华大基因、广州医科大Nature子刊发布测序新成果

　　

生物通报道  来自华大基因研究院、广州医科大学附属第一医院等处的研究人员报告称，他们首次完成了对亚洲患者原发性及转移性肺腺癌的大规模测序。研究成果发布在12月9日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。

华大基因研究院的王俊（Jun Wang）研究员、Qiang Pan-Hammarström教授，及广州医科大学附属第一医院的何建行(Jianxing He)教授是这篇论文的共同通讯作者。

肺癌是全球主要的癌症死亡原因，分为两大类型：非小细胞肺癌(NSCLC)和小细胞肺癌(SCLC)，分别占确诊肺癌病例的85%和15%。肺腺癌是最常见的NSCLC组织学类型，在全球每年导致50多万人死亡（延伸阅读：清华张永辉研究员Science子刊发表肺癌新疗法 ）。尽管在手术、分子分型及靶向治疗方面取得了一些进展，肺腺癌的预后仍然不良，其原因可能归结于：（1）疾病往往在晚期确诊，此时恶性肿瘤已扩散到一些局部和远端组织；（2）在近一半确诊患者中缺乏已知可靶向的驱动基因；（3）肿瘤间及肿瘤内复杂的异质性；及（4）对转移形成的机制认识不足，缺乏对应的治疗方法。

以往的一些研究已确定了肺腺癌基因组景观图的特征，鉴别出了许多潜在癌症驱动基因，并针对一些激活的致癌基因如EGFR、ERBB2和BRAF，及与ALK、ROS1和RET相关的易位或融合开发出了靶向性疗法。然而其中大部分的研究都主要将焦点放在从欧洲或北美患者处获得的肿瘤样本上，并且大多数样本都是在疾病早期阶段被收集。毫无疑问，考虑到肺腺癌快速增长的发病率，及不同种族人群之间潜在的遗传异质性，对来自东亚人群的肺腺癌进行全面的基因组分析具有重要的意义。

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此外，确定晚期肺腺癌，尤其是具有对应转移瘤的肺腺癌的遗传特征，不仅可以扩大肺癌变相关潜在癌症驱动基因的谱系，还能够增进我们对转移形成的认识，进一步指导转移性肺腺癌的诊断和治疗。近期的一项研究证实，在NSCLCs原发肿瘤和配对转移瘤之间频发体细胞基因变异呈高度一致性。这一初步的调查仅集中靶向了189个癌症相关基因，结果是受限的。

在这篇文章中研究人员报告称，对来自中国患者的335个原发肺腺癌和35个对应淋巴结转移瘤进行了综合基因组和转录组分析。总共鉴别出了13个显著突变基因，包括最常见的突变基因TP53和一些新的突变靶基因如RHPN2、GLI3和MRC2。此外，在来自转移瘤患者的肿瘤中显著富集了TP53突变。一些调控细胞骨架重塑过程的基因也频繁发生了改变，尤其是在转移样本中，IQGAP3高水平表达被确定为是不良预后的一个标记物。

新研究首次完成了亚洲患者肺腺癌的大规模测序，提供了原发性和转移肿瘤的一张综合突变景观图。这有可能为个体化治疗奠定了基础，并阐明了转移性肺腺癌的分子发病机制。

（生物通：何嫱）

生物通推荐原文摘要：

Frequent alterations in cytoskeleton remodelling genes in primary and metastatic lung adenocarcinomas

The landscape of genetic alterations in lung adenocarcinoma derived from Asian patients is largely uncharacterized. Here we present an integrated genomic and transcriptomic analysis of 335 primary lung adenocarcinomas and 35 corresponding lymph node metastases from Chinese patients. Altogether 13 significantly mutated genes are identified, including the most commonly mutated gene TP53 and novel mutation targets such as RHPN2, GLI3 and MRC2. TP53 mutations are furthermore significantly enriched in tumours from patients harbouring metastases. Genes regulating cytoskeleton remodelling processes are also frequently altered, especially in metastatic samples, of which the high expression level of IQGAP3 is identified as a marker for poor prognosis. Our study represents the first large-scale sequencing effort on lung adenocarcinoma in Asian patients and provides a comprehensive mutational landscape for both primary and metastatic tumours. This may thus form a basis for personalized medical care and shed light on the molecular pathogenesis of metastatic lung adenocarcinoma.