中国科学家Nature Genetics发表GWAS研究新成果

　　

生物通报道  来自复旦大学、电子科技大学、新加坡国家眼科中心等机构的研究人员，采用全基因组关联研究（GWAS）鉴别出了与原发性开角型青光眼相关的新易感基因。研究结果发表在8月31日的《自然遗传学》（Nature Genetics）杂志上(经典共享，罗氏普通PCR产品免费试用)。

复旦大学的孙兴怀（Xinghuai Sun）教授以及任职于电子科技大学医学院和四川省人民医院的杨正林（Zhenglin Yang）教授是这篇论文的共同通讯作者。孙兴怀教授的研究方向是青光眼和视神经疾病的诊治、研究。杨正林教授是我国眼睛疾病基因研究领域的知名专家。

青光眼是一种眼内压间断或持续升高的眼病，持续的高眼压可以给眼球各部分组织和视功能带来损害，如不及时治疗，视野可以全部丧失而至失明。青光眼是导致全球人类不可逆性失明的第二大原因，其被广泛分为开角型青光眼和闭角型青光眼两类。急性闭角型青光眼则往往眼压突然升高，对视力造成直接损伤，是一种疼痛性的眼科急症。相比之下，由于其病程发展缓慢往往遭到忽视，开角型青光眼有时被称作是沉默的视觉偷盗者。

全基因组关联研究（Genome-Wide Association Studies，GWAS）是指在全基因组层面上，开展多中心、大样本、反复验证的基因与疾病的关联研究，是通过对大规模的群体DNA样本进行全基因组高密度遗传标记（如SNP或CNV等）分型，从而寻找与复杂疾病相关的遗传因素的研究方法，全面揭示疾病发生、发展与治疗相关的遗传基因。

这一研究方法的引入，使对遗传流行病的发病预测不再停留在传统的年龄、家族史等“环境性”因素分析，而是通过对人体的全基因组的分析，找出可能导致今后发病的基因，并结合“环境性”因素，得出包括癌症在内的多种流行病的发病率。

在这篇新文章中，研究人员针对来自中国南方的1,007名罹患高压青光眼（HPG）的患者以及1,009名对照人群展开了原发性开角型青光眼GWAS研究。他们观察到在9q31.1上ABCA1基因附近的多个SNPs的关联性达到了全基因组的显著水平，并获得了一些证据表明还与16p13.2上的PMM2基因有关联。

随后，他们在分别来自新加坡的525个HPG病例和912个对照，以及来自中国的1,374个原发性开角型青光眼病例及4,053名对照人群中验证了研究发现。研究人员观察到两个位点上多个SNPs的关联性达到了全基因组的显著水平。ABCA1和PMM2都表达于小梁网、视神经和其他眼睛组织中。此外，ABCA1还高水平表达于视网膜节细胞层，这与它在青光眼形成中所起的作用相一致。

这些研究结果为我们更深入地了解青光眼的发病机制，为青光眼高危人群预警、早期诊断、个体化预防和治疗以及新型高效药物的筛选提供了理论依据和分子靶标。

不久前，杨正林教授课题组还与重庆医科大学附属第一医院的杨培增教授团队合作，通过GWAS鉴别出了伏格特小柳原田综合征(Vogt-Koyanagi-Harada syndrome ，VKH)新风险位点。研究结果提供了关于VKH综合征遗传学和生物学的一些重要新见解（延伸阅读：重庆医科大学Nature子刊发表GWAS新成果 ）。

生物通推荐原文摘要：

Common variants near ABCA1 and in PMM2 are associated with primary open-angle glaucoma

We performed a genome-wide association study for primary open-angle glaucoma (POAG) in 1,007 cases with high-pressure glaucoma (HPG) and 1,009 controls from southern China. We observed genome-wide significant association at multiple SNPs near ABCA1 at 9q31.1 (rs2487032; P = 1.66 × 10−8) and suggestive evidence of association in PMM2 at 16p13.2 (rs3785176; P = 3.18 × 10−6)……

作者简介：

孙兴怀，男，主任医师，教授，博士生导师，现任复旦大学附属眼耳鼻喉科医院院长，复旦大学上海医学院眼科学与视觉科学系主任、中国医师协会眼科分会副会长、中华医学会眼科分会副主任委员、全国青光眼学组副组长、上海市医学会眼科分会副主任委员、复旦大学学术委员会委员。从事临床眼科诊疗工作及其相关临床、基础研究和专科人才培养。擅长青光眼和视神经疾病以及低眼压的诊断和治疗，尤其是难治性青光眼的药物、手术等综合治疗。发表专业论文100余篇，主编专著4本，并担任《中华眼科杂志》、《中国眼耳鼻喉科杂志》、《上海医学》、《复旦学报（医学报）》等十多本杂志编委、副主编，以及全国统编教材《眼科学》五年制版、七年制版、八年制版的编委。曾获上海市高校优秀青年教师、复旦大学优秀研究生导师，享受国务院特殊津贴。

杨正林，四川省医院人类疾病基因研究四川省重点实验室主任，研究员，博士生导师。是我国眼睛疾病基因研究领域知名专家，国家杰出青年基金获得者。在四川建立了一个具有国际竞争力的眼睛疾病基因研究平台。发表SCI论文60余篇，鉴定了9个眼睛疾病基因，定位多个疾病连锁区域及易感位点，多次应邀在国内外学术会议上作大会报告。先后获四川省科技进步一、二、三等奖各2项，以及新世纪百千万人才工程国家级人选、全国医德标兵、卫生部突出贡献青年专家，享受国务院特殊津贴、省学术与技术带头人、省十大杰出青年、省五一劳动奖章、省海外****等荣誉称号。