2014创新产品:环状RNA的检测芯片

【字体: 时间:2015年02月03日 来源:生物通

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  环状RNA(circRNA)是RNA领域的最新研究热点。研究表明,这种非编码的RNA分子具有临床诊断标志物的潜力。Arraystar公司全球首推第一款商业化circRNA芯片。它利用特异性剪接位点探针技术,能准确检测不同生理及病理条件下circRNA的表达变化,帮助研究者对这种最新颖的ncRNA分子进行系统研究。

过去6年,生物通一直在追踪生命科学领域最前沿的创新产品,将其介绍给大家。2014年,生物通继续搜罗新上市的产品,为大家奉上一场技术盛宴。经过一个半月的网页和微信投票以及专家评鉴,2014生命科学十大创新产品终于出炉。

环状RNA(circRNA)是RNA领域的最新研究热点。研究表明,这种非编码的RNA分子具有临床诊断标志物的潜力。Arraystar公司全球首推第一款商业化circRNA芯片。它利用特异性剪接位点探针技术,能准确检测不同生理及病理条件下circRNA的表达变化,帮助研究者对这种最新颖的ncRNA分子进行系统研究。

基于此,这款circRNA芯片被生物通读者评为2014年生命科学十大创新产品之一。为了让读者更好地了解它,我们采访了Arraystar中国区唯一代理服务商 – 康成生物的技术人员。

Q:circRNA芯片通过什么原理来检测circRNA的表达变化,适合应用在哪些方面?

A:circRNA是目前生命科学领域新兴的研究热点分子之一。与传统的线型RNA(linear RNA,含5’和3’末端)不同,circRNA分子呈独特的闭合环状结构,不受核酸外切酶影响,表达更稳定,不易降解。circRNA由特殊的选择性剪切产生,大量存在于真核细胞的细胞质中,具有一定的组织、时序和疾病特异性。这些特征都表明circRNA有巨大潜力成为新型的临床诊断标志物(biomarker)。在功能上,近期的研究表明,circRNA可以通过吸附microRNA抑制后者对相应靶基因的调控,从而对疾病的调控起着非常重要的功能。Arraystar circRNA芯片采用了针对circRNA特异的剪切位点而设计的探针,准确而可靠的检测样本中circRNA的表达情况,帮助研究者对疾病特异性的circRNA进行研究。研究者只需提供样本,康成生物利用Arraystar circRNA芯片对样本中特异表达的circRNA进行筛选,并提供相应的数据分析服务。

剪接点特异性的探针:能准确可靠的检测circRNA,即便在相应线型RNA存在的情况下也能特异性检测circRNA。

*图释:Arraystar circRNA芯片采用了针对特异性剪接点的探针。 线型RNA经过不同的方式拼接:外显子A 的5’端和外显子B的3’端连接,形成环状RNA。Arraystar以circRNA特异性拼接位点作为靶标序列,设计芯片探针,即使在相应的线性RNA存在的情况下也可以准确的检测circRNA。

Q:目前是否有国内的客户使用了circRNA芯片,是否有成果发表?

A:circRNA芯片属于Arraystar公司最新产品,康成生物是Arraystar中国区唯一代理服务商。康成生物在推出不到半年时间内,国内已经有很多老师选择了康成生物的circRNA技术服务平台开展针对各种疾病的circRNA筛选,通常SCI文章发表至少需要1-2年,相信到时将有高水平的研究成果会陆续发表。

Q:康成生物目前还提供哪些非编码RNA的分析工具?

A:康成生物工程有限公司(简称“康成生物”)自2002年起专注于高通量筛选实验服务,是国内最早一批专业提供生命科学前沿研究技术服务的高科技企业。康成生物以lncRNA、microRNA、表观遗传学相关检测技术作为核心研发方向,在非编码RNA(ncRNA)研究领域,康成生物与丹麦Exiqon、美国Arraystar等国际知名芯片品牌合作,帮助老师们开展microRNA、lncRNA相关领域研究。除了 circRNA芯片技术服务外,康成生物目前还提供ncRNA的分析工具有: microRNA芯片、piRNA芯片、miRStar™ 癌症特异性microRNA PCR芯片、Exiqon microRNA PCR芯片、lncRNA芯片、LncPath™芯片、T-UCR芯片等。

2006年,康成生物首选与Exiqon公司合作,开始推出microRNA芯片技术服务,是Exiqon中国区独家代理商。Exiqon公司基于LNA(锁核酸)专利技术开发出的microRNA研究系列技术平台,在microRNA研究领域赢得了良好的声誉和权威性的地位。截止到2014年,康成客户采用Exiqon miRNA芯片及miRNA PCR芯片已发表大量SCI文章,平均影响因子大于5.5分的已超过70篇。

2009年,随着ncRNA研究进展的深入,一类新重要的非编码RNA分子 – lncRNA掀起科学界的热点话题,康成生物很快推出相应的技术服务平台,率先开展lncRNA表达筛查服务。康成选择的是来自美国Arraystar公司的lncRNA系列芯片,是Arraystar中国区唯一代理商。Arraystar LncRNA芯片,基于最全面的数据库和经典文献设计,有最合理的探针设计和最全面的lncRNA分类,是lncRNA研究领域的先驱和领导者。2013年,随着lncRNA研究的进展,Arraystar全新推出了LncPath™这一疾病/信号通路特异性的lncRNA芯片可以快速的将lncRNA的调控机制与其在特定的信号通路或疾病中的生物学功能联系起来,大大加快lncRNA功能的研究进展。迄今为止,使用康成生物lncRNA芯片服务的康成客户发表SCI文章已超过80篇,是国内唯一发表大量SCI论文的商业化lncRNA芯片平台,其中多篇发表在Cancer Cell、Mol Cell、Hepatology等国际顶尖杂志上。有关康成生物LncRNA最新专题报道:LncRNA: 从分子调控到临床应用的最新成果

详细了解康成生物的circRNA技术服务平台

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