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又一基因疾病数据库被公开
【字体: 大 中 小 】 时间:2008年03月13日 来源:生物通
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以色列耶路撒冷的希伯来大学将启动一个新的DNA-疾病数据库和基因分型服务。希伯来大学基因资源(HUGR)是一个常见疾病遗传相关研究的“病例对照DNA数据库”。该数据库的建立的目的是使研究人员能够通过HUGR网址选择样本、定制他们感兴趣的SNP分型,然后在6周内接收数据。
生物通报道:以色列耶路撒冷的希伯来大学将启动一个新的DNA-疾病数据库和基因分型服务。
希伯来大学基因资源(HUGR)是一个常见疾病遗传相关研究的“病例对照DNA数据库”。该数据库的建立的目的是使研究人员能够通过HUGR网址选择样本、定制他们感兴趣的SNP分型,然后在6周内接收数据。
目前,HUGR拥有15000个从以色列犹太人血液样本中抽提出的DNA样品。该校的遗传学家Ariel Darvasi表示,建这个数据库的基础就是有能够检测遗传相关性的DNA资源。
这个数据库囊括了代表16种不同疾病的样本,包括I型和II型糖尿病、各种癌症、神经和精神疾病、高血压和哮喘。这些样本还包含了从基因型到治疗和效果的家族历史等信息。
这个数据库中,每种疾病大约有500到1200个样本和含有5000个健康对照个体的DNA样本的对照组。之所以将这个数据库叫做HUGR,就是因为它很巨大“huge”。
HUGR成员计划使用所有样本的Kbioscience genotyping。Darvasi指出,HUGR服务的本身并不是为了提供基因组相关数据,而是细微能够帮助研究人员获得个体SNP的数据。
获得这些样本信息没有空间局限性,并且能够用于非常严格准确的科学研究。由于捐献样本的个体已经签订了对样本的弃权书,并同意进行遗传学研究,因此任何研究团体都可使用这些样本而不会牵扯版权问题。(生物通雪花)
英国莱斯特大学近期宣布,欧洲委员会斥资1750万美元资助一项将基因分型和显型数据整合到一个网络数据库中。
十九个研究机构(囊括了欧洲大部分研究机构)将参与这项国际合作计划,该计划目的是建立一个将疾病和基因联系在一起的“基因-疾病”数据库。这个Genotype-to-Phenotype数据库计划也叫做GEN2PHEN,该计划将大量的研究数据与基因序列如何影响各种显型(如个体在疾病表现和对药物治疗应答方面的差异)联系在一起。
在过去的几年里,技术的进步快速地增加了研究人员对糖尿病、心脏病、肥胖和自身免疫疾病备后的遗传变异的了解。通过GEN2PHEN计划,欧洲委员会计划将这些新知识集中在一起,并最终希望该数据库能够有助于未来的疾病预后、诊断和治疗。
目前,大量的令人振奋、有价值和重要的研究观察在不断积累,但是目前却没有通用的国际阅读系统能够接纳所有这些数据、存储和整合它们,进而使得这些巨大的数据能够为研究人员和医生所用。
该计划的领导人Anthony Brookes和其他研究人员预测这项计划将会使人们在接下来的几年里,在现有的人类遗传学基础上获得更全面、更有用和可用的知识。