细胞研究权威专家新工具：OpenFreezer

　　

生物通报道：在生物实验室经常有人说，我们最重要，最宝贵的资产就是冰箱里或者液氮罐里Eppendorf管里保存的东西了，但是在这些容器上要标注出处，用途，来源，时间等大量信息并不容易，而且还要考虑到某些人的潇（ma）洒（hu）字迹。更别提经年累月后，几经易手后，令人费解的一连串神秘的字母和数字，如SHC1-1 标识的是什么意思？那是一个质粒，还是引物？全长的还是部分片段？浓度是多少？在这种情况下，研究人员通常别无选择，只能抛弃这一也许具有重要价值的样品。

这种情况也许在每个实验室中不可避免，就算是进行了细致的文档记录，但是项目一旦完成，也许就不会再有人记起这些样品了。The Scientist杂志近期汇总了一下专家的意见，看看他们的实验室是如何保存样品的呢？

前文：专家们告诉你，他们如何保存样品？

第二个例子：来自多伦多大学和西奈山医院Lunenfeld-Tanenbaum研究所的Tony Pawson实验室

Tony Pawson院士是细胞信号与调控研究领域的权威专家，他曾识别出磷酪氨酸结合SH2结构域，并证明其在蛋白-蛋白相互作用中的功能，被汤姆森路透预测认为是有可能获得诺贝尔奖的科学家。

主要问题：

Pawson与其他研究人员在Lunenfeld-Tanenbaum研究所的实验室成立于2005年，自成立后这一实验室从美国国立卫生研究院的人类和小鼠哺乳动物基因文库（Mammalian Gene Collection，MGC，生物通注）克隆了大量基因。毫无疑问，他们需要保存数以万计的细菌群。

解决方案：

实验室人员Karen Colwill表示，Lunenfeld-Tanenbaum研究所的MGC克隆都是断断续续购买的，目前已经有了上千份样品，这些克隆是放在微孔板里运过来的，现在实验室也这么保存这些样品。

在一个–80°C超低温冰箱中，大约有751个96孔板和384孔板保存的七万多个克隆，它们被分别放在25个机架（每个架子上66块板）上。所以要找到任何一个克隆就需要记录的笔记本，此外，实验室还有将近1,000 个细胞株存储在液态氮中，为此Colwill和实验室软件工程师Marina Olhovsky 开发出了一种新工具： OpenFreezer （openfreezer.org）。

这一成果公布在Nature Methods杂志上（OpenFreezer: a reagent information management software system）。

OpenFreezer是一个免费的基于 Linux 的开源Web应用程序，可以用于保存和安全归档多个试剂文件，支持多用户界面。“这并不是一个简单的Windows下载文件，”Colwill说，“需要找个懂编程的人来解释，”才能应用这一程序。不过尽管如此，她也表示，这一工具“使用方便，直观”，目前已有20 多个机构使用该应用程序。

用户可以自定义 OpenFreezer，来跟踪和管理库存中任何类型的试剂，也包括质粒，插入片段，寡聚核苷酸，和细胞株等。这一数据库还可以捕捉到关联的信息，如核酸序列、样品浓度和体积，以及储存位置。

研究人员可以通过一个简单的Web浏览器连接上系统，目前Colwill等人正在开发手机应用软件。今年他们还将公布一个新的版本，升级到能添加实验手册和跟踪实验室订单的模块。

OpenFreezer 能帮助研究人员通过关键词，或者数据库识别符号来筛选寻找样品，并根据物理位置识别试剂。Colwill说，这一数据库目前已经在他们研究所用于记录多个实验室和用户的186,000 个样品。通过定期更新数据库，研究人员就能确保自己样品的安全归档，当然这前提是存储样品的时候要登记下来。不过Colwill也表示，这一系统还是能确保关键试剂的保存和寻找，实验室管理员可以要求研究人员进行常规的试剂保存，这样就能完善整个系统。

“OpenFreezer确实要比常规方法，更容易挽救前实验室成员的克隆样品，”Colwill说。

后文： 华裔学者：实验室保存样品的秘诀

原文摘选：

Chill GPS

Keeping track of frozen biological samples