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导语:
       
金秋十月,Nature Methods杂志迎来了自己的第十次生日,编辑们为此选出了近十年来最受人瞩目的十大技术。二代测序、细胞重编程、光遗传学、CRISPR等技术就像一次次海啸,席卷了生命科学的各个角落,其中超高分辨率显微技术更是拿下了本年度的诺贝尔化学奖。

Nature Methods十周年,十大技术盘点
Nature Methods杂志在十周年之际推出了纪念特刊,点评了在过去十年中对生物学研究影响最深的十大技术。二代测序、CRISPR、单分子技术、细胞重编程、光遗传学、超高分辨率显微镜等纷纷上榜。





二代测序:

走向云端的高通量测序
尽管你可能对它还不熟悉,但云计算可以很好的为中小型实验室服务,为他们解决高通量测序的数据分析难题。为此,Nathan Blow博士在Biotechniques上撰文对这一技术进行了详细的介绍。

首个基因组测序参考标准发布
最近,瓶中基因组联盟发布了标准基因型的参考数据集,为人们提供了一组高度可信的单核苷酸多态性(SNP)、插入缺失和纯合子参考基因型的测序检测结果。Zook及其同事在近期的Nature Biotechnology杂志上发文对此进行了描述。

多家知名机构联合发表基因组测序“通用语”
美国军队传染性疾病医疗研究中心(USAMRIID)牵头多家知名机构,在美国微生物学会旗下的mBio杂志上发布了病毒基因组测序的一系列标准,为从事病毒基因组测序的研究者们提供了一个通用“语言”。


基因组工程

张锋博士Nature Methods改良CRISPR筛选技术
此前,麻省理工Broad研究所的张锋博士领导研究团队,构建了一个全基因组范围内的CRISPR敲除文库(GeCKO),并在黑色素瘤模型中鉴定了对维罗非尼产生抵抗的突变。现在他们对整个体系进行了改进,并在七月三十日的Nature Methods杂志上展示了升级版的CRISPR敲除技术。

最新综述:三大基因组编辑工具在iPS中的应用
然而由于遗传变异等原因,iPS构建的疾病模型可能与患病细胞并不完全一样。现在的潮流是,将基因编辑工具用到iPS中去,获得同基因型的疾病模性。日前,Stem Cells and Development杂志上刊登的一篇综述性文章全面探讨了这个问题,我们可以在该杂志的网站上免费读到这篇综述。

三篇Nature子刊:如何克服CRISPR的脱靶效应
最近Nature Biotechnology杂志上发表了三个研究团队的研究成果,研究人员深入分析了CRISPR的脱靶效应,并提出了非常可行的解决之道。


细胞重编程

Nature子刊重大突破:细胞重编程生成首个完全器官
再生医学的核心目标是,从体外培养的细胞生成可移植的替代性器官。尽管人们进行了多番尝试,但迄今为止还没有获得功能完全的完整器官。现在Edinburgh大学的科学家们做到了这一点,他们将体外培养的细胞移植到小鼠体内,首次生成了完全功能的器官。

诺奖得主山中伸弥:解读细胞重编程的命运
Nature Methods杂志在十周年之际推出了纪念特刊,点评了在过去十年中对生物学研究影响最深的十大技术,其中就包括细胞重编程。iPS技术鼻祖山中伸弥教授,在这个特刊中发表文章解读了细胞重编程的命运。山中伸弥教授因这一技术获得了2012年的诺贝尔生理/医学奖。

Nature:STAP干细胞兴衰始末,如何瞒天过海
今年一月份Nature发表的两篇文章,曾被认为是干细胞制备的一次革命。文章指出,只要将已分化细胞置于压力条件下,就可以将它们“重编程”成为多能细胞(可分化为任何类型的组织)。然而不久,人们就发现了文章中的漏洞,对这项研究的重复也均告失败。文章的第一作者小保方晴子(Haruko Obokata)被判定存在学术不端的行为,而她所在的RIKEN发育生物学中心已面临改组。最终,Nature在文章发表后的五个月终于将其撤回,但这一事件仍旧余波未息。


光遗传学

光遗传学之父Science再发突破性成果
光遗传学技术是在动物模型中深入理解生物系统的有力工具。但第一代光遗传学技术并不完美:兴奋性的光敏蛋白很有效,但抑制性视蛋白的效率很低。Deisseroth的研究团队经过多年努力,重新设计了一种抑制性的光敏蛋白,大大提高了抑制性开关的工作效率。这一成果于四月二十五日发表在Science杂志上。

Science:走向临床的光遗传学
光遗传学诞生后的头十年,大大推动了人们对正常和病理性神经回路的理解。今后的十年,光遗传学将迎来与转化医学的联姻,为疾病治疗带来新的机遇。本期Science杂志上,Bryson等人就展示了这样一个范例,他们将光遗传学工具与再生医学知识结合起来,在周围神经损伤的小鼠模型中恢复了肌肉的功能。

Nature Methods十大技术:光遗传学的利与弊
Nature Methods杂志在十周年之际推出了纪念特刊,点评了在过去十年中对生物学研究影响最深的十大技术,其中就包括光遗传学技术。本次特刊以“Optogenetics: the age of light”为题,回顾了光遗传学近期取得的新成果,探讨了这一技术中存在的一些问题。





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