PNAS推翻前论：小鼠模型到底好不好用

人类疾病的小鼠模型，是医学研究中广泛使用的一个基本工具。2013年Seok等人发表文章指出，小鼠模型的基因表达不能很好的模拟人类炎症性疾病。现在一项新研究采用更恰当也更灵敏的方法，重新分析了Seok等人所用的数据集。研究指出，Seok等人的分析方法并不恰当，实际上结果应该是完全相反的。相关文章发表在八月四日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。

　　

生物通报道：人类疾病的小鼠模型，是医学研究中广泛使用的一个基本工具，帮助人们进一步理解多种疾病的病理过程和发病机理。然而，2013年Seok等人发表文章指出，小鼠模型的基因表达不能很好的模拟人类炎症性疾病，比如重度烧伤、败血症和急性感染等。（PNAS 2013, 110(9), 3507-3523）

这篇文章发表之后，在18个月内就被引用了四百多次，不仅在科学界中引起了很大的反响，也受到了纽约时报、CBS News等大众媒体的关注。小鼠模型是否能够有效用于医学研究，这个问题一时成为了争论的焦点。美国NIH的主管Dr. Francis S. Collins甚至透露，正在计划开发“组织芯片”来替代这样的动物模型。

藤田保健卫生大学的Tsuyoshi Miyakawa教授和Keizo Takao副教授，采用更恰当也更灵敏的方法，重新分析了Seok等人所用的数据集。他们发现，Seok等人的分析方法并不恰当，实际上结果应该是完全相反的。相关文章发表在八月四日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。

Miyakawa教授说，“那篇文章的作者之一在接受纽约时报采访时曾说过，当这篇文章被Nature和Science拒稿时，有人认为这项研究‘肯定是哪里有问题’。我也是这么想的。”

Seok等人主要针对在人类疾病中发生改变的基因，比较了这些基因在人类和小鼠之间的表达水平。但他们并没有考虑基因在小鼠模型中是否也发生了改变。研究人员指出，在比较人类和小鼠的基因组应答时，不应包括那些只在一种生物中发生改变的基因。

Seok等人比较基因表达模式得出的Pearson相关系数（R）为0.14 - 0.28，只有55% - 61%的基因向同样的方向改变。这项新研究针对在人类疾病和小鼠模型中都显著改变的基因，得出的R值为0.36 - 0.59，有77% - 93%的基因向一个方向改变。

Miyakawa等人通过生物信息学工具NextBio，对人类和小鼠的基因相似性进行了更为复杂的无偏好统计分析。研究显示，小鼠模型中的基因表达模式，与人类炎症性疾病高度相似。（延伸阅读：Nature Methods：论实验员性别的重要影响）

研究表明，人类疾病和小鼠模型具有许多共同的分子通路故障。针对人类疾病和小鼠模型的共同之处，可以为我们提供宝贵的信息，揭示人类疾病的病理过程和发病机理，并在此基础上开发新的治疗策略。

这项研究总结道，小鼠模型能够很好的模拟人类炎症性疾病，它仍然是医学研究中非常实用的动物模型。

 

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