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为健康再出击!联川16类703种遗传疾病Genes Panel上市!

【字体: www.ebiotrade.com 时间:2016年4月7日 来源:联川生物

摘要:

  继人类线粒体基因组Panel,乳腺癌BRCA1/2 Panel之后,联川最新推出基于VariantBaits™液相捕获技术的更大规模的人类遗传疾病Genes Panel。

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人类线粒体基因组Panel乳腺癌BRCA1/2 Panel之后,联川最新推出基于VariantBaits™液相捕获技术的更大规模的人类遗传疾病Genes Panel。

1. 遗传病Panel你做主

这个遗传疾病Panel收集了16大类703种人类遗传病的总计2017个高风险基因(如下表所列)。

现在起,您可以根据疾病研究需求,选择其中1种或多种(甚至全部)的疾病风险基因,采用联川VariantBaits™液相捕获技术快速定制化您自己的Genes Panel,高效靶向研究疾病发生的关键基因。

疾病分类

疾病分类(英文)

疾病名称

风险基因

心脏疾病

Cardiac Disorders

31项心脏疾病(如Arrhythmogenic Right VentricularCardiomyopathy (ARVC)Brugada Syndrome (BrS)等)

总计155个风险基因(如ABCC9 , ACTC (ACTC1), ACTN2, AKAP9, ANK2, ANKRD1, BAG3, BRAF, CACNA1C, CACNB2等)

性分化异常

Disorders of Sex Differentiation

14项性分化异常疾病(17 Alpha-Hydroxylase/17,20-Lyase Deficiency46,XY Disorder of Sex Development46,XY Gonadal Dysgenesis (SRY-related)等)

总计46个风险基因(如CHD7, FGF8, FGFR1, GNRH1, GNRHR, KAL1, KISS1, KISS1R, NR0B1, NSMF (NELF)等)

畸形病

Dysmorphology Disorders

56项畸形病(如Alagille syndromeAntley-Bixler Syndrome (ABS)Axenfeld-Rieger Syndrome等)

总计210个风险基因(如ACTB, ACTG1, BRAF, CBL, CBL, HRAS, KRAS, MAP2K1, MAP2K2, NRAS, PTPN11等)

内分泌失调

Endocrine Disorders

41项内分泌失调疾病(如Achalasia-Addisonianism-AlacrimaAdrenal Hypoplasia Congenita (AHC), X-linkedAllgrove Syndrome等)

总计100个风险基因(如CHD7, FGF8, FGFR1, GNRH1, GNRHR, KAL1, KISS1, KISS1R, NR0B1, NSMF (NELF), PROK2等)

眼病

Eye Disorders

45项眼病(如AchromatopsiaAniridiaAnophthalmia等)

总计47个风险基因(如DCDC1, ELP4, PAX6, WT1等)

血液病

Hematologic Disorders

15项血液病(如Blackfan-Diamond SyndromeCartilage-Hair HypoplasiaChuvash Type Polycythemia等)

总计13个风险基因(如RPS19RMRPVHLMPLELANE (ELA2)TERT等)

遗传性肿瘤综合征

Hereditary Cancer Syndromes

38项遗传性肿瘤综合征(如Attenuated Familial Adenomatous Polyposis (AFAP)Bannayan-Riley-Ruvalcaba SyndromeBasal cell nevus syndrome等)

总计62个风险基因(如APC, ATM, BMPR1A, BRCA1, BRCA2, CDH1, CDKN2A, CHEK2, EPCAM, MLH1等)

免疫失调

Immunologic Disorders

39项免疫失调(如Adenosine Deaminase DeficiencyAgammaglobulinemia, X-linkedAPECED等)

总计83个风险基因(如ABCA12, ABHD5, AGPS, ALDH3A2, ALOX12B, ALOXE3, AP1S1, ARSE, CERS3等)

代谢紊乱

Metabolic Disorders

102项代谢紊乱(如2-Methyl-3-Hydroxybutyryl-CoA Dehydrogenase Deficiency3-Hydroxy-3-Methylglutaryl-CoA Lyase Deficiency3-Hydroxyacyl-CoA Dehydrogenase Deficiency等)

总计156个风险基因(如ABCD4, ACSF3, CD320, HCFC1, LMBRD1, MCEE, MLYCD, MMAA, MMAB等)

线粒体疾病

Mitochondrial Disorders

63项线粒体疾病(如2,4-Dienoyl-CoA Reductase Deficiency (DECRD)3-Hydroxyisobutryl-CoA Hydrolase Deficiency (HIBCH)3-Methylglutaconic Aciduria Type VII (MGCA7)等)

总计319个风险基因(如AARS, AARS2, ABCB11, ABCB4, ABCB7, ABCD4, ACAD9, ACADM, ACADVL等)

神经系统紊乱

Neurological Disorders

102项神经系统紊乱(如Achalasia-Addisonianism-AlacrimaAicardi-Goutieres SyndromeAlexander Disease等)

总计403个风险基因(如ACTB, ACTG1, ARX, ATP6V0A2, B3GALNT2, B3GNT1, DCX, FKRP, FKTN等)

产前诊断

Prenatal Diagnosis

30项产前诊断(如46,XY Gonadal Dysgenesis (SRY-related)Achondroplasia (ACH)Androgen Insensitivity Syndrome (AIS)等)

总计153个风险基因(如AGPS, ARSE, COL1A1, COL1A2, COL2A1, CRTAP, DLL3, DYNC2H1等)

肾功能紊乱

Renal Disorders

15项肾功能紊乱(如Alport SyndromeBirt-Hogg-Dube SyndromeBranchiootic Syndrome等)

总计66个风险基因(如ALK, APC, ATM, AXIN2, BAP1, BARD1, BMPR1A, BRCA1, BRCA2等)

风湿性疾病

Rheumatologic Disorders

6项风湿性疾病(如Chronic Infantile Neurologic Cutaneous and Articular SyndromeFamilial Cold Autoinflammatory SyndromeFamilial Cold Urticaria syndrome

总计2个风险基因(NLRP3 (CIAS1)MEFV

骨骼疾病

Skeletal Disorders

32项骨骼疾病(如Acro-Renal-Ocular syndromeAnauxetic DysplasiaBasal cell nevus syndrome等)

总计75个风险基因(如AGPS, ARSE, COL1A1, COL1A2, COL2A1, CRTAP, DLL3, DYNC2H1等)

皮肤病

Skin Disorders

74项皮肤病(如Acral Peeling Skin SyndromeArthrogryposis-Renal Dysfunction-Cholestasis Syndrom-1Autosomal Recessive Congenital Ichthyosis

总计127个风险基因(如ABCA12, ABHD5, AGPS, ALDH3A2, ALOX12B, ALOXE3, AP1S1, ARSE等)

2. VariantBaits™—新的更灵活高效的靶向捕获技术

VariantPro™一步法靶向文库制备技术之后,为满足研究人员对更大规模靶向基因筛查的需求,联川推出VariantBaits™大规模靶向文库制备系统。

新的VariantBaits™系统基于液相杂交捕获技术,其核心技术之一是大规模合成寡核苷酸探针文库。

联川首席科学家高晓连教授是世界上最早提出采用超大规模合成技术(原位合成基因芯片技术)进行人工基因合成概念的科学家。基于此概念,2004年高晓连教授与哈佛大学George Church合作的光化学原位合成基因芯片进行快速合成有活性的基因的研究成果发表在国际顶尖期刊《Nature》上1。联川基于原位合成技术合成的寡核苷酸文库(Oligomix®)已被用户成功应用于基因合成,文库构建,新药发现等诸多研究领域,此外,越来越多的用户采用OligoMix®进行捕获探针的制备和技术开发,包括Molecular Inversion Probes(MIP),Selective Genomic Circularization(SGC)和Oligo-Selective Sequencing(OS-SEQ)已被证明在选择性富集指定基因组内的目标区域是非常有效的2~7

现在,基于成熟可靠的探针文库合成技术和靶向序列捕获经验,联川正式推出了具有自主知识产权的VariantBaits™液相捕获文库制备系统。这套捕获系统是采用液相杂交捕获靶标DNA,使用生物素标记探针诱饵,探针序列与靶向序列互补,从而富集与制备靶向序列文库。特别重要的是,VariantBaits™可以灵活高效地按照用户的需求合成定制化的捕获探针文库。

基于这套高效的靶向捕获系统,用户只需使用较低的测序深度,即可获取令人满意的测序覆盖度(如下图)。在测序深度100x(PE150)时,> 96%的靶向序列具有20x以上覆盖度,> 92%的靶向序列具有30x以上覆盖度。


 
• 高质量性能可靠的生物素标记的寡核苷酸探针
• 100%定制化探针设计——适合任意物种,任意序列!
• 灵活的探针文库,胜任小范围和大规模的靶向捕获
• 为用户设计最优的探针库,不收取额外费用
• 完美胜任NGS初学者和专家级用户的研究需求

参考文献
1. Gao X, Church, GM, et al. (2004) Accurate multiplex gene synthesis from programmable DNA chips. Nature 432, 1050-1054.
2. Eroshenko N, Kosuri S, et al. (2012) Gene Assembly from Chip-Synthesized Oligonucleotides. Current Protocols in Chemical Biology 1–17.
3. Myllykangas S, Buenrostro JD, et al. (2011) Efficient targeted resequencing of human germline and cancer genomes by oligonucleotide-selective sequencing. Nat Biotechnol 29, 1024-27.
4. Teer JK, Bonnycastle LL, et al. (2010) Systematic comparison of three genomic enrichment methods for massively parallel DNA sequencing. Genome Res 20(10), 1420-31.
5. Matzas M, Stähler PF, et al. (2010) High-fidelity gene synthesis by retrieval of sequence-verified DNA identified using high-throughput pyrosequencing. Nat Biotechnol 28(12), 1291-94.
6. Baker SC, Bauer SR, et al. (2005) The External RNA Controls Consortium: a progress report. Nat Methods 2(10), 731-34.
7. LC Sciences' customers - data unpublished

希望更多获取联川16类703种遗传疾病Genes Panel信息

关注联川微信公众号,获取最新医学检测panel讯息


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