• TomoPicker：基于正未标记学习的冷冻电子断层扫描大分子定位方法实现高标注效率

  在结构生物学领域，冷冻电子断层扫描(cryo-electron tomography, cryo-ET)技术能够以接近原生状态的分辨率可视化细胞内部大分子的三维结构，为揭示生命活动的分子机制提供了强大工具。然而，从拥挤的细胞环境中精准定位目标大分子（如核糖体）仍是重大挑战。传统模板匹配方法存在模板依赖性偏差且计算效率低，而基于深度学习的方法虽能实现高通量定位，却依赖大量人工标注数据——这对信号噪声比低、体积庞大的细胞断层扫描图像而言极为耗时。现有学习型方法如DeepETPicker在标注稀疏时性能显著下降，且多局限于稀疏单粒子或原核细胞场景，难以应对高度拥挤的真核细胞环境。为突破这一瓶颈，研究

  来源：Briefings in Bioinformatics

  时间：2025-11-29

• 肠杆菌（Enterobacter cloacae）SLD1a-1中硒酸盐还原酶的基因鉴定

  本研究聚焦于解耦菌属（Enterobacter）中硒酸盐还原酶系统的分子机制与环境功能。通过基因组测序与功能验证发现，解耦菌E. cloacae SLD1a-1携带一个包含四个基因的串联序列srnABCD，该基因簇编码一种膜结合的三聚体硒酸盐还原酶复合体。研究团队通过基因敲除实验证实srnA是催化亚基，其缺失导致菌株丧失硒酸盐还原能力，而通过同源重组技术将srnA成功导入缺陷型大肠杆菌ΔynfEF中，成功恢复硒酸盐还原活性，这表明该基因具有跨物种的功能保守性。在基因簇结构分析中，srnA编码的蛋白含有信号肽，经TAT转运系统分泌至膜腔，与srnB（铁硫蛋白亚基）和srnC（膜锚定亚基）形成异源

  来源：Applied and Environmental Microbiology

  时间：2025-11-29

• 尽管饮食会改变蟑螂肠道内的微生物群，但它对沙门氏菌（Salmonella Typhimurium）感染的影响却微乎其微

  德国小蠊的饮食对其沙门氏菌载体能力的影响研究摘要部分揭示了该研究的核心问题：德国小蠊的饮食结构是否影响其携带和传播沙门氏菌的能力。研究通过构建三种营养配比不同的合成饲料，发现尽管不同饮食显著改变了肠道菌群组成和多样性，但并未对沙门氏菌的体内定植和排泄产生实质性影响。这一发现挑战了传统认知中饮食与病原传播的关联性，为后续研究提供了重要参考。引言部分系统阐述了德国小蠊作为重要卫生害虫的生物学特性。该物种作为杂食性昆虫，其独特的肠道菌群结构使其成为多种病原体的潜在载体。研究团队特别关注了膳食中三大营养素比例对载体能力的影响，这在现有的昆虫传播机制研究中尚未得到充分验证。实验设计包含三个关键模块：1）

  来源：Applied and Environmental Microbiology

  时间：2025-11-29

• 关于趋磁性阿尔法变形菌（Alphaproteobacteria）中磁小体生物矿化过程的系统发育学和基因组学见解

  磁细菌基因簇进化与磁粒形态关联性研究解读磁细菌作为研究生物矿化与古环境的重要模型生物，其磁粒形态的遗传调控机制及进化路径长期存在争议。本研究通过宏基因组测序与形态学联合分析，首次在温带湖泊中发现五个未培养磁细菌物种，并构建了包含3.36 Mb高质量基因组的YYTV-2新物种。研究揭示了磁粒形态的进化特征与宿主菌系统发育的强关联性，同时发现水平基因转移与基因复制在磁粒基因簇演化中的关键作用。一、研究体系构建1. 样本采集：2022年4月在北京鱼眼潭湖采集表层沉积物，环境参数显示为弱氧化环境（pH 7.25，溶解氧0.3‰）2. 分离纯化：采用改进的毛细管磁分离技术，成功分离出5个OTU（操作分类

  来源：Applied and Environmental Microbiology

  时间：2025-11-29

• 通过蛋白质组学方法揭示了Onygena corvina中角蛋白降解的蛋白水解和非蛋白水解机制

  角蛋白降解的微生物机制与工艺优化研究进展角蛋白作为动物硬组织的主要成分，广泛存在于羽毛、羊毛、蹄甲等工业副产品中。这类生物质的强抗降解性给可持续资源化利用带来挑战。近年来，微生物降解技术因其环境友好和资源高效的特点备受关注，其中真菌属Onygena corvina因其独特的角蛋白分解能力成为研究热点。本研究通过基因组与蛋白质组联合分析，系统揭示了该真菌的角蛋白降解机制，为生物基材料开发提供了新思路。### 一、研究背景与意义角蛋白的化学稳定性源于其独特的超螺旋结构、二硫键网络及翻译后修饰体系。传统热化学处理能耗高且产生有毒副产物，而微生物降解具有定向性和环保优势。研究显示，全球每年产生超过30

  来源：Applied and Environmental Microbiology

  时间：2025-11-29

• 储存条件对白色念珠菌释放的细胞外囊泡的稳定性及其保护作用的影响

  本研究围绕白念珠菌（*Candida albicans*）外泌体（EVs）的稳定性、分离方法优化及其生物功能评估展开系统分析，旨在为EVs作为疫苗开发提供科学依据。研究团队通过对比不同分离技术、存储条件及冻融处理对EVs物理形态与生物活性的影响，揭示了EVs在长期存储和不同处理条件下的稳定性规律，并建立了基于蛋白与固醇比率的质控标准。### 一、研究背景与意义外泌体作为细胞分泌的纳米级囊泡，在传递遗传物质、调控细胞间通信及介导病原体感染过程中发挥重要作用。白念珠菌EVs因其携带多种抗原成分（如脂肪酸、萜类等），已被证实可激活宿主免疫应答并保护动物模型（如蜡蛾幼虫）免受致命性感染。然而，EVs的

  来源：Applied and Environmental Microbiology

  时间：2025-11-29

• 雨季（高流量事件）期间平原河流网络中细菌浮游生物群落的变化及其驱动因素：利用MIKE11模型对水位进行模拟

  在气候变化与人类活动双重压力下，河流生态系统正面临前所未有的挑战。本研究聚焦太湖平原河流网络，通过整合环境因子、水文模型与微生物组学方法，系统解析了梅雨季节前后细菌群落结构、功能模块及驱动机制的变化。研究发现，该区域细菌群落呈现显著时空异质性，且受水化学参数主导，为揭示人水耦合系统中微生物适应性机制提供了新视角。**研究背景与科学问题** 平原河流网络作为城市水代谢的核心通道，其生态响应机制尚未完全明晰。已有研究证实，人类活动通过改变土地利用和水文条件，导致微生物群落网络复杂度下降，但季节性水文波动（如梅雨期高强度径流）对细菌群落动态的调控机制尚存空白。本研究创新性地将MIKE11水文模型与

  来源：Applied and Environmental Microbiology

  时间：2025-11-29

• 研究选定硝基化合物对甲烷产生、瘤胃发酵以及体外甲烷生成古菌的抗甲烷生成作用

  ### 研究背景与意义 甲烷（CH₄）作为温室气体，其全球变暖潜能值是二氧化碳（CO₂）的28倍以上，反刍动物肠道发酵产生的甲烷排放占全球农业源温室气体排放的22%。尽管甲烷合成对反刍动物能量代谢至关重要，但其过量排放不仅加剧气候变化，还会导致动物能量损失（每日2%-12%的净能量摄入）。传统减排手段如饲料添加剂或管理优化效果有限，而硝基化合物（NC）因其强效抑制特性受到关注。现有研究多聚焦于单一化合物（如3-硝基氧丙烷），但缺乏对多种硝基化合物（如乙基硝roacetate, ENA；乙基2-硝ropropionate, ENP；硝酸盐, NO₃⁻）的系统性比较，尤其是剂量-时间动态交互作用

  来源：Applied and Environmental Microbiology

  时间：2025-11-29

• 综述：智能与自主温室系统的进展：物联网、人工智能和机器人技术整合的全面综述

  近年来，随着全球人口增长和气候变化加剧，传统农业模式面临严峻挑战。智能温室技术作为应对策略，通过整合物联网（IoT）、机器学习（ML）与深度学习（DL）以及机器人系统，显著提升了资源利用效率和作物产量。以下从技术发展、应用场景及现存问题三个维度进行系统分析。### 一、智能温室技术体系的发展脉络传统温室依赖人工管理，存在响应滞后和效率低下问题。2010年代初期，物联网技术开始应用于温室环境监测，通过无线传感器网络实现温度、湿度等基础参数的远程采集。2018年后，随着边缘计算和云计算的成熟，系统开始向"感知-分析-决策"闭环演进。2020年至今，深度学习算法的突破性进展推动技术进入新阶段，如YO

  来源：Smart Agricultural Technology

  时间：2025-11-29

• 绿色革命中降低株高的基因（Rht）并未增加近乎同源的小麦品系中的淀粉酶/胰蛋白酶抑制剂含量

  小麦矮秆基因（Rht）对ATI含量的影响研究摘要解读本研究通过分析四种小麦品种的近等基因系（NILs），系统评估了不同Rht基因组合对ATI（淀粉酶/蛋白酶抑制剂）含量的影响。实验采用液相色谱-串联质谱联用技术（LC-MS/MS），在2020-2023年连续三年开展田间试验，每个品种设置三个生物学重复，每个重复包含三次技术重复，确保数据可靠性。研究发现，绝对ATI总量在所有基因型间无显著差异，但ATI占粗蛋白比例在极端矮秆Rht2+3基因型中显著降低（-12%至-26%）。值得注意的是，半矮秆Rht1和Rht2基因型并未引起ATI含量的明显变化，这与传统认知中矮秆基因可能影响蛋白质代谢的假设相

  来源：Journal of Cereal Science

  时间：2025-11-29

• 优化全基因组范围内的纯合子区域检测：参考基因组质量及测序参数对近交评估的影响

  本研究聚焦于基因组同源段（Run of Homozygosity, ROH）检测在濒危物种近交评估中的应用，通过模拟数据与真实基因组数据的综合分析，系统探讨了测序深度、参考基因组连续性及物种间遗传距离对ROH检测的影响，并提出了优化参数建议。以下从研究背景、方法设计、核心发现与实际意义三个层面展开解读。### 一、研究背景与科学问题濒危物种常因栖息地破碎化导致种群隔离，近交衰退现象威胁种群存续。基因组同源段（ROH）作为近交的分子标记，其检测精度直接影响近交系数（FROH）的评估可靠性。然而，现有ROH检测方法面临两大挑战：其一，参考基因组连续性不足（如短读组装导致的重复断裂）可能错误分割长R

  来源：Molecular Ecology Resources

  时间：2025-11-29

• 腐烂的云杉木材作为土壤碳和能量在微生物群落中流动的一个因素

  森林枯木在碳循环与微生物功能中的作用研究——以波兰Babia Gora Massif为例（总字数：约2100字）1. 研究背景与科学价值气候变化对森林生态系统的影响日益显著，其中枯木分解过程及其对土壤系统的重塑作用受到学界广泛关注。枯木作为森林生态系统的重要组成，不仅为微生物提供分解底物，更在碳封存、养分循环和生物多样性维持中发挥关键作用。本研究聚焦中欧典型山地云杉林生态系统，通过解析不同海拔梯度枯木分解对土壤理化性质、酶活性及微生物群落结构的影响，揭示了枯木在碳氮循环中的独特机制。相较于前人关于阔叶树（如山毛榉）的研究（Błońska et al., 2024），本研究首次系统比较了针叶树（

  来源：Environmental Microbiology Reports

  时间：2025-11-29

• 环境条件的变化对不同苹果果实组织中的细菌微生物群落具有差异性影响

  摘要 苹果作为重要的经济作物，其产量和品质受多种因素影响，尤其是真菌病害导致的高额损失。近年来，植物微生物组调控成为替代化学杀菌剂的研究热点。本研究聚焦于加拿大大西洋沿海生态区的‘Honeycrisp’苹果，通过两年生长季的对比实验，系统分析管理方式（有机vs.常规）、环境条件（如降水）和果肉组织（核心与果皮）对苹果细菌群落结构、多样性和功能的影响。研究发现：1）核心与果皮微生物群存在显著差异，核心菌群α多样性较低但稳定性更强；2）有机管理显著提升核心菌群多样性，而常规管理对果皮菌群多样性影响相反；3）环境降水变化主要影响果皮菌群结构，核心菌群受环境波动较小；4）微生物互作网络分析揭示，核心

  来源：Environmental Microbiology Reports

  时间：2025-11-29

• 中国江苏油库岩芯中的微生物群落组成与功能

  该研究针对中国江苏油场HY1-1和HY7两处页岩油储层展开系统调查，重点解析了储层中微生物群落的结构特征及其代谢功能，为深层页岩油开发中的微生物调控提供了科学依据。以下是研究内容的详细解读：一、储层环境特征与微生物生存条件研究团队通过X射线荧光光谱(XRF)发现，储层岩石中富含硅、铝、铁、硫等元素，其中硅含量占比最高达60%，铝、铁、硫等金属元素含量显著。扫描电镜(SEM)观察显示，HY1-1和HY7储层岩石表面孔隙结构差异明显：HY1-1岩石表面呈现均匀孔隙分布，而HY7存在大面积无孔区域。值得注意的是，两样本中超过70%的孔隙直径大于1微米，其中25%-30%的孔隙分布在1-2微米区间，表

  来源：Environmental Microbiology Reports

  时间：2025-11-29

• 综述：生物炭及其基复合材料的电化学和生物传感应用

  生物炭基纳米复合材料在电化学传感器与生物传感器中的创新应用与发展1. 生物炭在电化学传感领域的核心优势生物炭作为新兴的纳米结构材料，凭借其独特的物理化学特性，正在成为电化学传感器研发的重要载体。这种由生物质热解产生的碳材料具有高达1000 m²/g的比表面积，丰富的含氧官能团（如羧基、羟基、酮基等），以及优异的导电性（10⁻³-10⁻² S/cm）。这些特性使其能够有效吸附目标分子，形成稳定的电荷转移界面，从而提升传感器的灵敏度和选择性。例如，纳米生物炭通过机械研磨可将粒径降至50-100 nm，同时保留多级孔结构，使表面活性位点密度提升2-3倍。2. 纳米生物炭的绿色制备技术当前生物炭制备主

  来源：Frontiers in Sensors

  时间：2025-11-29

• 误入歧途的恢复实践如何威胁巴西塞拉多生态系统的生物多样性与服务功能

  在巴西广袤的内陆，孕育着世界上生物多样性最丰富的热带稀树草原——塞拉多（Cerrado）。然而，这片被誉为“地球粮仓”的独特生态系统，正以惊人的速度被转变为大豆田、甘蔗园和桉树林。更令人担忧的是，旨在修复其生态损伤的恢复行动，却因根深蒂固的误解而常常南辕北辙，甚至加速了其独特生物多样性和关键生态系统服务的丧失。问题的核心在于一个普遍的认知错误：全球许多政策制定者、甚至部分科学家，仍将像塞拉多这样的热带稀树草原和草地视为退化的森林，认为恢复它们就意味着“多种树”。这导致了从“波恩挑战”（Bonn Challenge）到“万亿棵树计划”等全球性倡议，都错误地将植树造林作为应对这些地区环境退化的万能

  来源：Annals of Botany

  时间：2025-11-29

• GABA（γ-氨基丁酸）调节的转氨作用为小麦在水淹胁迫条件下的根系氮同化提供了另一种碳骨架来源

  本研究聚焦于淹水条件下小麦品种AK58（耐淹性差）与XM25（耐淹性强）的碳氮代谢互作机制，通过盆栽实验结合酶活性分析、代谢组学及同位素示踪技术，揭示了淹水胁迫对氮代谢的抑制效应及其调控机制。研究发现，淹水导致小麦根系α-酮戊二酸（TCA循环关键中间体）合成受阻，进而影响氮同化关键酶谷氨酰胺合成酶（GS）和谷氨酸合成酶（GOGAT）的活性，最终造成地上部氮素积累减少。耐淹品种XM25通过激活丙氨酸转氨酶（GPT）和丙酮酸激酶（PK）构成的代谢途径，将丙氨酸碳骨架转化为α-酮戊二酸，有效弥补了TCA循环的碳源缺失，从而维持了根系氮同化能力。这一发现为解析植物适应淹水胁迫的代谢调控网络提供了新视角

  来源：Environmental and Experimental Botany

  时间：2025-11-29

• 中国珠江三角洲梧州市集中式饮用水源地下水中重金属的来源分析及其对健康风险的季节性影响

  该研究针对中国珠三角地区Wuzhou City的集中式饮用水水源地地下水重金属污染问题，通过多维度分析揭示了污染特征、来源及健康风险，并提出针对性管理建议。研究历时两年，覆盖2024年雨季和旱季共198个采样点，结合水文地质条件与污染源解析技术，建立了"污染特征-来源解析-健康风险"的系统性评估框架，为类似区域的水资源管理提供了科学依据。一、区域水文地质特征与污染背景研究区域位于南亚热带季风气候区，地质构造以喀斯特地貌为主，发育第四纪冲积层和基岩裂隙水系统。区域内地层分布以寒武系砂页岩、泥岩为主，侵入岩体富含锰、铁等金属元素。水文地质条件显示地下水主要受大气降水补给，径流方向由高向低垂直分布，

  来源：Environmental Chemistry and Ecotoxicology

  时间：2025-11-29

• 野火扰动下兴安落叶松林土壤微生物群落结构、网络与构建过程的响应机制

  在全球气候变化加剧的背景下，森林生态系统正面临着日益频繁的野火威胁。作为北方森林的重要组成部分，兴安落叶松林在维持高纬度地区生态平衡中发挥着关键作用。土壤微生物作为森林生态系统的"隐形工程师"，通过参与生物地球化学循环、促进植物养分吸收等过程，维持着生态系统的稳定运行。然而，野火这一自然干扰因子如何影响土壤微生物的群落结构、种间互作关系及其组装机制，仍是当前生态学研究的重要课题。以往研究多集中于火灾对微生物分类组成的影响，而对微生物网络结构、功能角色及群落组装过程的认知仍存在明显不足。特别是对于中国唯一高纬度多年冻土区的兴安落叶松林而言，明确野火干扰下土壤微生物的响应规律，对理解寒温带森林生态

  来源：Journal of Plant Ecology

  时间：2025-11-29

• 从污染物到土壤改良剂：橄榄榨汁厂废料的植物毒性分析及物理化学特性研究，以实现农业的可持续利用

  橄榄油加工副产物资源化利用的生态风险与农业价值研究一、研究背景与意义 olive产业作为地中海地区重要的经济支柱，年产量占全球90%以上。其加工过程产生两大主要副产物：含水量高达95%的 olive mill wastewater（OMWW）和含油量3-5%的 olive mill solid waste（OMSW）。据估算，全球每年产生超过20亿吨固体废物和30亿立方米液体废水，传统填埋处理方式导致土壤酸化、水体富营养化等环境问题日益突出。当前研究多聚焦于单一废弃物的处理技术，而针对不同处理工艺（两相/三相离心）下副产物综合特性的系统性研究仍存在空白。二、材料与方法体系研究团队在突尼斯苏塞地

  来源：Bioresource Technology Reports

  时间：2025-11-29

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