• PseudoknotVisualizer：三维RNA结构上伪结的可视化工具

  RNA三维结构中伪结的可视化分析工具研究RNA分子三维结构的解析是理解其功能机制的重要基础。近年来，随着冷冻电镜技术的进步，虽然RNA的三维结构测定效率有所提升，但相关分析工具的完善仍存在明显缺口。特别是对于复杂RNA分子中常见的伪结结构，传统可视化手段难以有效呈现其空间特征与层次关系。日本学者Otagaki团队开发的PseudoknotVisualizer工具，通过创新性的分层着色方法，为RNA三维结构分析提供了新的解决方案。该工具的核心创新在于将伪结分解为多个非交叉层结构。通过动态规划算法，系统性地提取最大非交叉子集，形成具有明确层次特征的伪结可视化体系。具体实现方式包含两个用户友好型接口

  来源：PLOS Computational Biology

  时间：2025-11-21

• 实时预测流行病监测数据中的修订情况

  在面对传染病疫情时，实时数据的准确性对于公共卫生决策至关重要。然而，实际中，许多疫情数据在发布后会不断修订，这种现象通常源于报告延迟（称为“回填”）和其他因素。这些修订可能严重影响对当前疫情态势的理解、预测精度以及后续防控措施的设计。因此，如何有效处理数据修订并生成可靠的时间序列预测成为了一个重要课题。本文提出了一种名为Delphi Revision Forecast（Delphi-RF）的新框架，旨在解决这一问题。该方法采用非参数分位数回归技术，能够处理计数型和比例型数据，并适用于多种时间分辨率和疫情监测数据流。### 问题背景与挑战疫情数据的修订现象广泛存在于公共卫生领域，如流感、登革热和

  来源：PLOS Computational Biology

  时间：2025-11-21

• 通过在碳纳米管纤维上共电沉积亚甲蓝和葡萄糖氧化酶制备的柔性葡萄糖生物传感器

  这项研究提出了一种基于碳纳米管纱线（CNTYs）的新型葡萄糖传感器（CNTYs-MB/GOx），首次实现了甲基蓝（MB）和葡萄糖氧化酶（GOx）的共电沉积。该方法突破了传统平面碳电极（如玻璃碳、碳纸、碳布）的局限性，通过构建三维的CNTY网络，为传感器提供了更大的电活性表面积和高效的电子传输路径。这种结构不仅能够实现MB/GOx复合物的密集且均匀的固定，还显著提升了电催化性能。与物理吸附方法相比，共电沉积策略使得MB和GOx在CNTY表面协同组装，从而增强了酶的保留能力、扩大了电活性表面积，并促进了更有效的电子转移。这些优势为开发灵活、可穿戴的葡萄糖监测设备提供了新的可能性，超越了传统MB/G

  来源：Bioelectrochemistry

  时间：2025-11-21

• 染色体级基因组揭示熊科物种快速分化与古老基因流

  熊科动物作为全球大型哺乳动物中生态地位关键且易受威胁的类群，其八种现存物种中有六种被世界自然保护联盟列为“易危”。尽管熊类在形态、生理和行为上表现出惊人的多样性，例如北极熊为适应极地环境演化为白色皮毛，大熊猫为消化竹子特化了味觉受体基因，但对其进化历史的认知长期受限于基因组资源的匮乏。此前，仅有四种熊拥有染色体级别的参考基因组，亚洲黑熊等关键物种的系统发育位置因快速辐射带来的不完全谱系分选和基因流事件而存在争议。此外，熊科物种间染色体数目差异显著，熊属物种为2N=74，而大熊猫和安第斯熊分别仅为2N=42和52，其核型演化机制亦未明确。为突破这些瓶颈，研究团队在《Genome Biology

  来源：Genome Biology and Evolution

  时间：2025-11-21

• Nomilin 通过 Nrf2 通路减轻 OBS 引发的发育性心脏毒性

  在当今环境和健康研究领域，新型污染物的识别与评估正成为关注的焦点。近年来，随着对传统污染物如全氟辛烷磺酸（PFOS）的监管日益严格，其替代品——全氟壬烷磺酸钠（OBS）的使用逐渐增加。然而，尽管OBS在工业中的应用广泛，其对水生生物的影响，尤其是对心脏发育和功能的潜在危害，仍缺乏系统研究。因此，科学家们通过实验手段，利用斑马鱼胚胎这一重要的模型生物，来探索OBS的毒性机制，并评估天然化合物如柑橘类物质中的诺米林（NOM）是否能够提供有效的保护作用。斑马鱼作为一种模式生物，因其独特的生物学特性，成为研究环境污染物毒性的重要工具。其外部受精、快速的胚胎发育、透明的胚胎结构以及便于实时成像和实验操作

  来源：Aquatic Toxicology

  时间：2025-11-21

• 通过研究不同品种重猪的血浆代谢组，鉴定与饲料效率和生长率相关的生物标志物

  猪养殖业中，饲料成本是最大的支出之一，对生产系统的可持续性产生显著影响。因此，提高饲料利用效率是减少这些成本和环境影响的关键策略。特别是在意大利大型白猪的重型养殖系统中，这些猪在达到更高的活体重量后才被屠宰，以符合受保护的原产地命名（PDO）干腌火腿价值链的要求。由于生长速度与饲料利用效率密切相关，而PDO规则规定猪不能在设定的年龄限制前达到屠宰重量，因此需要控制猪的每日增重。本研究利用非靶向代谢组学方法，分析了意大利大型白猪的血浆代谢物，以识别那些能够区分饲料利用效率和生长速度不同的个体，并可能成为这两个性状的生物标志物。研究从672头经过性能测试的猪中选取了两个部分重叠的数据集，每个数据集

  来源：animal

  时间：2025-11-21

• 揭示科米萨纳绵羊（一种地中海乳用品种）中基因组适应性特征及产奶性能的痕迹

  这项研究聚焦于Comisana绵羊品种的基因组选择信号，旨在揭示其在低投入、半干旱地中海环境中长期适应的遗传基础。Comisana绵羊作为重要的地中海奶用品种，以其在恶劣环境下的生存能力和高产奶性能而闻名。研究通过整合Comisana与其他两个意大利本地绵羊品种——Sarda和Valle del Belice的基因型数据，利用扩展的等位基因纯合度（EHH）分析和群体分化检测方法，识别出八个可能受到选择作用的基因组区域。这些区域中包含了与环境适应性、免疫调节、组织修复以及乳制品生产相关的基因，从而为理解该品种的遗传机制提供了重要线索。研究采用中密度SNP芯片数据进行分析，涵盖了238个Comis

  来源：animal

  时间：2025-11-21

• 患者报告的从初次乳腺癌治疗到长期生存期间，对生存护理的参与度及沟通方式的变化

  摘要 背景 本研究的目的是评估从乳腺癌初次治疗到长期生存期间，初级保健医生（PCP）的参与度和沟通情况的变化，以及与长期生存期间PCP参与度和沟通水平较低相关的患者特征。 方法 iCanCare研究是一项针对2014-2015年在洛杉矶和乔治亚州监测、流行病学和最终结果登记系统中

  来源：Cancer

  时间：2025-11-21

• 多任务、类感知的对抗性训练以提高遥感目标检测的鲁棒性

  随着深度学习技术在遥感图像目标检测中的广泛应用，模型在对抗攻击下的鲁棒性和安全性问题逐渐成为研究重点。对抗攻击通过引入微小且难以察觉的扰动，能够误导目标检测系统，从而严重削弱其在视频监控、军事侦察、自然灾害监测以及环境保护等实际场景中的应用效果。为了应对多任务优化冲突和对抗攻击下的鲁棒性退化问题，本文提出了一种新颖的多任务和类别感知的对抗训练框架。该框架同时优化分类、边界框回归和置信度预测三个子任务，并引入了一种多任务最大化损失策略，以生成能够有效挑战模型的对抗样本。此外，还采用了一种类别感知的损失机制，以平衡不同目标类别间的鲁棒性。实验评估表明，该方法在PASCAL VOC和DIOR数据集上

  来源：Connection Science

  时间：2025-11-21

• 评估毛苕子（Vicia villosa Roth）作为绿肥在根茎作物种植中减少化学肥料投入的效果

  本研究探讨了在同一个生长季节中种植现金作物和绿肥作物的策略，特别是将豆科绿肥作物——毛叶苕子（*Vicia villosa* Roth）与根类作物——萝卜和胡萝卜进行轮作种植，评估其对作物产量和土壤肥力的影响。研究结果显示，通过这种轮作方式，可以有效提高土壤肥力，减少对化学肥料的依赖，从而推动可持续农业的发展。### 研究背景与意义随着全球对环境问题的关注日益加深，化学肥料的使用所带来的环境负担也逐渐显现。化学肥料主要由化石燃料制成，其生产过程会释放大量温室气体，对气候变化产生负面影响。例如，生产硝酸铵（33.5% N）、尿素（46% N）、磷酸盐（48% P₂O₅）和钾肥（60% K₂O）的

  来源：Plant Production Science

  时间：2025-11-21

• 可持续摩擦学材料：可生物降解的芦荟天然纤维与环氧复合材料的结合

  ### 摩擦学行为分析与优化本研究围绕芦荟纤维增强型环氧生物降解复合材料的摩擦学特性展开，旨在探讨其在不同滑动距离（SD）、滑动速度（SS）和施加载荷（AL）条件下的磨损损失（WL）和摩擦系数（CoF）。研究采用Box-Behnken设计（BBD）对实验进行系统规划，并通过期望分析（desirability analysis）实现对实验条件的优化。研究发现，随着AL的增加，材料的磨损损失显著上升，这主要是由于施加的载荷增大导致接触面积增加，从而加剧了材料的去除过程。此外，SS对摩擦热的产生以及接触界面的动态响应具有重要影响，较高的SS会促进摩擦热的积累，进而导致表面软化和磨损的增加。SD的增加

  来源：Journal of Natural Fibers

  时间：2025-11-21

• 巴基斯坦（北阿拉伯海）海域鲨鱼的分类学评估

  在巴基斯坦水域中，研究人员记录了41种鲨鱼，这些鲨鱼属于10个不同的科。这项研究通过外部形态学特征对这些鲨鱼进行了详细描述，并提供了区分形态相似物种的鉴定关键。这一信息对于提高鲨鱼分类的系统稳定性、增进对它们保护所需的知识以及推动该地区的鲨鱼资源管理具有重要意义。巴基斯坦位于阿拉伯海的北部，这一区域的海洋生态系统十分丰富，且受到季风的影响显著。夏季季风（5月至9月）和冬季季风（12月至2月）促使海洋环流的变化，进而影响了海洋生产力和鲨鱼的分布。此外，阿拉伯海的海底地形复杂多变，包括深海盆地、海底山脉和海岭，这些地理特征为不同种类的鲨鱼提供了多样化的栖息地。研究发现，鲨鱼在巴基斯坦水域的分布受到

  来源：The European Zoological Journal

  时间：2025-11-21

• 美国本土范围内，土壤颗粒物及与矿物相关的有机碳分解能力同时受到地球化学因素和微生物活动的共同影响

  科学造福社会土壤储存的碳量超过了大气和植被总和，使其成为调节地球气候的重要因素。土壤中的碳是保持锁定状态还是以二氧化碳的形式重新释放到大气中，将决定地球变暖的速度。然而，预测土壤碳的分解过程非常困难。目前的地球系统模型通常假设在相同生物群落或土壤类型中，碳的分解速率是恒定的（不受环境因素影响）。实际上，土壤并非均匀分布，不同地点之间存在显著差异。虽然土壤的pH值和氮含量等特性已被广泛研究，但人们对土壤中的矿物质和微生物的关注却相对较少。如果不考虑这些因素，模型将难以准确预测未来的土壤碳排放。在我们的研究中，我们利用长期实验数据、机制模型和机器学习方法，分析了美国各地的土壤碳分解情况。我们量化了

  来源：One Earth

  时间：2025-11-21

• 慢性髓性白血病（CP-CML）患者停用酪氨酸激酶抑制剂（TKI）后分子复发的早期预测因素

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  来源：Leukemia & Lymphoma

  时间：2025-11-21

• 综述：免疫疗法在改善唐氏综合征相关急性淋巴细胞白血病治疗效果中的新兴作用：一篇富有洞察力的综述

  摘要与唐氏综合征相关的急性淋巴细胞白血病（DS-ALL）是一种生物学特征独特的亚型，其治疗相关死亡率和复发率均较高。基因组分析显示，该亚型中常见CRLF2重排、JAK-STAT通路突变以及高风险亚型（如BCR::ABL1类似疾病）。传统化疗能够实现缓解，但在唐氏综合征患者中存在毒性限制。近期免疫疗法的进展，包括布林纳单抗（blinatumomab）、伊诺珠单抗奥佐格霉素（inotuzumab ozogamicin）和CD19靶向CAR T细胞疗法，在儿童和成人DS-ALL患者中显示出显著疗效和良好的耐受性。布林纳单抗和伊诺珠单抗能够清除微小残留病灶，可作为替代化疗或桥接治疗的手段；CAR T细

  来源：Leukemia & Lymphoma

  时间：2025-11-21

• 蕈样肉芽肿在诊断时解剖部位和分期的差异：一项基于人群的研究

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  来源：Leukemia & Lymphoma

  时间：2025-11-21

• 来特莫韦预防期间早期CMV病毒血症预测异基因造血干细胞移植后晚期CMV感染风险降低并与增强的T细胞免疫相关

  在异基因造血干细胞移植（alloHSCT）领域，巨细胞病毒（CMV）感染一直是挥之不去的阴影，是导致患者高发病率和高死亡率的主要病毒性并发症。传统上，CMV的管理主要依靠两种策略：抢先治疗（PET）或普遍预防。而来特莫韦（Letermovir），一种病毒末端酶复合物抑制剂的出现，改变了这一局面。它能在移植后100天内显著降低临床显著性CMV感染（csCMVi）的发生率，且相比用于抢先治疗的药物（如（缬更）昔洛韦或膦甲酸钠）毒性更低。然而，新的挑战随之而来：来特莫韦在有效减少早发性csCMVi的同时，其停药后（通常在移植后100天）出现的晚发性csCMVi已成为新的临床关切点，可能导致更多的晚期

  来源：Scientific Reports

  时间：2025-11-21

• 聚乙烯微塑料通过氧化应激与线粒体功能障碍诱导Wistar大鼠肾损伤的机制研究

  随着塑料制品在全球范围内的广泛使用，微塑料污染已成为备受关注的生态环境与健康问题。其中，聚乙烯微塑料（PE-MPs）因化学稳定性高、在环境中难以降解且易被生物体摄入，其对哺乳动物器官的潜在毒性逐渐引起科学界警惕。肾脏作为机体主要的代谢和排泄器官，因其血流量大、滤过功能活跃，尤其容易受到血液中循环微塑料颗粒的侵袭。然而，关于PE-MPs是否直接损害肾脏功能，以及其毒性作用的具体细胞与分子机制，目前仍缺乏系统性的实验证据。为此，来自泰国 Mae Fah Luang 大学、马来西亚 Universiti Putra 大学等多国研究团队在《Scientific Reports》上发表了最新研究成果。该

  来源：Scientific Reports

  时间：2025-11-21

• 表观遗传保守性揭示结直肠癌祖细胞保留正常结肠的表型可塑性

  在肿瘤演化过程中，单个祖细胞如何产生具有显著表型异质性的庞大肿瘤群体，一直是癌症生物学领域的核心谜题。尽管大多数驱动突变是克隆性的，但亚克隆突变多为"过客"突变，难以解释肿瘤内观察到的显著表型差异。越来越多的证据表明，表观遗传机制在塑造肿瘤异质性中扮演关键角色。其中，表型可塑性——即细胞快速可逆地改变表型的能力——被认为可能是推动肿瘤异质化的重要力量。正常结肠隐窝已展现出这种可塑性特征：干细胞与分化细胞具有相似且广泛开放的表观基因组，其基因表达主要受微环境诱导的转录因子调控，而非依赖表观遗传重塑。那么，在结直肠癌(CRC)进展过程中，这种干细胞样的可塑性特征是否得以保留？这正是Kelly St

  来源：Scientific Reports

  时间：2025-11-21

• 嵌入驱动双分支框架：实现乳腺癌肿瘤细胞密度精准分类的新突破

  在全球女性癌症发病率中，乳腺癌（BC）长期占据重要地位。传统的诊断方式如乳腺X线摄影、超声和磁共振成像虽广泛应用于早期筛查，但存在假阳性或假阴性的风险，往往需要进一步通过活检和组织病理学检查进行确诊。作为乳腺癌诊断的"金标准"，组织病理学图像分析（HIA）通过对苏木精-伊红（H&E）染色和免疫组织化学技术处理的组织样本进行分析，能够提供详细的肿瘤特征信息。然而，全幻灯片图像（WSI）的人工解读面临巨大挑战——组织变异和观察者差异导致诊断结果的不一致性，而整张WSI可能达到十亿像素级别，直接处理这样的高分辨率图像在计算上是不可行的。目前，基于人工智能（AI）的方法正在改变这一局面。深度学

  来源：Scientific Reports

  时间：2025-11-21

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