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scSemiPLC:一种半监督学习框架,通过聚类生成伪标签来注释单细胞RNA-Seq数据
本文针对单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据中细胞注释的挑战,提出了一种新型半监督学习框架scSemiPLC。该框架通过结合对比学习预训练、聚类驱动的伪标签生成以及一致性正则化机制,显著提升了细胞注释的效率和准确性,尤其在利用少量标注数据时表现突出。### 背景与问题传统细胞注释方法依赖人工标记的基因特征,存在效率低、可扩展性差等缺陷。随着scRNA-seq数据规模的扩大和复杂性的增加,自动注释方法面临两大核心问题:1. **标注数据稀缺性**:高质量标注数据获取成本高,且难以满足大规模训练需求;2. **伪标签质量不稳定**:现有半监督方法多采用固定阈值筛选伪标签,导致大量未利用数据被
来源:mSystems
时间:2025-12-09
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古DNA揭示日本Palaeoloxodon naumanni的早期演化:欧亚直齿象演化史的新篇章
在漫长的地球历史中,象类曾是北半球和非洲广布的巨型动物群代表,其中直齿象属(Palaeoloxodon)的演化历程尤为复杂。这一属类起源于非洲,约78万年前开始向欧亚大陆扩散,但其分类关系长期存在争议:其臼齿形态类似亚洲象(Elephas),而颅骨特征又接近非洲象(Loxodonta)。更棘手的是,欧亚大陆的Palaeoloxodon化石被划分为两种主要颅骨形态——原始的“Stuttgart形态”(以弱化的顶枕嵴为特征)和衍生的“namadicus形态”(顶枕嵴显著前伸)。这两种形态究竟代表不同物种、个体发育阶段,还是种群内变异?这一问题因缺乏古遗传学证据而悬而未决。日本群岛在更新世期间因海平
来源:iScience
时间:2025-12-09
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短链脂肪酸丁酸和乙酸通过G蛋白偶联受体43/FFAR2限制寨卡病毒的复制及其相关的眼部病变
本研究聚焦于短链脂肪酸(SCFAs)在抗寨卡病毒(ZIKV)感染及缓解病毒相关眼部并发症中的作用机制。短链脂肪酸是肠道菌群代谢的主要产物,包括丁酸、丙酸和乙酸等,近年来被发现具有广泛的抗病毒和调节免疫功能。然而,其对抗ZIKV感染及眼部损伤的具体机制尚未明确。研究团队通过体外细胞实验和体内小鼠模型,系统性地揭示了SCFAs(以丁酸衍生物苯丁酸和乙酸钠为代表)抑制ZIKV复制的双重机制——既通过直接灭活病毒颗粒发挥作用,又通过调控宿主免疫应答减少炎症反应和细胞死亡。在体外实验中,利用人眼小梁网细胞(HTMCs)模型,研究发现苯丁酸(PBA)和乙酸钠(NaAc)能显著降低ZIKV的复制效率,表现为
来源:Journal of Virology
时间:2025-12-09
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人类巨细胞病毒(CMV)次级包膜的形成需要gM/gN糖蛋白复合体,并涉及棕榈酰化过程
该研究系统探讨了人巨细胞病毒(HCMV)gM/gN复合体在病毒次级包膜形成中的关键作用,并通过多组学实验揭示了脂肪酸棕榈酰化修饰的调控机制。研究采用病毒突变体、siRNA干扰和电子显微镜技术,从病毒组装的时空组织、复合体功能定位及动态调控三个维度构建了完整的病毒形态发生模型。在病毒组装的时空调控方面,研究发现HCMV次级包膜形成存在严格的区域化特征。通过3D电子断层扫描技术观察到,病毒核衣壳在cVAC(病毒胞质组装室)中呈现中心富集的典型分布模式。突变体TB-gN-C123S病毒感染的细胞中,约78%的未包膜核衣壳异常聚集于cVAC边缘的Golgi膜区,且这种分布异常与病毒颗粒释放效率下降超过
来源:Journal of Virology
时间:2025-12-09
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基于网络分析揭示miRNA调控2型糖尿病β细胞胰岛素分泌的分子机制
随着全球糖尿病患病率的持续攀升,2型糖尿病(T2D)已成为严峻的公共卫生挑战。预计到2050年,全球糖尿病患者将达到8.53亿人。这种代谢性疾病的核心特征包括胰腺β细胞胰岛素分泌功能障碍和外周胰岛素抵抗。在疾病发展过程中,β细胞会通过代偿机制应对胰岛素需求增加,但最终导致功能衰竭。深入理解β细胞胰岛素分泌的分子调控机制,特别是其在高血糖状态下功能失调的原因,对于开发更有效的治疗方法至关重要。近年来,越来越多的证据表明微小RNA(microRNA, miRNA)在T2D发病过程中的β细胞代偿机制中发挥着重要作用。这些长度约22个核苷酸的非编码RNA通过结合靶信使RNA(mRNA)的3'非翻译区(
来源:iScience
时间:2025-12-09
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靶向TAZ特异性小分子抑制剂Alexidine抑制乳腺癌侵袭和转移的研究
乳腺癌是全球女性发病率最高的恶性肿瘤,其中转移性乳腺癌是导致患者死亡的主要原因。尽管当前治疗手段不断进步,但对转移性乳腺癌患者的治疗效果仍不理想,特别是三阴性乳腺癌患者往往面临更差的预后。这一临床困境促使科学家们寻找新的治疗靶点和策略。在乳腺癌的发生发展过程中,Hippo信号通路的关键转录共激活因子TAZ发挥着至关重要的作用。研究表明,TAZ在乳腺癌中的过表达频率高于其同源物YAP,且与肿瘤干细胞特性的维持、转移行为以及耐药性密切相关。TAZ主要通过与其转录因子TEAD相互作用,调控下游基因的表达,从而促进肿瘤细胞的迁移、侵袭和转移。因此,破坏TAZ-TEAD相互作用被认为是治疗乳腺癌的潜在策
来源:iScience
时间:2025-12-09
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乳腺癌中CTBP1的组织和细胞类型特异性基因调控:结合单细胞分析和成像数据的综合研究
该研究通过整合多组学数据,系统揭示了CTBP1在乳腺癌中的双重调控机制及其临床潜在价值。研究团队构建了涵盖基因组、单细胞转录组和MRI放射组学的综合分析框架,重点探讨了 succinylation 修饰通路与乳腺癌发展的关联性。在基因组层面,研究采用孟德尔随机化(MR)方法验证了CTBP1作为潜在保护因子的遗传关联性。基于国际基因组队列(IEU OpenGWAS)的eQTL数据,发现CTBP1基因表达与乳腺癌风险呈显著负相关(OR=0.95,95%CI 0.908-0.999,p=0.04)。补充的SMR分析进一步确认了该基因在乳腺癌预后中的保护作用(SMR OR=0.93,p=0.02),并
来源:Breast Cancer: Targets and Therapy
时间:2025-12-09
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双重受体靶向作用确保了低密度脂蛋白-二十二碳六烯酸纳米颗粒在多种乳腺癌细胞亚型中的摄取及抗癌疗效
### 乳腺癌治疗新策略:基于工程化低密度脂蛋白纳米颗粒的DHA递送系统#### 背景与意义乳腺癌的异常脂质代谢已被广泛认为是其发病和进展的核心机制之一。肿瘤细胞通过高表达LDLR(低密度脂蛋白受体)和SR-B1( scavenger receptor class B type 1)等受体过度摄取外源性胆固醇,以满足快速分裂和增殖的能量需求。传统化疗药物存在靶向性差、肿瘤渗透率低等问题,而基于脂蛋白的纳米递送系统因其天然生物相容性和靶向潜力受到关注。本研究创新性地将天然Omega-3脂肪酸DHA封装于工程化LDL纳米颗粒中,通过靶向肿瘤细胞的脂质代谢特征实现高效治疗。#### 研究方法实验采用
来源:Breast Cancer: Targets and Therapy
时间:2025-12-09
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基于放射组学的Nomogram在乳腺癌中预测HER-2状态的开发与验证:一项包含小规模验证队列的回顾性研究
本研究旨在通过整合多模态MRI影像特征与临床数据,构建首个基于radiomics的预测模型用于非侵入性评估乳腺癌HER-2表达状态。该模型经训练集(320例)和验证集(96例)双重验证,在预测HER-2阳性状态的AUC值分别达到0.866和0.876,显著优于传统影像诊断方法。研究创新性地将影像组学特征与肿瘤微环境免疫指标结合,发现HER-2阳性肿瘤具有独特的影像表现和免疫微环境特征,为乳腺癌精准治疗提供新思路。一、研究背景与意义乳腺癌HER-2状态是决定治疗方案的关键分子标志物。传统检测方法(IHC/FISH)存在创伤性、成本高、难以评估多中心病变等局限。本研究通过多模态MRI(DCE-MR
来源:Breast Cancer: Targets and Therapy
时间:2025-12-09
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综述:等离子体生物传感器和致动器用于集成即时诊断
纳米等离子体光学天线正引领着分子诊断领域的变革。它们不仅能够作为高灵敏度的传感器,还能作为高效的致动器,在即时诊断(POC)平台上实现从样本到结果的完整分析流程。本文将围绕等离子体生物传感与致动技术的核心进展展开论述。等离子体致动器用于捕获和富集核酸、蛋白质、外泌体、细胞及病原体一种被称为等离子体光学镊子的精细方法,能够捕获如核酸、蛋白质、外泌体、细胞和病原体等生物分子,即使在低浓度下也能实现,从而极大减少了对大量样本制备设备和化学品的需求。这些捕获平台中的光学力源于光与物质的相互作用,主要受电磁场的散射力和梯度力影响。纳米结构的等离子体效应能够改善光学捕获,显著降低所需的光学功率。因此,结合
来源:npj Biosensing
时间:2025-12-09
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综述:微型化光电化学生物分析
光电化学传感技术作为生物医学分析领域的重要工具,近年来在微纳米电极的集成应用方面取得了显著突破。该技术的核心在于通过光能激发与电化学信号转化的耦合作用,实现对复杂生物样本中目标物质的精准检测。研究团队系统梳理了微纳米电极在光电化学分析中的关键进展,从电极架构设计到检测机制,再到实际应用场景,构建了完整的理论框架和技术路线。在电极架构创新方面,研究者将传统宏观电极微型化并赋予光响应特性。光纤电极凭借其柔韧性和光学隔离优势,在体液检测中展现出优异性能,例如对血液中葡萄糖的连续监测。金属纳米线阵列通过表面氧化处理形成稳定的光电界面,特别适用于高浓度离子检测。碳基微电极因其独特的本征电催化活性,在单细
来源:TrAC Trends in Analytical Chemistry
时间:2025-12-09
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ZONAB基因调控nphp1基因敲除小鼠中的肾囊肿形成过程
Jiayong Lai|XiaoYa Wei|Dantong Li|Xiaohong Wu|Yaqing Liu|Huamu Chen|Zhihui Yue|Liangzhong Sun南方医科大学南方医院儿科,中国广州510515摘要肾小管扩张和皮质-髓质交界处的囊肿形成是肾髓质发育不良(NPH)的典型病理特征,可能与疾病进展有关。然而,NPH中肾囊肿形成的具体机制尚不清楚。细胞增殖的增加是囊肿形成的必要条件。ZONAB是一种与紧密连接相关的转录调控因子,能够靶向CCND1和PCNA等增殖相关因子。在本研究中,我们探讨了ZONAB在nphp1敲除(nphp1KO)小鼠中肾囊肿形成中的作用及其
来源:Translational Research
时间:2025-12-09
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综述:金属-有机框架/生物分子杂化材料在生物标志物检测和生物成像领域的最新进展
金属有机框架(MOF)与生物分子杂化系统在精准医学中的创新应用与挑战金属有机框架材料凭借其可调控的孔道结构、高比表面积和丰富的化学配位位点,正逐步成为生物医学检测与成像领域的关键载体。近年来,研究者通过系统整合DNA、酶、多肽等生物分子与MOF骨架,开发出具有多重功能优势的杂化体系。这类材料在保持MOF固有特性的基础上,显著提升了生物分子识别能力与信号转导效率,为解决传统诊断技术灵敏度不足、特异性不高等问题提供了新思路。在杂化系统构建策略方面,表面吸附法通过MOF表面官能团与生物分子的非共价相互作用实现快速负载,但存在分子脱落风险。针对这一缺陷,孔隙封装技术利用MOF可调孔径特性实现生物分子精
来源:TrAC Trends in Analytical Chemistry
时间:2025-12-09
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G9a-TRIM21轴通过诱导依赖于甲基化的泛素化作用以及FoxO3a的降解来加剧糖尿病性肾缺血-再灌注损伤,从而促进氧化应激和焦亡的发生
本研究聚焦于糖尿病缺血再灌注损伤(RIRI)的分子机制,首次揭示了组蛋白甲基转移酶G9a通过非组蛋白修饰调控FoxO3a蛋白稳定性,进而影响氧化应激和细胞焦亡的核心作用。该研究构建了糖尿病RIRI动物模型和细胞模型,结合蛋白质组学、分子互作分析和表位修饰技术,系统解析了G9a介导的FoxO3a降解通路的分子细节。在糖尿病RIRI病理进程中,G9a表达显著上调。通过建立条件性敲除G9a的小鼠模型,实验证实G9a缺失可显著减轻糖尿病RIRI的肾脏损伤,表现为血清肌酐(Cr)和尿素氮(BUN)水平下降,肾小管病理损伤评分降低,同时氧化应激标志物MDA含量下降,抗氧化酶SOD活性提升。这一系列结果在动
来源:Redox Biology
时间:2025-12-09
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基于近端线索的气候灾害备灾信息个性化干预:提升气候韧性的行为科学证据
随着气候变化加剧,野火、洪水等极端天气事件频发,给全球社区带来日益严峻的威胁。以美国为例,1980-2019年间年均造成10亿美元以上损失的气候灾害仅7.2起,而2019-2023年间这一数字激增至年均20.4起。2025年初的南加州野火更烧毁逾5.7万英亩土地,导致20万人流离失所。然而,尽管风险迫在眉睫,推动个体采取防护措施仍面临巨大挑战——许多房主对抽象的长期风险无动于衷,甚至拒绝遵循建筑规范进行房屋加固。这种“行动滞后”现象背后,是气候风险的心理距离(psychological distance)在作祟:当人们认为威胁遥远、模糊或与自身无关时,行动意愿便会骤减。为破解这一难题,斯德哥尔
来源:Nature Human Behaviour
时间:2025-12-09
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肝脏来源的循环血浆纤维连接蛋白调节成年雄性小鼠的骨小梁骨量和骨形成,其在血清中的水平与老年男性的骨密度相关
该研究聚焦于血浆纤维连接蛋白(pFN)在成年骨骼健康中的功能机制及其临床关联性。通过构建肝特异性纤维连接蛋白敲除小鼠模型,结合显微CT、双能X线吸收测定及组织学分析,揭示了pFN在骨形成与维持中的关键作用,并首次证实其性别差异效应。研究团队以6月龄雄性小鼠为实验对象,发现相较于野生型对照组,纤维连接蛋白缺失组存在显著骨量流失,表现为胫骨和椎骨骨小梁密度下降、骨矿化面积缩减,同时血清骨碱性磷酸酶(PINP)等骨形成标志物水平降低。值得注意的是,这一表型在雌性小鼠中并未出现,提示pFN的生物学效应存在性别特异性。研究创新性地通过异位标记追踪技术,证实血浆来源的纤维连接蛋白能够定向富集于骨髓微环境中
来源:Matrix Biology
时间:2025-12-09
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ROS/pH动态响应型可注射水凝胶通过重建氧化应激微环境来改善椎间盘退变
椎间盘退行化(IVDD)是导致慢性腰背痛的主要原因,其病理机制与细胞微环境中活性氧(ROS)过度积累密切相关。ROS的异常积累会触发细胞凋亡、炎症反应及细胞外基质(ECM)代谢失衡,最终导致椎间盘结构破坏和功能丧失。近年来,智能水凝胶因其响应性、生物相容性和可降解性成为组织工程领域的热点材料。本研究团队创新性地构建了CMC-PBA/ODEX/HMP@Lut三重功能水凝胶,通过分子级交联设计实现pH和ROS双响应特性,为IVDD治疗提供了全新策略。### 一、研究背景与科学问题IVDD的病理进程涉及多因素协同作用。研究表明,椎间盘细胞微环境中的ROS失衡是驱动退变的关键机制:一方面,酸性环境(p
来源:Materials Today Bio
时间:2025-12-09
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NIR-II响应型导电丝素微针贴片:用于术后黑色素瘤消融、感染伤口愈合及实时监测
该研究针对术后黑色素瘤管理的临床难题,开发了一种基于天然生物材料的多功能一体化微针贴片系统,实现了肿瘤治疗、感染控制、伤口愈合监测及实时反馈的协同作用。以下从技术路径、创新突破、临床价值三个维度进行解读:一、技术路径创新1. 材料体系重构采用丝绸纤维蛋白(SFMA)与改性β-环糊精(Ac-β-CD)构建复合水凝胶基质,通过光交联形成具有三维多孔结构的微针阵列。这种材料体系兼具生物相容性(源自天然蚕丝蛋白)和机械性能(压缩强度达131.9 kPa),可稳定穿透角质层(平均入皮深度450μm)。2. 功能模块集成- 光热治疗单元:引入 лигносульфат-допированный полиг
来源:Materials Today Bio
时间:2025-12-09
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自调节的新西番莲素/丝素蛋白复合气凝胶:通过pH响应性释放促进伤口愈合
本研究针对慢性伤口治疗中存在的炎症持续、氧化应激失衡及组织修复效率低下等核心问题,创新性地开发了基于天然材料的多功能气凝胶敷料MT-LCA+SF-Ne。该材料通过整合木屑纤维素气凝胶(MT-LCA)、丝心蛋白(SF)和橙皮苷(Ne)三重活性成分,构建了具有pH响应释药特性、机械性能优异及生物相容性良好的新型伤口治疗体系。在材料构建方面,研究团队采用离子液体辅助处理技术,通过部分溶解木屑纤维素获得多级孔结构的MT-LCA基材。该基材具有超过200 kPa的压缩模量,其三维互联的孔道系统(孔径50-200 μm)既能有效吸收渗出液,又为活性成分提供了缓释载体。通过超声处理将丝心蛋白与橙皮苷复合封装
来源:Materials Today Bio
时间:2025-12-09
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硝普钠通过HO-1/NOX和AKT/eNOS信号通路改善慢性肾脏疾病中的缺血诱导性新生血管形成
慢性肾脏病(CKD)患者的血管并发症管理研究进展CKD患者普遍存在血管内皮功能障碍和缺血性血管病变的临床特征。台湾阳明大学医学院的研究团队通过建立5/6肾切除联合单侧下肢缺血的小鼠模型,系统研究了钠硝普钠(SNP)在改善CKD相关血管病变中的作用机制。该研究揭示了新型血管生成促进策略,为CKD合并外周动脉疾病(PAD)的干预提供了理论依据。CKD患者的血管并发症具有显著病理特征。随着肾小球滤过率(GFR)下降,血液中积累的尿毒症毒素(如ADMA、IS)通过多重机制导致血管内皮损伤。ADMA作为一氧化氮合成酶(NOS)的竞争性抑制剂,不仅降低NO生物利用度,还会诱导eNOS解耦联,使细胞从NO生
来源:Life Sciences
时间:2025-12-09