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Nature Protocols介绍快速定量肿瘤蛋白的新方法
在过去十年中,基因组学研究已经系统绘制了人类癌症的遗传改变,但这些改变对蛋白质组的直接影响还知之甚少。NIH临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)的蛋白组学研究表明,将蛋白质组和磷酸化蛋白质组数据与基因组数据相整合,才能改善癌症通路的鉴定。然而,实体瘤组织在组成上比细胞系要复杂得多,至少包含了上皮、基质和血液成分。人们需要更复杂且更耗时的方案来处理实体瘤组织,才能检测到低丰度的蛋白(如癌基因和肿瘤抑制因子)。为此,在液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)分析之前必须降低样品的复杂性。基于这个目的,Broad研究所蛋白质组学平台的研究人员近日在《Nature Protocols》杂志上报道了一
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技术入股,弄潮蓝海——让硒和农产品发生奇妙反应
科技日报: 叶 青一边是富有成效的科研成果,一边是广阔的市场前景,如何踢好“临门一脚”,顺利推进科技成果转化呢?“锁在抽屉中的科研技术,迈向市场举步维艰,需要政策的保障。”陈填烽是暨南大学化学与材料学院的一名教授,今年,在国家、广东省和暨南大学相关科技成果转化政策的支持下,他的纳米硒制备与应用技术以技术入股形式成立公司,推动纳米硒产业发展。本领神奇 纳米硒发力农业硒被誉为“生命的火种”,其生物学功能主要是提高人体免疫力、抗氧化、保护修复细胞、防癌抗癌、对重金属有解毒作用等,合理地摄入硒元素对人体健康、预防治病有着重要作用。然而我国缺硒地区高达72%,缺硒省份有22个。“东北地区的克山病、大骨节
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3D超分辨率成像技术开启阿尔兹海默症新认识
近年来统计,美国85岁以上的老人40%患有阿尔兹海默症,这种疾病通常在患者意识到患病前10至20年已经开始发展。阻碍医学界治疗阿尔兹海默症(AD)的主要问题是不清楚疾病最初从何时、何地开始。普渡大学的研究人员开发了一款超分辨率“纳米镜”,可以提供比之前精细10倍的脑内分子3D视图。这种成像技术有助于揭示疾病的发展和新疗法的介入位点。这篇发表于《Nature Methods》的文章帮助研究者更好地了解AD患者脑中斑块结构,找出可能会造成损害的特征。在个体发展出AD之前,脑内开始出现淀粉样斑块(一种蜡质沉积物)积聚。这些积聚物与周围细胞相互作用引起炎症,破坏神经元并导致记忆障碍。目前,斑块沉积是A
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Nature子刊:癌细胞Wnt信号研究提出治疗新方法
生物通报道:大肠癌是导致癌症死亡的主要原因,每年导致全球约700000人死亡。超过90%的大肠癌在Wnt信号组件基因中携带体细胞突变,如腺瘤结肠息肉(APC)抑癌基因,从而导致Wnt信号的组成性激活。这反过来又造成CSCs的产生,它们通常可对常规化疗产生耐药性。因此,阻断Wnt信号的治疗药物,有可能根除癌症干细胞,并治愈疾病。然而,尽管有丰富的资料数据,并对相关研究和研发有大量投资,但目前却没有Wnt抑制药物被纳入临床实践。由日本国立癌症中心(NCC)、日本理化学研究所生命科学技术中心(CLST)等处的研究人员组成的团队开发了一个新的小分子Wnt抑制剂,命名为NCB-0846。这种抑制剂可为药
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国家科学技术奖励回归初心
■记者 王静近日,司法部官网发出消息,就《国家科学技术奖励条例(修订送审稿)》(以下简称《条例》)向全社会征求意见,并称此次《条例》的修改旨在“增强立法的公开性和透明度,提高立法质量”。据了解,《条例》是继1999年、2003年两次大修之后的第三次大修。修订后的条文共计5章31条,其中保留4条、修改21条、新增6条。每年国家科学技术奖的颁发都会受到全社会高度关注。正因如此,其所承载的往往不只是一种荣誉,还衍生出一些“附加值”。比如,很多科研机构把是否获得国家科技奖励作为考评研究人员的一项指标,有的将其与项目申请或职称评审直接挂钩。这显然超出了奖励的初衷,并且可能是促成此次《条例》修订的重要因素
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革命性新成果:替代动物实验的一种更便宜检测方法
生物通报道:全球有数百万只动物被用于关于人类和环境使用化合物的毒性试验。最新一项研究指出,毒理学家开发出了一种新筛选方法,可以准确预测这些检测结果。这一研究成果公布在T Toxicol Sci杂志上。研究人员从公共数据库(包括PubChem和美国国家毒理学计划)中找到了1000万种化学结构和现有化学安全性数据的信息,开发出一种(至少)比动物试验本身可靠的运算新方法,这种工具在预测动物试验结果方面准确率为87%,而重复动物试验平均只有81%。英国替代优化和减少研究用动物国家中心Fiona Sewell(未参与该项研究)表示,“毫无疑问,这是一种创新方法,时间将证明,在实践中,它是否为基于实验动物
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你的抗癌药选对了吗?新技术助你实现快速药筛
癌细胞是人体失去控制的细胞。事实上,它们转化于身体细胞,伤害它们的物质也会造成体内健康细胞损伤。全球范围上万家研究机构都在寻找癌细胞的特殊弱点。例如,科研人员发现,在DNA损伤修复基因突变导致的某类型的乳腺癌和卵巢癌中,一组新获批的药物“PARP抑制剂”可以治疗这种癌症,让癌细胞难以复制它们的DNA,最终死亡,但是正常细胞却不受影响,因为它们有完整的DNA修复机制可以应对药物的抑制作用。在成千上万只细胞中观察药物药效苏黎世大学疾病分子机制系的Jone Michelena等人利用体外癌细胞培养来观察新药的确切效果。“我们的方法基于荧光高通量显微镜,可以精确地记录和观察药物在数千种细胞中的工作情况
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合成生物学:掀起第三次生物技术革命
■通讯员 姜天海 记者 甘晓科幻电影《银翼杀手2049》描写了“复制人”的日常,他们是一群与人类具有完全相同智能和感觉的人造生命,被认为可能对人类本身带来威胁。现实中,科学家眼里的“人造生物体”却并非如此。7月7日至8日,在深圳召开的第四届合成生物学青年学者论坛上,上千名海内外青年学者围绕合成生物学最新前沿热点议题进行交流。“人造生物体”受到了极大关注。学者们认为,继“DNA双螺旋发现”和“人类基因组测序计划”之后,合成生物学有望掀起第三次生物技术革命,将向农业、医药、健康和环境领域不断深入发展。交叉、融合、颠覆性合成生物学近年来因其交叉、融合和颠覆性受到广泛关注。今年习近平总书记在两院院士大
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也许并不需要药神!Nature最新发现预测白血病的新方法
生物通报道:对于大热电影《我不是药神》,网友们除了关注源自真实案例的故事情节外,围绕白血病药物,和治疗方面的讨论也愈演愈烈。慢粒白血病可能发生在任何年龄段,但是如果能有一种方法,预测白血病的患病风险,防范于未然,那就再好不过了。近期一个国际研究小组发现患有急性髓性白血病(AML)的患者在发病之前,血液中会出现基因改变,这一发表在7月9日Nature杂志上的最新成果指出,鉴别DNA变化的血液检测可以揭示健康人群中AML的根源。而且进一步的研究也可以更早的发现和监测有AML风险的患者,开辟了患癌可能性的新研究领域。这项研究由Sanger研究所,欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)等多家大型研究
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技术方法:如何计算进化生物学的突变率
生物通报道:变异是进化的原料,这对于了解进化生物学的速度至关重要。突变率有多种计算用途,比如,进化生物学家可以基于物种的突变率,预测一个物种首次分化为两个物种时的“分子钟”。科学家们还利用这些速率来追踪流感等病毒的演变速度。癌症生物学家也可以利用突变率估计肿瘤细胞基因组随时间变化的速度。“这是每一个进化模型中必须输入的参数,”新加坡基因组研究所的博士后Yuan Zhu说。科学家之前是根据表型变化来推断突变,例如耐药性的出现。现在,由于越来越多成本低,速度快的DNA测序出现,已经有了更复杂的方法来处理全基因组突变率。这些技术可以应用于任何物种。虽然迄今为止科学家们主要只是分析了微生物和病毒,但他
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《中国科学: 生命科学》专刊:生物质谱研究方法
生物通“核心刊物”栏目创办于2002年,主旨在于向国内专业人士展示科研核心刊物,以及生命科学领域杂志每期重点内容,为读者呈现精彩纷呈的国内科研动向,和重大科研进展。目前包括《遗传》、《中国生物工程杂志》、《科学通报》等重点期刊,也欢迎生物类期刊联系合作(联系邮箱:journal@ebiotrade.com)。生物通报道:生物质谱是质谱学的一个崭新领域,目前已广泛应用于蛋白质,脂类,代谢物,乃至核酸等生物分子的分析,成为多门“组学” ,如蛋白质组学,代谢组学,脂质组学等新兴学科的核心技术。 《中国科学: 生命科学》的生物质谱专辑结集出版了国内生物质谱领域关于研究方法与应用的14篇评述文章和研究论
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《Nature》子刊:干细胞技术拯救人类心力衰竭
华盛顿大学医学院病理学教授Charles "Chuck" Murry说:“将新生肌肉细胞整合入心脏,让它们有力的再次跳动。在动物模型中,这些细胞使心脏功能得以恢复至正常水平的90%及以上。”Murry和同事在7月2日的《Nature Biotechnology》杂志上发表了他们的最新进展,文章主要作者包括Yen-Wen Liu、Billy Chen和Xiulan Yang。这一次,他们使用人类胚胎干细胞来源的心肌细胞(hESC-CMs)重新组件猕猴梗塞的心脏,成功减少了心脏疤痕大小,显著恢复了猴子的心脏功能。“这将为心脏病患者带来福音,”Murry说。大多数心力衰竭出于心脏病发作引起的心肌死亡
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线粒体功能受损?这种简单方法可迅速替换
线粒体不仅是细胞的能量工厂,还参与诸多细胞过程。线粒体的功能缺陷会引起许多严重的健康问题。韩国的研究人员近日开发出一种简单的方法,能够将健康的线粒体导入缺陷的细胞中,从而拯救细胞的代谢功能。这项成果发表在《Scientific Reports》期刊上。线粒体是重要的细胞器,负责许多必需的细胞功能,包括能量代谢、自由基的产生、钙稳态的维持以及细胞存活和死亡。它的功能缺陷被认为与许多严重的疾病有关,如衰老、癌症、代谢紊乱和神经退行性疾病。对于功能受损的线粒体,人们已经开发出修复和重编程的治疗策略,来恢复它的功能。不过,若存在遗传缺陷,更换受损的线粒体则是一个更有吸引力的选择。最近的一些研究已将健康
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2018国家科学技术奖初评通过项目公布
2018年度国家科学技术奖初评工作已经结束。根据《国家科学技术奖励条例实施细则》的规定,现将初评通过的40项国家自然科学奖项目、51项国家技术发明奖通用项目和140项国家科学技术进步奖通用项目在科技部网站(http://www.most.gov.cn)和国家科学技术奖励工作办公室网站(http://www.nosta.gov.cn)公布。初评通过的21项国家技术发明奖专用项目和41项国家科学技术进步奖专用项目在委托管理单位、提名单位及项目完成单位等进行内部公布。自初评通过项目公布之日起20日内,任何单位或者个人对公布项目和项目主要完成人、主要完成单位有异议的,可以以书面方式向我办提出,并提供必
来源:国家科学技术奖励工作办公室
时间:2018-07-04
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新组织成像技术:实时诊断癌症进展
该系统利用精确定制的光脉冲,用多个波长同时成像,使研究者得以研究组织和细胞内的并行过程,为癌症研究提供肿瘤进展、组织病理学和诊断学依据。研究人员在最近发表的《Nature Communications》文章中报道了这款名为“同时无标记自体荧光多谐波源显微术(simultaneous label-free autofluorescence multi-harmonic microscopy,SLAM)”的新技术。文章通讯作者、伊利诺伊大学香槟分校生物工程和电子计算机工程教授Stephen Boppart既是一名工程师,也是一名医生。Stephen Boppart“在过去一个世纪,我们通过移除、处
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广州医科大学最新文章:首次提出基因的致病潜力研究方法
随着新一代基因测序技术的发展,得到一个人的全部基因序列已不是一件困难的事。但我们每个人的基因都有成千上万个基因变异。这些基因变异与人类健康的关系,即其致病性的评估,是当前全世界最前沿、最重要的25个科学问题之一,且被列为第4个科学大问题。广州医科大学神经科学研究所、附属第二医院廖卫平教授团队长期致力于基因致病性的研究,首次提出了基因的致病潜力的研究方法;并以癫痫性脑病为例,总结了癫痫性脑病相关基因的致病性的评估方法和标准,提出了基因致病潜力的评估指南。相关研究结果发表在Nature杂志子刊Genetics in Medicine上,这是世界上首次提出的基因致病潜力的评估方法和指南,为破解这一
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革命性技术改写视网膜细胞研究规则
几十年来,科学家们希望理解视网膜的视觉输入,但不得不借助侵入性技术解剖视网膜来记录细胞活动。化学和化学生物系教授Charles Lieber和Beth Friedman团队开发了一款全新技术,使科学家们在清醒的动物体内长期追踪数十个细胞放电模式成为可能。文章发表在最新一期的《Science》,第一作者是Lieber实验室的博后研究员Guosong Hong。该系统利用了Lieber实验室开发的超精细网状电子(ultraflexible mesh electronics)技术,它能在单个细胞水平非侵入性地注射和与组织相互作用,在长达数周时间里记录多种视网膜细胞活动。在新研究中,Lieber和Ho
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国家科学技术奖励拟放宽国籍限制
《国家科学技术奖励条例(修订送审稿)》(以下简称《条例》)及其说明公布,公开征求社会各界意见。公众可以登录司法部官网、中国法律服务网、中国政府法制信息网等查看。《条例》中规定,奖励对象由“公民”调整为“个人”,放宽了国家科学技术奖励对象的国籍限制。现行《国家科学技术奖励条例》于1999年颁布,至今已经实施19年。目前,科技部已向国务院报请审议《条例》。奖励对象由“公民”调整为“个人”目前的修订草案对条文内容进行了修改和调整,修订后的条文共计5章31条,其中保留4条,修改21条,新增6条。记者注意到,奖励对象由“公民”调整为“个人”,放宽了国家科学技术奖励对象的国籍限制,使今后将符合条件的外籍人
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《Nature Methods》表观遗传学研究惊现重大技术错误!
瑞典林雪平大学(Linköping University)的研究人员发现,表观遗传学领域使用最广泛的方法之一,DIP-seq,可能会产生误导性结果,《Nature Methods》论文指出,大数据和先进DNA分析方法被用于大量表观遗传学研究,之前报道的DIP-seq数据应被回收处理以纠正误差,这可能导致表观遗传学领域颠覆性的新发现。原则上,我们体内每一个细胞的DNA序列都是相同的。然而,基因组在不同类型细胞中的行为相当不同。这意味着,存在额外信号控制每种细胞类型应该使用哪种基因。其中一种调控方式是通过直接在DNA序列上添加化学基团进行标记,这些DNA序列化学修饰通常被称为部分“表观遗
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最新发现:一种用于分析转座子的新方法
生物通报道:转座子这些所谓的“跳跃基因”如果插入健康的基因,就可能会引发疾病。不过迄今为止,人们还不清楚转座子的跳跃是由何种原因引起的。维也纳兽医大学的一组研究人员提出了一种新的方法来分析转座子跳跃,这一研究成果公布在Molecular Biology and Evolution杂志上。转座子以一种比“正常”基因更自由的方式,诠释了基因组的灵活性。它们在基因组中复制,并选择它们自己的位置。转座子可以跳跃到一个基因中,并使其不起作用。因此,它们是不同生物发展的一个重要判别标记。然而,目前还不清楚的是,跳跃基因是如何发展的,是什么影响着它们的活性。一般来说,转座子是通过DNA测序而被检测到的。但是