• Tisagenlecleucel在复发性或难治性B细胞恶性肿瘤中的预后因素和疗效：一项单中心真实世界研究

  李秀贞（Soo Jung Lee）| 吉俊敏（Gi June Min）| 朴成洙（Sung-Soo Park）| 郑英宇（Youngwoo Jeon）| 尤在元（Jae Won Yoo）| 杰沃克·杰卡尔（Dong Wook Jekarl）| 李在元（Jae Wook Lee）| 姜基成（Ki-Seong Eom）| 郑纳根（Nack-Gyun Chung）| 闵昌基（Chang-Ki Min）| 趙硕古（Seok-Goo Cho）| 金永古（Yonggoo Kim）| 尹在浩（Jae-Ho Yoon）韩国天主教大学医学院圣文森特医院实验室医学系，首尔，大韩民国摘要背景Tisagenlecle

  来源：Cytokine & Growth Factor Reviews

  时间：2025-11-19

• SILVA数据库2026：rRNA资源整合DSMZ数字多样性平台的新纪元

  在微生物学研究领域，核糖体RNA（rRNA）序列一直是解析生命之树的核心工具。自2007年问世以来，SILVA数据库作为全球权威的rRNA资源库，持续为科研界提供经过质量校验、比对和分类的rRNA序列。然而，随着测序技术的飞速发展，数据量呈指数级增长，传统的数据处理流程面临计算效率低下、分类标准不统一、以及跨平台互操作性不足等挑战。更严峻的是，微生物分类学体系本身正处于变革期——国际原核生物命名法规（ICNP）正式承认“门”（phylum）级分类单元，基因组分类数据库（GTDB）推翻了部分传统分类框架，而新出现的SeqCode更允许以基因组序列作为命名依据。这些变革使得如何将rRNA序列分类与

  来源：Nucleic Acids Research

  时间：2025-11-19

• IPD-IMGT/HLA数据库：新一代序列提交工具如何推动HLA超多态性研究的全球协作

  在人类基因组中最复杂的区域——6号染色体上的主要组织相容性复合体（MHC）区域内，存在着47个被称为HLA（人类白细胞抗原）的超多态性基因。这些基因编码的蛋白质在免疫应答中扮演着关键角色，它们通过呈递抗原肽段来激活免疫系统，但同时也给器官移植带来了巨大挑战：供者与受者之间的HLA不匹配可能引发排斥反应，直接影响移植成功率。随着测序技术的飞速发展，从早期的血清学分型到如今的下一代测序（NGS）和第三代测序（TGS）技术，科学家们发现的HLA等位基因数量呈爆炸式增长。截至2025年7月，IPD-IMGT/HLA数据库已收录超过43,000个独特等位基因，较2023年增长23%。然而这种快速增长也带

  来源：Nucleic Acids Research

  时间：2025-11-19

• 乳酸传感器NDRG3通过与syntaxin-5的长异构体的相互作用，减缓了内质网（ER）到高尔基体（Golgi）的运输过程

  重要性哺乳动物细胞可以通过稳定缺氧诱导因子（HIF）家族中的氧依赖性转录激活因子来适应低氧环境，这些因子在血管生成、细胞存活和增殖中起着关键作用。已有明确证据表明，在细胞对缺氧的反应中还存在不依赖于HIF的机制。例如，在缺氧条件下，乳酸的积累会稳定NDRG3蛋白，从而激活细胞内信号通路，促进血管生成和细胞生长。在这里，我们发现缺氧和细胞内乳酸水平升高会通过NDRG3和Syntaxin-5（Stx5）调节内质网到高尔基体的膜运输过程，而Syntaxin-5是一种与多系统疾病相关的SNARE蛋白。我们的数据扩展了对细胞缺氧反应的理解。摘要BET1、GOSR2和STX5的变异体可导致致命的遗传性疾病

  来源：Proceedings of the National Academy of Sciences

  时间：2025-11-19

• Reactome知识库2026：基于FAIR原则的人类生物学通路资源升级与AI集成

  随着高通量技术的飞速发展，生命科学领域正面临数据海啸的冲击。研究人员如何从数以万计的分子相互作用中梳理出具有生物学意义的通路网络？临床医生如何快速理解基因突变对细胞功能的影响？这些挑战催生了对标准化、可视化生物学知识平台的迫切需求。Reactome知识库作为经专家人工审编的开放式资源，致力于以分子细节描述人类生理和疾病机制，但其原有架构已难以满足日益增长的多维数据整合需求。为解决上述问题，国际研究团队在《Nucleic Acids Research》发表了Reactome知识库2026版本的重大升级。该研究通过重构技术框架和引入人工智能工具，实现了从宏观通路导航到微观分子动态的全尺度可视化突破

  来源：Nucleic Acids Research

  时间：2025-11-19

• 黏附G蛋白偶联受体ADGRL2与Gα13结合，从而促进表皮细胞的分化

  重要性粘附G蛋白偶联受体（aGPCRs）仍然是研究最少的GPCR亚家族之一，其中以latrophilin家族在神经科学领域中的研究最为深入。在这项研究中，我们发现ADGRL2是一种作为表皮稳态关键调节因子的粘附GPCR。我们证明其下游信号分子Gα13也在同一调控轴上发挥作用，共同调控表皮的分化过程。尽管对超过七种aGPCRs的结构研究主要集中在细胞内环2（ICL2）处的G蛋白相互作用上，但我们的基于脂质纳米盘的纯化方法揭示了ADGRL2与Gα13在细胞内环3（ICL3）处存在先前未被发现的相互作用。这一独特的相互作用表明Gα13可能对latrophilin家族成员具有特异性，为GPCR信号传导

  来源：Proceedings of the National Academy of Sciences

  时间：2025-11-19

• antiSMASH数据库v5发布：微生物次级代谢产物基因组挖掘的金标准工具升级

  在微生物世界的隐秘工厂中，数以万计的基因簇如同精密的生产线，源源不断地合成着具有抗菌、抗肿瘤等活性的特殊代谢产物。这些被称为“次级代谢产物”的化合物，不仅是青霉素、链霉素等经典药物的来源，更是新型抗生素研发的宝库。然而，如何从海量基因组数据中精准定位这些生产车间——生物合成基因簇（BGC），一直是困扰研究人员的难题。传统的基因组挖掘工具如antiSMASH虽已成为行业金标准，但其单基因组分析模式难以满足跨物种比较的需求。更棘手的是，公共数据库中存在大量重复基因组和碎片化序列，前者导致数据冗余，后者则会割裂完整的BGC区域，严重影响预测准确性。例如，一个本应连续排列的聚酮合酶基因簇可能因基因组组

  来源：Nucleic Acids Research

  时间：2025-11-19

• OmniPath：多组学整合知识库的十年革新与生物网络解析新纪元

  随着单细胞测序、空间转录组等技术的突破，生物医学研究正步入多组学时代。海量的分子数据为解析疾病机制带来机遇，但如何从数十亿个数据点中提炼生物学意义却成为新的挑战。就像拥有无数拼图碎片却缺少完整图纸，研究人员迫切需要系统化的先验知识来指导数据分析。然而，现有的分子通路数据库存在显著局限：它们或如SIGNOR、Reactome等专注于特定类型的相互作用，或如STRING依赖相关性推断而缺乏因果关联，更关键的是，这些资源分散在百余个独立平台中，格式各异且更新频率参差不齐，使得整合应用成为巨大障碍。为破解这一难题，由德国海德堡大学Denes Turei与Julio Saez-Rodriguez领衔的国

  来源：Nucleic Acids Research

  时间：2025-11-19

• UCSC Genome Browser 2026升级：解锁28 000种基因组可视化与数据共享新范式

  当“端粒到端粒”（T2T）联盟在2022年公布首个完整无缺口人类基因组T2T-CHM13/hs1时，科研界一片欢腾，但紧随其后的却是“注释荒漠”的尴尬：新装配的变异、基因、表观修饰信息远少于经典的GRCh38/hg38，导致研究者面对“序列完整却功能未知”的空白图谱无从下手。与此同时，临床实验室每天把大量患者变异文件（VCF）上传到UCSC Genome Browser，却因缺乏便捷的托管与共享通道，只能依赖个人网盘或自建服务器，既不符合HIPAA隐私规范，也拖慢了多学科协作。更棘手的是，ClinVar数据库中已收录的90余万个变异，其蛋白截短突变（premature termination

  来源：Nucleic Acids Research

  时间：2025-11-19

• Paratope可塑性决定了抗HER2（4B5）抗体的特异性

  在现代医学中，抗体检测技术已成为诊断和治疗多种疾病的重要工具。特别是HER2（人类表皮生长因子受体2）作为乳腺癌治疗的关键靶点，其识别和检测方法的发展对患者分层和个性化治疗方案的制定具有深远影响。然而，随着HER2靶向治疗的广泛应用，包括在非乳腺癌类型的肿瘤中，一些关于抗体交叉反应的报道引发了对其诊断准确性的重要讨论。这些交叉反应可能影响对HER2表达的正确判断，尤其是在肿瘤细胞的胞质和细胞核中出现的非膜性信号。本文探讨了4B5抗体的识别机制，其在HER2以外的靶点如HER4和ZSCAN18上的交叉反应，并进一步揭示了4B5在多种肿瘤组织中出现胞质和核内信号的原因。通过表面等离子体共振（SPR

  来源：mAbs

  时间：2025-11-19

• 综述：先进的基于细胞因子的免疫疗法：定向细胞内递送策略，以提高抗肿瘤效果并降低毒性

  近年来，癌症免疫治疗已成为肿瘤治疗领域的重要方向之一。传统的免疫疗法，如高剂量白细胞介素-2（IL-2），虽然在某些癌症治疗中展现了良好的临床效果，但其广泛的细胞受体结合特性也导致了显著的全身毒性。这种毒性限制了其在临床上的广泛应用，促使研究人员不断探索更精确的细胞因子传递策略，以提高治疗效果同时减少副作用。因此，开发出一种能够“cis”靶向特定免疫细胞群体的细胞因子递送方式，成为了当前研究的热点。细胞因子是免疫系统中重要的信号分子，它们通过与特定的细胞表面受体结合，调控免疫反应的多个阶段，包括T细胞的增殖、分化、迁移和功能维持。以IL-2、IL-7、IL-15和IL-21为代表的γ链细胞因子

  来源：mAbs

  时间：2025-11-19

• 雪貂Fcγ受体的IgG结合特性

  本研究聚焦于通过分析小动物模型中的抗体（Ab）与Fcγ受体（FcγR）之间的相互作用，以期为临床前研究提供更精确的参考依据。作为重要的实验动物模型，仓鼠（Mustela putorius furo）在模拟人类呼吸道病毒感染和免疫反应方面具有独特优势。近年来，仓鼠因其在呼吸系统生理结构和病原体传播特性上与人类高度相似，被广泛用于评估疫苗免疫原性、被动抗体转移效果及多种病毒的感染机制。然而，与人类和小鼠相比，关于仓鼠中FcγR及其与抗体的结合特性研究仍显不足。为此，本研究首次系统地鉴定并表征了仓鼠的FcγRI、FcγRII和FcγRIII受体，探索其与仓鼠及人类IgG的结合特性，并进一步分析糖基化

  来源：mAbs

  时间：2025-11-19

• β-肾上腺素信号阻断通过激活细胞毒性CD4 T细胞抑制肿瘤转移

  肿瘤微环境是一个复杂的生态系统，不仅包含癌细胞和免疫细胞，还受到神经系统的密切调控。近年来，神经-肿瘤相互作用成为癌症研究的热点，其中交感神经系统释放的儿茶酚胺通过β-肾上腺素受体(β-adrenergic receptor, βAR)信号通路影响肿瘤进展的多个方面。研究表明，β-肾上腺素信号能够促进肿瘤生长、血管生成和免疫抑制，但对其在肿瘤转移过程中的具体作用机制，尤其是对免疫系统的调控方式，仍有许多未知。丹麦癌症免疫治疗国家中心的研究团队在《Nature Communications》上发表的最新研究，深入探索了β-肾上腺素信号阻断在肿瘤转移中的作用机制。研究人员发现，非选择性β-阻断剂普

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-19

• 乳腺癌重塑前哨淋巴结淋巴管生态：单细胞与空间转录组学揭示MGP介导的转移新机制

  当乳腺癌细胞开始它们漫长的征途时，首先抵达的"前哨基地"便是前哨淋巴结。这个本应是人体免疫防御的关键堡垒，却在癌症的侵蚀下发生了惊人的转变——从免疫卫士的据点演变为癌细胞扩散的中转站。尽管小鼠模型研究已证实肿瘤诱导的淋巴管生成能促进淋巴结转移，但人类淋巴结中淋巴管内皮细胞在肿瘤影响下究竟如何变化，始终是肿瘤学研究领域的盲区。为了解决这一关键问题，来自芬兰图尔库大学的研究团队在《Nature Communications》上发表了突破性研究。他们通过对初治乳腺癌女性患者配对获取的转移和非转移淋巴结进行高精度单细胞转录组和空间转录组分析，首次绘制出人类淋巴结淋巴管内皮细胞在肿瘤影响下的重塑图谱，并

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-19

• 人源细胞器SPFH蛋白复合物的高分辨率冷冻电镜结构解析揭示其独特组装机制与功能意义

  在细胞这座精密的生命工厂中，膜结构如同分工明确的车间，而驻扎在膜上的蛋白质机器则是完成各类生命活动的关键执行者。其中，SPFH蛋白家族（以其代表成员Stomatin、Prohibitin、Flotillin和HflK/C命名）作为一个在生命三界中广泛存在且结构古老的蛋白家族，通过形成独特的环状寡聚化复合物，在细胞膜组织、蛋白质质量控制等基础生命过程中扮演着重要角色。尤其引人注目的是，这些蛋白复合物大多锚定在膜上，形成圆顶状的分子笼结构，但其精确的组成结构和工作机制长期以来如同一个“黑箱”，困扰着科学家们。尽管先前的研究已解析了细菌中的HflK/C复合物、胞质中的vault复合物和flotill

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-19

• COVID-19与心血管疾病长期风险：基于瑞典总人群的社会因素与疫苗接种影响研究

  当全球刚刚从COVID-19大流行的急性冲击中缓过神来，一个潜在的长期健康危机正悄然浮现——越来越多的证据表明，SARS-CoV-2感染可能对心血管系统造成持久伤害。尽管早期研究主要集中在重症住院患者身上，但占感染绝大多数的轻症病例的心血管风险始终是个未知数。更令人担忧的是，随着病毒不断变异和季节性流行成为常态，准确评估COVID-19后心血管并发症的长期风险模式变得尤为紧迫。以往的研究存在明显局限：多数聚焦疫情早期阶段，随访时间较短，且未能充分考虑疫苗接种状态和社会经济因素的作用。特别是关于轻症感染者的心血管风险数据极为有限，而这部分人群的预防需求可能最为广泛。正是在这样的背景下，瑞典哥德堡

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-19

• CFTR调节剂ETI通过改善宿主生理驱动囊性纤维化微生物组重构：IMMProveCF IV期试验

  囊性纤维化(CF)是一种危及生命的遗传性疾病，由CFTR基因突变引起，导致上皮细胞氯离子通道功能受损。这种缺陷使得患者呼吸道和消化道分泌异常粘稠的黏液，为细菌感染创造了温床，引发慢性炎症和组织损伤。在CFTR调节剂问世之前，患者需要长期大量使用抗生素来控制感染，这反而加剧了微生物群落失调，促进了金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)和铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)等病原体的定植。尽管2019年获批的三联CFTR调节剂疗法elexacaftor/tezacaftor/ivacaftor(ETI)通过恢复CFTR功能显著改善了CF患者的肺功能和临

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-19

• NUP98-HOXA9癌蛋白从纳米组装体到宏观相分离的构象扩张机制揭示转录调控新范式

  在真核细胞的基因调控网络中，转录因子（Transcription Factors, TFs）如同精准的分子开关，通过识别特定DNA序列并招募转录机器，控制着基因的时空表达。绝大多数转录因子具有嵌段共聚物般的结构特征：一端是折叠有序的DNA结合结构域（DNA-binding domain, DBD），另一端则是富含固有无序区域（Intrinsically Disordered Regions, IDRs）的柔性片段。近年来，研究揭示转录因子及其协同蛋白可通过液-液相分离（Liquid-Liquid Phase Separation, LLPS）形成动态的“转录凝聚物”（Transcription

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-19

• 从组合到联合：大脑表征动态转换驱动认知任务学习的机制突破

  每天学新技能时，大脑像临时拼装乐高：先随手抓起通用模块（组合编码）快速搭出“能用”的模型，再反复打磨成专用零件（联合编码）使动作又快又准。这套“从通用到专用”的直觉虽耳熟能详，却从未在活人脑中看到实时全景。过去研究只能捕捉到练习后激活降低或少数脑区增强的碎片信号，对“表征几何”如何重塑、不同脑系统如何分工缺乏计算层面的动态描述。正因为缺这张“高清路线图”，人们无法解释为何初学易相互干扰、熟练后却自动防串扰，也难以阐明海马-小脑等记忆结构在认知学习中的确切角色。Ravi D. Mill 与 Michael W. Cole团队决定填补这一空白。他们综合语言理论、长期记忆与互补学习系统（comple

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-19

• 控制感通过提升预期精度调节疼痛感知的神经机制

  疼痛是一种复杂的感官和情感体验，受到多种心理因素的显著调节。其中，控制感——即个体认为自己能够影响或改变环境事件的能力——长期以来被认为是调节疼痛感知的关键因素。然而，关于控制感如何影响疼痛的机制存在争议：一种直观的理论认为，失去对疼痛的控制会增加不愉快感并导致更高的疼痛评分；而疼痛的信息价值理论则提出，施加控制的能力实际上可能会增加疼痛，因为机体可以通过远离疼痛源来应对。更复杂的是，以往研究中控制感常常与可预测性相混淆，因为可感知为可控的刺激通常也是可预测的。这种混淆可能解释了为什么有些研究发现控制感与疼痛强度降低相关，而另一些研究则观察到控制感对疼痛没有行为效应甚至会增加疼痛。近年来，概念

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-19

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