• Nature子刊：应用PEM-seq技术全面解析Cas12家族基因编辑工具酶的特性

  基因编辑的安全性问题一直是CRISPR-Cas系统应用于临床的关键。除了具有脱靶活性，CRISPR-Cas系统在基因编辑过程中还会产生染色体易位、染色体大片段缺失等染色体结构异常产物；并会同时介导外源载体DNA片段的整合1。这些副产物严重威胁了基因组的稳定性，常常与癌症的发生相关联，阻碍了CRISPR-Cas系统临床转化的进程。为了检测上述基因编辑过程中的副产物，北京大学生命科学学院、北大-清华生命科学联合中心胡家志研究员课题组前不久开发出高灵敏度的可以全面且定量评估CRISPR编辑特征的高通量测序方法PEM-seq2。从理论上来说，基因编辑工具包括Cas9和碱基编辑器等都可以利用P

  来源：北京大学新闻网

  时间：2022-10-18

• Nature Biotechnology：新的CRISPR-Cas方法带来更精确的DNA切割

  由马萨诸塞州总医院(MGH)的研究人员领导的一个团队已经克服了通过CRISPR-Cas酶和其他技术切割和编辑DNA的主要限制。最近的这项创新发表在《自然-生物技术》杂志上，它将简化和加快分子克隆方法，并扩大它们的用途。CRISPR-Cas编辑已经改变了研究人员改变DNA的能力——例如，用限制性内切酶或从细菌中分离的蛋白质无法做到的方式切割特定的DNA序列，而这种蛋白质已经被用于切割特定位点的DNA序列几十年了。尽管CRISPR-Cas工具可以被编程定位和切割几乎任何DNA序列，但其定位的一个主要限制是要求首先识别位于目标侧翼的短序列，称为原间隔相邻基序(PAM)。因此，DNA以前只能在这个特定

  来源：Nature Biotechnology

  时间：2022-10-13

• RNA折纸技术在合成生物学中的应用

          分子模型显示dCas9结合到引导RNA - RNA折纸融合分子，将转录因子带入启动子序列。开发精确控制生物过程的工具一直是合成生物学这个现已成熟的领域的主要支柱之一。这些科学工具借鉴了大量研究领域的原理，当结合在一起时，可以实现独特的应用，对现代社会具有潜在的变革意义。由于与细胞折叠和表达的兼容性，在生物学背景下翻译现代RNA纳米技术创新具有巨大的潜力，但也带来了独特的挑战，如严格的性能条件和RNA分子固有的不稳定性。然而，安德森实验室最近开发的一种被称为“RNA折纸”的RNA结构设计方法正试图解决这个问题。这种方法试图生成复杂的人

  来源：Nucleic Acids Research

  时间：2022-10-11

• 微生物学家改善啤酒的味道

  比利时研究人员通过识别和改造一种基因，改善了现代啤酒的味道，这种基因对啤酒和其他一些酒精饮料的味道有很大影响。这项研究发表在美国微生物学会的《应用与环境微生物学》杂志上。几个世纪以来，啤酒都是在开放的水平大桶中酿造的。但在20世纪70年代，该行业转向使用大型封闭容器，这更容易灌装、清空和清洁，使酿造量更大，降低了成本。然而，这些现代方法生产的啤酒质量低劣，因为风味生产不足。在发酵过程中，酵母将麦芽浆中50%的糖转化为乙醇，另外50%转化为二氧化碳。问题是:二氧化碳给这些封闭的容器加压，削弱了味道。分子细胞生物学名誉教授Johan Thevelein博士和他的团队开创了识别酵母中负责重要商业特性

  来源：American Society for Microbiology

  时间：2022-10-11

• Science Advances：侵袭性肺癌的新基因靶点

  西北医学院(Northwestern Medicine)的科学家发现并描述了一种新的基因，该基因负责激活小细胞肺癌的一种侵袭性亚型——P亚型，目前尚无有效的治疗方法。西北大学范伯格医学院生物化学和分子遗传学助理教授、该研究的主要作者Lu Wang说:“这种癌症对很多药物都有耐药性，但关注它的研究并不多。”“通过识别这个重要的基因，我们现在有了一个非常好的药物靶点。”Lu Wang说:“当我们告诉患者这种癌症没有有效的治疗方法时，对患者和他们的家人来说是毁灭性的打击。”部分问题在于，小细胞肺癌的治疗方法一直相对不变，主要依靠化疗。王说，大多数患者会产生化疗耐药，影响有限的治疗方案的整体疗效，并导

  来源：Science Advances

  时间：2022-10-11

• 将诺贝尔奖技术与治疗技术结合，克服CRISPR一个关键限制

  美国西北大学的一组研究人员设计了一种新的基因编辑平台，它可以为未来基于crispr的近乎无限的治疗方法的应用提供信息。通过化学设计和合成，该团队将获得诺贝尔奖的技术与他们自己实验室诞生的治疗技术结合在一起，克服了CRISPR的一个关键限制。具体来说，这项突破性的工作提供了一种系统，可以为生成名为CRISPR-Cas9的基因编辑机器提供所需的数据。该团队开发了一种将Cas-9蛋白转化为球形核酸(SNA)的方法，并将所需的关键成分装入其中，以访问广泛的组织和细胞类型，以及基因编辑所需的细胞内分隔室。这项研究发表在《美国化学学会杂志》上的一篇题为“CRISPR Spherical Nucleic A

  来源：Northwestern University

  时间：2022-10-10

• 一种与干细胞分化有关的特殊液滴可能为新的癌症疗法提供靶点

  干细胞充满潜力。它们变成其他细胞类型的能力对我们的身体至关重要，无论是在发育过程中还是在整个生命过程中。但如果这种潜能出了问题，就会让我们垮掉，把一些最有用的细胞变成恶性癌症。在研究干细胞分化通路时，加州大学圣巴巴拉分校的研究人员发现，所有参与的蛋白质并没有形成流水线或刚性结构，而是结合成一个液滴。通过建模和操作，研究小组开始揭示细胞如何使用这种液滴来处理和传递信息，以及它在癌症中是如何发生故障的。他们的研究结果发表在《PNAS》上。分子、细胞和发育生物学系的助理教授、资深作者Max Wilson说:“细胞中也发生了组织蜘蛛网上露珠的相同过程，使这种液体分子计算机根据命令出现或消失。一旦出现问

  来源：PNAS

  时间：2022-10-09

• Science子刊：肺癌治疗的新靶点

  肺癌是全球癌症死亡的主要原因之一。尽管筛查和治疗技术都有了改进，但肺癌通常在肿瘤扩散的晚期才被诊断出来。西北医学院的研究人员在小鼠身上进行的一项新研究证明并描述了一种负责激活一种侵袭性小细胞肺癌亚型的新基因。他们的发现可能会导致改进方法和治疗方法。这项名为“POU2AF2/C11orf53 functions as a coactivator of POU2F3 by maintaining chromatin accessibility and enhancer activity”的新研究发表在《Science Advances》杂志上。研究人员写道:“小细胞肺癌(SCLC)约占所有肺癌的1

  来源：Science Advances

  时间：2022-10-08

• 应用PEM-seq技术全面解析Cas12家族基因编辑工具酶的特性

  基因编辑的安全性问题一直是CRISPR-Cas系统应用于临床的关键。除了具有脱靶活性，CRISPR-Cas系统在基因编辑过程中还会产生染色体易位、染色体大片段缺失等染色体结构异常产物；并会同时介导外源载体DNA片段的整合1。这些副产物严重威胁了基因组的稳定性，常常与癌症的发生相关联，阻碍了CRISPR-Cas系统临床转化的进程。为了检测上述基因编辑过程中的副产物，北京大学胡家志课题组前不久开发出了高灵敏度的可以全面且定量评估CRISPR编辑特征的高通量测序方法PEM-seq2。从理论上来说，基因编辑工具包括Cas9和碱基编辑器等都可以利用PEM-seq方法进行评估，进而从编辑活性、脱靶活性、染

  来源：生命科学联合中心

  时间：2022-10-02

• 揭秘CRISPR护卫RNA独特的进化之路

  中国科学院微生物研究所向华/李明研究团队此前发现一类全新的可以护卫CRISPR-Cas的双RNA型毒素-抗毒素系统CreTA（Science, 2021），进一步研究发现CreTA起源于mini-CRISPR结构，但其重复序列repeat发生了高度退化（Nucleic Acids Res, 2021）。CreTA的repeat序列为何会发生这一退化，其进化驱动力是什么，科学家们尚不清楚。近日，李明团队和向华团队在Nucleic Acids Research上报道了关于此问题的最新研究进展。 　　研究团队通过大量遗传学实验发现，CreA只能利用携带该CreTA元件的CRISPR-Cas

  来源：中科院

  时间：2022-09-30

• Nature Biotechnology公布CRISPR技术重要进展：移除癌基因的结合位点可以减缓癌细胞的生长

  研究人员发现了一种机制，癌症患者普遍激活的一种癌基因会影响细胞的生长速度。在未来，这些发现可以帮助开发新的治疗方法，防止癌症基因诱发肿瘤生长。专注于MYC肿瘤基因影响的研究人员揭示了有关调节癌细胞生长的因素的新见解。MYC促进了对细胞生长很重要的基因的表达，而且已知它在所有人类癌症中的一半以上都过度活跃。然而，目前还没有抑制MYC功能的药物，因为它的蛋白质结构不太适合作为治疗的靶标。防止MYC活性的另一种选择是抑制MYC靶基因的功能。在最近的研究中，隶属于芬兰科学院肿瘤遗传学研究中心的赫尔辛基大学的研究人员已经确定了MYC的靶基因，这些基因负责其促进生长的作用。在健康组织中，细胞生长和增殖是受

  来源：Nature Biotechnology

  时间：2022-09-29

• Nature子刊：基因编辑技术可准确复制侵袭性淋巴瘤

          图片:Marco Herold教授，Sarah Diepstraten博士，yeexuan Deng和Gemma Kelly副教授    一种强大的新型基因组编辑技术使研究人员能够以前所未有的准确性复制人类疾病，有望彻底改变一系列癌症的药物研发过程。该技术由WEHI团队推进，可以激活任何基因——包括那些已经被沉默的基因——从而在一个无与伦比的水平上探索新的药物靶点和耐药性的原因。研究人员利用这种独特的技术首次复制了一种侵袭性淋巴瘤，他们利用这种技术确定了一种基因，该基因负责触发对澳大利亚目前使用的一种血癌新疗法

  来源：Nature Communications

  时间：2022-09-28

• 从皮肤细胞克隆来的迷你猪为阿尔茨海默病的治疗提供了新的视角

  几十年来，来自世界各地的研究人员一直在努力了解阿尔茨海默症。现在，奥尔胡斯大学生物医学系和临床医学系的合作培育出了一群迷你猪，这可能会使阿尔茨海默症的研究和治疗向前迈进一大步。这些克隆猪出生时带有SORL1基因突变，这很有趣，因为在所有早发性阿尔茨海默症的人类病例中，有多达2-3%的人存在这种突变。由于基因突变，猪在很小的时候就出现了阿尔茨海默氏症的症状。这给研究人员提供了一个跟踪疾病早期迹象的机会，因为猪显示出的生物标记物的变化与用于人类诊断的生物标记物相同。“通过跟踪猪随着时间的变化，我们可以更好地了解细胞中最早的变化。之后，这些变化会导致大脑发生不可逆转的变化，从而导致痴呆。但现在我们可

  来源：Aarhus University

  时间：2022-09-27

• 精确基因组编辑在治疗遗传性视网膜疾病方面的潜力

          图:精确基因组编辑在治疗遗传性视网膜疾病中的示意图。    来源:美国国家科学院院刊在一篇新论文中，加州大学尔湾分校的研究人员解释了精确基因组编辑剂如何实现遗传视网膜疾病(IRDs)的精确基因校正和疾病拯救。这项名为“Precision genome editing in the eye”的研究发表在本周的《美国国家科学院院刊》上。本文描述了目前治疗遗传性视网膜退行性疾病的临床前成功和临床基因组编辑方法，并强调有希望在活的有机体内基因编辑将是未来IRDs的治疗范式。目前，对于这些通常导致失明的毁灭性疾病，还没有

  来源：Proceedings of the National Academy of Sciences

  时间：2022-09-27

• 精确基因组编辑在遗传性视网膜疾病治疗中的潜力

  在一篇新论文中，加州大学欧文分校的研究人员解释了精确基因组编辑剂如何在遗传性视网膜疾病(IRDs)中实现精确的基因校正和疾病拯救。这项名为“眼睛中的精确基因组编辑”的研究发表在本周的《PNAS》上。本文描述了目前治疗遗传性视网膜退行性疾病的临床前成功和临床基因组编辑方法，并强调体内基因编辑有望成为未来视网膜退行性疾病的治疗范式。目前，对于这些通常导致失明的毁灭性疾病，还没有有效的治疗方法。Krzysztof Palczewski博士解释说:“基因组编辑技术是针对遗传疾病根源的一种极好的方法。”他是UCI医学院唐纳德·布伦眼科教授和通讯作者。“基因组编辑技术不断发展，以更少的副作用和风险实现精确

  来源：PNAS

  时间：2022-09-27

• 《Nature》子刊RNA编辑工具是一种快速、简便的COVID-19和其他疾病检测工具

  莱斯大学博士后研究员Jie Yang领导了一项努力，将Cas13基因组编辑工具改造为一种高灵敏度的检测器，用于检测导致COVID-19的SARS-CoV-2病毒的存在。一种基于CRISPR的新工程方法准确地找到了导致COVID-19的SARS-CoV-2病毒的RNA。这种高灵敏度的检测器有望使COVID-19和其他疾病的检测快速而简单。莱斯大学和康涅狄格大学的合作者进一步设计了RNA编辑CRISPR-Cas13系统，以提高其检测生物样本中微量SARS-CoV-2病毒的能力。一个巨大的好处是，它不需要金标准PCR检测所需的耗时的RNA提取和扩增步骤。与PCR检测相比，新平台非常成功。事实上，在对

  来源：Nature Chemical Biology

  时间：2022-09-23

• Nature子刊：利用“隐形”染色体传递积极性状

          图:父系和母系特征的遗传交换通常发生在染色体的整个长度上。通过用CRISPR/Cas分子剪刀反转大部分染色体(黄色)，这种交换现在可以被限制在极端端(紫色和蓝色)。    图片来源:Michelle Rnspies, KIT理想的作物植物是美味和高产，同时还能抗病虫害。但是，如果相关基因在染色体上的距离很远，那么在繁殖过程中，这些积极的性状可能会丢失。为了确保积极的性状可以一起传递，卡尔斯鲁厄理工学院(KIT)的研究人员使用CRISPR/Cas分子剪刀来反转染色体，从而使其在基因上失去十分之九的活性。染色体这部

  来源：Nature Plants

  时间：2022-09-23

• Nature子刊：“隐形”染色体传递积极性状的可利用性

  理想的作物植物是美味和高产，同时还能抗病虫害。但是，如果相关基因在染色体上的距离很远，那么在繁殖过程中，这些积极的性状可能会丢失。为了确保积极的性状可以一起传递，卡尔斯鲁厄理工学院(KIT)的研究人员使用CRISPR/Cas分子剪刀来反转染色体，从而使其在基因上失去十分之九的活性。染色体这部分编码的性状在基因交换中变得“不可见”，因此可以不受影响地遗传下去。研究人员在《Nature Plants》杂志上发表了他们的发现。利用CRISPR/Cas分子剪刀可以对植物中的基因进行定向编辑、插入或抑制。(CRISPR是聚类规则间隔短回文重复。)这种方法可以使植物对害虫、疾病或环境影响更有抵抗力。Hol

  来源：Nature Plants

  时间：2022-09-22

• 破解皮肤癌转移到大脑的机制，扩散可被抑制80%

  特拉维夫大学(Tel Aviv University)的研究人员首次破解了一种能够使皮肤癌转移到大脑的机制，并利用现有的治疗方法成功地将疾病的扩散推迟了60%到80%。这项令人鼓舞的研究是由特拉维夫大学萨克勒医学院的Ronit Satchi-Fainaro教授和博士生Sabina Pozzi领导的。研究结果发表在科学杂志《JCI Insight》上。Satchi-Fainaro教授解释说:“在晚期，90%的黑色素瘤(皮肤癌)患者会发生脑转移。这是一个令人费解的统计数据。我们希望看到肺部和肝脏的转移，但大脑应该是一个受保护的器官。血脑屏障阻止有害物质进入大脑，但在这里，它并没有起作用——来自皮肤

  来源：Tel-Aviv University

  时间：2022-09-21

• 只需静脉！用CRISPR消除罕见“肿胀病”

  一家生物技术公司报告说，在医学上，将CRISPR基因编辑器注入三名患有罕见遗传病患者的血液中，可以缓解他们的症状。这项实验性的治疗使一种肝脏蛋白质变硬，这种蛋白质会导致喉咙和四肢疼痛并可能危及生命。该公司的试验中有两个人在注射了一次CRISPR后表现非常好，他们不再需要药物来控制病情。数据报告于会议今天在柏林的这种病，叫做遗传性血管性水肿。这项努力标志着Intellia Therapeutics公司第二次使用体内释放的CRISPR直接使人体内的基因失活。但Intellia总裁兼首席执行官John Leonard表示，最新的研究结果反映了第一份与注射该工具相关的临床益处的报告，该工具可以切除或替

  来源：AAAS

  时间：2022-09-20

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