染色体基因芯片分析（Chromosomal Microarray Analysis，CMA）能在全基因组范围内同时检测很多种因染色体拷贝数变异而导致的疾病，因为其通量大，分辨率高，技术平台日益成熟，目前染色体基因芯片已经逐步应用于多种疾病的临床诊断和研究。

       以往经典地针对多发畸形和智力落后患者的检测手段主要是细胞遗传学的方式。细胞遗传学主要研究染色体畸变与遗传病的关系，对于遗传咨询和产前诊断具有重要意义。

       目前主要的研究方法有: 1.染色体核型分析；2. FISH(fluorescence in situ hybridization)技术；3.基因组芯片杂交。其中基因组芯片杂交技术是FISH技术的一大延伸与重大飞跃，它通过单一的一次杂交，可对某一样本整个基因组的染色体拷贝数量的变化进行检查……

全基因组芯片扫描技术解析自闭症成因

基因芯片作为细胞遗传学检测手段中最新的一种，有相对以往经典的遗传学检测无法比拟的优势：
①能在全基因组范围内同时检测很多种因染色体失衡而导致的疾病；②能同时检测到染色体的缺失（deletion）和增加（duplication），并能准确地测定其大小；③能检测到≥10%水平的嵌合体；④分辨率高，相比传统核型分析高出近千倍。染色体基因芯片分析检测平台及技术日益成熟，已经逐步应用于多种疾病的临床诊断和研究，为分子诊断平台的完善提供了重要的技术支持……

讲座：基因芯片技术在肿瘤等疾病研究中的应用
美国Affymetrix与华大基因开展战略合作
昂飞Dx2基因芯片通过SFDA认证 首次进入体外诊断领域

       在2012年3月29日美国遗传医学学院（American College of Medical Genetics ，ACMG）会议上，犹他大学儿科和病理小组与犹他大学ARUP公司诊断实验室做了联合使用Affymetrix基因芯片分析揭示慢性淋巴细胞白血病（Chronic Lymphocytic Leukemia）与10q24.32复发性等位基因缺失（Recurrent Monoallelic Deletion）有关的报告。慢性淋巴细胞白血病（Chronic Lymphocytic Leukemia ，CLL）具有非常多样化的临床表型……

ACMG：基因芯片分析技术研究进展
用基因芯片技术挑出正常胚胎
华裔研究组Nature子刊：更快，更便宜基因芯片 

       一例7岁女孩，因为不明原因智力落后发育迟缓就诊，2岁时曾做过先心手术（房缺，室缺），
来上海儿童医学中心就诊时智力IQ测定语言只相当于2岁半儿童，操作IQ只相当于3岁职场儿童，辅助检查染色体，核磁共振，串联质谱等等检查均未见异常，此时临床基本没有任何手段做进一步检查。

       然后余永国医生等人运用全基因组芯片检测（Affymetrix cytoscan HD），但是样本芯片结果QC失败，再次重复还是QC失败，用最新的Affymetrix 750K芯片结果还是质控失败，浪费了三张芯片，医生们开始分析原因，重新召回患者，在提取新鲜的DNA时发现患者外周血有一层脂肪，提示高脂血症！

       这样他们又改良现在成熟的DNA提取方法，先分离淋巴细胞，然后再提取DNA，这一次全基因芯片结果质控通过，结果显示患者1p36缺失综合征，而这个综合征除了智力落后，发育迟缓以外，高脂血症，性发育不良也是该病的重要表现之一……

       美国医学遗传学学院（American College of Medical Genetics，ACMG）在2011年的标准及指南（见图1）中明确指出，芯片已经成为检测新生儿体质异常（constitutional abnormalities）的首选方法，而Affymetrix是在该标准推出后第一个研发生产细胞遗传学芯片的厂家。有鉴于此，Affymetrix公司推出的新一代细胞遗传学解决方案将体外诊断带到了一个新的高度，在避免传统技术及芯片设计存在的问题的同时，满足您的需求。本着以基因为中心的设计原则以及结合独特的人类基因组骨架设计，在一张芯片上将非多态性标志物和SNP标志物相结合，从而不遗漏检查对象全基因组范围内任何极细小的变化，方便临床医师和科研人员对遗传疾病致病机理和产前产后筛查等领域进行研究。

图1：美国医学遗传学学院（ACMG）标准及指南

该解决方案包括（图2）：

1. 具有通过美国FDA认证、欧盟CE认证及中国SFDA认证的GCS 3000Dx v.2系统及科研用途的GCS 3000 7G系统；
2. 高密度的CytoScan™ HD芯片及面向临床的CytoScan™ 750K芯片；
3. 包含所有重要试剂的CytoScan™试剂盒；
4. 完全免费、界面友好的ChAs软件，支持遗传疾病的分析：对于用户限定的区域提供完整的区域信息摘要，对目标区域应用单独的过滤器来去除不相关信息，从而进行特定的分析和报告，用户可以无限制的自定义细胞遗传学相关区域。
   图2：Affymetrix新一代细胞遗传学基因芯片解决方案

芯片设计策略：
       众所周知，完善的细胞遗传学解决方案需要SNP和CNV的双重信息，而Affymetrix的这两款芯片正是本着这样一个设计原则，并且在标志物数量及各大基因数据库覆盖率方面具有明显优势。

参数如下：

       另外，免费且界面友好的细胞遗传学软件ChAs使您能够在整个基因组上查看和总结染色体畸变，这些染色体畸变可能包括拷贝数的扩增或缺失，样品嵌合性，或杂合性缺失等，软件能与细胞遗传数据库连接给出基因相关信息。您可以无限制的自定义细胞遗传学相关区域，也可以在整个基因组上或设定的目标区域内应用单独的过滤器来去除不相关信息，从而进行特定的分析和报告。CytoScan系列芯片与ChAs软件的共同使用，使您有了一套专业而全面的解决方案，来进行细胞遗传学异常的研究。

基因芯片及配套产品订购信息：

另有用于质控的Nanodrop 2000/c及Affymetrix实验流程指定的ABI 9700 PCR仪等相关配套产品，如需详细资料，详询基因有限公司，联系邮箱：INQ_ACD@genecompany.com

结束语：

生命科学与生物医药研究的成果千千万，但是能应用到临床上的却不多，全基因组芯片技术在临床上的成功应用，对于无数遗传病患者，或者可能孕育患有遗传病患儿的家庭来说意义重大，这也正是基础研究的意义所在，希望在未来，有更多此类技术和产品能在临床上发挥出应有的热量……