• 影响激素受体阳性乳腺癌发病的环境因素：将灰尘擦拭样本中的化学特征与自我报告的暴露源相结合进行分析

  摘要背景乳腺癌是一种高发疾病。化学物质暴露可能会增加患乳腺癌的风险，然而人类接触的大多数化学物质在乳腺癌研究中的研究仍不充分。目的本研究旨在验证以下假设：在患有乳腺癌和未患乳腺癌的女性家庭中，环境中存在的化学物质的数量存在差异，并且这些化学物质的种类与参与者自我报告的暴露源有关。方法2003年至2009年间，在“姐妹研究”（Sister Study）队列的入组阶段收集了家庭灰尘擦拭样本。我们评估了其中在入组后10年内发展为激素受体阳性乳腺癌的参与者（n=40，“病例组”）以及在同一时期未患乳腺癌的参与者（n=40，“对照组”）的样本。通过液相色谱-串联质谱技术结合数据库挖掘方法对灰尘擦拭样本进

  来源：Journal of Exposure Science & Environmental Epidemiology

  时间：2025-11-22

• 白海流域不同河流中欧洲珍珠贝（Margaritifera margaritifera）的脂肪酸组成

  摘要本研究首次分析了来自俄罗斯卡累利阿共和国克姆河（河口）、乌赫塔河和沃兹马河的欧洲珍珠贝（Margaritifera margaritifera）的外套膜、足部（肌肉）和肝胰腺中的脂肪酸（FA）组成。结果显示，这些珍珠贝组织中的饱和脂肪酸和多不饱和脂肪酸含量高于单不饱和脂肪酸，这可能与产卵后的生理变化有关。在珍珠贝的肝胰腺中，多不饱和脂肪酸占主导地位，尤其是n-3系列脂肪酸；其中16:1(n-7)、18:1(n-7)、18:3(n-3)、20:5(n-3)和22:6(n-3)脂肪酸的含量较高，而16:0、18:0、18:1(n-9)、20:1(n-11)和20:4(n-6)脂肪酸的含量则较低

  来源：Doklady Biochemistry and Biophysics

  时间：2025-11-22

• 多地点粉碎策略揭示柳枝稷生物质组成的显著环境变异及其标准化处理方案

  在可再生能源研究领域，柳枝稷（Panicum virgatum L.）作为一种多年生草本植物，因其高生物量和适应性强等特点，被公认为生物燃料生产的理想原料。然而这种广泛分布于北美大陆的能源作物，其生物质细胞壁组成受到遗传背景和生长环境的双重影响，这为标准化生产带来了巨大挑战。特别是在大规模多环境试验中，不同研究机构采用的样本处理方式各异，导致近红外反射光谱分析结果难以直接比较，严重阻碍了柳枝稷品质育种工作的推进。为解决这一方法论难题，David J. Thomas领衔的研究团队在《BioEnergy Research》上发表了创新性研究成果。研究团队设计了三阶段实验方案：第一阶段比较了两种柳枝

  来源：BioEnergy Research

  时间：2025-11-22

• 极端事件期间，前期气候对生态系统生产力异常的显著影响

  摘要生态系统不仅受到当前气候的影响，还通过其对植被生长和环境条件的影响而受到过去气候的塑造。这些滞后响应被称为“记忆效应”，它们可能会加剧或缓解极端气候对生态系统功能的影响。然而，记忆效应对生态系统生产力的影响方向、强度和持续时间仍不甚清楚。在这里，我们采用基于涡度协方差数据的可解释机器学习框架来模拟1995年至2020年期间的生态系统总初级生产力，并进一步研究记忆效应对生态系统生产力正极值和负极值的影响特征。我们的结果显示，在极端气候条件下，过去的气候条件对生态系统生产力的贡献最大（占38.2%），其中降水因素占记忆效应的42.2%，其次是温度（22.1%）和蒸气压亏缺（20.8%）。由长期

  来源：Nature Geoscience

  时间：2025-11-22

• 大麻使用动机组合的生态瞬时评估研究：多重动机模式与使用结果的关联分析

  在当今社会，大麻使用的普遍性及其对公共健康的影响日益受到关注。人们使用大麻的原因多种多样，有的为了寻求愉悦（增强动机），有的为了社交应酬（社交动机），有的为了缓解焦虑或疼痛（应对动机或医疗动机）。理解这些使用动机如何影响实际使用行为及其后果，对于制定有效的干预策略至关重要。以往研究大多孤立地考察单一动机的效应，或者简单地统计动机的数量。然而，现实情况往往更为复杂——使用者经常在同一时间点出于多种原因而使用大麻。这种多重动机共现的现象是否意味着不同的风险水平？特定的动机组合（例如，同时为了应对情绪和社交娱乐）是否比单纯使用动机数量更能预测不良后果？这些问题尚未得到充分解答。为了深入探究大麻使用动

  来源：Journal of Cannabis Research

  时间：2025-11-22

• 儿童期氟暴露与终生认知能力的关系

  本文探讨了儿童时期饮用水中氟暴露与其在青少年及中年阶段认知表现之间的关系。研究基于美国全国代表性样本数据，通过分析儿童在成长过程中接触的氟水平，结合青少年时期的学业成绩和成年后（约60岁）的认知能力评估，揭示了氟暴露对长期认知功能的潜在影响。研究结果表明，儿童在成长过程中接触推荐水平的氟，可能在青少年时期带来适度的认知优势，但这种优势在成年后趋于减弱，甚至不再具有统计学意义。在引入研究背景时，文章首先指出，氟化物在饮用水中的广泛应用已显著降低了儿童和成人的龋齿风险。美国的公共卫生部门也认可了这一措施的有效性，将其列为20世纪最伟大的公共卫生干预之一。然而，自20世纪40年代起，氟化物在饮用水中

  来源：SCIENCE ADVANCES

  时间：2025-11-21

• 用于直接评估土壤环境中微生物的磁响应纳米培养物

  磁性纳米培养系统（MNCs）是一种创新的微生物培养技术，旨在模拟微生物的天然微环境，同时实现对复杂环境中微生物的高效回收。这项技术的核心在于利用磁性纳米颗粒（MNPs）和聚二甲基硅氧烷（PDMS）基质相结合，形成具有磁响应特性的纳米级生物反应器。这些纳米培养系统不仅能够维持微生物的活性，还能通过外部磁场进行精确操控，从而实现对特定微生物的分离和研究。这一方法在生物勘探和微生物生态学研究中具有重要意义，尤其是在探索那些无法在传统实验室条件下培养的微生物方面。微生物在生态系统中扮演着至关重要的角色，例如土壤中的营养循环和海洋中的氧气生成。然而，尽管已知微生物种类繁多，超过98%的微生物仍然未被发现

  来源：SCIENCE ADVANCES

  时间：2025-11-21

• 一个关于鸟类强制性巢寄生行为进化起源的综合性框架

  鸟类的专性巢寄生行为（OBP）在多个不同谱系中重复进化，这一现象构成了进化生物学中的一个重要谜题。尽管宿主与寄生者之间的共进化已广泛研究，但OBP最初演化的有利条件仍不清楚。本研究通过整合理论建模、古气候图谱和系统发育比较分析，旨在识别OBP演化的关键驱动因素。理论模型表明，随着亲代抚育成本的增加，尤其是在环境压力下，OBP可能具有选择优势。然而，这种策略的长期维持需要额外的生命周期适应，包括繁殖数量的增加。古气候数据支持这一框架：OBP的起源往往发生在重大气候变迁之后，而在随后更为稳定的时期，寄生行为得以固定。系统发育分析揭示了OBP与高死亡率的生态特征相关，例如开放栖息地的使用。我们还发现

  来源：SCIENCE ADVANCES

  时间：2025-11-21

• proGenomes4：为微生物组学研究提供200万高质量原核基因组的一致注释资源

  在微生物学研究领域，海量基因组数据的涌现如同一把双刃剑。自30年前首个微生物基因组测序完成以来，测序技术的飞速发展使得公开数据库中的微生物基因组数量呈指数级增长。然而，这些数据来源分散、质量参差不齐、注释标准不一，导致研究人员在开展大规模比较分析时面临巨大挑战。正如文献所述，NCBI RefSeq、PATRIC等主流数据库虽提供基础注释，但缺乏系统性的功能注释层；GTDB虽解决分类学不一致问题，却未涵盖深度功能信息。更关键的是，基因组质量评估、栖息地信息整合及移动遗传元件等专项注释的缺失，极大限制了从基因组数据中挖掘生物学洞察的深度与可靠性。为破解这一难题，由欧洲分子生物学实验室、Keio大学

  来源：Nucleic Acids Research

  时间：2025-11-21

• 局地气候适应性驱动旱雀麦全球入侵的基因组学证据

  在全球变化背景下，生物入侵已成为导致生物多样性丧失和生态系统退化的主要驱动力之一。然而，入侵物种成功的进化机制至今尚未明确——究竟是由于被入侵生态系统的脆弱性，还是入侵物种本身具备强大的适应能力？特别是，适应性进化在入侵过程中扮演何种角色？如果入侵种能够快速适应当地环境，将显著提升其适应度并促进种群扩张；但持续的基因流也可能淹没当地适应性。旱雀麦（Bromus tectorum）作为全球最具破坏力的入侵植物之一，为解析这些科学问题提供了理想模型。这种原产于欧亚大陆和非洲的禾本科植物，在19世纪末期已遍布北美，尤其在美国西部内陆山区引发严重的生态后果：通过加速火循环周期取代本地多年生植物，导致生

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-21

• 环境丰富通过抑制Tlr4介导的铁死亡减轻脑缺血再灌注损伤：缺血性卒中康复潜在新策略

  脑卒中如同“大脑断电”，血流中断后神经元迅速陷入能量危机，兴奋毒性、氧化应激与炎症交织成“死亡风暴”，即便及时再通，超90分钟的缺血仍难逃不可逆损伤。现有溶栓、取栓被窄至4.5小时时间窗束缚，大量患者错失良机，康复阶段更缺乏可推广的无创干预。能否在“黄金时间”之外找到一把钥匙，重启神经元的自我修复程序？上海中医药大学团队将目光投向“环境丰富（Environmental Enrichment, EE）”——这一无需药物、仅需“更有趣的生活空间”的干预方式，探究其能否在缺血再灌注（I/R）损伤后阻断新型程序性细胞死亡“铁死亡（ferroptosis）”，为卒中康复打开新窗。研究在《Molecula

  来源：Molecular Neurobiology

  时间：2025-11-21

• 通过合成社区进行基准测试，为利用Hi-C邻近性关联技术推断病毒与宿主之间的关系提供了基础数据

  病毒-宿主相互作用在生态系统的运作中起着关键作用，特别是在微生物群落中。随着研究的深入，科学家们发现病毒在调节微生物活动和进化方面具有重要作用，例如通过改变宿主的代谢活动形成新的“病毒细胞”，诱导裂解从而控制微生物种群动态，以及促进水平基因转移从而影响长期的进化轨迹。然而，大多数环境中的病毒仍然无法与其宿主建立明确的联系，这限制了我们对病毒在生态系统中功能的全面理解。为了解决这一问题，Hi-C（高通量染色体构象捕获）技术被引入，以实验性地推断病毒与宿主之间的相互作用。Hi-C利用邻近连接技术，通过甲醛交联，捕捉物理上共定位的DNA分子，并通过限制性酶切、重连接和高通量测序来分析这些连接，从而揭

  来源：PLOS Biology

  时间：2025-11-21

• MeNet：一种用于多环境农艺性状基因组预测的混合效应深度神经网络

  在作物育种领域，准确预测农艺性状是提高育种效率、选育优良品种的关键。随着高通量基因分型技术的飞速发展，利用全基因组变异信息对大规模群体进行表型预测已成为现代育种的核心技术之一。传统的基因组预测方法，如最佳线性无偏预测（BLUP）及其衍生模型，在过去三十年中发挥了重要作用。这些线性模型擅长捕捉加性遗传效应，但对于复杂的非加性效应，如基因与基因之间的上位性（epistasis）以及基因与环境的互作（G×E），往往力不从心。然而，这些非线性效应在决定许多重要农ronomic性状（如产量、品质）中扮演着至关重要的角色。为了应对非线性关系的挑战，机器学习方法，如支持向量机（SVM）、随机森林（RF）以及

  来源：Plant Communications

  时间：2025-11-21

• 植物间的信号传递：是构建抵御压力的网络，还是仅仅是在“窃听”彼此的信息？

  亮点 植物与微生物组之间的信号传递（Plant/Microbiome to Plant/Microbiome, PM-to-PM）是健康生态系统的基石。 摘要 生态系统的整体功能取决于其生物多样性的丰富程度以及栖息其中不同物种之间的复杂相互作用。因此，了解全球变化因素（包括气候变化）及其组合如何影响不同生态系统和农业生态系统中物种间的复

  来源：TRENDS IN Plant Science

  时间：2025-11-21

• 综述：通过基于多组学的预测育种技术加速多年生作物的改良

  随着全球气候变化和农业环境的不断变化，多年生作物（Perennial crops）正面临着前所未有的挑战。这些作物因其无需每年重新种植、持续产出以及对环境影响较小（如减少土壤侵蚀）而备受关注。然而，这种再生机制也使它们更容易受到环境压力的影响，进而威胁到其生产可持续性。因此，如何在多年生作物中实现快速而有效的遗传改良成为亟待解决的问题。尽管传统的育种方法仍然是遗传改良的重要手段，但由于其周期长、效率低，难以满足当前快速适应环境变化的需求。近年来，随着技术的进步和数据的丰富，预测育种（Predictive breeding）逐渐成为一种新的研究方向，尤其在多年生作物中展现出巨大的潜力。预测育种是

  来源：The Plant Genome

  时间：2025-11-21

• 基于Vrn、Ppd和Rht等位基因的硬粒小麦形态-物候性状的基因组预测模型

  这项研究探讨了在气候条件不断变化的背景下，如何通过整合特定基因的等位基因组合（AC）和全基因组关联分析（GWAS）中识别出的标记（M）来提高硬粒小麦（durum wheat）的适应性。研究采用了一种系统的方法，结合了186个硬粒小麦基因型，包括地方品种（LR）、老品种（OC）和现代品种（MC），在八个不同的播种与季节组合环境中进行试验，以评估其对开花时间（FT）、抽穗期（HD）和植株高度（PH）的影响。研究发现，这些基因的变异在作物适应性中起到了关键作用，尤其是在调整播种日期以适应不同气候条件的背景下，基因型和环境的相互作用（G × E）变得尤为复杂。通过利用基因组预测（GP）模型，研究者探索

  来源：The Plant Genome

  时间：2025-11-21

• 在苔原生态系统生产力方面，植物功能特征的不确定性可能超过气候情景的不确定性

  摘要 预测全球变化对物种组成的影响仍然具有挑战性，但植物功能特征为从植物层面到群落和生态系统层面进行研究提供了关键的联系。功能特征的变化在多大程度上能够影响生态系统对气候变化的响应，仍然是一个关键问题。 我们利用特定地点的功能特征和物候观测数据，运行了点尺度群落陆地模型（Community Land Model, CLM）模拟，以表征高山苔原的生长策略。我们通过实地观测验证了模拟结果，并将参数化结果与使用默认参数化的结果

  来源：New Phytologist

  时间：2025-11-21

• GMSHMT08介导的大豆抗胞囊线虫作用受到两种热休克蛋白70s的负调控

  摘要 大豆基因 GmSHMT08（Rhg4）是一种赋予大豆对胞囊线虫（SCN）抗性的关键基因，而这种病原体对大豆具有毁灭性影响，但其抗性机制至今仍不清楚。热休克蛋白70（HSP70）主要负责维持蛋白质稳态和调节植物免疫。在本研究中，通过CRISPR/Cas9技术敲除了两个高度相似的GmHSP70基因（GmHSP70-13a（Glyma.13g254900）和GmHSP70-15a（Glyma.15g059900）后，大豆的抗性得到了增强；而过度表达这两个基因则会抑制抗性。GmHSP70-13a和GmHSP70-15a均能与关键的一

  来源：Plant, Cell & Environment

  时间：2025-11-21

• 欢迎病原体的到来：短暂的高温会减弱苹果植株对阿奇苯唑-S-甲基（Acibenzolar-S-Methyl）的免疫反应

  气候变暖正以前所未有的速度改变着全球生态系统，其中植物与病原体之间的相互作用尤为显著。随着温度升高，植物免疫系统的表现可能受到显著影响，从而改变植物对病原体的抗性。这一现象在不同植物种类中呈现出差异化的反应模式，因此研究特定作物如何应对高温下的免疫挑战具有重要的现实意义。本文以苹果（*Malus domestica*）为研究对象，探讨了高温如何影响由植物免疫诱导剂 ASM（acibenzolar-S-methyl）引发的防御机制，并进一步揭示了其对两种重要病原体——苹果火疫病菌 *Erwinia amylovora* 和苹果黑星病菌 *Venturia inaequalis* 的作用。###

  来源：Plant, Cell & Environment

  时间：2025-11-21

• 综述：病毒性暗物质：揭示蛋白质功能、生态学特性及生物技术潜力

  病毒是地球上最丰富的生物实体，它们在塑造微生物群落和影响生态系统功能方面扮演着核心角色。然而，大多数病毒基因仍未被充分研究，构成了所谓的“病毒暗物质”。通过宏基因组学研究，科学家发现，40%至90%的病毒基因缺乏已知的同源基因或功能注释。这种知识上的空白限制了我们对病毒序列数据的解读能力，阻碍了我们对病毒与宿主相互作用的理解，并阻碍了对病毒基因生态或应用价值的评估。其中，辅助病毒基因（AVGs）是病毒暗物质中最引人注目的组成部分，包括辅助代谢基因（AMGs）、辅助调控基因（AReGs）和宿主生理调控基因（APGs），这些基因可能在感染过程中改变宿主的功能，进而影响微生物代谢、应激耐受性或抗性。

  来源：Biochemistry

  时间：2025-11-21

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