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宏基因组等多组学方法研究揭示肥胖和减重干预人群肠道微生物和血清代谢组变化
2017年6月19日，来自上海交通大学医学院附属瑞金医院、华大等机构的研究人员通过宏基因组关联分析，结合血清代谢组学和蛋白组学研究手段，完成了中国青年肥胖人群肠道菌群、循环氨基酸和临床表型之间的关系研究，建立了宏基因组和临床指标的分类与预测模型。这项研究阐明了肥胖病的起因和发展的分子机制，为建立肥胖病精准分子分型和临床转归精准预测提供了理论基础，其最新成果在线发表于国际著名杂志Nature旗下子刊Nature Medicine。肥胖已经成为世界性流行疾病，是2型糖尿病、心血管疾病和癌症的主要风险因子之一。根据《中国居民营养与慢性病状况报告(2015年)》，2012年我国成人肥胖率为11.9%，
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一种投机微生物为何能杀死癌细胞？阻止癌细胞增殖获重要突破
生物通报道：“这些发现将对癌症生物学研究和癌症药物开发起重要影响，”血液、肿瘤和细胞治疗学副教授Sasha Shafikhani博士说。该研究小组在调查投机微生物杀死癌细胞时， 意外发现了两项新进展。Shafikhani实验室研究铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa）很多年了。该致病菌可分泌几种毒素引起感染。其中一种名为ExoT的细菌毒素可抑制细胞分裂，阻碍伤口愈合，同时也能杀死癌细胞。当研究人员试图找出ExoT对抗癌细胞的致死机制时，偶然地解决了一个神秘问题。至少20年前，医学研究人员一直在思考，细胞在执行正常凋亡程序之前，如何通知左右邻居“我需要被更换”这个信息，让周
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Oncogene：肿瘤治疗新靶点研究新突破
上海交通大学药学院李大伟教授课题组经过多年研究在肿瘤治疗新靶点研究方面取得重大突破，其研究揭示了乳腺癌中高表达的人前梯度蛋白2（AGR2）在肿瘤发生发展中的新作用机制。同时，根据相关机制开发的人源化抗体药物Agtuzumab（18A4Hu）在抗肿瘤及药物联用方面也表现出了优良的治疗效果，相关的一系列研究发表在Nature子刊《Oncogene》上以及Biochemical and Biophysical Research Communications》上。随着人们对肿瘤的深入了解，肿瘤微环境在肿瘤发生发展中的作用越来越受到研究者的关注。肿瘤微环境中含有多种可溶性蛋白因子，肿瘤细胞通过这些微环境
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清华大学最新文章：突破浓度限制的单分子FRET成像新方法
2017年5月11日，清华大学生命科学学院陈春来研究组在《Angewandte Chemie》（德国应用化学）杂志在线发表题为 “Single molecule photoactivation FRET, a general and easy-to-implement approach to break the concentration barrier”的研究论文。该论文报道了利用光激活的荧光团代替传统荧光团，以突破全内反射荧光显微技术中的荧光浓度屏障的通用方法，实现将标记物种的最高浓度限值提高2-3个数量级，从而可以在接近生理条件的μM浓度下进行单分子FRET测量。单分子荧光技术可以在复杂
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最新Nature文章：抵抗尿路感染新方法
一只住在膀胱壁上的大肠杆菌（黄色）生物通报道尿路感染（urinary tract infections，UTIs）是最常见的感染性疾病之一，它们容易反复复发。大多数UTIs因肠道大肠杆菌散播到泌尿道引起。每年全球近1亿人口受UTIs困扰。数据显示，尽管患者接受了抗生素治疗，6个月内（一般约1个季度）仍容易再次感染。UTIs引起疼痛、灼痛和尿频。严重情况还会扩散到肾脏和血液，危及生命。圣路易斯华盛顿大学最新发现，一种分子诱饵可靶向减少肠道UTIs细菌。研究发现，肠道致病细菌(uropathogenic Escherichia coli,UPEC)数量越少，患UTIs风险越低。“我们研究的最终目标
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借助单细胞RNA-Seq技术，将乳腺癌看得更清楚
生物通报道 一项新的单细胞RNA-Seq转录组分析技术的出现，让研究人员能够快速鉴定肿瘤中的各种细胞，以及肿瘤微环境中的基质细胞和免疫细胞。这项技术于近日发表在《Nature Communications》杂志上。分子靶向治疗是近年来肿瘤学研究领域的热点。在乳腺癌治疗方面，自从内分泌治疗应用于雌激素受体（ER）阳性肿瘤以来，许多分子靶向治疗明显改善了患者的疗效。HER2阳性患者的成功治疗就是一个例子。临床实验人员通常利用基因组和基因表达谱分析来鉴定每个患者的大块肿瘤，但肿瘤内的细胞往往表现出明显的异质性，可能影响治疗效果。循环肿瘤细胞的单细胞转录组分析可以更准确地估计肿瘤异质性，从
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新方法|用RNA寻找罕见遗传病基因触发器
生物通报道：大约有一半罕见遗传病患者的致病基因仍未找到。其中一个原因是由于人类基因信息量巨大。针对这一问题，信息学和医学领域科学家们联手寻找解决方案。由慕尼黑工业大学和Helmholtz 慕尼黑中心组成的研究小组已开发出一种能显著提高搜索成功率的新方法。不只着眼于DNA，新方法的寻找策略还包括RNA筛查。所谓的罕见疾病其实并不罕见，它们影响着约8%全球人口，绝大部分是遗传疾病。确定哪些基因能引发疾病对开发治疗方法很重要。自从实现人类全基因组测序已经过去很多年了，研究人员可以通过病人的组织样本创建一个包含患者所有遗传信息列表。其中也包含着导致疾病的突变信息，但问题在于，正确地找到它们具有难度。困
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新方法|为缺血提供潜在治疗方法
生物通报道：陈教授与其临床合作伙伴C. Keith Ozaki医学博士、Joseph Woo医学博士共同开发了这款具有针对性的促新血管生长人工补丁。他们的研究发表于最新一期《Nature Biomedical Engineering》。“注射生长因子促进新血管生长是一种很有前途的缺血治疗实验方法，是较为流行的血管再生治疗手段，”陈教授说。“但在实践中，新生血管分支往往萌生成一个混乱曲折网络，像小毛球一般堵在那里，血液无法有效通过。我们想用人工干预手段使它们变得有序。”陈和同事们设计了两个内皮细胞补丁，其中一个注入的细胞被预先组织成特定结构，另一个细胞没有任何组织结构，仅是简单地把细胞注入进去。
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Nature子刊：金纳米粒子活细胞成像新技术
来自中科院上海应用物理研究所物理生物学研究室，加州大学圣地亚哥分校的研究人员发表了题为“Real-time visualization of clustering and intracellular transport of gold nanoparticles by correlative imaging”的文章，发展了一种基于金纳米粒子的荧光-纳米等离子体双模态成像fPlas探针，并对其在胞内运输中的聚集过程及聚集态对其传输动力学的影响开展研究。这一研究成果公布在Nature Communications杂志上。文章由中科院樊春海研究员等人领导博士研究生刘蒙蒙和副研究员李茜等完成。胞吞及囊
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Nature Genetics同期两篇文章：GWAS和Hi-C技术解密全新癌症相关基因
生物通报道：睾丸癌是最常见的年轻男性癌症。铂类化疗是较为成功的治疗手段，但仍有少部分男性对其缺乏反应。一般患者的初次确诊年龄在二三十岁，这意味着他们今后的人生不得不忍受长期化疗带来的副作用。伦敦癌症研究所（ICR）的科学家们调查了3万名男性DNA，发现了19种与睾丸癌有关的新基因变异。结合先前鉴定的遗传因素，研究人员受试者中挑选出了1%的高危人群。这些男性一生中患睾丸癌的风险约为7%，是普通男性（约0.5%）的14倍。这项由Movember资助的研究，发表于6月12日的《Nature Genetics》，文章指出的风险基因的激活方式为潜在的新型疗法提供了线索。研究结果与同期《Nature Ge
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新技术|让变性蛋白质“复活”的简便方法
生物通报道：圣彼得堡国立信息技术机械与光学（ITMO）大学和希伯来大学的化学家们找到了一种办法，使化学变性后的蛋白质重新恢复蛋白质结构。作者强调了该方法的通用性，它不仅适用于特定分子还适合多蛋白系统，在此以前没有人成功复原过复合酶。这项技术可简化用于阿尔茨海默症和帕金森治疗药物的生产步骤，降低生产成本。这项研究发表于5月3日的《Scientific Reports》。蛋白质，特别是担当化学反应催化剂的酶类，是制药和食品工业的基石。然而，在合成过程中受强酸、碱或加热影响，80%产物发生损耗，失去天然构型和化学活性，即蛋白质变性。因此，工业界一直在寻求使蛋白质结构和功能复原的通用方法，来降低成本和
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突破限制，集成高维技术发现DC细胞新亚型
生物通报道：树突状细胞（Dendritic cells，DCs）是目前所知的功能最强大的专职抗原呈递细胞，有两个主要细胞系：浆细胞样树突状细胞（plasmacytoid DCs，pDC）和常规树突状细胞（conventional DCs，cDC）。功能专门化的cDC又分为两个细胞系：cDC1和cDC2，这两种细胞的起源和分化途径目前仍不明朗。由于DC是健康和疾病免疫反应的重要调控者，为了有针对性地制定它们的干预策略，人们需要深入了解它们的起源、功能特性和调控它们稳态的机制。因此，新加坡免疫学信息网的Peter See和Florent Ginhoux等人联合其他机构，采用两种无偏差高维技术（un
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【IVD盛宴启幕，倒计时20天】第三届中国先进体外诊断技术与应用论坛
由国家卫计委、湖北省卫计委、湖北省政府特别支持，武汉国家生物产业基地建设管理办公室、武汉东湖国家自主创新示范区生物医药行业协会主办，商图信息（BMAP）承办的NIVD 2017第三届中国先进体外诊断技术与应用论坛，启幕在即。届时，30余位行业一线专家，400余位产学研医政的好学者都将汇聚一堂，同台论道。本届论坛也是第二届“中国光谷”国际生物健康产业博览会（6月30日-7月2日，为期三天，中国光谷科技会展中心）的系列论坛之一。作为明星论坛，NIVD 2017将从广受关注的IVD行业政策与战略发展、医学实验室发展探索、前沿体外诊断技术临床应用聚焦等角度着手，为相关人士提供技术与应用的广阔交流平台。
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冯雁研究团队在酵母合成人参皂苷Rh2方面取得突破
近日，国际代谢工程领域重要学术期刊《Metabolic engineering》在线发表上海交通大学生命科学技术学院冯雁教授团队最新研究成果“Biosynthesis of Plant-derived Ginsenoside Rh2 in Yeast via Repurposing a Key Promiscuous Microbial Enzyme”。博士生庄宇和杨广宇副研究员为并列第一作者。人参皂苷Rh2是药用植物人参中的关键活性组分，具有良好的抗癌、抗氧化活性，在治疗肿瘤、心脑血管疾病等方面具有重要的应用潜力。然而由于人参栽培周期长（5-6年）以及Rh2含量低（0.001%），很难实现规
来源：上海交通大学新闻网
时间：2017-06-08
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华东理工大学再发Nature Methods文章：细胞代谢研究新技术
生物通报道：来自华东理工大学，中国科学技术大学等处的研究人员发表了题为“Genetically encoded fluorescent sensors reveal dynamic regulation of NADPH metabolism”的文章，开发了一系列特异性检测NADPH的高性能遗传编码荧光探针iNap，实现了在活体、活细胞及各种亚细胞结构中对NADPH代谢的高时空分辨检测与成像。这一研究成果公布在6月5日的Nature Methods杂志上，由华东理工大学杨弋教授，赵玉政研究员课题组与中国科学技术大学刘海燕教授课题组合作完成。第一作者为华东理工大学博士生陶荣坤、赵玉政研究员和中科
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朱健康教授等人PNAS利用CRISPR技术解析DNA甲基化
来自中科院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组和郎曌博研究组的研究人员发表了题为“Critical roles of DNA demethylation in the activation of ripening-induced genes and inhibition of ripening-repressed genes in tomato fruit”的文章，利用CRISPR/Cas 9技术获得了番茄sldml2 的突变体植株，发现了番茄SlDML2 调节的DNA去甲基化不仅可以激活成熟需要的基因，同时还可以抑制成熟不需要的基因，在调节番茄果实成熟的过程中发挥了重要作用。
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高通量检测单细胞中RNA和蛋白质的新方法
生物通报道 定量单细胞中的RNA和蛋白质，这有助于了解组织或肿瘤内的基因表达有何差异。多年来，为了实现精确定量，人们开发出各种各样的方法。大约20年前，Robert Singer及其同事开发出单细胞荧光原位杂交（sm-FISH）方法。它已被证明是在细胞水平上研究RNA定位的宝贵工具。与RT-PCR不同，sm-FISH用许多短的寡核苷酸探针（大约20个碱基）来靶定单个转录本。研究人员在每条探针上连接单个荧光基团，继而在显微镜下观察微弱的荧光。之后，为了提高这种技术的可靠性，研究人员在同一RNA上连接大约50个寡核苷酸探针。这样，每个mRNA分子都发出强烈的荧光，在显微镜下清晰可见。最
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赛贝生物正式成为Takara-Cellartis肝脏细胞定向分化技术服务指定供应商
2017年4月起，北京赛贝生物技术有限公司（以下简称：赛贝生物）正式成为Takara Bio旗下Cellartis品牌肝脏细胞定向分化技术服务指定供应商，同时Takara Bio授权其可以在全国范围内销售Cellartis品牌的干细胞研究用产品。此次Takara Bio携手赛贝生物，力争为干细胞研究者提供高品质的干细胞产品和高标准技术服务，使得干细胞研究者可以充分结合自身科研情况去选择更高效的科研方案，合力推进干细胞科研和应用的发展。合作伊始，双方诚意推出“肝脏细胞定向分化技术服务特惠活动”，客户可以8折特惠价享受高品质肝脏分化技术服务。肝脏定向分化技术服务以肝脏细胞为模型的实验越来越受到重视
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一图看懂《“十三五”生物技术创新专项规划》
当前，生物技术在引领未来经济社会发展中的战略地位日益凸显。现代生物技术的一系列重要进展和重大突破正在加速向应用领域渗透，在革命性解决人类发展面临的环境、资源和健康等重大问题方面展现出巨大前景。生物技术产业正加速成为继信息产业之后的又一个新的主导产业，将深刻地改变世界经济发展模式和人民社会生活方式，并引发世界经济格局的重大调整和国家综合国力的重大变化。抢占生物技术和生物技术产业的战略制高点，打造国家科技核心竞争力和产业优势，事关重大、事关全局、事关长远。根据《国民经济和社会发展第十三个五年规划纲要》、《国家创新驱动发展战略纲要》、《“十三五”国家科技创新规划》、《中国制造2025》等战略部署要求
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科学证明：节食是低效的减肥方法
生物通报道：因为大脑会阻止你通过减少食量的方法燃烧脂肪。今日发表在《eLife》杂志的一篇名为“小鼠mTOR复合物1（mTORC1）整合AGRP神经元内外有关食物的自适应能量消耗调制”的文章解答了“节食对减肥经常失效”的原因：当食物稀缺时，脑细胞将主动防止我们燃烧卡路里。（配图并非来自原文）“过去我们只知道大脑在调节我们食物摄取和卡路里燃烧的补偿平衡，但是它的调节方式一直是个谜，”剑桥大学代谢研究实验室的Clémence Blouet博士说。“如今，我们发现了小鼠适应低热量饮食的神经信号调节机制，由于老鼠与人有着生理学和生物学上的相似，这项发现将有助于解释低热量饮食限制人们减肥的真正原因。”研
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