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刘秀芬等人PNAS文章：人类基因组的基因进化
生物通报道：在11月13日的《美国科学院院刊》的网站上公示了美国健康研究院癌症研究所的华人学者刘秀芬（Xiu-Fen Liu）等人有关人类基因组中POTE-actin基因表达和进化的研究论文。研究组之前曾描述了一种灵长类特异性基因家族POTE，这种基因在许多中癌症中表达，但正常器官中的量很有限。13个POTE基因分散在8个不同的染色体中，并且由一个原始的基因ANKRD26经由人类基因组的扩增和重组进化形成。依据序列相似性，POTE基因家族成员分为三类。通过对基因组数据库进行分析，这个研究组在祖先POTE横向同源物（Paralog）的一个羧基末端确定出一种肌动蛋白反转录转座子插入。通过North
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《科学》一著名文章被疑造假
生物通报道：来自11月14日The Scientist杂志的消息，密苏里州大学在今年2月发表的《Science》杂志上的一篇有关早期胚胎发育的文章遭到质疑，这篇由生物化学系R. Michael Roberts实验室完成的问题挑战了传统的观点，认为在早期胚胎发育过程中单个分裂球（individual blastomere）之间是不同的。在这篇中的三张实验图片被疑有造假，目前密苏里州大学正在展开调查。链接：Science 17 February 2006:Vol. 311. no. 5763, pp. 992 - 996DOI: 10.1126/science.1120925Cdx2 Gene E
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本期《科学》两焦点文章：疾病基因定位与新基因组测序
生物通综合：11月10日的《Science》杂志公布了海胆基因组测序结果，引来了各大媒体杂志争相报道，除此之外，在这一期的研究报告中，有关老年黄斑病变（Age-related Macular Degeneration，简称AMD）的精确基因定位的两篇文章也引起了本领域的密切关注，而且这两篇分别报道都有中国科学家的参予。发现老年黄斑病变致病基因：HTRA1来自美国犹他州大学医学院Moran眼科中心（Moran Eye Center），Eccles人类遗传学协会（Eccles Institute of Human Genetics），以及中国四川大学医学院和四川省人民医院等处的研究人员（第一作者为
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《自然·医学》：华裔学者找到肺损伤关键蛋白
生物通报道：耶鲁大学医学院的一项新研究揭示出，因细胞死亡、高浓度氧（组织氧过多）和肺中液体过多导致的急性肺损伤可能通过调节Ang2蛋白（angiopoientin2）的量来控制。这项研究的结果刊登在11月5日的《自然·医学》杂志的网络版上。这项由耶鲁大学的Jack Elias教授的实验室完成的研究首先在小鼠模型中分析了对因组织氧过多引起的急性肺损伤（HALI）的应答，然后又对成人和婴儿进行了同样的研究。研究组与alnylam Pharmaceuticals公司进行了合作研究，使用了该生物技术公司的RNA干扰技术来沉默Ang2基因。这篇发表的文章的作者还包括华裔学者朱周（Zhou Zhu）、张旭
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一种全新的DNA结构—xDNA
生物通报道：James Watson和Francis Crick在53年前确定出了规则的DNA结构，并因此成为现代分子生物学的奠基人。现在，斯坦福大学的研究人员确定出了xDNA的结构——一种膨胀的DNA，具有奇怪的双螺旋分子。这种分子比天然的DNA更耐热、宽20％。由于这种膨胀的DNA能发荧光，因此可能成为一种医学和科学探针。斯坦福的Fric T. Kool和同事在2003年创造出了xDNA。他们将一个苯环添加到形成天人DNA的化学集团上。20埃宽的天然DNA和周长2.4埃的苯环构成这种全新的宽双螺旋。目前，研究人员已经能够将所有四种扩大的DNA碱基与四个天然碱基结合，从而创造出一种完整的八碱
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TIP芯片：垃圾DNA中的突变“现形”！
生物通报道：约翰霍普金斯大学高通量生物中心（High Throughput Biology Center，HiT）研究人员最近发明出两种基因“芯片”技术，可以帮助研究人员诊断一些令人费解的疾病——基因组中垃圾DNA突变引发的疾病。转位因子在基因组中跳跃，插入基因时会破坏基因的功能。霍华德研究人员设计的一种芯片叫做TIP-chip（转录因子插入位点，transposable element insertion point），可以定位于转位因子所附着的、破坏正常基因功能的基因组位点。TIP-chip芯片的详细资料刊登于本周PNAS。最为常见的基因芯片是排列有微小格子的玻片（glass slides
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斯坦福：干细胞反转录PCR分析
生物通报道：在近期的《美国科学院院刊》杂志网站上公示的一篇研究论文中，斯坦福大学、瑞典隆德大学的研究人员描述了他们对发育中的祖细胞（干细胞）群中转录因子表达进行的一项系统、定量分析。 研究人员利用一种以微流控芯片为基础的“数字化RT-PCR”来分析这种干细胞中的转录因子表达情况。这种分析能够计算从单个细胞制备的cDNA样本中的模板分子。 通过对五种处于早期发育阶段的造血前体细胞进行分析，研究人员发现造血干细胞中转录因子PU.1的表达有明显的变化，并且flk2-和flk2+共同骨髓祖细胞中PU.1表达的模式不同。 这项分析还揭示出在被研究的细胞群中，GAPDH转录本
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关于细胞教材中G蛋白部分的新思考
生物通报道：为什么肾上腺素（adrenaline、epinephrine）只能使心跳加速而不是心跳减慢？如今成为研究人员饶有兴味的研究课题，即将面世的11月21日PNAS一篇文章对这种现象进行了解释。许多药物并不是作用于细胞内部，它们与胞外受体相结合，然后激活细胞内部的G蛋白。乔治亚医学院（MCG）生物物理学家Nevin A. Lambert博士说：“如果你想改变细胞的作用方式，需要转换向胞内传递的胞外信号。如同一场接力赛，G蛋白与受体相互作用：G蛋白汇集到受体区域，与受体相互撞击。受体本身不发生变化，只是开启G蛋白。”虽然只有四大类G蛋白，但是细胞中的G蛋白拷贝数却是千千万万，它们与细胞表面
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RNAi筛选：揭开RTK信号途径近侧效应器面纱
生物通报道：一种用于分离RTK信号途径近侧效应器（Proximal effectors，生物通编者译）的RNAi筛选实验，揭开了一些新的调节者面纱，其中一些在其他途径中也发挥功能。RTK（受体酪氨酸激酶，Receptor tyrosine kinase ）介导的ERK（细胞外信号调节激酶，extracellular signal-regulated mito-gen-activated protein kinase） 途径，在许多发育和病理事件中发挥关键作用。大量正向遗传学筛选（forward genetic screens）和哺乳动物细胞培养实验，描述了这种信号途径的关键成分。然而，传统的正
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效应T细胞？调节T细胞？：免疫系统对抗感染的最佳策略
生物通报道：Ⅰ型糖尿病、关节炎等自身免疫性疾病和癌症都是免疫系统相关疾病，最近伦敦国王大学研究人员发现了一种新机制，也许可以治疗这些疾病的新途径。研究详细结果刊登于网络版Nature。T细胞抵抗肌体感染。研究人员先前鉴定出的两种T细胞，都产生于胸腺：“效应T细胞”（effector T cells），攻击被感染的细胞；“调节T细胞”（regulatory T cells），抑制免疫系统的，在感染过程中保护炎症对肌体的损伤。如果向接受移植手术的患者注射调节T细胞，会帮助患者抑制排斥反应。目前研究人员发现了一种新机制，可以判断T细胞最终成为效应细胞还是调节细胞的命运。研究人员认为这种机制可以进一步
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首张“幸福指数世界地图”问世
生物通报道：莱斯特大学心理学家Adrian White最近绘制出首张“幸福指数世界地图”。Adrian White对联合国教科文组织（UNESCO）、美国中央情报局（CIA）、WHO、伦敦智库新经济基金会（New Economics Foundation）、Veenhoven 数据库、非洲公共调查机构Afrobarometer以及联合国人类发展报告（UNHDR）公布的数据进行整理，启动了主观幸福感指数项目——首张幸福指数世界地图。此项目公布于今年9月的某心理学杂志，将在今年晚些时候举行的研讨会上公布结果。各种实验中，参与者被问及关于幸福和对生活的满意度的问题。meta-analysis依据来自
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王清华最新文章:多转座子基因组
生物通报道：在11月13日的《美国科学院院刊》网站上公示了来自美国新泽西大学的华裔学者王清华（Qinghua Wang，音译，文章第一作者）和Hugo K. Dooner的有关玉米基因组结构变异的最新研究成果。玉米可能是所有农作物中最多样化的物种。通过比较两种不同的玉米自交系McC和B73的（inbred lines）bz基因组区域，研究人员以外地发现了大量的单模标本差异。构成了玉米中多数DNA成分的反转录转座子簇在构成上有明显的变化并且在基因中的相对位置也有明显变化。这些Corn Belt自交系的等位bz区域只具占所有序列的少数。为了进一步分析由反转录转座子、helitrons和其他插入形式
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许左尚：如何设计特异性siRNA
生物通综合：来自美国马萨诸塞大学医学院的研究人员在siRNA特异性研究方面获得了突破，这一研究结果公布在《Nature Methods》杂志上。小干扰RNAs(siRNAs)是指能够减少目标mRNAs表达的小型RNAs。近来，生物学家已经把siRNAs作为一种重要的工具投入到应用中。siRNAs也具有临床治疗的潜在意义，它可以作为治疗剂用于减少致病突变基因的表达。但是，为了释放出siRNAs全部的潜在功效，弄清楚目标特异性的管理规则就变得非常之重要。一个主要的挑战就是要开发出siRNAs，使它能够区分出同一基因的两个相似变异体，这样其中的一个基因变异体被剔除，而其它的变异体则安然无恙。由美国马
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《自然》子刊：辨别力高的siRNA
生物通综合：一项新的研究揭示了如何设计出能够区分出同一基因的相似变异体的高度特异性的小干扰RNAs。 小干扰RNAs(siRNAs)是一些能够减少目标mRNAs表达的微小RNAs。近年来，生物学家已经把siRNAs作为一种重要的工具。siRNAs也具有临床治疗的潜在意义，它可以作为药物用于减少致病突变基因的表达。但是，为了释放出siRNAs全部的潜在功效，弄清楚目标特异性的规则就变得非常重要。一个主要的挑战就是要开发出能够区分出同一基因的两个相似变异体的siRNAs——这样以来，其中的一个基因变异体被剔除，而其它的变异体则安然无恙。
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PLos：解开病毒感染性的奥秘
生物通综合：来自美国宾州大学医学院 (University of Pennsylvania School of Medicine)的科学家发现了一个因为病毒的感染，而改变正常细胞的活动过程，并因而造成细胞癌化肿瘤生长的机制。 这一研究成果公布在最新一期 PLoS Pathogens期刊上。在这篇论文中，研究人员锁定的病毒就是俗称卡波氏肉瘤相关疱疹病毒 (Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus；简称 KSHV)的感染源，过去临床上的经验发现，这类的病毒并不能攻击健康的免疫系统，但对于像爱兹病患或是因为器官移殖而必须接受药物治疗的人来说，不健全的免疫防御系统
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干细胞重大成果：成功将脐血变成肺细胞
生物通报道：明尼苏达州大学的研究人员首次成功“诱骗”脐带血干细胞分化成一种肺脏细胞类型。这种脐带血细胞分化成了一种类型的肺细胞——II型肺泡细胞。这些细胞负责分泌表面活性剂，以使肺脏中的气囊保持开放状态，从而使空气能够进出气囊。这种细胞还能促进损伤后的气管修复。明尼苏达州大学医学中心的研究人员David Mckenna博士说，“将来，我们可能检测患肺脏疾病的婴儿的脐带血来研究疾病的发生情况，并可能开发出更好的治疗药物。”这项研究的结果刊登在11月7日的Cytotherapy杂志上。II型肺泡细胞在胚胎发育晚期才形成，这也是一些早产儿出生时肺脏发育不充分的原因。这种细胞和气囊作为一个整体成熟并在
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PNAS:人唾液中发现比吗啡还强的天然止痛药
生物通报道：一项新的研究显示，人类的唾液能够产生一种天然的止痛药，而且这种止痛药比吗啡的效果还要强6倍。这项研究的结果刊登在近期的《美国科学院院刊》杂志上。这种被命名为opiorphin的物质可能成为新一代的天然止痛片，用以缓解疼痛并且不会像吗啡那样上瘾和产生心理上的副作用。当法国巴斯德研究所的研究人员将一种能触发疼痛的化合物注射到大鼠的爪子里时，他们发现1克药物/千克体重的opiorphin的止痛效果与3克/千克体重morphine的效果相同。研究人员Rougeot和同事发现opiorphin能够通过抑制天然止痛鸦片——脑啡肽）的破坏作用来作用于神经细胞。Opiorphin是一种很简单的分子
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microRNA另一种转录机制：垃圾DNA“天生我材必有用”
生物通报道：人类将近一半的DNA都是由转座子形成的。转座子还有一个名称——垃圾DNA(junk DNA)，以前大家都认为垃圾DNA可能没有什么功能，但是越来越多的研究表明它们并非百无一用。爱荷华大学研究人员Beverly Davidson的最近发现了一种转录microRNAs的新机制，而且一些垃圾DNA含有转录microRNAs的序列。这些发现拓宽了对高速发展的功能基因组研究领域的认知，并且对于研究神秘的“垃圾DNA”带来了新的曙光。Davidson及其同事研究一组microRNAs，在人类基因组中的出现或者形成方式。与原先的推论相反，他们发现这些microRNAs形成所用到的分子机制，与转录
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Invitrogen增加一个新的高层职位
生物通报道：Invitrogen公司已经晋升Bernd Brust为欧洲和美洲的高级销售副总裁——该公司增加的一个新的高层职位。Bernd Brust原本是欧洲区域的总经理和副总裁。他与2004年加盟Invitrogen，此前在GE Medical System Information Technologies担任销售和市场经理。Invitrogen公司表示，Brust的直销和网络销售方式促使他们创造出这个新职位。Invitogen公司还宣布说原欧洲销售副总裁将会接替Brust之前的工作。Illumina同意以6亿美元收购SolexaIllumina 公司 (I
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换种思路寻找药物靶点（图）
生物通报道：美国圣地亚国家实验室（Sandia National Laboratories）研究人员John Shelnutt和宋玉江（Yujiang Song，音译）找到一种可以观测细胞上药物结合靶点的新方法。研究结果将刊登于下一期《Angewandte Chemie Int. Ed.》。Shelnutt和宋在文章中描述了一种通过脂质体（liposomes）基架，生产多孔渗水的、纳米级别的、中空铂球（platinum spheres）的新方法。脂质体是一种精微的液囊，主要用于递送特异疫苗、酶或者药物。早期工作中，Shelnutt等在脂质体基架上，生产连续铂纳米薄片，最终得到泡沫状的铂纳米结构
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