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Science子刊：消除测序偏好的有效方法
生物通报道：苏黎世联邦理工学院（ETH Zurich）的研究人员开发了确保测序质量的有效方法，并在此基础上获得了全面且准确的抗体图谱。这项研究发表在最近的Science Advances杂志上。为了跟踪免疫系统激活后的抗体生成情况，研究人员对携带抗体生产指令的mRNA进行了测序分析。“近年来测序技术取得了很大的进展，测序速度显著加快，测序成本大幅下降。然而目前的测序方法并不适合分析抗体RNA,”领导这项研究的Sai Reddy教授解释道。机体产生的抗体种类非常多，测序抗体RNA需要很高的灵敏性和准确性。Reddy及其同事创建了一个使用基因条码的控制系统，对RNA测序进行补充和完善。这个系统与计
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基因测序新贵在专利诉讼期间发布新技术
首创了一种名为纳米孔测序的新DNA分析技术的英国牛津纳米孔技术公司，对其产品的核心部分一直守口如瓶。不过，紧随一项来自测序行业巨头——启迪公司的专利侵权诉讼，该公司揭示了驱动其最新设备的东西，即一种看上去巧妙避开了启迪公司挑战的细菌孔。同此前方法相比，纳米孔测序在分析DNA方面更加便捷和廉价。它的原理是测量单核苷酸通过一个比DNA本身大不了多少的小孔时，产生的电流变化。2014年，牛津纳米孔公司推出第一台商用纳米孔测序仪—— 一种被称为MinION的手持设备。尽管研究人员对该技术给予好评，并且致力于提高它的准确性，但他们只能揣测MinION是如何在启迪和其他公司失败的地方成功的。MinION的
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Cell子刊：2015年精选技术文章
生物通报道：作为分子生物学，生物化学等研究领域的著名期刊，创刊于1997年的Molecular Cell杂志致力于发布侧重于基础研究层面的最新生物学研究成果。近期Molecular Cell杂志公布了Best of 2015（年度最佳论文），其中主要聚焦于技术方面的科研进展。之前Molecular Cell杂志曾推出过技术专刊：《细胞》十一篇文章介绍前沿技术，而此次的年度最佳论文则精选了更多的新技术，其中包括四篇技术综述与六篇技术研究论文。上文：Molecular Cell：年度最佳技术文章Tracking Distinct RNA Populations Using Efficie
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北大学者最新文章首次利用超分辨成像技术观测活细胞
近日，在国家自然科学基金国家重大科研仪器研制项目（31327901）、面上项目（31271423、21573013）等资助下，北京大学研究人员首次应用新型超分辨成像技术实现了活细胞单个转录工厂(RNA Pol II cluster)的动态过程观测和定量分析，研究成果以“Study of RNA Polymerase II Clustering inside Live-Cell Nuclei Using Bayesian Nanoscopy” （《应用贝叶斯超分辨显微术对活细胞RNA聚合酶II复合物的动态研究》）为题于2016年2月8日在国际著名期刊ACS Nano 杂志在线发表。北京大学生物
来源：国家自然科学基金
时间：2016-03-14
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山大泰山学者再发转录组组装新方法
生物通报道：最近，来自山东大学和美国阿肯色州立大学的研究人员在国际著名学术杂志《PLOS Computational Biology》发表一项最新生物信息学成果，题为“BinPacker: Packing-Based De Novo Transcriptome Assembly from RNA-seq Data”。 这项研究提出了一种新的从头组装方法——BinPacker，通过解决一系列的bin-packing问题，将转录组组装问题，塑造为跟踪一系列的items的轨迹，它们的大小代表它们相应亚型的覆盖度。本文通讯作者分别为山东大学数学学院的李国君教授和阿肯色州立大学的黄秀珍博士（音译，Xiu
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单细胞测序为研究免疫反应提供新方法
生物通报道 欧洲分子生物学实验室等机构的研究人员近日开发出一种计算方法，能够从单个T细胞的RNA测序数据中重建配对的T细胞受体（TCR）序列，将T细胞特异性与功能反应相关联。这项成果于本周发表在《Nature Methods》期刊上。T细胞受体是T细胞表面的特异性受体，负责识别MHC所呈递的抗原。它是异源二聚体，由T细胞发育过程中的V(D)J重组而产生。小鼠TCR的DNA序列多样性已达到5 x 1021个不同组合，使得人们推测相同的TCR基因来自相同的T细胞克隆。这款工具名为TraCeR。它能将测序读取组装成连续序列，以寻找全长的TCR重组序列。重要的是，重建的重组序列包含几乎全长的V(D)J
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台湾流感疫情：死亡病例数突破百人 预计还会增长
新华社台北３月８日电（记者王昀加 何自力）台湾流感疫情仍在蔓延，引发社会各界持续关注。台湾“疾病管制署”８日表示，台湾已有超过１００人在目前的流感季死亡，预计未来死亡人数还会继续增加。“疾管署”当天发布新闻公告说，过去一周（３月１日－７日）台湾新增３１４例流感并发重症确定病例，死亡新增３７例；自去年７月１日以来，台湾已累计出现１４２３例流感重症病例，造成１２１人死亡。“疾管署”表示，台湾的流感重症通报数自２月２２日达到高峰后，已开始缓慢下降，显示流感已过感染高峰期，但预计死亡人数近期仍会持续增加。该机构预测，至今年３月底，台湾累计流感重症病例数将达到１８００至１９００例，死亡数升至２３０至２９
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宋红军、明国丽等寨卡研究获重要突破
生物通报道：最近几个月，寨卡病毒（Zika virus）在拉美国家呈现爆炸式蔓延。这种病毒感染后的症状很像感冒，也就是发烧和肌肉关节疼痛。随着寨卡疫情愈演愈烈，医生们发现一种严重神经疾病（格林—巴利综合征）突然增多，“小头婴”的出生率也显著提高。不过人们对这种病毒及其引发的问题还知之甚少。幸运的是，科学家们的寨卡病毒研究终于取得了重要突破。三月四日Cell Stem Cell杂志发表的最新研究显示，寨卡病毒能感染形成大脑皮层的神经干细胞，阻碍这些细胞的生长。Johns Hopkins大学的宋红军（Hongjun Song）、明国丽（Guo-li Ming）夫妇与佛罗里达州立大学的Hengli
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知名学者丁胜Cell Stem Cell重大突破：构建新型细胞
生物通报道 Gladstone研究所的科学家们找到了一种方法来构建介于胚胎干细胞和成体心脏细胞之间的一种新型细胞，这有可能掌握了治疗心脏病的一把钥匙。这些诱导可扩增心血管祖细胞(ieCPCs)可以有组织地发育为心脏细胞，且仍然保留了增殖能力。当注入到心脏病发作后的小鼠体内时，这些细胞显著地改善了心脏功能。这项研究工作发布在《细胞干细胞》（Cell Stem Cell）杂志上。论文的主要作者、Gladstone研究所博士后Yu Zhang博士说：“数十年来科学家们一直在尝试通过移植成体心脏细胞来治疗心力衰竭，但这些细胞自身无法增殖，因此它们不能在受损的心脏中存活下去。我们构建的ieC
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2016生物制药与技术中国展
2015年，在国务院印发的《中国制造2025》中，生物医药及高性能医疗器械等一起被列为中国十大重点发展产业领域。与此同时，2015年国务院、CFDA关于药审改革、临床试验规范、新药品注册管理办法等法律法规的发布，新版《中国药典》的颁布，及医保倾斜性政策、药价调整等政策的出台，2016年的生物制药行业正面临全新的变革与发展。在此契机下，由欧洲博闻展览咨询有限公司(UBM EMEA)和中国医药保健品进出口商会（CCCMHPIE）主办，上海博华国际展览有限公司（UBM Sinoexpo）协办的“2016生物制药与技术中国展”(BioPh China 2016)将于2016年6月21-23日在上海新国
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测序技术精度对精准医学意义重大
生物通报道：2015年1月20日，美国总统奥巴马在国情咨文中提出“精准医学计划”，希望精准医学可以引领一个医学新时代。在奥巴马宣布启动精准医学计划的一年后，中国当前正在确定它自己的更大型的项目计划。2015年12月9日至12日，由中国药理学会药物基因组学专业委员会主办、上海交通大学Bio-X研究院与康昱盛承办的国际精准医学与未来健康前沿研讨会暨全国第三届药物基因组学学术大会，在上海隆重召开。（2015精准医学压轴大戏即将上演）中国政府有望在今年3月批准它的下一个五年计划之后正式宣布该计划。尽管目前尚不清楚将会投入多少资金——但几乎可以确定的是，会比美国2.15亿美元的计划规模更大，投入资金更多
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PNAS发布表观遗传学研究新方法
生物通报道：表观遗传学修饰是一种不改变DNA序列的重要调控机制。DNA上的表观遗传学标签控制着基因的开和关，可以决定细胞的命运。目前已知的DNA修饰都是人们偶然发现的。MIT和佛罗里达大学的研究人员最近开发了一个探索未知DNA修饰的系统方法，并将其发表在二月二十九日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。“我们开发的技术平台可以发现新的核酸修饰，”MIT的Peter Dedon教授介绍道。研究人员将生物分析化学、比较基因组学和长读取测序结合起来，在细菌中发现了一种新的DNA修饰。这种修饰可以帮助细菌抵御入侵者，保护自己的基因组。Dedon及其同事认为，细菌和病毒中应该还有多种不为人知的DNA修饰，
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科学突破奖启动2017年生命科学奖等三个奖项提名活动
-科学突破奖启动2017年基础物理学奖、生命科学奖和数学奖提名征集活动 旧金山2016年3月2日电 /美通社/ -- 科学突破奖 (Breakthrough Prize) 已启动2017年基础物理学奖、生命科学奖和数学奖提名征集活动，并将于2016年秋末在硅谷举行盛大颁奖典礼，届时该颁奖礼将在全球直播。 网络提名截止日期为2016年5月31日。只可提名他人，而不允许自我提名。欲获取提名表和查看相关规则，请访问：www.breakthroughprize.org 。 作为科学界第一巨奖，科学突破奖将在其举办的第五年颁发最多五个生命科学奖、一个物理学奖和一个数学奖，以此表彰顶尖科学家。
来源：Breakthrough Prize
时间：2016-03-03
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40年WB实验经验凝聚 尽在《蛋白印迹技术手册》
让我们把Western Blotting做得更好40年WB实验经验凝聚 尽在《蛋白印迹技术手册》• 1975年，Dr. Southern使用Merck Millipore的硝酸纤维素膜发明了Southern Blotting技术• 1979年，Dr. Towbin使用Merck Millipore的硝酸纤维素膜发明了Western Blotting技术• 1985年，Merck Millipore发明了世界上第一张0.45μm PVDF膜 (Immobilon®-P)• 1988年，Merck Mi
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大大简化药物发现过程的新方法
生物通报道：最近在《Nature Biotechnology》发表的一篇论文，来自麻省理工学院-哈佛大学布罗德研究所和Dana-Farber癌症研究所的研究人员描述了一种新的方法，大大简化了早期药物发现中一个费力的实验过程。他们的方法称为PRISM，采用一种分子条形码系统，以前所未有的规模和速度，在癌症和其他细胞系上检测潜在的药物化合物。该系统可同时汇集和检测多个细胞系，并有望加快靶向治疗方法的发现，更好地代表疾病广泛的遗传多样性。本文资深作者、布罗德研究所首席科学官Todd Golub指出：“以前，你原则上可以在几百个细胞系上检测感兴趣的化合物，但它需要实验室成员去冰箱，拿出几百瓶——每一瓶
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中科院成果入选《MIT科技评论》十大技术突破
2月23日，国际著名技术评论期刊《麻省理工科技评论》（MIT Technology Review）公布了2016年十大技术突破。中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员高彩霞及其团队关于植物基因精准编辑技术的研发成果名列其中。《麻省理工科技评论》指出，该技术能够精准、高效、低成本地进行植物基因组编辑，有望用于生物安全的作物遗传改良和定向育种，提高农业生产率，满足日益增长人口的需求。高彩霞团队主要贡献在于建立成熟、高效的农作物基因精确编辑技术平台并对重要农作物的定向育种进行了成功尝试，取得了一系列世界领先的成果。2013年，高彩霞团队率先利用基因编辑系统CRISPR/Cas对水稻和小麦的多个基因进
来源：中科院遗传与发育生物学研究所
时间：2016-02-29
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两篇Science发表埃博拉突破性成果
生物通报道：埃博拉病毒（EBOV）感染人类会引起致命的出血热，发病率和病死率极高。1976年人们在撒哈拉以南地区的埃博拉河附近首次发现这种病毒。2014-2015年埃博拉病毒在西非造成了严重的疫情，导致超过一万一千人死亡。目前还没有任何治疗埃博拉的药物通过FDA审批。美国国立过敏与传染病研究所(NIAID)的研究团队日前在埃博拉治疗方面取得了重要突破。他们从埃博拉幸存者体内分离的一种单克隆抗体，能够有效保护感染了埃博拉的猕猴，有望成为潜在的埃博拉药物。这一成果以两篇文章的形式发表在二月二十五日的Science杂志上。研究人员获得了1995年刚果埃博拉疫情的幸存者血样，发现这名幸存者具有对抗埃博
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Nature技术人物：为何想象力很重要
——如何结合生物学、化学和合成生物学为一蛋白添上合成氨基酸，这考究个人的想象力生物通报道：Jason Chin在其学术生涯中首先接受的是成为一名化学家的教育，之后又是生物学家，但他表示这些都不是他特别感兴趣的。他喜欢各种不同观点结合在一起，“我认为通过与各种新的ideas接触，抛却不同学科的偏见能令我们成为更优秀的科学家，”Chin说。目前作为剑桥大学MRC分子生物实验室(MRC LMB)项目负责人，Chin成立了LMB的化学与合成生物学中心，同时他也任职于剑桥大学化学系。“蛋白质是一种迷人的分子，”要想了解这种分子如何在细胞和有机体中行使功能并不容易，尤其是尝试将蛋白分子变化与宏观现象联系起
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Technology Review十大突破技术：免疫系统的改造
MIT Technology Review杂志近日发布了2016年度10大突破技术（10 Breakthrough Technologies 2016）。免疫改造、植物/作物的基因编辑、可回收的火箭、特斯拉的自动驾驶技术等上榜。编辑认为，这些技术在过去一年建立了令人印象深刻的里程碑。Technology Review认为，遗传改造的免疫细胞正在挽救癌症患者的生命，不过这仅仅是开始。未来一到两年，我们将看到“合成免疫学”的出现，利用改造的T细胞来搜索和消灭疾病细胞。除了癌症，糖尿病、多发性硬化和狼疮等也将受益于这项技术。Layla Richards是一名12个月大的女婴，患有白血病。她曾接受化疗
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北京大学开发创新性三重组学测序技术
生物通报道 来自北京大学、首都医科大学的研究人员报告称，他们开发出了一种创新性的单细胞三重组学测序（triple omics sequencing）技术：scTrio-seq，并利用它揭示出了肝细胞癌中的遗传、表观遗传及转录组异质性。这一重要的研究发布在2月23日的《Cell Research》杂志上。北京大学生命科学学院的汤富酬( Fuchou Tang)研究员、黄岩谊(Yanyi Huang)研究员以及首都医科大学彭吉润(Jirun Peng)教授是这篇论文的共同通讯作者。近年来开发出的单细胞基因组、DNA甲基化组和转录组测序技术大大地帮助解析了细胞群中的异质性。来自国内外的研
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