染色质分析工具及其应用（二）[创新技巧]

之前生物通介绍了EpiQ染色质分析试剂盒的原理与方法，现在就让我们来看看世界各地的科学家是如何利用这个试剂盒的吧。

与癌细胞增殖联系起来

Ian Marc Bonapace博士是意大利Insubria大学结构与功能生物学系的教授。与一群日本科学家合作，他在上世纪90年代末发现了UHRF1蛋白。那时Bonapace正在寻找调控细胞分化与增殖的蛋白。自UHRF1被发现以后，研究表明它在基因调控中扮演着重要的角色。具体来说，它控制着细胞增殖时重建正确的DNA和染色质修饰的表观遗传学机制。

Bonapace研究的主要目标是确定UHRF1最终以何种方式影响了癌症治疗。他们认为，此蛋白至少能作为癌症侵袭性的一个标志物。未来，他们希望能发现一些阻碍UHRF1活性的分子，这有可能作为一种阻止肿瘤生长和转移的方法。

在这项研究中，他们使用的主要方法包括染色质免疫沉淀、蛋白抽提和纯化，共沉淀和凝胶过滤，以鉴定此蛋白参与形成了哪些复合物。在2010年初，Bonapace得到了EpiQ试剂盒。为了检验它的效果和适用性，他开展了一个实验，在两个不同的前列腺癌细胞系中比较三个不同的肿瘤抑制基因。这两个细胞系分别为：非侵袭性的LNCAP和侵袭性的PC3。

Bonapace谈到：“这些实验的结果正是我们所预计的。LNCAP细胞中肿瘤抑制基因未下调，而PC3细胞中则完全下调（因此染色质处于关闭状态）。”

Bonapace还谈到，在得到EpiQ试剂盒之前，使用染色质免疫沉淀方法来确定基因是否表达，一般需要几天。而使用这个试剂盒，你能立即确定基因是否被抑制，之后再决定是否要通过耗时耗力的实验来研究为什么。Bonapace还介绍了EpiQ试剂盒对其研究的潜在影响，不但大大节省时间，还能有效利用资源，因为他不断检测不同类型的细胞和肿瘤，看看同一个目的基因是否受UHRF1蛋白存在或缺失的控制。

“这个试剂盒的主要应用不太在于发现什么，而是为了解基因是否表达提供了一个捷径。一旦你了解了这个，你就能设计实验，来更详细地了解为什么是这样，”这位意大利教授如是说。

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（原文来自Bio-Rad，生物通编译）

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