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生物通首页 > 今日动态 > 专题总汇 > LncRNA:从分子调控到临床应用的最新成果2016版


       康成生物工程有限公司(简称“康成生物”)自2002年起专注于高通量筛选实验服务,是国内最早一批专业提供生命科学前沿研究技术服务的高科技企业。康成生物以lncRNA、microRNA、表观遗传学相关检测技术作为核心研发方向,是Agilent、Arraystar、Exiqon、SABiosciences等国际知名芯片品牌的服务代理商。

       2009年,随着非编码RNA(ncRNA)研究进展的深入,一类新的ncRNA分子—lncRNA掀起科学界的热点话题,并逐渐成为分子生物学及临床医学研究的重要方向。康成生物与美国Arraystar公司合作,利用Arraystar LncRNA系列芯片平台,率先开展lncRNA表达筛查服务。Arraystar公司是LncRNA研究领域的先驱和领导者,是lncRNA表达谱检测的首选平台。2016年最新推出的第四代LncRNA芯片,来源于最新最全的数据库,并采用严格的筛选程序和转录本特异性设计,同时检测LncRNA和mRNA,芯片注释LncRNA基因组信息、分类及潜在的调控机制,为深入研究LncRNA复杂生物学功能提供参考信息。迄今为止,作为Arraystar中国区唯一代理商,康成客户采用Arraystar LncRNA芯片已发表SCI论文超过160篇,其中多篇发表在Cancer Cell, Mol Cell,Hepatology等国际顶尖杂志上。

LncRNA研究背景及其与疾病的关系




  Arraystar LncRNA芯片:

LncRNA芯片技术的领跑者:目前Arraystar发布了最新版本的人类V4.0 LncRNA芯片和小鼠V3.0 LncRNA芯片。
经典与创新的碰撞:收录金标准LncRNAs,可靠的LncRNAs以及编码蛋白的mRNAs,更新、更全面。
系统而实用的LncRNA注释:注释LncRNA基因组信息、分类及潜在的调控机制,为深入研究lncRNA复杂生物学功能提供参考。
转录本特异性的探针设计:芯片探针可以准确地检测同一基因的不同转录本。

Arraystar公司 LncRNA芯片


  LncRNA在临床医学研究中的新成果:

LncRNA是临床医学研究中新兴的热点分子,可以通过不同的分子生物学机制调控编码基因的表达,参与疾病相关的信号通路,从而对疾病的发生、发展及治疗有重要作用。作为一类新型的具有生物学功能的临床标志物,lncRNA具有非常广阔的临床应用前景。利用Arraystar公司lncRNA芯片,近年来,国内外学者发表一系列高水平科研论文,帮助我们进一步认识lncRNA在疾病的重要作用,开拓临床医学研究的视野,并对我们后续的科研有进一步的指导意义。


   
  为什么选用LncRNA芯片比RNA-seq更合适:

LncRNAs比蛋白编码RNAs表达水平低
RNA-seq对于低丰度转录本的定量不准确
增加测序深度不能提高低丰度转录本的检测准确度
RNA-Seq不能精确定量lncRNA与RNA-Seq数据分析不成熟密切
相关
芯片比RNA-Seq更适合低丰度lncRNAs 表达谱的检测

Arraystar LncRNA芯片:比RNA-seq更适合于LncRNAs表达谱检测


  (1)LncRNA与癌症:

癌症相关的研究是进展最快,成果最丰富的领域。研究者利用Arraystar LncRNA芯片对不同癌症的发生、发展等进行了深入研究。

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  Arraystar ncRNA Promoter 芯片:

Arraystar 启动子芯片是专门为研究启动子区域的甲基化,羟甲基化,组蛋白修饰以及转录因子结合而设计的产品,覆盖所有RefSeq数据库基因的启动子区(Arraystar RefSeq Promoter Array)或是所有非编码RNA的启动子区(Arraystar ncRNA Promoter Array),能够满足不同客户的需求。180 K的芯片,启动子的覆盖范围近2kb,并覆盖了几乎所有启动子区附近的CpG岛,是一款高品质高性价比的甲基化芯片产品。

Arraystar Human ncRNA Promoter Microarray
Arraystar Mouse ncRNA Promoter Microarray


  (2)LncRNA与代谢及心脑血管疾病:

心脑血管疾病以及相关的代谢疾病是一类严重威胁现代人身体健康的疾病。利用细胞、血管、血浆等临床常见样本,研究者使用Arraystar LncRNA芯片对这类疾病进行开拓性的研究。

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  LncPath™ 疾病/信号通路特异性 LncRNA 芯片

迄今为止,研究得比较透彻的lncRNA还很少,超过99%的lncRNA的功能和调控机制尚不清楚。为了促进lncRNA的研究,Arraystar公司开发了LncPath™ 疾病/信号通路特异性LncRNA芯片。LncPath™ 芯片可以同时检测与特定疾病或信号通路相关的lncRNA以及相应的靶基因,帮助客户快速的将lncRNA的调控机制与其在特定的信号通路或疾病中的生物学功能联系起来。

LncPath™ 疾病/信号通路特异性LncRNA芯片列表 

疾病:

癌症
(HumanMouse)

心血管疾病
(HumanMouse)

神经退行性疾病
(HumanMouse)

 

信号通路:

血管生成信号通路
(HumanMouse)

细胞凋亡信号通路
(HumanMouse)

Wnt 信号通路
(HumanMouse)

表观遗传信号通路
(HumanMouse)

Hedgehog 信号通路
(HumanMouse)

Hippo信号通路
(HumanMouse)

代谢信号通路
(HumanMouse)

凋亡性坏死信号通路
(HumanMouse)

上皮间质转化(EMT)信号通路
(HumanMouse)


  (3)LncRNA与其他疾病:

       利用不同疾病的临床样本,研究者使用Arraystar LncRNA芯片筛查出疾病特征性lncRNA表达谱变化,提示lncRNA具有广泛而重要的临床应用价值,为lncRNA的深入研究提供了强有力的临床依据。
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  (4)LncRNA与生殖、发育、再生:

       LncRNA还广泛参与生物体的生长发育、生殖健康、组织再生等基本生物学过程。针对不同时间点的Arraystar LncRNA芯片结果,研究者可以深入探讨生物生长发育等过程中的lncRNA表达谱变化,并进一步揭示lncRNA的重要功能。
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  (5)LncRNA与药物:

       药物相关的lncRNA研究是一类极为重要、具有重大应用价值的研究方向。利用Arraystar LncRNA芯片,研究者可以对药物的药理、毒理、成瘾性、安全评估等方面进行系统而全面的分析,为人类的健康提供可靠保证。
川大生物治疗国家实验室应用LncRNA芯片解析可卡因成瘾机制
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