有异议，可通过书面形式向国家海洋局学会办公室提交意见，国家海洋局学会办公室将于收到书面意见之日起1个月内责成有关单位处理完毕。异议期结束后，国家海洋局将正式发文
-
Nature发表再生医学重要突破 合成水凝胶将类器官带入临床
生物通报道：类器官可以用来模拟疾病、测试药物甚至替换患者的受损组织，在再生医学领域有广泛的应用前景。不过，类器官一直很难以标准化的可控方法进行培养。EPFL研究团队十一月十七日在Nature杂志上发表文章，展示了一种完全可控的类器官培养基质。他们正在为这种合成“水凝胶”申请专利。类器官的培养始于干细胞。培养干细胞的凝胶含有促进干细胞自我更新和分化的生物分子，可以模拟干细胞的天然环境，为其提供富含蛋白和糖的细胞外基质。干细胞粘附在细胞外基质上，自行组织成微型器官，比如视网膜、肾或肠。微型器官能真实反映一些关键的生物学机制，可用于疾病研究或药物测试。目前人们所用的凝胶来自于小鼠，这种凝胶存在不少问
-
上海交大教授Sci Rep：定量蛋白质组学技术揭示新分子机理
生物通报道：上海交通大学农业与生物学院的研究人员发表了题为“Cellulase from Trichoderma harzianuminteracts with roots and triggers induced systemic resistance to foliar disease in maize”的文章，通过定量蛋白质组学等多种实验方法，揭示了哈茨木霉菌纤维素酶与玉米根系互作系统诱导玉米抗叶斑病的分子机理。 这一研究成果公布在11月10日的Scientific Reports杂志上，文章的通讯作者为上海交通大学农业与生物学院陈捷教授，陈教授主要从事蛋白质组学与分子病理学、环境微生物
-
SMART技术助力艾伦细胞类型数据库（Allen Cell Types Database）
11月初，Takara Bio USA, Inc., (TBUSA; 原 Clontech Laboratories, Inc.)宣布SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing被艾伦脑科学研究所（Allen Institute for Brain Science）选定用于艾伦细胞类型数据库（Allen Cell Types Database）中的脑细胞单细胞表达图谱项目，SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing将用于超过100,000个小鼠和人类的大脑皮层单细胞转录组图谱分
-
Nature子刊发布新技术：即插即用，30分钟检测艾滋病毒
——这种U盘一样的的新型血液检测设备未来将可以用于偏远地区的艾滋病检测 生物通报道：目前世界上全球平均每天有6000人感染艾滋病，艾滋病患者以每天增加7千人的数字在成长，其中包括1800位新生儿。尽管早期诊断与治疗，可以降低并发症的产生，但是并非所有国家都有这样的技术与设备。这种情况在发展中国家更为严重。目前的艾滋病病毒HIV检测需要数周时间，而来自伦敦帝国学院的一组研究人员研发出了一种简单的诊断设备，在半个小时内就能得到准确的结果。研究人员在991个血液样本中检验了这一诊断方法，准确率高达95%。这一研究成果公布在11月4日的Nature Scientific Reports杂志上。“监测病
-
Nature子刊发表微生物疗法重要突破
生物通报道：微生物疗法是指用基因工程菌来对抗疾病。这一领域近年来发展得很快，人们已经在动物模型和人体内看到了成功的希望。不过，这些基因工程菌可能去到目标位点以外的地方。Caltech研究团队开发的方法解决了这个问题。他们的基因工程菌会在特定温度下激活治疗程序，人们只需要通过超声工具温和加热靶位点的组织。举例来说，医生可以给癌症患者服用这种基因工程菌，然后用超声波加热肿瘤位点，促使细菌对肿瘤展开攻击。这项研究于十一月十四日发表在Nature Chemical Biology杂志上。要制造这种温控细菌，研究人员首先得找到根据温度变化改变活性的遗传开关。他们最终确定了两个候选开关，一个来自沙门氏菌，
-
Science：新技术使肿瘤受困于“蜘蛛网”
生物通报道：经过十多年的研究，比利时Switch实验室（VIB/KU Leuven）揭示了一种新的特制分子（designer molecule），可通过淀粉样蛋白形成的机制，抑制一个充分验证的癌变基因。这项工作表明，淀粉样蛋白结构，可以被用来合理地开发一种新的生物分子，对抗各种各样的疾病。本研究发表在国际权威期刊《Science》，下一步研究人员打算将这一突破性的技术——Pept-in，转化为让患者直接受益。在煮熟的鸡蛋、啤酒泡沫和蜘蛛丝中的蛋白质，都有一个类似的结构部件：淀粉样蛋白。这些结构也活跃在人类中，在诸如黑色素生产和细胞激素储存这样的过程中发挥作用。然而，淀粉样蛋白也与白内障、老年痴
粤公网安备 44010602000434号