复旦大学特聘教授miRNA新成果登上《Molecular Cell》

【字体: 时间:2007年12月07日 来源:生物通

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  来自美国科罗拉多大学细胞与发育生物学系,霍德华休斯医学院,美国斯克利普斯研究院(The Scripps Research Institute ,TSRI)的研究人员在对线虫蛋白研究的过程中,识别出了3500多个潜在的miRNAs靶标,补充了目前数量有限的miRNA靶标mRNA,为解决这一科学研究局限性提供了重要的资料(生物通注)。这一研究成果公布在《Molecular Cell》杂志上。

  

生物通报道:来自美国科罗拉多大学细胞与发育生物学系,霍德华休斯医学院,美国斯克利普斯研究院(The Scripps Research Institute ,TSRI)的研究人员在对线虫蛋白研究的过程中,识别出了3500多个潜在的miRNAs靶标,补充了目前数量有限的miRNA靶标mRNA,为解决这一科学研究局限性提供了重要的资料(生物通注)。这一研究成果公布在《Molecular Cell》杂志上。

文章的通讯作者是美国科罗拉多大学终身教授韩珉博士,其先后获得过美国生命科学研究基金会博士后奖学金,Lucile Markey学者,Searle学者,Basial Oconner学者等多项奖励。现任NIH基金评审委员会成员,吴瑞协会理事。1999年起每年为复旦大学生科院的研究生讲学,现任复旦大学特聘讲座教授(生物通注)。

微小RNA (microRNA,简称miRNA)是生物体内源长度约为20-23个核苷酸的非编码小RNA,通过与靶mRNA的互补配对而在转录后水平上对基因的表达进行负调控,导致mRNA的降解或翻译抑制。对于miRNAs的研究起始于时序调控小RNA(stRNAs),由于miRNAs在物种进化中相当保守,在植物、动物和真菌中发现的miRNAs只在特定的组织和发育阶段表达,而且这种特异性和时序性,决定了组织和细胞的功能特异性,表明miRNA在细胞生长和发育过程的调节过程中起多种作用,因此miRNA的研究受到了生物学家的广泛关注。

虽然目前针对miRNAs的基因调控作用研究得较多,但是发现的miRNA靶标mRNA数量依然有限,只有少量mRNA得到了实验鉴定。在最新的这项研究中,研究人员利用各种有效实验手段发现了3500多个潜在的miRNAs靶标,这是对目前miRNA靶标的一个重要补充。

研究人员首先发现GW182家族蛋白AIN-1和AIN-2能调控miRNA靶标的表达,但不影响miRNA的生物发生(biogenesis),免疫共沉(Immunoprecipitation,IP,生物通注)和质谱分析(mass spectrometry)表明AIN-1和AIN-2这两种蛋白只与miRNA特异性Argonaute蛋白:ALG-1和ALG-2,以及核心翻译起始复合物元件相互作用。研究发现在AIN-2复合物中存在许多miRNA靶标,这些miRNA靶标与相应的miRNAs表达相关。

进一步研究人员利用pyrosequence方法(焦磷酸测序法,生物通注,原理见Pyrosequencing工作原理)联合IP,以及AIN-1/AIN-2相关RNAs芯片分析,从中识别出了106个之前已注释的miNRAs,以及9个新的候选miRNAs,但是几乎没有siRNAs,重要的是,研究人员还发现了3500多个潜在的miRNAs靶标,这几乎包含了目前所有已知晓的靶标。

这一研究成果提出了一种系统识别miRNA靶标的有效生化方法,并且也为了解miRNA效应器复合物(miRNA effector complexes,生物通注)的特征提供了重要的资料。
(生物通:张迪)

原文摘要:
Molecular Cell, Vol 28, 598-613, 30 November 2007
Systematic Identification of C. elegans miRISC Proteins, miRNAs, and mRNA Targets by Their Interactions with GW182 Proteins AIN-1 and AIN-2
Abstract

附:
韩珉博士

1956年8月, 博导, 美国科罗拉多大学
mhan@colorado.edu

韩珉博士是美国科罗拉多大学终身职位的教授。

1983年起他在加洲大学洛杉叽分校师从著名分子遗传学家Michael Grunstein研究组蛋白功能,首次用遗传方法确立了组蛋白和核小体在活体转录调控和染色体分离中的功能。
1986年和1988年作为研究生在美国生化协会大会和Gordon会议上发表演讲。研究成果后来在《纽约时报》和《科学美国人》中被描述。
1988年起在加洲理工学院追随著名遗传学家Paul Sternberg作博士后。
1990年确立了Ras原癌基因在发育模式形成中的功能,为此Cell和Nature杂志发表了专题综述文章。美国报界也广泛报道了这一结果。
1991年起在科罗拉多大学任教。在使用抑制基因筛选Ras调控信号通路中的调控基因和线虫发育的多个研究领域作出了重要贡献。同时还参与人类疾病基因定位、克隆与研究。
1997年成为著名休斯医学研究院成员。

还先后获得美国生命科学研究基金会博士后奖学金,Lucile Markey学者,Searle学者,Basial Oconner学者等多项奖励。现任NIH基金评审委员会成员,吴瑞协会理事。1999年起每年为复旦大学生科院的研究生讲学,现任复旦大学特聘讲座教授。2001年起与许田和庄原教授在复旦大学建立了发育生物学研究所并共同主持工作。


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