农科院朱兴全教授Nature Communications发布新基因组草图

　　

生物通报道  来自中国农业科学院、墨尔本大学、华大基因研究院等机构的研究人员报告称，他们成功地绘制出了人畜共患病原体犬弓蛔虫（Toxocara canis）的基因组序列草图，由此为未来针对犬弓蛔虫及其他相关寄生虫的分子研究提供了一个有用的资源。研究成果发布在2月4日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。

中国农业科学院的朱兴全（Xing-Quan Zhu）研究员、墨尔本大学的Robin B. Gasser教授以及Pasi K. Korhonen是这篇论文的共同通讯作者。朱兴全研究员主要从事重要人兽共患寄生虫的基因组、蛋白质组、转录组、microRNAs、线粒体基因组、互作组、分子疫苗、分子检测技术研究，迄今发表SCI收录论文达230多篇。

寄生虫对全球的人类健康造成了长期的破坏性影响。大约有20亿人遭受到诸如钩虫、鞭虫和蛔虫等土源性寄生虫的感染，这些人群主要集中在拉丁美洲、非洲和亚洲的一些贫困地区。由这些寄生虫所造成的全球疾病负担大致与结核病及疟疾相当。例如在全球范围内，受到蛔虫感染的人数便超过10亿，其造成了以儿童为主的人群营养缺乏、认知及身体发育受损，严重情况下甚至导致死亡（延伸阅读：华大基因，墨尔本大学发Nature文章 ）。

弓蛔虫病(Toxocariasis)是一种在许多发展中国家高度流行的疾病，它是由来自犬科动物和猫科动物等肉食动物的弓蛔虫(Toxocara spp.)发生人畜共患传播所引起。犬科动物的犬弓蛔虫是一种公认的人畜共患疾病主要病原体；这一物种具有复杂的生命周期，还涉及到诸如啮齿类动物等转续宿主。在人类尤其儿童中，犬弓蛔虫可侵入到各种组织中引起内脏幼虫移行症、眼幼虫移行症、弓蛔虫病相关神经疾病（包括嗜酸性脑膜炎）和/或隐匿性弓蛔虫病。此外，一些临床和实验研究还表明，犬弓蛔虫感染与一些过敏性疾病如哮喘、慢性瘙痒症和荨麻疹之间有关联。尽管研究人员针对已临床及流行病学进行了充分的研究，然而到目前为止尚未全面地调查这一寄生虫的分子生物学。

在这篇新文章中，研究人员采用新一代测序生成了犬弓蛔虫的基因组草图和转录组，这将为未来的生物学和生物技术研究提供重要的支持。这一基因组大小为317 Mb，具有13.5%的重复序列，至少包含了18,596个蛋白质编码基因，预计产物包括至少373种肽酶、458种激酶、408种磷酸酶、273种受体以及530种转运蛋白和通道。研究人员检测了在幼虫期、以及雄性和雌性成虫期的转录情况，确定了这一寄生虫的基因沉默工具，探究了与发育或宿主-寄生虫互作相关的分子。发现了犬弓蛔虫的分泌蛋白质组（870个分子）中具有丰富的肽酶，与穿透及降解宿主组织相关，并且有一组分子被认为是调控或抑制了宿主的免疫反应。

这一基因组为未来科学团体对犬弓蛔虫开展广泛的后基因组研究提供了一个有用的资源，并将推动开发出一些新的干预措施（药物、疫苗和诊断方法）来对抗弓蛔虫病以及相关的寄生虫病。

（生物通：何嫱）

生物通推荐原文摘要：

Genetic blueprint of the zoonotic pathogen Toxocara canis

Toxocara canis is a zoonotic parasite of major socioeconomic importance worldwide. In humans, this nematode causes disease (toxocariasis) mainly in the under-privileged communities in developed and developing countries. Although relatively well studied from clinical and epidemiological perspectives, to date, there has been no global investigation of the molecular biology of this parasite. Here we use next-generation sequencing to produce a draft genome and transcriptome of T. canis to support future biological and biotechnological investigations……

作者简介：

朱兴全研究员

现任家畜疫病病原生物学国家重点实验室副主任、中国农业科学院兰州兽医研究所家畜寄生虫病研究室主任、博士生导师。近年来主持承担“国家杰出青年科学基金项目”、国家“973”计划、“973”计划前期研究专项、国家自然科学基金项目（重点、面上、国际合作项目）、国家公益性行业（农业）科研专项等重要研究课题20多项。在国际上已发表SCI收录论文230多篇，其中影响因子2.9以上的80多篇，影响因子5以上的14篇，总影响因子600以上。在国际上参编英文专著3部。在国内核心期刊发表论文120多篇，主编、主审、副主编、参编、参译专著、教材10部。