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世界顶级光学显微镜观测DNA修复
生物通报道：H2AX蛋白是第一个到达DNA出事现场的救护员。研究人员利用世界顶级光学显微镜（在美国是独一无二的）首次对H2AX在细胞核中的分布进行了观察，发现他它们成群分布，当DNA受损时会径直到达受损/修复位点发挥作用。许多生物学过程是建立在直接观测基础之上的。高清晰度的电子显微镜需要繁琐的制样过程，因此经常不在研究人员考虑范围之内；光学显微镜样本准备过程简单，并且能够对活细胞进行观察，但是受限于低分辨率。生物物理学家通过调节光波，扩大了光学显微镜的应用范围，目前最先进的4Pi显微镜能够观察到细胞核内的“风景”。PNAS一篇文章报道，Jackson 实验室分子生物物理研究所Joerg Bew
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AAAS科学新闻奖揭晓
生物通报道：一篇关于阿尔茨海莫氏症现代科学研究的深入人心的故事、一系列关于美国西部气候变化影响的报道和一篇关注致寻找香蕉优良生长条件的科学美文，荣获2006年美国科学促进会（American Association for the Advancement of Science）科学新闻奖（Science Journalism Awards）。科学新闻奖设立于1945年，独立评审小组由科学新闻记者组成，评奖范围涉及期刊、广播、电视和互联网等的科技成果报道，目前又增加了关于儿童的科学新闻，候选名额面向全世界记者。The Philadelphia Inquirer 报记者Stacey Burling
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为什么我们不能靠虹膜识别等生物识别产业致富？
人们很容易把生物识别看成科学幻想小说里的未来技术，与太阳能汽车、克隆人这类东西联系在一起。实际上，生物识别离我们并不遥远。 生物识别技术（Biometric Identification Technology）是利用人体生物特征进行身份认证的一种技术。生物特征是唯一的（与他人不同），可以测量或可自动识别和验证的生理特性或行为方式，分为生理特征（如指纹、脸形、虹膜等）和行为特征（如笔迹、声音、步态等）。目前已经出现了许多生物识别技术，如指纹识别、手掌几何学识别、虹膜识别、视网膜识别、面部识别、签名识别、声音识别等，但其中一部分技术含量高的生物识别手段还处于实验阶段。我们相信随着科学技术的飞速进步
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资料库：一个信号引起上万个回应
生物通报道：细胞信号机制通常通过蛋白质修饰来传递信息，最重要的就是磷酸基团的可逆性连接，即所谓的蛋白质磷酸化作用。德国马克思·普朗克生化研究所的研究人员现在已经发明了一种能够鉴定和定量蛋白质中特定位点被磷酸化以响应活细胞中特定的刺激物。在Matthias Mann的领导下，研究人员发现了2244个蛋白质中6600个磷酸化位点（其中90％是之前未知的）并且观察了它们当时的动力学变化。所有这些磷酸化位点信息都储存在了新近创立的Phosida数据库中，以使它们能够被不同领域的科学家有效利用。哺乳动物细胞不断接收来自它周围的信号，并作出适当的反应。例如，生长因子能够促使细胞的生长。这些被调节和控制的过
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经费不足使大型基因组计划陷入停顿
生物通报道：在成功测序了已经灭绝的猛犸部分基因组后，该“冰河时代基因组计划”因缺乏经费而中止。 McMaster大学McMaster Ancient DNA Centre的Hendrik poinar和他的研究咱细胞这项测序已灭绝动物的基因组计划能够揭示出它们在进化历史、种群、多样性和其他关键特征方面原本难以获得的信息。破译猛犸基因组可能有助于解开这些动物在冰河世纪晚期因何原因被杀死的谜团。 到目前为止，研究人员只测序了猛犸化石中残留的线粒体DNA。而细胞核DNA的测序则是更为复杂的一个课题，因为核DNA序列更长并且每个细胞只有两条链。到今年为止，只有少数的细胞核基因被测序
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搞怪基因名，着实难登大雅之堂
生物通报道：若是在草场上或者广播中听到“极端份子”（Lunatic fringe）、“独眼小东西”（one-eyed pinhead），可能代表一种侮辱，但这些却是研究人员给他们所发现的基因的怪名字。研究人员的主要目的是使这些名字“令人难忘”——随着越来越多的基因被挖掘出来，一点点怪异能够帮助研究人员将它们与其它基因区别开来。但是麻烦也跟着来了，在科学向医学转化的时候，这些实验室昵称实在是难登临床大雅之堂。比如，医生需要对患有“sonic hedgehog”、“mothers against decapentaplegia”等基因缺陷的病人耐心解释这些古怪的名字。伦敦大学学院生物学教授、人类基
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芯片服务信息及基因泰克新闻
生物通报道：美国糖尿病、消化和肾脏疾病研究所的Genomics Core实验室近日宣布将会为所有NIH（美国健康研究院）的所有研究机构提供它的芯片服务。Genomics Core（基因组核）实验室的主管Margaret Cam表示，这项业务拓展只是一个开端，处方NIH决定使用其他供应者的芯片。该事件也反映出NIH预算需求的增加。NIDDK Genomics Core目前使用Affymetrix和Codelink平台，并且将为其他NIH研究人员提供他们的服务，每个样本收费400美元，超过100个样本时的价格为350美元。（生物通杨遥）基因泰克9.19亿美元收购其合作伙伴Tanox公司基因泰克上周
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Nature新闻：人造DNA片段，拉响病原体入侵警报
生物通报道：能够在肌体中巡逻，搜寻入侵者的微小设备，是纳米研究人员一直梦寐以求的。11月10日Nature新闻报道说最近由以色列研究人员研制的一种分子装置似乎实现了此梦想。他们得到的这种“DNA 装置”（DNA machine）通过阅读病毒基因组侦察病毒，然后以可见光的方式“报警”。但是这种装置距离成为消灭病毒的纳米机器人（nanobot）似乎还很远，因为至少目前还需要在许多其它化学成分的帮助。研究人员说发明这种设备的初衷不是研制某种分子机器人，而是研制一种可以跟踪病毒，比如血样中病毒的新方法。DNA既可以作为模板，也有催化剂的功能耶路撒冷希伯来大学Itamar Willner及其同事说，他们
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microRNAs也许可以成为疾病的生物标记
生物通报道：美国Wake Forest 大学医学院Nilamadhab Mishra博士及其同事，最近在华盛顿举行的美国风湿病学会（American College of Rheumatology ，ACR）上报告说他们找到了狼疮病的生物标记，他们发现一些micro-RNAs在五名狼疮患者和六名正常志愿者之间表达不同。风湿病学副教授Mishra说：“我们首次发现这些micro-RNAs是人类狼疮的一个发病原因。” micro-RNAs是一系列短链核糖核酸，在肌体中发挥重要的调节作用，特别是抑制基因表达。这些发现是Mishra对组蛋白研究结果的一部分。组蛋白是一种环绕在DNA周围，与DNA共同组
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首个真核细胞全蛋白组研究完成
生物通报道：11月12日《Nature Genetics》一篇文章，对黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）精子的381种蛋白做了描述。此次研究标志着首次对高等真核细胞的“全细胞” 蛋白组分特征进行研究。这种“蛋白组”包含精子生存和发挥特定功能所需的所有蛋白，研究人员利用这些信息寻找一些精子相对于其它精子成功率更高的原因。几乎有一半的果蝇精子蛋白组的蛋白基因，在人类和小鼠精子中都是相应的。因此果蝇成为研究哺乳动物雄性不育的一个优势模型。将果蝇精子蛋白组和其它物种精子蛋白组进行对比，有助于找到进化线索和精子蛋白组的核心——精子进行有性繁殖所需的最基本成分。弄清这些也有助于研究
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顶级杂志蛋白分析 华人科学家贡献突出
生物通综合：11月9日出版的《Nature》杂志发表了有关蛋白结构的文章5篇，主要是三个方面的内容：Rhomboid蛋白，C3b和Wza蛋白。其中参予实验的有许多是华人科学家，比如Rhomboid蛋百结晶结构分析中就有吉林大学的研究人员参予，Wza蛋白三维结构分析的第一作者为Changjiang Dong。Crystal structure of a rhomboid family intramembrane protease p179Wza the translocon for E. coli capsular polysaccharides defines a new class of m
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《自然》再披《科学》文章造假
生物通报道：在最新一期的《自然》杂志上，公布了1993年的一项研究的勘误声明，但该篇文章指出《自然》并不是近几周发表此类声明的唯一一个顶级杂志。在10月27日，《科学》杂志刊登了有关在今年2月刊出的一篇发育生物学论文的简短声明，该声明表示，目前正在调查密苏里州大学的这项研究，并且指出报道的研究结果可能不可靠。这篇论文报道说一种叫做Cdx2的基因在小鼠胚胎特定细胞（在进行第一此分裂后）中表达，并且这种基因的表达促使形成特化组织。只有那些不表达Cdx2的细胞会形成构成身体的不同细胞类型。这些发现非常重要，因为一直以来发育生物学家都对哺乳动物胚胎是否在这种初期阶段确定它们细胞的命运存在争议。结果一出
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蛋白质结构计划开启了新一代的科学研究
生物通综合：蛋白质结构计划 (Protein Structure Initiative；简称PSI) 是一项起源于2000 的中长期研究计划，在历经六年的开创期之后，相关研究领域的科学家，开始从这个锁定蛋白结构的数据库中，获得许多资源共享的珍贵成果。据了解这个由美国国家卫生研究院 (National Institutes of Health)的国立综合医学科学研究所 (National Institute of General Medical Sciences)所赞助的研究计划，打从一开始，就锁定发展解析蛋白结构为目标，参与计划的研究单位与科学家，一方面发展最尖端的自动化结构结晶技术，同时也发
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本期《科学》《自然》精选
生物通综合：11月9日《Nature》封面故事：成年视网膜能够结合新的光受体细胞光受体损失会在很多视网膜疾病中导致不可逆转的失明。试图通过向成年视网膜中移植大脑或视网膜干细胞来修复这种损伤的努力基本上都失败了，没有生成新的光受体，也几乎没有迹象表明移植的细胞能与视网膜神经元连接或恢复视力。现在，用小鼠做的一个实验表明，成年视网膜能够结合新的光受体细胞，前提是移植的细胞是处于某个特定发育阶段的专一的视杆前体细胞，是由转录因子Nrl（在本期封面照片中心位置所示细胞中标记为绿色，视网膜色素显示为红色）的表达定义的。这项研究为从胚胎或成年干细胞生成适合移植的细胞铺平了道路。这些发现还向一个被人们普遍接
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《自然》杂志连续多篇文章报道眼睛疾病研究成果
生物通报道：《自然》杂志连续三期都刊登了有关眼睛疾病的研究新发现、进展，并且受到了广泛的关注。这些成果包括发现能够保持角膜清透的蛋白质、细胞移植治疗眼睛疾病、以及眼癌研究的新发现。这些成果将对人类眼睛健康产生深远影响。眼癌中p53途径的失活刊登在11月2日的《自然》杂志上的一篇文章中，来自美国圣·犹大儿童研究医院等研究机构的研究人员与意大利、比利时的研究人员报道了眼癌中p53途径的被失活。已经知道，在大多数人类肿瘤中，Rb和p53途径都发生了基因突变，但是眼癌被认为是一个例外。大量的研究表明由RB1（retinoblastoma1）基因突变引发的眼癌绕过了p53途径，因为它们起源于视网膜发育过
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本期Science主打文章：海胆基因组测序计划收官
生物通报道：休斯敦贝勒医学院(Baylor College of Medicine，BCM-HGSC)人类基因组测序中心主持的海胆基因组测序计划（Sea Urchin Genome Sequencing Project ,SUGSP)协会，于11月9日宣布完成对紫海胆（Strongylocentrotus purpuratus）基因组的破译、分析工作。结果刊登于11月10日Science杂志。棘皮动物门大约出现于5.4亿年以前，代表成员包括海胆、海星、海参等。在2.5亿年前二叠纪末期的第三次物种大灭绝后，现代海胆逐步成为棘皮动物门的霸主。棘皮动物是后口动物，它们的原肠胚孔形成肛门，而口部是后来
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发现幼年大鼠脊髓损伤部位存在干细胞
生物通报道：神经研究人员长久以来一直认为，修复受损神经的唯一途径是建立新的神经连接。最近乔治敦大学医学中心研究人员发现，在年轻大鼠中脊髓受损部位附近存在一些细胞，能够限制神经损伤，恢复运动和感觉。相同的过程在成年大鼠却疗效甚微，恢复所需时间也较久。研究结果刊登于11月《Experimental Neurology》杂志。脊椎动物神经系统是双向传递系统。感觉信息由感觉感受器捕捉，再传给负责感觉的神经细胞，最后到达大脑皮质而被认识。运动信息则是从大脑皮质运动区发出命令，传到承担这种运动的神经细胞，再到达肌肉，从而引发肌肉运动。功能完全丧失的轴突不能再生。但是研究人员认为在局部受损的、已经丢失部分轴
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小鼠模型低估了Tyk2在人类中的作用
生物通报道：东京医科齿科大学（Tokyo Medical and Dental University）Yoshiyuki Minegishi博士及其同事最近鉴别出一种罕见的人类Tyk2缺陷症患者，并证明人类Tyk2分子与人类免疫反应中多种关键细胞因子有关，强调Tyk2在人体中的重要地位，并证明在人类和在小鼠中功能不同。文章刊登于10月电子版《Immunity》。Tyk2是一种非受体酪氨酸激酶，属于Janus 激酶(Jak)家族成员之一，是IL-12 和IFN-gamma信号途径都需要的一种酶。高IgE 综合症（hyper IgE syndrome ，HIES）是一种原发性免疫缺陷病(prima
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生长因子——过犹不及
生物通报道：蛋白之间的相互作用既意味着潜在的癌症风险，也意味着潜在癌症治疗。许多生物学过程都复合儒家的“过犹不及”规律：增之一分太多，减之一分太少，恰如其分刚刚好。体内微量浓度的生长因子也是如此。一种叫做胰岛素样生长因子-1（insulin-like growth factor-I ，IGF-I）的蛋白，太多会引发癌症，太少又会引起身材矮小、痴呆和骨质疏松等疾病。最近费城儿童医院和宾州大学医学院研究人员对肿瘤生长抑制因子p53对于生长激素/IGF系统的影响做了更深一步分析，新发现的两种信号途径的相互影响更突出了一个问题——长期服用生长激素和IGF-I的后果，同时为将来的癌症治疗开辟了新的道路。
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捕获自然固氮中间体
生物通报道：氮是植物生长所需的一种重要营养物质，固氮（nitrogen fixation）对于植物显得尤为重要。自然界在环境温度和压力下即能完成固氮，但是人工将氮气转化为氨-肥（ammonia fertilizer）需要在高温、高压下才能完成。最近由犹他州立大学、维吉尼亚工学院和西北大学研究人员组成的小组，对含有固氮酶的微生物的生物固氮过程和近期报道的化学固氮过程之间是否原理一致进行了分析。他们的研究方法使观测微生物固氮具体步骤成为可能。研究结果刊登于PNAS的固氮（Nitrogen Fixation）专刊，题目为《A methyldiazene (HN=N-CH3) derived spec
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