2011新产品盘点:高通量测序仪[新品推荐]

【字体: 时间:2011年12月31日 来源:生物通

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  顺应这一发展趋势,高通量测序仪也朝着两个方向发展。高端仪器的性能越来越强劲,读长本来就领先的GS FLX再度升级,达到1000 bp,赶超了传统的毛细管电泳测序法。那边厢,第三代测序仪PacBio RS继续发力,读长超过2500 bp。同时,几家公司也陆续推出了个人型测序仪(即台式测序仪),争取覆盖更多的实验室。

生物通编者按 在过去的一年,高通量测序正朝着两极化的方向发展。一方面,大型基因组中心(如华大基因)凭借雄厚的实力,对大量物种的基因组进行测序和分析。另一方面,更多较有实力的实验室也开始购置新一代测序仪,应用在重测序和宏基因组研究中。

顺应这一发展趋势,高通量测序仪也朝着两个方向发展。高端仪器的性能越来越强劲,读长本来就领先的GS FLX再度升级,达到1000 bp,赶超了传统的毛细管电泳测序法。那边厢,第三代测序仪PacBio RS继续发力,读长超过2500 bp。同时,几家公司也陆续推出了个人型测序仪(即台式测序仪),争取覆盖更多的实验室。下面,生物通小编就盘点一下今年的新品。

大型测序系统

GS FLX+ 系统(罗氏454生命科学)

6月,454生命科学宣布推出了全新的GS FLX+系统。此仪器能够产生高达1,000 bp的测序读长,赶超了传统的毛细管电泳测序法。读长的改善也使得通量提升了近50%,达到1 Gb,从而降低了大型测序项目的测序成本。在分辨复杂基因组的高度重复区域时,这种长且准确的读长特别有用,可显著改善拼接。详细内容

随后,药物基因组公司利用这一系统,完成了大麻这一重要药用植物两个品系(Cannabis sativa和Cannabis indica)的全基因组测序。此次基因组测序结果包括超过1310亿的碱基对序列,是现有最大的大麻基因组基因集合。详细内容

PacBio RS系统(Pacific Biosciences)

Pacific Biosciences公司自今年4月底正式推出全球首个第三代测序平台PacBioRS单分子实时测序系统后,一直致力于进一步优化其试剂的性能并努力开拓更多的应用。据最新消息,其新版本的C2试剂将在今年年底或明年年初正式发布,C2试剂可使该系统的平均读长从现在的1300bp提升至2700bp!进入专题

个人型测序仪

Ion PGM半导体测序仪(Life Technologies)

首款基于半导体技术的测序仪让人眼前一亮。这块创新的半导体芯片让测序仪更快速、更易用,且价格更具竞争力。Ion PGM™测序仪的读长目前达到200 bp,通量即将达到1 Gb,且整个测序流程不到8小时。详细内容

MiSeq个人化测序系统(Illumina)

MiSeq让更多的实验室有机会使用新一代测序。包括文库制备,以及数据分析,整个测序流程可以在8小时内完成。适合各种新一代测序及Sanger测序的应用,一次运行可获得多达2GB的数据结果,2天内可以完成多至96个样本384个靶位点的PCR产物测序(包含PCR扩增反应及测序),完全取代传统Sanger测序,且无论测序深度还是数据质量,都远远超越Sanger测序结果。详细内容

生物通曾对市场上热门的三款个人型测序仪(除了以上两款,还有去年推出的GS Junior)进行了性能参数的比较,包括通量、读长、质量和费用,详见三款热门个人型测序仪比拼(http://www.ebiotrade.com/newsf/2011-9/2011913172558322.htm)。

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