测序牛人发布蛋白单分子测序技术 美国亚利桑纳州立大学Biodesign研究所的Stuart Lindsay及其同事,在纳米孔DNA测序技术的基础上,开发了能够精确鉴定氨基酸的蛋白单分子测序技术。这一技术不仅可以用来在临床上测序蛋白质和检测新生物指标,还有望给医疗领域带来彻底的改变,在单分子水平上精确监控患者对治疗的应答情况。
Nature子刊:基于纳米孔的新甲基化检测技术 Mayo诊所与Illinois大学的研究人员合作,开发出了一种检测甲基化DNA的新单分子检测技术,这种技术以固态的纳米孔为基础。文章发表在Nature旗下的Scientific Reports杂志上。 基于纳米孔的单分子蛋白检测技术 就在全世界对Oxford Nanopore的迷你MinION测序仪翘首盼望之时,该公司的创始人Hagan Bayley又宣布了纳米孔(nanopore)技术的蛋白质组应用。这项成果发表在《Nature Biotechnology》杂志上。 两篇PNAS:蛋白纳米孔检测DNA甲基化 两个独立的研究团队利用通道蛋白实现纳米孔测序,成功鉴别了5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶。这两篇文章发表在同一期的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 $1000的蛋白质组测序还有多远? $1000的基因组测序,在过去似乎是远在天边,如今已经近在眼前了。那么,蛋白质组呢?蛋白质承担着生物体内的关键作用,如生长发育、催化化学反应、参与运输、抵御病原体等。这些表达的蛋白质,能为我们带来更多的健康和疾病信息。那么,$1000的蛋白质组测序呢?目前看来仍是mission impossible。
Oxford Nanopore与Illumina断绝关系 Oxford Nanopore Technologies公司(以下简称Oxford)昨日在其年度报告中表示,它与Illumina公司签订的商业化协议将于2016年6月30日终止。两年前,Illumina就2009年1月与Oxford签订的协议条款提出仲裁要求,而如今的这一决定与此有关。 纳米孔测序仪将启动早期试用计划 英国Oxford Nanopore Technologies公司在沉寂了一年之后,终于有新消息宣布了。近日,该公司亮相美国人类遗传学协会的年会(ASHG),宣布将在11月底启动MinION测序仪的早期试用计划。 纳米孔测序仪开放试用 公布部分参数 MinION试用计划于本周一(11月25日)启动,将延续到2014年初,具体截止日期未定。根据这项试用计划,参与者须支付1,000美元的押金以及运费,而后将收到一台MinION测序仪,包括测序USB装置、流动槽和软件。 纳米孔测序仪的数据首次公布 自英国Oxford Nanopore公司在去年11月启动MinION测序仪的早期试用计划以来,人们一直就在盼望着MinION的数据。上周,在基因组生物学技术进展大会(AGBT 2014)上,有关MinION的首个数据终于出炉。
眼见为实的电镜测序技术 此前科学家们曾提出,基于电子显微镜的第三代DNA测序技术将能够得到超常的读长。今年有两项研究分别展示了这一理论的实用性,使电镜测序成为来年备受期待的新测序方法。 诺奖得主谈单分子实时测序的优势 Pacific Biosciences的单分子实时测序技术(SMRT)因其出色的读长而引人注目。然而,因通量较低,且一直被错误率高的流言所困扰,SMRT技术似乎有些被忽视。近日,几位著名科学家在《Genome Biology》杂志上发表文章,试图消除这些误解,为SMRT正名。 Nature解读:千元基因组真的来了? 一月十四日Illumina的CEO Jay Flatley宣布,该公司将推出新系统HiSeq X Ten,该系统“只需$1,000就可完成全覆盖的人类基因组测序”。Nature网站特别发文,帮你解读即将到来的千元基因组时代。 二代测序,新年新总结 自从哈佛大学遗传学家George Church和454 Life Sciences公司Jonathan Rothberg掀起二代测序NGS的革命以来,已经过去了将近十年。毫不夸张地说,这段时间以来NGS技术已经发生了翻天覆地的变化,在测序通量突飞猛进的同时,测序成本直线下降。