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华大最新《Nature》封面文章 土豆基因组图谱

       2011年7月10日,由中国华大基因研究所为首的29家中外科研机构联合在国际著名杂志《自然》(Nature)上在线发表了题为“块茎作物马铃薯的基因组测序及分析”( Genome sequence and analysis of the tuber crop potato)的研究论文,新研究为马铃薯的遗传学研究及分子育种提供了非常有价值的资源。

       马铃薯是世界上四大作物之一,也是最重要的蔬菜作物。破译马铃薯基因组序列对帮助科学家们从分子水平上了解马铃薯的生长、发育及繁殖过程,以及改良和提高马铃薯的品种产量、品质和抗病性具有重要的意义。
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     华大基因最新研究进展 


基因组研究为攻克香港猩红热疫情提供线索
6月24日,香港大学、深圳华大基因研究院和军事医学科学院微生物流行病研究所今日发布对香港猩红热致病菌株的最新研究进展,发现一种重要的毒力因子及多种抗生素的抗性基因。

德国爆发大肠杆菌已发现8种抗生素的抗性基因
6月4日,深圳华大基因研究院、德国汉堡大学医学院、中国疾病预防与控制中心和军事医学科学院微生物流行病研究所发布了对德国爆发的大肠杆菌的最新研究进展,已发现8种抗生素的抗性基因。

切叶蚁基因组揭示社会行为与共生关系的进化事件
来自丹麦哥本哈根大学、深圳华大基因研究院的国际研究小组共同主导完成了切叶蚁Acromyrmex echinatior的基因组测序与分析工作。通过与其它已知蚂蚁基因序列比较及分析发现一些特定基因与切叶蚁社会行为及共生方式具有重要的关系,此成果为社会行为学等研究奠定了重要的遗传学基础,并使人们对切叶蚁这种特殊的生物有了更进一步的认识与了解。

“千种单基因病计划”再获新进展外显子测序揭示ZNF644基因突变可能导致高度近视
2011年6月9日,四川省人民医院杨正林教授科研团队与深圳华大基因研究院共同在国际知名期刊《PLoS Genetics》上发表合作研究成果——《通过外显子测序技术鉴定高度近视患者的ZNF644基因突变》。这是我国科学家利用外显子测序技术进行单基因病致病基因研究的又一项重要成果,将为近视相关的医学研究奠定重要的生物学基础。

世界首个鹅全基因组序列图谱绘制完成
2011年6月3日,浙江省农业科学院、象山县浙东白鹅研究所和华大基因在宁波市象山四季佳利酒店召开新闻发布会,宣布“鹅全基因组序列图谱绘制完成”。这是我国独立研究完成的全世界首个鹅全基因组序列图谱。

华大基因和GT公司共同宣布首个中国仓鼠卵巢细胞系基因组测序完成
011年6月12日,毅新兴业公司技术总监、英国Sanger中心学者张玉军博士作为共同作者在《Nature Genetics》上发表了使用高通量测序进行进化基因组学研究的最新成果。文章报道了不同人类家庭间存在基因突变模式差异的现象。该研究发现,平均每人从双亲遗传获得大约60种新的突变,这远远超出了之前科学家的预测,引起生物学界的极大轰动。


     千人基因组计划 


千人基因组计划的最新研究成果
英国遗传学家霍尔丹曾提出,男性生殖细胞系可能比女性生殖细胞系更容易突变。而千人基因组计划的成员利用新兴技术,首次直接比较了男性和女性的生殖细胞系突变率,认为生殖细胞系的de novo突变率要比之前意识到的变化更大。该项研究成果发表在6月12日的《Nature Genetics》在线版上。

特种兵团负责人罗锐邦解析千人基因组计划
2010年最受瞩目的基因组项目当属“千人基因组”计划首个发表的研究成果——发表在Nature封面上,而且在这项成果中,我们可以看到中国科学家作出的杰出贡献。

《Nature》特写:千人基因组计划
十年前,用两个指头就能计算完已经测序的人类基因组数目,去年,数完两只手上所有的指头才统计完这一数目,而今天人类基因组测序的面貌已经焕然一新了。《Nature》杂志以“Human genome: Genomes by the thousand”为题,对近期“千人基因组”计划的成果进行了特写报道。

华大基因:国际千人基因组计划又取得重大突破
由中国深圳华大基因研究院(BGI-Shenzhen),英国桑格(Sanger)研究所,美国国立人类基因组研究所(NHGRI)等共同发起并主导的“国际千人基因组计划”协作组完成了几乎覆盖全人类基因组的遗传多态性图谱,该研究成果于28日发表在国际顶尖杂志《自然》上,这是全球科学家在人类基因组学领域取得的又一次重大突破。

Nature:中国科学家参与的千人基因组计划
最新出版的Nature杂志的封面是“千人基因组”计划的最新研究成果,这也是这一计划自两年前(2008年)启动后的首次发表的成果,在这一成果中,我们可以看到中国科学家作出的贡献。


 

     国外基因组研究新成果 


韩国人基因组研究最新成果
韩国首尔大学领导的研究小组近日在《Nature Genetics》杂志上发表了一篇文章,介绍了他们对韩国人基因组、外显子组和转录组的研究成果。研究人员测序了10个全基因组、8个外显子组和17个转录组,鉴定出数百万个SNP,其中很多都未曾报道过。

Nature重要突破:癌症基因组新成果
在最新出版的Nature杂志上,TCGA计划研究组成员报告了卵巢癌的最新研究成果:浆液性卵巢囊腺癌(serous ovarian adenocarcinoma)中的mRNA和miRNA表达分析,启动子甲基化,DNA拷贝数,以及316个样品中编码基因外显子组的序列分析等。

《Nature Genetics》揭示人群间新突变产生速度和模式的差异
2011年6月12日,毅新兴业公司技术总监、英国Sanger中心学者张玉军博士作为共同作者在《Nature Genetics》上发表了使用高通量测序进行进化基因组学研究的最新成果。文章报道了不同人类家庭间存在基因突变模式差异的现象。该研究发现,平均每人从双亲遗传获得大约60种新的突变,这远远超出了之前科学家的预测,引起生物学界的极大轰动。

多名研究人员Nature破解常见白血病基因组
西班牙奥维耶多大学(Universidad de Oviedo),英国桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)组建了多达60多名研究人员的研究组采用最新测序技术,破译慢性淋巴细胞白血病(Chronic lymphocytic leukaemia,CLL)的基因组,并找到了4个关键的基因。这对于这种疾病的诊断和治疗具有积极的意义。这一研究成果公布在Nature杂志上。

Nature新闻:新一代测序使一对双胞胎受益
来自Nature官网新闻的报道,新一代基因组测序帮助医生为一对患有儿童罕见性疾病的双胞胎制定了有效的治疗策略。这一案例再次验证了基因组测序在临床上的广阔应用前景,并为科学家们在未来精确解析罕见性疾病的遗传根源带来了新希望。

 

     测序新技术 


罗氏诊断中国应用科学部的过去、现在与未来
在罗氏诊断中国应用科学部总监郭伟立先生就应用科学部的过去、现在与未来做精彩的介绍后,编者有幸采访了郭先生,其中多个观点编者很想在第一时间和大家分享。拥有测序读长最长的454何时能把读长进一步提升至800bp?罗氏诊断将如何帮助科学家们去面对基因组测序后的海量数据?罗氏诊断中国应用科学部是如何在过去的5年实现5倍的业绩增长的?它带给我们科学家的服务提升又是什么呢?2011年度最值得向读者推荐的创新新技术是什么?

基于单分子测序仪的基因表达分析新技术
日本横滨市RIKEN Omics科学中心(RIKEN Omics Science Center)的研究人员开发出一种新的基因表达分析技术,只需100 ng总RNA,就能准确定量地测定基因表达水平。

Nature子刊:追踪RNA动态的新方法
近日来自美国哈佛-麻省理工博德研究所的科学家们开发了一种具有高分辨率及广泛适用特性的新技术用于追踪细胞内的RNA动态。研究人员称这项新技术为科学家们了解那些必需RNA分子的生命过程开启了多个新窗口,并将帮助他们了解细胞中的异常分子事件。

第三代基因组测序仪实现单分子速读
在美国佛罗里达州马可岛召开的“基因组生物学与技术进展大会”上,来自加利福尼亚门洛帕克市的太平洋生物科技公司介绍了其研制的第三代基因组测序仪,该测序仪实现了一次标记一个分子式的单分子速读。

第三代DNA测序技术新突破
来自美国华盛顿大学等处的研究人员利用纳米生物学技术获得了新一代测序技术的突破,这种新方法能为癌症、糖尿病或某些成瘾患者量身绘制个性化基因测序蓝图,提供更加高效的个体医疗。这一研究成果公布在PNAS杂志上。




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