• 抗体设计的里程碑——利用人工智能从0开始

  研究人员首次利用生成式人工智能(AI)帮助他们制造出全新的抗体。这就是我们十年后设计抗体的方式。本周在bioRxiv的预印本中报道的原理验证工作，提高了将人工智能引导的蛋白质设计引入治疗性抗体市场的可能性，该市场价值数千亿美元。抗体是一种与疾病相关的蛋白质紧密结合的免疫分子，通常是用暴力方法制造的，包括对动物进行免疫或筛选大量分子。尽管抗体在现代医学中发挥着核心作用，但目前科学家们尚无法理性地设计出能与特定目标抗原表位结合的新型抗体。传统的抗体发现过程，通常涉及耗时的动物免疫或文库筛选方法。然而，现在研究团队展示了一种精细调整后的RFdiffusion网络，这种网络能够设计全新的抗体可变重链（

  来源：bioRxiv

  时间：2024-03-20

• 《Cell》为什么“女儿”能继承“妈妈”的防晒力？

  阳光中的紫外线辐射会损伤我们的DNA和RNA，从而导致晒伤，增加患皮肤癌的风险。德国弗莱堡马克斯·普朗克免疫生物学和表观遗传学研究所的研究人员现在发现了一种细胞屏障，可以保护细胞免受紫外线辐射引起的受损RNA的有害影响。当细胞分裂时，它们将防御系统传递给它们的子细胞。这个系统包括由DHX9酶形成的特殊压力颗粒，它捕获受损的RNA以保持新细胞的健康。母亲和女儿之间有着强烈的联系，但你知道这种亲密关系的联系一直延伸到细胞水平吗?在细胞分裂的过程中，新的子细胞从母细胞中继承遗传物质和其他分子的混合物。这种遗传既包括有益的成分，可以帮助它们在生命中有一个强健的开端，也包括潜在的有害突变或受损分子，对新

  来源：MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT

  时间：2024-03-20

• Cell最新发现一种复杂的机制：子细胞保护自己免受来自母细胞的紫外线损伤RNA的伤害

  母亲和女儿之间有着强烈的联系，但你知道这种亲密关系的联系一直延伸到细胞水平吗？在细胞分裂的过程中，新的子细胞从母细胞中继承遗传物质和其他分子的混合物。这种遗传既包括有益的成分，可以帮助它们在生命中有一个强健的开端，也包括潜在的有害突变或受损分子，对新生的子细胞构成重大挑战。子细胞如何管理和减轻有害遗传的影响仍然是一个谜。马克斯普朗克免疫生物学和表观遗传学研究所的一项研究现在揭示了一种复杂的机制，通过这种机制，子细胞可以保护自己免受来自母细胞的紫外线损伤RNA的伤害。当阳光照射到我们的皮肤时，会带来温暖和活力。然而，在这温柔的拥抱之下隐藏着一个潜在的威胁：紫外线辐射，阳光中最具能量的成分。虽然我

  来源：AAAS

  时间：2024-03-20

• Cell首发性成果：测量细胞凝聚物的pH值

  科学家们试图了解支配生物分子凝聚体Condensates的物理和化学特性，现在他们有了一种重要的方法来测量这些神秘而又重要的细胞区室的 pH 值和其他新出现的特性。凝聚体是蛋白质和核酸的群落。它们没有膜，可以根据需要聚在一起或分开。核仁是细胞中重要的凝聚物。它在细胞生理中起着至关重要的作用，是核糖体产生的部位。核糖体是多种蛋白质和RNA的集合体，遗传密码在其中被翻译成合成蛋白质。核糖体产生的损害和其他核仁功能障碍是癌症、神经变性和发育障碍的核心。华盛顿大学生物分子凝集物中心的生物医学工程Rohit Pappu实验室的研究人员首次在凝集物领域发现了核仁子结构的组装方式。他们测量了核仁内部独特的p

  来源：AAAS

  时间：2024-03-20

• 合成肝素：实验室合成与猪源产品相似的生物工程肝素，并可转化为低分子量肝素

  肝素是世界上使用最广泛的抗凝血药物，用于从肾脏透析到心脏手术的各种手术都需要用到。目前，肝素是从猪肠中提取的，但伦斯勒理工学院的科学家们已经发现了如何在实验室中制造肝素。他们还开发了一种生物制造工艺，可能会彻底改变世界如何获得这种关键药物的供应。在美国国家科学院院刊上发表的一项研究中详细介绍了他们的专利工艺，研究人员已经与美国食品和药物管理局合作，并开始扩大商业化生产的规模。肝素被世界卫生组织认定为基本药物，需求量一直很高。为了满足需求，每年要加工数十亿头猪的肠道，生产约100吨纯化肝素。超过70%的供应来自中国。动物性产品容易出现短缺，包括不安全的供应链、污染和显著的可变性。2008年的肝素

  来源：PNAS

  时间：2024-03-20

• 最大和最小的哺乳动物的参考基因组出炉

  同时研究世界上最大和最小的哺乳动物，也许是一件很酷的事情。美国莫格里奇研究所（Morgridge Institute for Research）的一组研究人员最近组装了两个新的参考基因组——一个来自最大的哺乳动物，另一个来自最小的哺乳动物。蓝鲸的基因组发表在《Molecular Biology and Evolution》杂志上，伊特鲁里亚鼩鼱（Etruscan shrew）的基因组发表在《Scientific Data》杂志上。两篇论文的第一作者、莫格里奇研究所的计算生物学家Yury Bukhman表示：“基因组是生物体的蓝图。为了操控细胞培养物或测定基因表达等情况，你需要知道该物种的基因组

  来源：AAAS

  时间：2024-03-20

• Nature子刊：普通糖尿病药物与“抗饥饿”分子有关，可导致体重减轻

  根据一项对小鼠和人类的新研究，剧烈运动后产生的一种“抗饥饿”分子是糖尿病药物二甲双胍引起的适度体重减轻的原因。这种分子是斯坦福大学医学研究人员在2022年发现的。斯坦福医学院(Stanford Medicine)和哈佛医学院(Harvard Medical School)的研究人员共同做出的这一发现，进一步证实了这种名为lac-phe的分子在新陈代谢、运动和食欲方面的关键作用。这可能为一种新的减肥药铺平道路。病理学助理教授Jonathan Long博士说:“到目前为止，用于控制血糖水平的二甲双胍也会带来减肥的方式还不清楚。现在我们知道，它通过与剧烈运动相同的途径来减少饥饿。了解这些途径是如何被

  来源：Nature Metabolism

  时间：2024-03-20

• 间歇性的食物摄入会激活肝细胞中的“GPS基因”，从而完成出生后肝脏的发育

  在哺乳动物中，肝脏在任何特定时刻检测身体的能量需求，并动员营养储备来满足它。这是一项重要的功能，它被细分为多个任务:从当激素胰岛素提醒需要能量时向血液中释放葡萄糖，到合成必需的脂肪或蛋白质。这些任务落在肝细胞上，肝细胞根据它们在肝脏中的空间位置来处理其中一个。到目前为止，人们还不清楚肝细胞是如何分配与其定位相关的任务的。西班牙国家癌症研究中心(CNIO)的研究人员发现，一种名为mTOR的基因负责组织肝细胞位置图。他们还发现，引发肝细胞特化的因素是出生后的喂养（用嘴吃东西）。不同之处在于出生前后营养物质到达机体的方式:一种情况下，营养物质通过脐带没有中断，另一种情况下，营养物质在用嘴进食时以间歇

  来源：Nature Communications

  时间：2024-03-20

• 泌尿道癌细胞的进化图

  威尔康奈尔医学院的研究人员进行了迄今为止最全面的输尿管癌或肾脏尿液收集腔的分析，称为上路尿路上皮癌(UTUC)。该研究比较了原发性和转移性肿瘤的特征，为这些侵袭性癌症的生物学和潜在的治疗方法提供了新的见解。在3月18日发表在《Nature Communications》上的这项研究中，研究人员检查了44例原发性和转移性UTUC肿瘤的组织样本。他们比较了这些肿瘤中的基因突变和基因活性模式，并利用一种可以在单细胞分辨率下可视化蛋白质表面标记的技术绘制了细胞类型。一个关键的发现是，这些UTUC肿瘤的基本分子特征——它们的分子亚型——在从原发到转移阶段的进化过程中大多是稳定的。这表明，治疗UTUC患者

  来源：Nature Communications

  时间：2024-03-20

• Cell子刊：抗凋亡MCL-1在线粒体代谢中的作用

  细胞的生与死是由一些过程控制的，如果这些过程被破坏，就会导致癌症。细胞凋亡是细胞程序性死亡的过程，受b细胞淋巴瘤-2 (BCL-2)蛋白家族的严格调控。这包括骨髓细胞白血病-1 (MCL-1)，一种帮助细胞存活的抗凋亡蛋白。然而，来自St. Jude儿童研究医院的研究人员发现了MCL-1的另一个关键作用:调节线粒体中长链脂肪酸氧化的过程。这些发现发表在今天的《分子细胞》杂志上，指出了一种众所周知的促生存蛋白的次要作用，同时为混淆的临床试验结果提供了见解。 蛋白质通常被想象成工具箱中的工具，每种工具都有特定的功能。但就像现代多功能工具提供了一系列的用途——根据需要切割、打磨、研磨和刮擦

  来源：AAAS

  时间：2024-03-20

• 里程碑新成果：2型糖尿病的异质性

  德国糖尿病中心(DDZ)的一项里程碑式的研究发表在《柳叶刀糖尿病与内分泌学》这项研究揭示了2型糖尿病的异质性。研究人员采用了一种创新的算法，利用常规数据对2型糖尿病患者进行分层，从而将糖尿病的代谢多样性可视化。2型糖尿病是一种具有高度多样化进展途径的疾病。由德国糖尿病中心(DDZ)领导的一个团队使用一种创新的算法，使用常规测量变量，从胰岛素敏感性、胰岛素分泌、脂肪组织分布和促炎谱等方面开辟了2型糖尿病多样性的新视角。这项工作提出了一种独特的、树状的糖尿病异质性表示，最初是由英国的研究人员在Ewan Pearson的领导下开发的，现在已经根据德国糖尿病研究(GDS)和LURIC队列的数据进行了改

  来源：AAAS

  时间：2024-03-20

• 驱动癌症突变的关键酶的作用

  由加州大学尔湾分校领导的一个研究小组发现，APOBEC3A和APOBEC3B酶通过修饰肿瘤基因组中的DNA，在驱动癌症突变中发挥关键作用，为干预策略提供了潜在的新靶点。今天发表在《自然通讯》杂志网络版上的这项研究，描述了研究人员如何确定APOBEC3A和APOBEC3B检测特定DNA结构的过程，从而导致肿瘤基因组中不同位置的突变。UCI生物化学助理教授、通讯作者Rémi Buisson说:“了解癌细胞如何积累突变，从而导致疾病进展、耐药性和转移的热点，这是至关重要的。APOBEC3A和APOBEC3B都在许多种肿瘤中产生突变，但直到现在我们还不知道如何识别它们各自引起的特定类型。这一发现将使我

  来源：AAAS

  时间：2024-03-20

• 全球首个人工智能引导的抗体表位定位服务

  Rapid Novor公司和MAbSilico公司宣布，他们已经合作提供世界上第一个用于抗体开发的人工智能驱动的HDX-MS表位定位服务。通过将HDX-MS的实验数据与人工智能驱动的计算建模的预测分析无缝集成，研究人员可以以无与伦比的精度和速度全面了解抗体结构、动力学和相互作用。  “人工智能有望成为抗体药物发现和开发的转折点，”Rapid Novor销售和营销副总裁Iain Rogers表示。“通过将HDX-MS的稳健性与人工智能驱动的计算建模的预测能力相结合，我们开发了一个可以加速抗体发现和表征的通道。”当在不同时间点暴露于氘中时，Rapid Novor采用HDX-MS

  来源：Rapid Novor、MAbSilico

  时间：2024-03-20

• 二甲双胍诱导Lac-Phe肠-脑信号轴 这糖尿病药也能减体重的机制初探

  斯坦福大学医学研究人员在2022年发现：剧烈运动后产生的一种“抗饥饿”分子是糖尿病药物二甲双胍引起的适度体重减轻的原因。在斯坦福医学院(Stanford Medicine)和哈佛医学院(Harvard Medical School)的研究人员新发表在3月18日的《Nature Metabolism》杂志上的一项研究中，将二甲双胍治疗与诱导食欲抑制代谢物n -乳酰-苯丙氨酸联系起来，进一步证实了这种名为lac-phe（N-lactoyl-phenylalanine）的分子在新陈代谢、运动和食欲方面的关键作用，这种代谢物是由肠道产生的。这可能为一种新的减肥药铺平道路。许多糖尿病患者服用二甲双胍后，

  来源：med.stanford

  时间：2024-03-20

• PNAS：预测细胞行为

  细胞在体内的迁移是一种基本的生物现象。免疫细胞不断寻找病原体，癌细胞在体内迁移，导致转移。在身体内部，许多表面，如组织、血管或突出物都有弯曲的形状。MPI-DS主任Eberhard Bodenschatz解释说:“我们能够证明这些曲率直接影响细胞的运动模式。”科学家们可以通过实验证明，细胞更喜欢某些弯曲，这种现象被称为“弯曲性”。为了揭示这一机制，他们创建了一个含有用于运动的活性细胞骨架成分的囊泡的计算机模型。这种结构类似于生物细胞，在体内迁移。“使用这种最小的细胞模型，我们系统地探索了各种曲面上的弯曲机制，”以色列魏茨曼科学研究所的Nir Gov报告说。“模型细胞显示出特定的迁移模式，例如，

  来源：AAAS

  时间：2024-03-20

• 新型水凝胶超强粘合封闭伤口 促进胃肠道伤口愈合

  胃肠道(GI)手术、结肠镜检查等介入性筛查程序以及溃疡等自然发生的并发症可导致包括内出血、肠壁穿孔和渗漏在内的不良事件。为了解决目前可用的胃肠道伤口管理材料的局限性，Brigham妇女医院的研究人员，麻省总医院布里格姆医疗保健系统的创始成员，开发了一种可喷涂的粘性水凝胶产品。研究小组开发了一种独特的生物材料，以促进胃肠道中各种恶劣条件下的伤口愈合，这些条件使这些伤口的愈合特别具有挑战性，如酸性PH，酶，细菌和肌肉收缩。此外，他们设计的材料易于应用，并可与当前的技术;它通过一个微小的导管输送，小到可以插入任何商业内窥镜。与组织接触后，材料立即形成粘接屏蔽。在使用大型动物模型的临床前研究中，研究小

  来源：news-medical

  时间：2024-03-20

• 上班族的好消息:每天走1万步，死亡风险降低39%

  步数越高，风险越低，与久坐时间无关。澳大利亚悉尼大学查尔斯·珀金斯中心最近的一项研究为上班族带来了令人鼓舞的消息，表明每天增加步数可以帮助减轻长时间坐着带来的健康风险。发表在《英国运动医学杂志》(British Journal of Sports Medicine)上的这项针对7.2万多人的研究发现，每天多走1万步左右，与减少死亡(39%)和心血管疾病(21%)的风险有关，无论剩下的时间有多长。先前的研究表明，每天走的步数越多，死亡和心血管疾病的风险越低，而单独的研究表明，久坐不动的行为与心血管疾病和死亡的风险增加有关。然而，这是第一次通过佩戴在手腕上的可穿戴设备客观地测量每天的步数是否可以抵

  来源：scitechdaily health

  时间：2024-03-20

• 科学家开发了一种计算工作流程，可以预测与癌症体细胞突变相关的代谢物和代谢途径

  癌症以不同于正常细胞的异常代谢过程为特征。因此，人们对肿瘤代谢进行了广泛的研究，以制定有效的诊断和治疗策略。癌症代谢研究的显著成就包括发现肿瘤代谢物*，以及美国食品和药物管理局(FDA)批准针对与肿瘤代谢物相关的酶的抗癌药物。已获批准的抗癌药物如“Tibsovo(有效成分:ivosidenib)”和“Idhifa(有效成分:enasidenib)”都用于治疗急性髓性白血病。尽管取得了这些成就，但由于代谢组学等方法耗时且昂贵，研究癌症代谢，特别是肿瘤代谢物仍然具有挑战性。因此，虽然相对大量的癌症相关基因突变已经得到了很好的研究，但确诊的肿瘤代谢物数量非常少。肿瘤代谢物:一种在癌细胞中异常积累时显

  来源：AAAS

  时间：2024-03-20

• 与冠心病相关的新型蛋白质生物标志物

  冠心病是一个主要的全球健康问题，尤其是在2型糖尿病患者中。德国糖尿病研究中心(DZD)、亥姆霍兹慕尼黑和慕尼黑路德维希-马克西米利安大学(LMU)的研究人员发现了与糖尿病患者和非糖尿病患者冠心病发展相关的新型蛋白质生物标志物。研究结果发表在《Cardiovascular Diabetology》杂志上。冠心病是世界上最常见的死亡原因之一，特别是在欧洲:在这里，它占所有死亡人数的近一半。在中年人中，患有2型糖尿病(T2D)的人患冠心病的风险是没有T2D的人的2到4倍。研究小组调查了蛋白质生物标志物在有和没有T2D的个体中对冠心病事件的预测性能。在他们的研究中，研究人员使用了奥格斯堡地区合作健康研

  来源：Cardiovascular Diabetology

  时间：2024-03-20

• 超罕见综合症相关的基因突变的内部工作原理

  渥太华大学医学院的一个研究小组完成了一项令人兴奋的新研究，揭示了导致一种超罕见综合征的基因突变的内部工作原理，自20世纪60年代初首次描述以来，报告的病例不到100例。这一来之不易的研究发现可能会加速Borjeson-Forssman-Lehmann综合征(BFLS)治疗方法的发展。BFLS是一种与X染色体有关的神经发育障碍，以癫痫发作、智力残疾和行为障碍为特征。患有这种毁灭性疾病的儿童通常还表现出身体症状，包括独特的面部特征和生长缺陷，如手指变细。这项严谨的研究结果发表在EMBO Reports上，可能会产生更广泛的影响，可能会为其他罕见的x连锁神经发育综合征的治疗前景带来光明。“对神经发育

  来源：生物医学前沿

  时间：2024-03-20

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