• 禾谷镰刀菌GPCR FfGpr1-Gα-AC信号转导通路解析及其对赤霉素生物合成的调控机制

  这项研究深入解析了禾谷镰刀菌(Fusarium fujikuroi)中G蛋白偶联受体(GPCR) FfGpr1与Gα亚基FfG2组成的信号转导网络。通过双分子荧光互补技术(BiFC)首次捕捉到FfGpr1-FfG2和FfG2-腺苷酸环化酶(AC)在细胞膜上的动态互作，特别在隔膜部位呈现更强的荧光共定位。基因编辑实验显示，缺失Ffgpr1会完全阻断葡萄糖诱导的cAMP合成，而组成型激活突变体FfG2Q204 L则显著增强该通路活性。在赤霉素代谢调控方面，研究团队观察到有趣的双向调节现象：Ffgpr1缺失突变体使GA3产量降低21%，但意外激活了赤霉素合成基因簇中FfCPS/KS、FfP450-2

  来源：Journal of Applied Microbiology

  时间：2025-07-30

• 神圣莲花中萜烯合酶的系统鉴定及杀虫抗菌化合物γ-桉叶醇的异源生物合成研究

  在植物与环境的长期协同进化过程中，萜类化合物作为重要的次生代谢产物，不仅构成了植物精油的主要成分，更在生态防御和种间通讯中扮演关键角色。神圣莲花作为古老的被子植物活化石，其精油中含有丰富的萜类成分，其中γ-桉叶醇(γ-eudesmol)尤为突出，具有潜在的药用价值。然而，受限于植物体内含量低、提取困难等问题，γ-桉叶醇的生物活性研究和应用开发长期受阻，其生物合成机制更是未解之谜。武汉大学中南医院泌尿外科、湖北省基础生物科学研究中心的科研团队在《Horticulture Research》发表重要成果，通过系统鉴定神圣莲花萜烯合酶基因家族，成功解析了γ-桉叶醇的生物合成途径，并实现其高效微生物合

  来源：Horticulture Research

  时间：2025-07-30

• 梅花鹿诱导多能干细胞系的成功建立

  在这项突破性研究中，科研人员从梅花鹿(Cervus nippon)胎儿成纤维细胞(SDFs)出发，运用包含OCT4、SOX2、c-MYC、KLF4等9个核心转录因子的"鸡尾酒"组合，成功诱导出具有完整多能性特征的梅花鹿诱导多能干细胞(SD-iPSCs)。这些细胞不仅高表达NANOG等关键多能性标志物，在畸胎瘤实验中更展现出分化为三胚层组织的强大潜力。研究团队意外发现，在经典mTeSR1培养基中添加Wnt/β-catenin通路抑制剂XAV939，能像"魔法配方"般显著提升SD-iPSCs的自我更新能力。更令人振奋的是，这些干细胞在模拟牛类滋养层干细胞(TSCs)的培养条件下，成功获得了CDX2

  来源：Biology of Reproduction

  时间：2025-07-30

• 整合素因子FAM27E3通过p53信号通路促进甲状腺乳头状癌淋巴结转移的机制研究

  背景甲状腺乳头状癌（PTC）占甲状腺癌90%以上，其20%-90%的淋巴结转移率构成临床重大挑战。整合素家族作为细胞外基质受体，在肿瘤转移中起关键作用。研究团队前期建立的7基因整合素风险模型中，FAM27E3（FAM-interleukin-27受体亚基3）显示出显著预后价值，但其在PTC转移中的具体机制尚未阐明。方法学创新研究整合7个GEO数据集（n=216）作为训练组，GSE60542（n=92）作为验证组。采用一致性聚类（k=2）区分PTC亚型，WGCNA分析（软阈值β=5）鉴定出128个肿瘤相关核心基因。通过LASSO回归筛选出FAM27E3作为关键转移相关因子，并建立EMT评分（76

  来源：Frontiers in Genetics

  时间：2025-07-30

• 泛素化相关基因标志物(MMP1/RNF2/TFRC/SPP1/CXCL8)在宫颈癌预后预测中的鉴定与验证

  泛素化相关基因在宫颈癌预后预测中的突破性发现1 Introduction宫颈癌(CC)作为女性生殖系统最常见恶性肿瘤，全球每年新增病例达57.7万例。尽管中国5年生存率(67.6%)优于美国(62.6%)，但约30%患者治疗后出现复发转移。泛素-泛素样(UB/UBL)修饰系统通过调控蛋白质降解、DNA损伤修复等过程参与肿瘤发生发展，但其在CC中的具体作用机制尚不明确。2 Manuscript formatting2.1 Data sources研究整合了8对自测CC组织样本与TCGA-GTEx-CESC数据库(304肿瘤/13正常样本)，筛选出465个泛素化相关基因(UBLGs)。GSE529

  来源：Frontiers in Genetics

  时间：2025-07-30

• 基于综合生物信息学与机器学习的干燥综合征外周动脉粥样硬化生物标志物探索及免疫浸润特征研究

  研究背景干燥综合征（Sjögren’s syndrome, SS）是一种以外分泌腺体损伤为主的自身免疫性疾病，而外周动脉粥样硬化（Peripheral atherosclerosis, PA）与慢性炎症密切相关。近年研究发现，SS患者动脉粥样硬化风险显著升高，但具体机制尚未明确。两者共享的病理特征包括内皮功能障碍、炎症因子释放及免疫细胞浸润，提示可能存在共同的分子调控网络。研究方法研究整合7个GEO数据集（GSE7451等），通过LIMMA包筛选差异表达基因（DEGs），结合WGCNA构建共表达网络。利用机器学习算法（支持向量机递归特征消除SVM-RFE、最小绝对收缩选择算子LASSO、随机森

  来源：Frontiers in Genetics

  时间：2025-07-30

• SLC38A1与STX11：线粒体动力学和线粒体自噬相关生物标志物在骨关节炎免疫浸润中的关键作用

  单细胞测序揭示OA相关免疫与内皮细胞亚群特征通过对GSE152805单细胞数据集的分析，研究团队从10,032个软骨组织细胞中鉴定出6种关键细胞亚群：软骨细胞、内皮细胞、巨噬细胞、单核细胞、T细胞和组织干细胞。其中，内皮细胞、单核细胞和T细胞表现出SLC38A1与STX11的高表达特征，暗示这些细胞在OA微环境中的特殊作用。细胞通讯分析进一步揭示，单核细胞通过IL-1B–IL-1R2配体-受体对实现自分泌调控，而软骨细胞则作为枢纽与其他细胞广泛互作。多组学整合锁定线粒体相关枢纽基因研究团队通过WGCNA分析GSE57218数据集，发现MEturquoise模块（2,866个基因）与线粒体功能评

  来源：Frontiers in Genetics

  时间：2025-07-30

• 黄果西洋参(Panax quinquefolius L.)端粒到端粒基因组组装揭示黄酮类生物合成机制

  吉林农业大学中药材学院的研究团队在《Horticulture Research》发表了一项突破性研究。西洋参作为传统名贵药材，其标志性活性成分人参皂苷的研究已较为深入，但决定果实颜色和药用价值的黄酮类化合物合成机制却长期成谜。更棘手的是，西洋参作为异源四倍体植物，基因组高度重复且复杂，此前发布的基因组版本存在大量缺口，严重阻碍了相关研究。为解决这一难题，研究人员选择经过连续四代自交选育的纯合黄果品种"中农洋参2号"(ZN)为材料，采用PacBio HiFi和ONT超长读长测序技术相结合的策略，辅以Hi-C染色质构象捕获技术，成功构建了首个西洋参T2T基因组。这个4.33 Gb的基因组不仅完整解

  来源：Horticulture Research

  时间：2025-07-30

• 癌症免疫治疗新视角：lncRNA与免疫检查点动态协同调控网络的构建与功能解析

  在肿瘤与免疫系统的复杂博弈中，免疫检查点(Immune Checkpoint, ICP)介导的逃逸机制已成为癌症治疗的重要靶点。尽管PD-1/PD-L1抑制剂等免疫疗法取得突破，但临床响应率不足50%的困境提示着调控网络的复杂性。近年研究发现，长度超过200nt的长链非编码RNA(lncRNA)不仅能调控肿瘤发生，还通过干扰素通路等机制影响免疫治疗效果。然而，lncRNA如何与ICP协同参与癌症进展的动态调控？这种协同关系是否具有阶段特异性？这些问题成为破解肿瘤免疫耐药机制的关键。哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院的研究团队在《Briefings in Bioinformatics》发表的研

  来源：Briefings in Bioinformatics

  时间：2025-07-30

• 转录因子FTD1介导油菜素内酯信号通路并稳定MONOCULM 1蛋白调控水稻分蘖

  在植物王国中，油菜素内酯(BRs)这类多羟基化甾醇激素犹如精准的分子开关，调控着水稻分蘖数等重要农艺性状。科学家们从fewer tillers and dwarf 1 (ftd1)突变体中抽丝剥茧，发现FTD1这个GRAS家族转录因子暗藏玄机——其C端保守的GRAS结构域竟能与分蘖核心调控因子MONOCULM 1 (MOC1)亲密互动，像 molecular glue 般阻止MOC1被26S蛋白酶体降解。更有趣的是，激酶OsGSK2会"标记"FTD1进行磷酸化修饰，为这个稳定蛋白"颁发"降解通行证。当BRs信号来临时，会巧妙抑制OsGSK2的磷酸化活动，使FTD1蛋白水平飙升，进而筑起保护MO

  来源：Plant Physiology

  时间：2025-07-30

• 基于预训练RNA语言模型的2'-O-甲基化位点预测工具2OMe-LM的开发与应用

  在RNA表观遗传学领域，2'-O-甲基化(2OMe)作为一种关键修饰，通过核糖2'羟基的甲基化参与基因表达调控、免疫识别等关键生物学过程。这种修饰的异常与地中海贫血、先天性肌营养不良等疾病密切相关。然而传统检测方法如液相色谱-质谱联用(LC/MS)和二代测序技术(Nm-seq/RiboMeth-seq)存在通量低、成本高的瓶颈，而现有计算预测工具多依赖传统序列编码方法，难以捕捉RNA修饰的复杂特征模式。针对这一挑战，中南大学计算机科学与工程学院的研究团队开发了创新性深度学习框架2OMe-LM。该研究整合来自RMBase v3.0等数据库的16,074条人类RNA样本，通过多组学数据融合构建高质

  来源：Bioinformatics

  时间：2025-07-30

• 甘蓝型油菜花色精准设计：基于类胡萝卜素、甜菜红素和花青素代谢通路的协同调控

  在观赏植物经济价值持续攀升的背景下，甘蓝型油菜作为全球第三大油料作物，其传统黄白色系花朵已无法满足观光农业的多元化需求。尽管通过远缘杂交可获得粉色、紫色等新花色，但伴随的硫苷和芥酸含量升高严重制约其食用价值。如何突破花色改良的技术瓶颈，成为油菜多功能育种的关键科学问题。中国农业科学院油料作物研究所的科研团队创新性地将动物植物界广泛分布的三大色素——类胡萝卜素（黄色）、甜菜红素（红色）和花青素（蓝色）的代谢调控网络作为突破口。研究以甜菜红素合成基因簇RUBY（包含CYP76AD1、DODA和GT三个基因）为核心元件，通过农杆菌介导的遗传转化，在甘蓝型油菜中首次构建了完整的甜菜红素合成通路。研究采

  来源：Horticulture Research

  时间：2025-07-30

• RGCN-BA：基于关系图卷积网络的单细胞RNA测序聚类与批次效应校正一体化模型

  在生命科学领域，单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术犹如一台高倍显微镜，让科学家们得以观察每个细胞的基因表达图谱。这项革命性技术虽然揭示了前所未有的细胞异质性，却也带来了两大技术难题：如何准确区分细胞类型？如何处理不同实验批次间的技术偏差？传统方法如同"分步拆解乐高积木"——先校正批次效应再执行聚类，这种割裂的处理方式往往导致生物信息丢失或引入新偏差。正是这个"先有鸡还是先有蛋"的困境，激发了上海交通大学王月月团队在《Briefings in Bioinformatics》发表创新解决方案。研究团队创造性地将关系图卷积网络(RGCN)与批次感知机制结合，开发出RGCN-BA模型。该模型的

  来源：Briefings in Bioinformatics

  时间：2025-07-30

• CAP肽段联合植物激素人工诱导跨物种昆虫瘿瘤样结构的机制研究

  在自然界中，昆虫诱导植物形成的瘿瘤堪称"延伸的表现型"典范——这些结构精巧的肿瘤样组织不仅为昆虫提供栖居空间和营养来源，其形态特征还严格遵循"建筑师"昆虫的物种特异性。然而一个世纪以来，科学家们始终被一个核心问题困扰：究竟是什么样的"分子钥匙"能让昆虫如此精准地操控植物发育程序？虽然植物激素、氨基酸和蛋白质等候选分子陆续被提出，但真正的效应分子始终未能锁定。京都府立大学(Kyoto Prefectural University)生命环境科学研究科的研究团队通过创新性的研究策略破解了这一难题。他们建立的拟南芥瘿瘤形成实验体系(Ab-GALFA)如同分子显微镜，成功捕捉到角倍蚜(S. chinen

  来源：Plant and Cell Physiology

  时间：2025-07-30

• 多组学整合分析揭示缺血性脑卒中新型遗传位点与候选基因的分子机制

  缺血性脑卒中(Ischemic Stroke, IS)作为致残和致死的主要病因，其复杂的遗传机制仍是未解之谜。尽管溶栓治疗能挽救部分脑组织，但多数患者仍面临运动障碍、认知衰退等长期后遗症。当前研究面临三大瓶颈：已知遗传位点功能阐释不足、多组学数据整合缺乏、跨平台分析工具缺失。针对这些问题，大理大学临床医学院联合内蒙古大学生命科学学院等机构的研究团队，在《Molecular Therapy Nucleic Acids》发表了突破性成果。研究通过meta分析整合62,100例IS患者和1,234,808例对照的GWAS数据，结合转录组(eQTL)、蛋白质组(pQTL)和单细胞测序技术，首次构建了从

  来源：Molecular Therapy Nucleic Acids

  时间：2025-07-30

• 新型GalNAc-siRNA药物RBD1016在HBV感染小鼠模型中实现持续HBsAg降低与血清学转换的机制研究及治疗潜力

  乙型肝炎病毒(HBV)感染如同潜伏在肝脏中的"定时炸弹"，全球近3亿慢性感染者面临肝硬化和肝癌的威胁。尽管核苷(酸)类似物(NAs)能抑制病毒复制，但年功能性治愈率不足1%，且存在基因型差异和耐药性问题。更棘手的是，长期高水平的乙肝表面抗原(HBsAg)会形成"免疫麻痹"，使机体丧失清除病毒的能力。这种困境催生了科学界对新型疗法的探索，其中靶向病毒生命周期的RNA干扰(RNAi)技术尤为引人注目。苏州瑞博生命科学有限公司的研究团队在《Molecular Therapy Nucleic Acids》发表的研究中，开发出新型GalNAc偶联siRNA药物RBD1016。该药物通过靶向HBV基因组中

  来源：Molecular Therapy Nucleic Acids

  时间：2025-07-30

• 综述：长链非编码RNA MALAT1在纤维化疾病中的关键作用

  MALAT1的生物学特性MALAT1（转移相关肺腺癌转录本1）是一种长度超过8000 nt的lncRNA，位于人类染色体11q13上，在哺乳动物中高度保守。其成熟过程涉及RNase P和RNase Z的切割，形成稳定的6.7 kb核内片段和61 nt的胞质小RNA（mascRNA）。独特的3'端三螺旋结构赋予MALAT1核酸外切酶抗性，使其半衰期长达9-16小时。生理功能与病理关联在神经发育中，MALAT1通过调控突触细胞黏附分子（如neuroligin 1）影响海马神经元突触密度。骨骼肌形成过程中，MALAT1表达与肌生成抑制素（myostatin）呈负相关，沉默MALAT1可抑制肌细胞增殖

  来源：Molecular Therapy Nucleic Acids

  时间：2025-07-30

• 外周血巨噬细胞相关标志物CCR2与TLR3：急性肾移植排斥反应的无创诊断新靶点

  摘要本研究聚焦巨噬细胞相关基因在急性肾移植排斥（AR）外周血中的诊断价值。通过整合GSE15296（训练集）和GSE46474（验证集）数据，筛选出41个差异表达巨噬细胞相关基因（DEMAGs），功能富集分析显示其显著富集于Toll样受体通路（TLR）、TNF信号通路等免疫调控相关通路。材料与方法研究采用多算法联合策略：数据挖掘：从MSigDB获取240个巨噬细胞相关基因（MAGs），与DEGs交集得到DEMAGs。Hub基因筛选：PPI网络结合机器学习（LASSO回归和随机森林）鉴定出CCR2和TLR3为核心基因。实验验证：构建大鼠肾移植AR模型（Allo组vs Syn组），血清转录组测序证

  来源：Renal Failure

  时间：2025-07-30

• 老年（≥70岁）晚期下咽鳞癌患者手术联合术后放疗的生存获益分析：一项单中心回顾性研究

  研究背景与现状在全球人口老龄化和危险因素（烟草、酒精、HPV感染）增加的背景下，头颈鳞癌（HNSCC）在≥70岁人群中的发病率显著上升。下咽癌作为预后最差的头颈部肿瘤，70-85%患者确诊时已属III-IV期。当前NCCN指南推荐手术±术后辅助治疗或根治性放化疗作为主要方案，但针对老年患者的治疗策略仍存争议。由于高龄患者常合并多种基础疾病，临床决策时往往被排除在手术适应症之外。研究方法与设计这项单中心回顾性研究纳入2006-2020年间山东省耳鼻喉医院收治的77例≥70岁III-IV期下咽鳞癌患者。所有病例均经MDT评估后接受手术治疗，其中26例仅手术（Group A），51例手术+放疗（Gr

  来源：Cancer Management and Research

  时间：2025-07-30

• 中国版爱丁堡认知行为ALS筛查量表(ECAS)教育分层常模建立及与MMSE的一致性研究

  这项开创性研究为汉语人群量身打造了认知评估的金标准。研究团队精心招募了358名健康志愿者，横跨中国不同地域，其中340人同时完成了经典迷你精神状态检查(MMSE)。受试者按年龄分为6组，按学历划分为5个梯队。数据分析揭示教育水平与爱丁堡认知行为ALS筛查量表(ECAS)得分显著相关(p < 0.001)。经严格Bonferroni校正后，初中与高中组差异消失，遂合并为中学组。研究团队据此建立了基于教育程度的ECAS诊断临界值。更令人振奋的是，在调整年龄、性别和教育因素后，ECAS总分与MMSE展现出惊人的一致性(p < 0.001)，犹如认知评估领域的双生子。这项研究不仅填补了汉语ALS患者认

  来源：Amyotrophic Lateral Sclerosis and Frontotemporal Degeneration

  时间：2025-07-30

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