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NEJM公布CAR-T癌症疗法历史性突破:癌症复发患者依然有效
CAR-T疗法工作原理UT Southwestern的Simmons综合癌症中心的研究人员进行的一项历史性研究证实了CAR-T疗法的有效性:CAR-T疗法利用基因修饰的免疫细胞成功治疗了儿童和年轻人的急性淋巴细胞白血病(ALL)。 这一研究成果公布在New England Journal of Medicine杂志上。索取完整版的《癌症研究概览》请填写联系表格“虽然大多数ALL患儿对化疗反应良好,但是这个试验的患者是癌症已经复发的患者,他们迫切需要一种替代方案,这项研究利用经基因改造后的患者T细胞来对抗患者的癌细胞,结果令人惊喜——许多患者都有良性反应,”Simmons综合癌症中心的助理教授T
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《Nature》里程碑式突破!检测细胞相互作用新方法
“几乎所有免疫学研究都基于细胞-细胞接触,”Victora说。“因为大多数免疫反应要求细胞必须在物理上相互接触才能交换信号。”在近期发表的这篇《Nature》文章中,Victora团队利用最新开发的LIPSTIC系统,监测了免疫细胞之间的短暂“邂逅”:一群看起来一样的细胞,单个细胞偶尔“亲吻”另一个细胞,然后“跑开”。为了追踪细胞的这种瞬时相互作用,Victora实验室的博后研究员、本文第一作者Giulia Pasqual为细胞的物理接触结构打上了标签。这种标签相当于“口红”的生物等效物,当参与免疫反应的两个细胞发生接触,细胞表面就会蹭上“口红”,而流式细胞术可以很容易地识别被标记的细胞。“我
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曹雪涛院士2018年Nature发文:多项先进技术解析关键DNA修饰酶
第二军医大医学免疫学国家重点实验室,中国医学科学院/北京协和医学院的研究人员发表了题为“Tet2 promotes pathogen infection-induced myelopoiesis through mRNA oxidation”的文章,利用紫外交联免疫共沉淀结合高通量测序(CLIP-seq)和单个核苷酸分辨率的全转录组RNA甲基化测序等RNA相关组学技术,发现DNA羟甲基化酶Tet2能够作为一种RNA结合蛋白作用于免疫分子mRNA水平,进而促进感染状态下机体外周血天然免疫细胞的数量增加,利于病原体的清除。这一研究成果公布在1月24日的Nature杂志上,文章的通讯作者是曹雪涛院士
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2018年新技术:大数据时代的神经科学
成像技术和高通量记录技术的进步正在以前所未有的速度生成神经科学数据,科学家们需要更加有效的数据分析方法,这在一些分支学科,如连接组学(connectomics,《细胞》特辑:联接组学),还有神经元活动的分析中尤其重要。机器学习(Machine-learning),特别是深度学习方法可以帮助处理和分析大量的数据。在监督式的深度学习中,卷积神经网络将训练数据通过简单模块的多层网络进行学习。这样的网络逐步提取数据并提取特征,这些特征可以用于分析新数据。根据输入数据和网络训练的方式,提取的特征可能差别很大。基于图像的数据,目前通常是手动分析,未来也许可以通过先进的机器学习来分析。例如,脑组织的电子显微
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2018年新技术:新一代XFELs
——新的X射线自由电子激光(X-ray free electron laser,XFEL)设备将能扩大这种技术的使用范围,促进方法的发展,并推动结构生物学领域XFEL是什么?X射线自由电子激光(XFEL)是一种X射线,但它被誉为“第四代X射线光源”,其峰值亮度比第三代同步辐射光源高9—10个量级(即10的9—10次方);成像时间尺度可达到飞秒量级(1秒的1000万亿分之一);而且相干性更好,属于相干的X射线光源。XFEL所具有的这些以往任何X射线光源都不可比拟的优点,使科学家可以在亚纳米尺度的空间分辨能力研究飞秒时间尺度的超快动力学过程,这将带来物质科学和生命科学等领域的一系列重大变革。以结构
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Nature Methods:直接测序RNA的新方法
生物通报道 《Nature Methods》上最新发表的一项研究表明,纳米孔测序技术可实现RNA直接测序,产生实时的序列数据,无需逆转录或扩增,从而避免引入偏倚。这是目前第一种真正直接的RNA-seq方法。细胞的转录组蕴含了丰富的信息,包括基因的结构、转录本的表达水平和反义转录。捕获这些信息的最好方法是准确、定量地揭示碱基的存在和身份,而不需要预先知道序列。当然,这种方法最好能生成跨越剪接点的连续序列。目前最常用的RNA-seq策略是利用poly(dT)引物或随机六聚体引物进行cDNA合成。之后再通过PCR来扩增这些cDNA链,不过这可能会降低cDNA文库的复杂性,影响cDNA的相
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李慧林博士:糖生物学突破性成果—OST原子级结构
生物通报道:美国文安德尔研究所等处的研究人员揭示了负责修饰蛋白质的一种重要复合物的原子级结构,这种复合物即寡糖基转移酶(oligosaccharyltransferase,OST)复合体,是蛋白糖基化过程中的一个关键作用因子,参与了许多细胞过程,与人体中众多的功能密切相关,其失调也与癌症等疾病密不可分,可以作为新药物的理想靶标,因此这项新研究也为癌症和其他疾病的新药开发铺平了道路。这一研究成果公布在1月22日Nature杂志上,由文安德尔研究所的表观遗传学中心教授李慧林(Huilin Li)博士领导完成,李博士是国际知名的结构生物学家,在冷冻电镜(cryo-EM)研究领域拥有超过20年的经验(
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线粒体靶向小分子示踪技术发现调控细胞命运的新机制
我国学者在线粒体靶向小分子示踪与调控细胞命运研究领域取得重要进展日期 2018-01-23 来源:医学科学部 作者:李恩中 蒋景英 【大 中 小】 【打印】 【关闭】 多功能近红外小分子IR-DBI通过白蛋白介导的EPR效应被动运输和转运蛋白介导的主动运输双重靶向机制选择性蓄积在缺氧细胞线粒体在国家自然科学基金项目(项目编号:81130026、81402784)等资助下,中国人民解放军第三军医大学创伤、烧伤与复合伤国家重点实验室史春梦教授研究组联合药学院和西藏军区总医院,在线粒体靶向近红外荧光小分子化合物示踪与调控缺氧细胞命
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《Nature》长文发表温州医科大学李校堃团队在FGF研究领域的重大突破
-----解析FGF23蛋白质机器、揭示FGF23蛋白功能之谜温州医科大学药学院李校堃教授团队与美国纽约大学医学中心MoosaMohammadi教授团队通过数年联合攻关,在国际上率先解析“抗衰老蛋白αklotho-成纤维细胞生长因子受体1c (FGFR1c)-成纤维细胞生长因子23 (FGF23)”三元复合物晶体结构。这一相关成果以长文(Article)形式发表在国际顶级综合性学术期刊《Nature》(影响因子40)(αKlotho is a non-enzymatic molecular scaffold for FGF23 hormone signaling,Nature, 2018)。作
来源:温州医科大学药学院
时间:2018-01-22
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Science:能一次筛查八种常见癌症的液体活检技术
科学家朝着癌症研究最热门的方向迈出了重要的一步:一个可以及早发现肿瘤的血液检测——CancerSEEK。约翰霍普金斯大学的肿瘤学教授Nickolas Papadopoulos领导的研究组开发出这个新方法能通过单一血液检测筛查八种常见类型癌症,这主要是根据对DNA和蛋白的综合分析实现的。研究人员在在1005名肿瘤尚未扩散的患者中,证明CancerSEEK检测癌症的特异性高达99%!这意味着健康人出现假阳性结果的可能性非常低。同时检测癌症的敏感性高达69-98%(取决于癌症类型)。这一研究成果公布在1月18日的Science杂志在线版上。同期Science上也发布了评论性文章。Papadopoul
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2018年新技术:质谱成像起飞
是否可以在不使用到任何荧光标记或抗体的前提下,对组织中甚至单个细胞中的多个分子分布进行成像并确定它们的化学特性呢?这不是一个荒谬的想法,因为质谱成像技术(mass spectrometry imaging,MSI)确实有可能做得到。几十年前,质谱技术首次被用于针对组织和细胞中的元件分布进行成像。1997年,范德堡大学质谱研究中心主任,生物化学教授Richard Caprioli博士第一次提出基质辅助激光解吸电离(MALDI)质谱分子成像技术,这项技术不局限于特异的一种或者几种蛋白质分子,它可在组织切片中找到每一种蛋白质分子,并提供这些蛋白质分子在组织中的空间分布的精确信息,而事先无需知道所检测
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新技术同时追踪HIV感染时的核酸和蛋白
如果将HIV病毒感染人体的过程看成是几个啮合的齿轮,那么宿主细胞是大齿轮,而促进感染的HIV组分(DNA、RNA和蛋白)是小齿轮。尽管人们能够单独观察核酸和蛋白,但目前还无法同时追踪这些齿轮如何共同作用,让病毒成功感染细胞。美国埃默里大学的研究人员近日开发出一种新颖的显微镜技术,让人们能够以单细胞的分辨率同时追踪病毒RNA、DNA和蛋白质的变化。这项成果于近期发表在《Nature Communications》杂志上。据这项研究的通讯作者、埃默里大学医学院的Stefan Sarafianos介绍,这种新技术被称为基于多重免疫荧光细胞的DNA、RNA和蛋白质检测(MICDDRP),它让人们首次追
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2018年新技术:新一代超分辨率显微技术
生物通报道:多年前,超分辨率成像就已经成为结构生物学中的一种主要技术,增进科学家们对大分子复合物组织的理解。2013年,科学家们借助于低温电子显微镜(cryo-EM)的粒度平均方法(particle-averaging methods),利用单分子定位显微镜(SMLM)的荧光标记蛋白定位,分析细胞核孔复合物(NPC)的结构(Science 341,655-658,2013)。这项研究的基础在于已知的孔隙对称性。尽管在这种情况下并不严格需要,但如果没有之前的基于荧光结构的先验知识,研究也不能顺利开展。时至今日这一研究领域的技术进步已经指出了荧光在结构生物学研究中的越来越多的应用。首先,超分辨率方
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PacBio测序技术揭秘最有趣的基因组
生物通报道 新南威尔士大学领导的研究团队近日对澳洲野狗(dingo)的基因组进行了测序和组装,希望借此了解犬驯化的整体状况,以及澳洲野狗在澳大利亚的历史。新南威尔士大学的Bill Ballard周一在动植物基因组大会(PAG)上介绍了研究进展。这个基因组测序项目由悉尼大学的Claire Wade共同领导,并且赢得了去年PacBio的SMRT资助计划。这只名为Sandy的澳洲野狗打败了粉红鸽子、爆裂甲壳虫和亚洲蛇等对手,在“世界上最有趣基因组”的评选中一举夺得冠军。作为一只野生的纯种澳洲野狗,Sandy是相当稀有的。两年前Sandy和它的两个姐妹被发现时,它们还是被遗弃的幼崽。当时的
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2018年新技术:高通量电生理学
电生理学(Eectrophysiology)已广泛用于记录大脑中的神经元活动。膜片钳(Patch-clamp)技术能帮助科学家们了解各个神经元性质,而电生理细胞外记录(extracellular recordings)则能用于评估多个神经元的活性。然而,这两种技术的通量都有限,不过近期光学记录(optical recording)技术的出现带来了新希望。膜片钳并不容易操作,但是自动化程序可以改善这种方法。特别是图像导向性膜片钳机器人(image-guided patch–clamp robots)能增加靶向神经元记录的通量(Neuron 95,1037-1047,2017; Neuron 95
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远程遥控癌症免疫疗法新技术
机械遗传学(mechanogenetics)侧重于了解细胞和组织的机械性能变化和物理力如何影响基因表达。如今,研究人员希望借助机械遗传学创新方法,使用超声波机械扰动T细胞,将机械信号转化为细胞遗传信号,实现远程控制基因和细胞激活。根据顶级学术期刊《PNAS》最新发表文章(2018 115),研究人员展示了该远程遥控机械遗传学系统可以作用于工程嵌合抗原受体(chimeric antigen receptor,CAR)表达T细胞,使其靶向杀伤癌细胞。工程CAR-T细胞具有机械传感器和遗传转导模块,可被经过微泡放大的超声远程激活。加州大学圣地亚哥分校生物工程教授Peter Yingxia
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『新技术』高效扩增原代T细胞,为推广细胞免疫疗法铺路
利用人体免疫系统对抗癌症和其他疾病的过继性细胞转移技术能持续缓解病情,已有证据表明是一种极具潜力的有效疗法。但是,治疗性T细胞生产周期较长,如果想获得足以消灭靶细胞所需的T细胞数量通常需要花费数周。哈佛大学Wyss生物工程研究所生物启发工程(Biologically Inspired Engineering)David Mooney和工程与应用科学学院(SEAS)的John A. Paulson课题组在《Nature Biotechnology》发表文章,介绍了一种简单易行的T细胞新扩增方法,可增速2至10倍,并证明该方法生产的嵌合抗原受体表达T细胞(chimeric antigen rece
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减脂新方法:光照
生物通报道 皮下白色脂肪组织(subcutaneous white adipose tissue,scWAT)是人体的主要脂肪,是调节全身代谢的关键成员。“当太阳光中的蓝光(波长400-500纳米左右的可见光)穿透我们的皮肤,到达下方的脂肪细胞时,脂肪滴的体积就会减少,而且还会被细胞释放出来。换句话说,蓝光照射能让我们的细胞不至于储存过多油脂,”这篇最新《Scientific Reports》文章的通讯作者、艾伯塔大学糖尿病研究所所长、药理学教授Peter Light说。“这项研究结果证明了一个现象,北方人在一年中有8个月都日照不足,这种情况可能会促进人体脂肪储存,导致‘秋冬季长膘’现象,”他
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香港理工大学发表前沿技术:快速鉴别中药真伪
生物通报道:来自Eurealert的消息,香港理工大学应用生物及化学科技学系的研究人员发表了题为“Rapid Differentiation of Ganoderma Species by Direct Ionization Mass Spectrometry”的文章,研发了快速鉴别中药材真伪的新方法,并应用于灵芝和天麻的鉴定。该方法简单、快速,仅需约十分钟即可鉴定一个药材样品的真伪,区分野生还是人工培植种类以及不同产地。该方法亦可用于鉴定其他中药材。这一研究成果公布在分析科学前沿杂志Analytica Chimica Acta上,由姚钟平博士研究组完成。姚钟平博士主要研究方向为建立传统中药、
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赛默飞推出最新下一代基因测序仪Ion GeneStudio S5系列
与Illumina达成协议推动科研领域更广泛使用Ion AmpliSeq技术
2018年1月12日,上海——近日,科学服务领域的世界领导者赛默飞世尔科技(以下简称:赛默飞)宣布推出最新系列桌上型下一代基因测序仪Ion GeneStudio S5 Series,配套包括最新的Ion 550的5款芯片。同时,赛默飞也于近日宣布与Illumina公司(NASDAQ:ILMN)达成协议,授权Illumina销售Ion AmpliSeq产品给Illumina下一代测序平台(以下简称:NGS)的科研客户。赛默飞新推出的Ion GeneStudio S5 Series能够为研究人员提供更多的灵活性和通量选择,实现在同一平台上开展广泛的实验研究,特别是在包括肿瘤研究、遗传病、微生物及感