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由Lactococcus petauri NC2产生的新型IId类细菌素petauricin A和petauricin B的纯化与特性研究
乳酸菌产生的芽孢杆菌素因其安全性备受关注。本研究从发酵香肠中分离出Lactococcus petauri NC2菌株,通过三步色谱纯化结合质谱分析鉴定出分子量分别为4711.8 Da和5432.7 Da的两种新型芽孢杆菌素petauricin A和B。基因组学分析发现包含petA、petB等前体基因及合成相关基因的IId型基因簇。序列比对显示petauricin A与garvicin AG1相似度97%,petauricin B与garvicin AG2相似度72%。实验证实petauricin A仅抑制L. garvieae,而petauricin B对Lactococcus、Latilactobacillus等7个属的细菌具有广谱杀菌活性。该成果首次揭示了L. petauri属的芽孢杆菌素特性。
来源:BMC Microbiology
时间:2026-02-24
男同性恋者感染淋病奈瑟菌后肛门直肠及口咽部微生物群的变化:一项前瞻性队列研究
MSM群体肛周及咽喉部淋病奈瑟菌感染前后菌群动态研究表明,16S rRNA测序和LEfSe分析显示感染后肛周Dorea、Lachnoclostridium等属显著富集,咽喉部Rothia属显著富集,菌群网络复杂度降低,并关联到磷酸壁酸合成及嘧啶代谢通路(均P<0.05)。
Prinsepia Uniflora(蔷薇科)的完整线粒体基因组:从头组装、特征分析及系统发育研究
线粒体基因组首组装及进化分析揭示Prinsepia uniflora存在大量短重复序列和A/T偏好性密码子使用,并发现20个叶绿体基因向线粒体转移的片段,系统发育分析确认其与Prunus padus和Prunus cerasus的亲缘关系。
来源:BMC Genomics
SF-1对性别逆转鱼类Cheilinus undulatus中AMH基因启动子活性的调控及其适应性进化
humphead wrasse的性别逆转机制与适应性进化研究揭示了amh基因正选择及SF-1调控作用,核受体家族特征与体型、转座子丰度关联,为濒危物种保护提供分子证据。
DeepSGE:利用残差网络结合高效通道注意力机制和动态图注意力网络来预测空间基因表达
基于ECA-ResNet、Vision Transformer和动态图注意力网络提出的新方法DeepSGE可有效提取病理切片图像的纹理特征并动态建模局部与全局依赖关系,在三个ST数据集上显著优于现有方法,揭示了细胞分子特征与组织结构的内在关联。
一种基于纳米体的去蛋白系统,用于定向敲低盘状粘菌(Dictyostelium discoideum)中的特定蛋白质
本研究开发了一种基于ALFA标签和纳米抗体的条件性蛋白降解系统,通过靶向Skp1-Cullin-F-box复合体实现细胞类型特异性蛋白降解,结合IAA诱导的AID2系统验证了其效应用于黏菌功能研究。
来源:BMC Molecular and Cell Biology
在高胆固醇饮食诱导的动脉粥样硬化小鼠模型中,合生元(Lactiplantibacillus plantarum M10和异麦芽糖)对肠-心脏轴的调节作用
本研究比较合生元(Lactiplantibacillus plantarum M10+Isomaltose)与辛伐他汀在高胆固醇饮食小鼠中的预防动脉粥样硬化效果。结果显示合生元显著改善体重、血脂、血糖,调节肠道菌群(增加有益菌如Ruminococcus、Lactobacillus、Faecalibacterium),降低炎症因子和氧化应激,减少肝脂肪变性及大动脉增厚,提示其作为潜在预防策略的临床价值待验证。
GENOVIS:一个集成的Python包助力群体遗传可视化分析,实现六种关键图谱的自动化与图形化生成
这篇研究介绍了GENOVIS——一款支持命令行与图形界面的Python包,旨在简化群体基因组学中六大核心可视化分析(如SNP密度热图、纯合子片段分布图、群体关系矩阵热图、3D PCA、混合成分柱状图与曼哈顿图)。工具以灵活的Python框架为基础,提供统一、用户友好的界面,能快速生成可直接用于出版的高质量图形,显著提升了分析流程的可及性与可重复性。
西南肉山羊的基因组特征及与繁殖相关基因的鉴定
本研究分析了西南地区七个人工山羊品种的遗传结构、多样性和繁殖相关基因,发现存在三个遗传群组,基因流显著,并在多个关键基因中检测到正选择信号,为保护育种提供依据。
2022年11月至2023年7月期间,在坦桑尼亚进行的常规哨点监测中收集到的SARS-CoV-2奥密克戎谱系的基因组多样性
本研究对2022年11月至2023年7月坦桑尼亚90份样本中80个SARS-CoV-2基因组序列进行分析,发现存在7个奥密克戎亚型,其中22F(XBB*)和22E(BQ.1)分别占56.3%和21.35%。区域分布显示四个亚型于2022年11月引入后引发本土传播,主要扩散方向为达累斯萨拉姆向外围地区。通过系统发育分析揭示出具有坦桑尼亚特色的独立亚型,证实了病毒在当地的持续传播。
源自人类尿液的干细胞外泌体能够抑制败血症相关急性肾损伤中的炎症和氧化应激
尿液来源干细胞外泌体通过抑制氧化应激和炎症反应改善脓毒症相关急性肾损伤的机制研究。
从中国东北地区分离出的三种真纤毛虫的分类学与系统发育研究:Euplotes heilongjiangensis 新种、E. daqingensis 新种以及 E. cf. daidaleos(孔膜目、纤毛虫门、真纤毛虫亚纲)
本研究对中国东北地区自由生活Euplotes纤毛虫进行形态学及分子生物学分析,确认了Euplotes heilongjiangensis和Euplotes daqingensis为新物种,并探讨了其系统发育地位,为环境监测和资源研究提供可靠依据。
通过全基因组关联分析来鉴定中国地方鹅生长速度性状的候选基因
中国本地鹅生长率相关基因的基因组关联分析研究,通过测量255只鹅0-10周体重数据,构建生长曲线模型评估相对和绝对生长率,发现70个SNP位点关联36个基因,其中5个基因同时在生长率和相对生长率中显著,并通过功能富集分析鉴定了多个候选基因。
公牛精子在睾丸后成熟过程中的蛋白质组动态变化
哺乳动物精子在附睾内转运过程中通过与附睾微环境相互作用,逐步获得、丢失或修饰蛋白质组成。本研究采用全基因组测序方法,比较了睾丸精子(TestSperm)、头段附睾精子(CaputSperm)和尾段附睾精子(CaudaSperm)的蛋白质组特征。结果显示:TestSperm富含转录后调控相关过程,可能参与精子发生和分化调控;CaputSperm显著富集于整联蛋白介导的内吞途径和非经典内吞途径,可能促进精子-附睾体相互作用及囊泡融合;CaudaSperm则与特定精子功能(运动性、受精能力)和氧化磷酸化(OXPHOS)相关,反映精子成熟过程中代谢从糖酵解向OXPHOS的过渡。此外,泛素-蛋白酶体系统(UPS)在跨物种的附睾精子中均显著富集,而组蛋白修饰酶在头段附睾精子中的表达提示组蛋白修饰在维持 eviction 与 retainment 平衡中起关键作用。本研究揭示了精子蛋白组重塑在附睾后成熟及功能获得中的核心作用。
Microtus fortis的染色体水平基因组:揭示适应性进化与天然寄生虫免疫机制
田鼠首个染色体级基因组揭示MHC I类基因家族显著扩张与寄生虫抵抗关联
长期通过尾部悬吊方式模拟失重状态对大鼠肠道微生物群及肠道-肝脏轴稳态的影响
肠道菌群调节与微重力下肝损伤机制研究。采用hindlimb悬挂大鼠模型模拟长期微重力暴露,发现显著增加肝脂沉积、氧化应激及炎症反应,肠道机会致病菌比例升高,屏障功能受损,次级胆汁酸(熊去氧胆酸、石胆酸)和色氨酸代谢紊乱。研究证实肠道菌群是维持肠肝轴稳态的关键靶点,为长期太空任务健康保障提供新思路。
在体内模型中,Gardnerella菌在尿路中的持续存在及其致病性的菌株水平异质性与比较性系统基因组分析结果一致
Gardnerella菌尿路定植与致病性差异研究通过构建小鼠模型,比较四个主要分支的18株Gardnerella菌的体内定植能力及致病机制,发现Clade2菌具有更强的持续定植和引发尿路上皮脱落及水肿的潜力,并通过基因组全景分析鉴定了45个相关基因,其中Clade2携带更多定植相关基因,Clade4携带更多致病基因,为靶向治疗提供依据。
分析虹鳟(Oncorhynchus mykiss)主要脂肪库中分离出的成熟脂肪细胞的转录组多样性
本研究通过高通量RNA测序分析虹鳟鱼 visceral(VAT)、subcutaneous(SAT)和 intramuscular(IMAT)三种脂肪组织库的转录特征,发现其存在显著的功能分化:VAT以脂代谢和免疫应答为主,受miRNA强调控;SAT维持代谢平衡和脂肪动态调节,呈现中度miRNA调控;IMAT主要参与能量代谢与肌肉互作,miRNA调控较弱。揭示了脂肪组织库的分子异质性及miRNA的特异性调控机制。
对五种毒葛(Toxicodendron vernicifluum)样本的叶绿体基因组密码子使用模式进行分析和比较
本研究分析漆树(Toxicodendron vernicifluum)五个接入点的叶绿体基因组密码子偏好,发现均呈现高A/T含量和A/T结尾密码子偏好,自然选择是主要驱动因素,并评估了拟南芥、杨树和酿酒酵母作为异源表达宿主的潜力。
在非生物胁迫条件下,对Cardamine hupingshanensis中的U-box E3泛素连接酶基因(ChPUBs)的鉴定与特征分析
耐硒植物基因组的U-框泛素连接酶家族及其环境应答机制研究,通过鉴定114个ChPUB基因,揭示其通过ABA和冷信号通路整合调控非生物胁迫响应,特别是硒胁迫诱导叶部显著上调表达,为植物重金属适应机制研究提供新资源。
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