RNA测序有助于前列腺癌个性化治疗

【字体: 时间:2014年08月27日 来源:生物通

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  根据最近发表在《Genome Biology》的一项研究报道,RNA测序,而不仅仅是DNA测序,能够帮助医生预测前列腺肿瘤如何响应治疗。因为肿瘤的RNA显示了一种治疗方法正在引起的实时变化,作者认为这可能是一种有用的工具,帮助诊断和预测哪种治疗方法将最有利于患者个人。

  

生物通报道:根据最近发表在《Genome Biology》的一项研究报道,RNA测序,而不仅仅是DNA测序,能够帮助医生预测前列腺肿瘤如何响应治疗。因为肿瘤的RNA显示了一种治疗方法正在引起的实时变化,作者认为这可能是一种有用的工具,帮助诊断和预测哪种治疗方法将最有利于患者个人。

来自温哥华沿岸卫生研究所的Colin Collins和Alexander Wyatt及其他研究人员,将25名患者的治疗预后结果与他们前列腺肿瘤的RNA序列相匹配。研究人员认为,一些患者肿瘤的RNA之间所存在的相似性,可能打开新的治疗途径。

前列腺癌是全球第四大最常见癌症,但是能够被有效地管理。医生通常推荐联合疗法,因为患者对治疗的反应差异很大。这些治疗的副作用可能很大,因此目前的研究主要集中在精准施药——根据患者的肿瘤分子变化对他们进行分类,只给他们施用预计最有效的治疗方法。

为了探讨前列腺癌最高风险案例之间的变化,研究人员进行了一系列的基因组分析,包括25名患者前列腺肿瘤的RNA测序。RNA分子指导细胞生产哪种蛋白质,所以RNA序列可显示肿瘤细胞与正常细胞的表现有多么大的不同。

温哥华前列腺中心的Alexander Wyatt称:“大多数基因组测序研究都集中在DNA,这给了我们关于肿瘤来历的重要信息。在我们这项研究中,我们检测RNA,它可以告诉我们,肿瘤收集时哪些基因正在被使用和被破坏。”

然后,他们使这一数据与每名患者的详细随访数据相匹配。这样,他们就能看到什么序列中断与不同疗法的阳性反应有关,他们认为这可以有助于个性化医学。

Alexander Wyatt称:“我们对患者之间的基因组差异数量感到惊讶。这种复杂性可能有助于解释‘为什么患者对治疗方法反应不同,为什么一些肿瘤生长速度更快’。我们对肿瘤-肿瘤间变异的了解越多,就越能精确地定制患者肿瘤特异性的管理措施。总的来说,对于癌症研究来说,这是一个激动人心的时刻,因为全球基因测序工作意味着,我们正在向着精密肿瘤学前进。”

这一信息的另外一个潜在应用是,在某些群体中,在肿瘤中被破坏的基因和途径类型具有相似性。这可能表明,一种潜在的癌症机制可被用来制定新的癌症治疗方法。

Alexander Wyatt这样说道:“尽管在单个基因水平上患者之间存在巨大的复杂性,但当我们检测受影响基因的功能时,患者群体之间出现了明显的共性。最终也许有可能利用这种趋同的生物学。”

(生物通:王英)

延伸阅读:Nature Genetics:复旦参与发现前列腺癌风险的影响机制

生物通推荐原文:
Alexander W Wyatt, Fan Mo, Kendric Wang et al. Heterogeneity in the inter-tumor transcriptome of high risk prostate cancer. Genome Biology 2014 15: 426

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