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华人科学家Science文章发现水稻家化转折点
生物通报道:本期（3月9日）Science文章上，来自美密歇根州立大学植物学系的Tao Sang博士和他的同事Changbao Li的公布了他们有关水稻不掉粒性状的基因变异分析的研究结果，为水稻如何家化提供了重要基因信息。世界目前有一半的人口在食用水稻，主要分布在亚洲、欧洲南部和热带美洲及非洲部分地区。其总产量占世界粮食作物产量第三位，低于玉米和小麦，但能维持较多人口的生活。水稻之前一直认为原产于印度，但根据河姆渡出土的4700年前的稻种残留物，是目前全世界发现最早的稻种，证实长江下游是原产地之一。水稻家化的一个重要特征就是从种子满地散发的野草变成了能夹住成熟的颗粒直到被收获，这确保了水稻能够
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肥胖和相关的代谢疾病的治疗新靶标
生物通报道：在一项发表在3月的Cell Metabolism的新研究中，研究人员发现了一个可能用于治疗肥胖和相关代谢疾病的新目标。此外，研究人员还发现了一种新化合物可以抑制食欲和体重的增加。Prosidion生物技术公司的Hilary Overton和Christine Reynet领导的研究组发现一类叫做oleoylethanolamide的化合物。该物质是一种天然产生可减少食物摄入合减少增重脂肪信号的物质，它通过G蛋白偶连受体(GPCR) GPR119发挥功能。GPR119主要存在于人和小鼠的胰脏和消化道中，也存在于啮齿动物的脑部。研究人员对几十万种化合物进行筛选，看它们是否能活化GPR1
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导致婴儿猝死的关键物质新发现
生物通报道：芝加哥大学的 Jan-Marino Ramirez 教授领导的研究组发现复合胺（serotonin） 可能是婴儿猝死症 (sudden infant death syndrome，SIDS) 的关键物质。在美国，SIDS 是小于一岁的婴儿的主要死因，而且每年约有3,000个婴儿死于SIDS。 这项研究主要分析了起博器细胞 (pacemaker cells) 内 serotonin 受干扰时组织缺氧的情况。这种细胞是一类控制呼吸节律的特殊神经细胞。研究人员发现起博器细胞需要正常含量的 serotonin才能引发呼吸与自我苏醒。 Jan-Marino Ramirez指出，该项新研究的结
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能关闭细胞能量制造的基因被发现
生物通报道：约翰霍普金斯大学的研究人员发现了HIF-1基因的一种新的功能。众所周知，ATP为细胞提供进行生化反应的能量。在这项新的研究中，研究人员发现，当细胞缺氧时会减少含有丰富能量的ATP分子的制造，并增加毒性分子的制造，而HIF-1基因则可帮助细胞在缺氧状态下存活。这项研究的结果公布在3月8 日的Cell Metabolism中。研究中使用了一种缺少HIF-1 基因表达的小鼠细胞进行研究分析。细胞的能源供应由两种利用葡萄糖的机器或机制供应：其中一个机器是粒线体，它可利用氧气分解葡萄糖和制造ATP；另外一种不需要氧气且效率较差的机制为糖酵解作用。当氧气充分时，细胞利用粒线体消耗葡萄糖，但是这
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生物酶计算器系统被发明
生物通报道：以色列希伯来大学的化学家Itamar Willner开发出了一套可进行运算的酶系统。这个系统利用两种酶组成AND、XOR及InhibAND逻辑门（logic gates），然后利用前二者或后二者的连结来进行二进制加减运算。组成逻辑门的两种酶分别为辣根过氧化酶（horseradish peroxidase, HRP）和葡萄糖脱氢酶（glucose dehydrogenase, GDH），两个输入值（inputs）A、B则分别为过氧化氢（H2O2）和葡萄糖（glucose）：若过氧化氢或葡萄糖存在则A或B值为1，否则就是0。HRP能通过烟酰胺腺嘌呤二核酸（NADH）将H2O2还原成H2
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难道臭氧也对基因芯片有影响？
生物通报道：您的实验室正在利用基因芯片进行实验研究吗？实验室的消毒手段是否有利用紫外线杀菌消毒？如果包括了以上这两项，请注意以下这一数据：随着臭氧浓度的增加，Cy5信号逐渐下降，在30-60 ppb（ppb,十亿分之一）信号大概损失了40％，更加严重的是，在80-90 ppb水平下，Cy5信号损失了大概50％。由于大部分实验室使用Cy5/Cy3比率来检测Oligo芯片或cDNA芯片的结果，因此如果臭氧降低其中一种染料的信号而不是两种，这样会对生物芯片结果产生人为的不利影响。而且如果是在一次实验中做完所有的芯片，这个问题不大——因为信号损失是一样的。但是如果在不同的时间进行同一个芯片实验，或者在
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3月10《科学》选读
啮齿动物填补化石记录的空白 一项新研究指出，去年在老挝发现的一种新啮齿动物是人们认为已经灭绝了1100万年的物种的一个幸存者。Mary Dawson和同事将这个类似松鼠的动物的骨骼残骸，与一个人们了解甚少的、灭绝了的东南亚啮齿动物作了比较，确认该动物其实是这个消失了的家族的一个现今仍存活的成员。这个新物种在2005年被发现时曾引起广泛的注意，因为它被认为是一个全新的活着的哺乳动物家族。但是，本文作者说这个啮齿动物是“拉撒路效应(Lazarus effect)”的一个典型表现，该效应是指一个生物体在化石记录中消失了很长时间后的突然重新出现。这些研究人员写道，这个现象在哺乳动物和其它脊
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又一个科学丑闻？《自然》展开调查
实验无法重复，《自然》杂志和美国普渡大学展开调查 Rusi Taleyarkhan是一位美国核工程师，他在2002年发表于美国《科学》杂志上的论文中声称，首次观察到气泡核聚变现象，论文发表后掀起一阵“风暴”，因为这意味着可能出现一种取之不竭的新能源，但该论文也受到不少怀疑和批评。尽管Taleyarkhan反复报告自己的新实验证实了这一发现，但除了Taleyarkhan的研究小组，在整整四年的时间里，全世界没有科学家能够重复他的实验。目前，《自然》杂志和Taleyarkhan所在的普渡大学正在对气泡核聚变实验进行调查。 &
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大米促进中国人进化
美国遗传学家乔纳森·普里查德和同事进行的研究发现，在距今1．5万年至5000年的时间里，大约有700个人类基因组的基因在自然选择过程中发生了改变，这表明人类仍在进化。例如在中国人的进化过程中，农业的变化起到了不容忽视的推动作用。 这一重要发现刊登在美国最新出版的一期《科学公共图书馆生物学》杂志上。 人类仍在进化 呈现进化特征的基因分布在味觉、嗅觉、消化系统、骨骼构造、皮肤颜色和大脑功能等各个方面。 “有足够的证据证明，在过去的一万年里，自然选择是人类进化的重要推动力，认为人类进化已经停止的说法毫无道理。”普里查德说。 研究人员在对非洲、东亚和欧洲
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胶囊可在体内“行走” 美研制出纳米级胶囊
本报华盛顿3月10日电 美国伊利诺斯州大学的科研小组日前宣布，他们创造性地利用油脂和纳米粒子混合，以新方法研制出纳米级胶囊。纳米级胶囊可用于制造新药和农业方面需要的新材料。 该大学材料科学系的科学家史蒂夫•格冉尼克教授表示，他们研制的纳米级胶囊是利用生物适应性材料获得的。与目前广泛使用的胶囊相比，纳米级胶囊更能稳定油脂，解决人工油脂空心胶囊的技术难题。油脂是组成细胞膜的基本物质。在过去，制作有效的人工油脂空心胶囊是不可能实现的事，其重要原因是人工油脂空心胶囊很不稳定。格冉尼克教授和研究生张亮方（音译）研制的纳米级胶囊，则具有较好稳定油脂和阻止其解体的性
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墨破译一豆类固氮菌基因序列
经过７年的研究，墨西哥国立自治大学的科学家日前宣布成功破译一种豆类作物固氮菌的基因序列，并首次为这种固氮菌绘制了完整的基因图谱。据新华社墨西哥城３月１２日电，以基因学专家科利亚多为首的科研小组发布消息说，他们研究的这种细菌名为埃特里根瘤菌，它能在豆类作物根部固定游离氮元素，合成含氮养料供作物享用。专家在研究中发现，这种固氮菌拥有的碱基对超过６５０万个，其基因序列很复杂。科利亚多指出，破译固氮菌的基因序列有助于为豆类、玉米等作物研制新的生物肥料，使这些作物有可能在贫瘠土地中生长。据科利亚多的科研小组介绍，上述研究工作于去年１１月结束，取得的科研成果已得到美国国家科学院的认可，相关论文刊登在该院３
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日本研究人员发现合成达菲的新途径
生物通报道：自从禽流感在世界范围内肆虐以来，瑞士罗氏公司的流感特效药“达菲”被认为是低于禽流感在人类中爆发的救命稻草。据了解，达菲的原材料是植物提取物，因而无法满足各国政府囤积达菲以防止禽流感的巨大需求。最近，日本东京大学的研究人员则通过人工合成方法制造出了合成版的达菲。这种技术将可能缓解达菲的供不应求。这种新的达菲制造方法将会具有稳定的达菲生产量。发明设计这种新制造方法的生化学家是Masakatsu Shibasaki。合成达菲的原料是容易获得的化合物1,4-环己二烯，而不是植物提取物。Shibasaki表示，这种合成产物确实是达菲，并且东京大学已经与罗氏公司商谈合作事宜。东京大学已经于20
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MiRNA-mRNA互做的基因组图谱被确定
生物通报道：纽约大学比较功能基因组学中心和加州大学伯克利分校的研究人员通过计算机分析预测出了线虫整个基因组范围的microRNA靶标图谱。MicroRNA能与一种叫做3'UTR的特殊部分中的信史RNA（mRNA）结合，并且能够调节它们。这个预测图片的部分通过一种新的活体方法确定。这种新方法能够确定mRNA的3'UTR部分是否在活体生物的发育过程中被调节。这项研究的结果公布在近期的Current Biology杂志上。在确定microRNA（miRNA）的靶标过程中，研究组分析了线虫基因组的功能。线虫是第一个完成了完整基因组测序的动物种类，并且是研究胚胎发育的一个经典模型生物。利用由纽约大学开发
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脂肪和纳米颗粒创造的载体奇迹
生物通报道：伊利诺伊州大学的研究人员通过混合脂肪和纳米颗粒，制造出了可用于传递药物和农业材料的新工具。这项技术是制造纳米大小胶囊的一种新方法，而且制造出的胶囊具有极佳的生物兼容性。利用这种技术制造出来的这种空心、可变形且具有生物功能的胶囊可以用于传递药物，以及作为胶质的生理感应器及酶催化反应。研究人员在近期的Nano Letters上公布了这项新技术。脂肪是细胞膜的重要组成成分。由于脂囊泡太过精细，所以无法以合成方式建构。Granick 和他的研究生Liangfang Chiang发现了一种可以稳定脂肪并且避免脂肪受到破坏的方法。首先，研究人员先准备好特定大小的脂囊稀溶液。接着，将化学物质包入
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人类基因组计划+6年
生物通报道：距离2000年6月人类基因组计划宣布完成了基因组序列“工作框架图”已经有近6年时间了，但是是不是如当初科学家们构想的那样，知道了人类的全部遗传信息即基因组序列，就可以任意控制人的生老病死吗？根本不是那么回事，基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力根据,但实际上大部分疾病并不是因为基因改变所造成。并且，基因的表达方式错综复杂，同样的一个基因在不同条件、不同时期可能会起到完全不同的作用，关于这些方面的问题，基因组学是无法回答的。因此所谓的后基因组学诞生了，这个计划里包含了许多内容，比如功能基因组学，结构基因组学，蛋白质组学，还有人提出了“药物基因组学”，“环境基因组学
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3月9日《自然》精选
封面故事：鞭毛对锥体虫的重要性寻找预防非洲睡眠疾病的疫苗的希望很渺茫，目前用来治疗该疾病的大多数药物都是过时的药物，并不是特别有效，而且难以用在该疾病所流行的撒哈拉以南非洲地区普遍存在的那种发病情况。所以，发现有可能成为药物干预目标的一类新分子，对这一领域的研究工作可能是一大促进。睡眠疾病寄生虫布氏锥体虫（Trypanosoma brucei）是一种原生动物，长有鞭子一样的鞭毛。现在，RNA干涉（RNAi）基因抑制（knock-down）实验结果表明，拥有一个能够正常发挥功能的鞭毛，是该寄生虫在血液中生存所必需的。这说明，这种鞭毛可以成为治疗方法的一个可能的作用点，而蛋白组分析也表明，存在若干
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2006年博士后最佳工作场所调查之排名
生物通报道：2006年The Scientist杂志3月刊公布了年度“博士后最佳工作场所”调查。 Top 15 North American Institutions Rank in 2006Rank in 2005NameCountry No. of postdocs in the life sciences Average annual postdoc salary(or salary range) Postdoc office,assc, or advisor? 1 12 The J. David Gladstones Institutes USA 83 $51,180 Off
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Science封面文章：4.5埃微观世界揭示酶复杂结构
生物通报道：哺乳动物脂肪酸合成酶系统（Fatty Acid Synthase ，FAS）是细胞内最复杂的酶系统之一，近期来自瑞士联邦理工学院的（Swiss Federal Institute of Technology ，ETH Zurich)分子生物学与生物物理学系的研究人员获得了猪脂肪酸合成酶系X-ray结晶图（x-ray crystallographic map），比较于真菌脂肪酸合成酶有很大的不同（见下图）。这一研究成果公布在3月3日Science杂志上。 （灰色为真菌脂肪酸合成酶，彩色为哺乳动物脂肪酸合成酶）在大肠
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揭示与癌症有关的基因的共性
生物通报道：Navarra大学的两名研究人员Javier Novo和José Luis Vizmanos对与癌症的发生有关的基因进行了一项生物信息学研究。这项研究的结果公布在近期的Trend in Genetics上。在这项生物信息学研究中，研究人员确定了那些与癌症的发生有关的基因的结构和功能上的共性。这项研究的分析结果支持了有关“肿瘤发生的最重要机制是发生随机缺损的基因”的假说。当一个正常的细胞发生癌变时，它最重要的一个变化就是它的基因组变得不稳定，并且在不同的地方出现了缺口。虽然到目前为止，已经有很多研究提供了这类缺损的例子，但是人们对导致缺口发生的因素以及如何产生易位都知之甚少。在这项新
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发现有助于多发性硬化症检测的蛋白质
生物通报道：约翰霍普金斯大学的 Avindra Nath 教授领导的研究组发现，只存在于脑脊髓液中的血清胱抑素（cystatin）蛋白质，可能有助于医生辨别多发性硬化患者或是自体免疫疾病高风险者。多发性硬化症是一种常见的自体免疫疾病，在这种疾病中，免疫系统攻击髓鞘 (myelin)。这种疾病每年影响超过 10,000 位美国人，其中多数为女性。到目前为止，人们还不能通过血样或其它方式进行这种疾病的检测。在分析人类的脑脊髓液后，Nath 等人发现，尺寸为12.5 kDa 的血清胱抑素是较大的 cystatin C（血清胱抑素C）的降解产物，进而抑制包括组织蛋白酶B在内的一些酶。已知，组织蛋白酶B
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