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  • 从代谢流分析到自包含细胞模型:系统生物学中质量守恒与热力学约束的数学框架

    2 案例研究2.1 生化反应系统中的质量平衡所有确定性模型的核心特征是质量守恒,这在单个生化反应和整个细胞模型中均适用。质量守恒通过化学计量矩阵(N)实现,其维度为l×q(l为化合物数量,q为反应数量)。关键方程N·r=0描述了稳态下的代谢通量分布,其中r代表反应速率向量。值得注意的是,生长速率μ作为稀释项出现在质量平衡方程中,其定义为生物量随时间的变化率。2.2 无生物量流出的通量模型通过简化网络示例,文章展示了如何利用线性规划求解通量分布。当反应数量超过化合物数量时,解空间呈现无限多解。此时需要引入目标函数(如最大化特定反应速率或最小化总通量和)来获得生理相关解。典型案例显示,不同目标函数

    来源:Frontiers in Systems Biology

    时间:2025-08-23

  • 乙烯抑制剂AVG与1-MCP调控'Ambrosia'和'富士'苹果采前落果、裂果及品质的分子机制研究

    1 引言苹果产业面临采前落果和裂果导致的重大经济损失,尤其在'Ambrosia'和'富士'等主栽品种中更为突出。乙烯作为关键植物激素,通过调控果实成熟、离区形成和细胞壁代谢参与这些过程。氨基乙氧基乙烯基甘氨酸(AVG)通过抑制1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶(ACS)阻断乙烯合成,而1-甲基环丙烯(1-MCP)则通过竞争性结合乙烯受体(ETR/ERS)抑制信号传导。然而,针对中东海岸气候条件下两种调节剂的时效性和剂量效应缺乏系统研究。2 材料与方法研究在美国宾夕法尼亚州Aspers的果园进行,采用随机区组设计,设置130 mg a.i. L−1 AVG(全剂量)、65 mg a.i. L−1 A

    来源:Frontiers in Plant Science

    时间:2025-08-23

  • FLT3突变急性髓系白血病患者中吉瑞替尼的真实世界疗效:意大利多中心研究数据

    FLT3突变急性髓系白血病治疗新进展:吉瑞替尼意大利真实世界研究解读背景与方法急性髓系白血病(AML)是全球癌症相关死亡的第十一大原因,过去30年发病率增加15%。分子特征已成为AML诊断、分类和治疗的核心,其中FLT3突变是最重要的治疗靶点之一。吉瑞替尼作为I型FLT3抑制剂,可同时靶向FLT3-ITD和TKD突变。这项多中心回顾-前瞻性观察研究(REL-AML 002/2021)纳入意大利27家医院自2018年1月起参与EAP计划的205例R/R FLT3突变AML患者,旨在评估吉瑞替尼在真实临床实践中的疗效。研究人群患者中位年龄60岁(18-87岁),54.1%为女性。79.5%患者接受

    来源:Cancer

    时间:2025-08-23

  • 囊性纤维化患者伯克霍尔德菌复合体(BCC)四株临床菌株完整基因组解析及其临床意义

    这项突破性研究揭示了囊性纤维化(CF)患者肺部致命性感染的分子特征。伯克霍尔德菌复合体(BCC)作为CF患者的重要条件致病菌,其基因组结构复杂程度令人惊叹——研究团队从加拿大CF患者临床样本中分离的4株菌株,经多焦点序列分型(MLST)鉴定包含Burkholderia cenocepacia、B. contaminans和B. multivorans三个物种,每株菌均携带3条环状染色体(大小从549kb到3.8Mb不等),部分菌株还含有1-2个质粒。研究采用创新的双平台测序策略:牛津纳米孔MinION平台获得超长读长(N50最高达19.4kb),结合Illumina MiSeq短读长数据(Q3

    来源:Microbiology Resource Announcements

    时间:2025-08-23

  • 温带与亚热带环境下WOFOST-Potato模型的时间依赖性敏感性分析及其对马铃薯气候适应性建模的启示

    在全球气候变化背景下,马铃薯作为第四大粮食作物,其种植范围正从传统温带地区向亚热带扩展。然而,当前广泛使用的作物生长模型WOFOST-Potato主要基于温带环境数据开发,对高温条件的模拟存在显著局限性。尤其在印度等亚热带地区,马铃薯作为冬季作物面临生长季初期和末期的高温胁迫,而现有模型对光合作用高温响应的参数化可能低估了作物的实际适应能力。这一问题直接影响了模型在粮食安全预测和气候适应性育种中的应用价值。为突破这一瓶颈,Jian Liu等研究人员在《European Journal of Agronomy》发表研究,首次将时间依赖性敏感性分析应用于WOFOST-Potato模型。团队选取荷兰

    来源:European Journal of Agronomy

    时间:2025-08-23

  • 印度中部有机与常规棉作系统长期经济及产量比较:小麦-大豆轮作视角

    在全球有机产品需求激增的背景下,印度作为世界最大棉花种植国(超1300万公顷),其小农户面临传统Bt棉种植成本攀升、害虫抗性加剧(如粉红棉铃虫)及气候不确定性的多重挑战。尽管有机棉产量占全球首位,但关于有机与常规系统长期经济可行性的科学证据仍存争议。印度中部典型的棉花-小麦/大豆轮作体系如何平衡生产力与盈利性?这项发表在《European Journal of Agronomy》的研究通过16年田间试验给出答案。研究团队采用随机区组设计,在中央邦尼马尔河谷(北纬22°8',东经75°4')建立长期试验平台,比较四种生产系统:生物动力(BIODYN)、有机(BIOORG)、常规(CON)和Bt棉

    来源:European Journal of Agronomy

    时间:2025-08-23

  • Vorceed™ Enlist®玉米与SmartStax® PRO杂交种对玉米根虫的田间防效、成虫羽化及产量影响研究

    Highlight单株羽化试验2022-2023年在美国玉米带12个地点进行的田间试验显示,Vorceed™ Enlist®玉米所含的CRW抗性事件(DP-004114-3 × MON-87411-9)在自然感染条件下表现优异。试验田前茬为商业玉米或诱捕作物(表3),采用零膨胀负二项模型(Bliss & Fisher, 1953)分析每株成虫羽化数量,模型参数包括处理组(Tm)和零值概率(πk)。成虫羽化两年间从12个试验点共收集2,292头玉米根虫成虫,其中北方根虫(NCR)仅占6.7%。数据显示,对照组的西方根虫(WCR)羽化量(12.8 ± 1.01头/株)显著高于转基因处理组(

    来源:Crop Protection

    时间:2025-08-23

  • 跨物种非语言发声中的"是"与"否"声学编码:人类对犬类指令的声学特征研究

    在动物与人类的交流中,一个长期存在的谜题是:在没有语言辅助的情况下,简单的肯定/否定指令能否通过声音的物理特性实现跨物种传递?传统研究认为,哺乳动物的声音交流主要局限于自我参照的情感表达(如"接近我"或"避开我"),而人类独特的语言能力使其能够传达更抽象、情境无关的指令。但这是否意味着非语言发声就无法承载这类基础语义?这项发表在《Cognition》上的研究给出了突破性答案。为探究这个问题,来自匈牙利罗兰大学的行为学研究团队设计了一套精巧的实验范式。研究聚焦人类与家犬这对特殊的跨物种组合——犬类因其与人类共生的独特历史,成为研究跨物种声音解码的理想模型。实验要求52名人类参与者用中性音节"bü

    来源:Cognition

    时间:2025-08-23

  • 幼儿概率推理能力的发展轨迹:从启发式策略到比例推理的转变

    概率推理是人类认知系统的核心能力之一,但关于这种能力何时形成却存在长达半个世纪的学术争议。经典发展理论代表Piaget认为儿童直到12岁才能理解概率概念,而现代研究团队如Denison却发现12个月婴儿已具备概率直觉。这种巨大分歧源于方法论差异:早期研究依赖语言表达可能低估儿童能力,而近期实验发现婴儿的"概率选择"可能只是父母无意识引导的结果。更复杂的是,不同研究使用的概率比率(LR)、实验范式(如实体瓮vs虚拟动画)和策略控制方法存在显著差异,导致3-5岁这个关键发展窗口的研究结论相互矛盾。为厘清这些问题,Sarah Placì团队在《Cognition》发表的研究中,创新性地设计了在线交互

    来源:Cognition

    时间:2025-08-23

  • 红藻B-藻红蛋白胰酶消化释放的色肽对SARS-CoV-2主蛋白酶的抑制活性研究

    亮点• B-藻红蛋白(B-PE)消化产物对SARS-CoV-2主蛋白酶(Mpro)的抑制活性显著优于C-藻蓝蛋白(C-PC)• 鉴定出11种含四吡咯色基的短肽(2-7个氨基酸),其IC50值达微摩尔级• 分子对接揭示色肽通过结合Mpro的Cys145-His41催化二元体发挥作用材料与方法实验采用食品级纯度的藻胆蛋白(C-PC纯度3.2,B-PE纯度1.2),通过胰酶模拟肠道消化。使用RP-HPLC分离活性组分,并通过MALDI-TOF/TOF质谱解析色肽序列。抗Mpro活性采用荧光底物法测定,结合分子动力学模拟(100 ns)验证结合稳定性。结论本研究首次证实红藻B-PE消化产生的色肽能靶向

    来源:Algal Research

    时间:2025-08-23

  • 基于血培养参数评估革兰阳性球菌菌血症患者感染性心内膜炎低风险分层模型的诊断效能研究

    感染性心内膜炎(IE)一直是临床诊断的棘手问题,特别是当患者出现由金黄色葡萄球菌(S.aureus)、链球菌或粪肠球菌(E.faecalis)引起的菌血症时。这些被Duke标准列为典型IE病原体的微生物,常常迫使医生进行包括经食道超声(TEE)在内的一系列心脏影像学检查。然而,这种"宁可错杀一千"的做法不仅增加医疗负担,也给患者带来不必要的痛苦和经济压力。当前虽有VIRSTA、POSITIVE等评分系统,但或因变量过多难以实施,或因预测性能不佳,始终未能真正解决临床困境。这项发表在《Open Forum Infectious Diseases》的研究另辟蹊径,聚焦两个简单直观的血培养参数:初始

    来源:Open Forum Infectious Diseases

    时间:2025-08-23

  • Farquhar-von-Caemmerer-Berry模型变体在参数估计中的误差机制及其对光合作用研究的影响

    光合作用模型是理解植物碳同化过程的核心工具,其中Farquhar-von-Caemmerer-Berry(FvCB)模型自1980年提出以来,已成为植物生理学、生态学乃至气候模拟的基石。然而随着模型广泛应用,文献中出现了多种变体方程,特别是"min-A变体"(通过最小化净同化速率确定限制因素)与原始"min-W变体"(通过最小化羧化速率确定限制因素)的差异长期未被系统评估。更令人担忧的是,约半数高引用论文和主流分析软件仍在使用可能产生显著误差的min-A变体,这给光合参数估计带来了潜在风险。为厘清这一问题,Edward B. Lochocki和Justin M. McGrath团队在《in s

    来源:in silico Plants

    时间:2025-08-23

  • 哑蟋蟀属(Goniogryllus)的进化之谜:基于整合分类学的翅型多态性与系统发育研究

    在直翅目(Orthoptera)蟋蟀科(Gryllidae)的演化长卷中,哑蟋ryllus属(Goniogryllus)因其独特的"沉默特性"引人注目。这项研究通过整合分类学方法,解开了这个主要分布于中国的特殊类群的身世之谜。研究团队发现,这个不会鸣唱的属竟与能发声的Phonarellus和Vietacheta属有着密切的亲缘关系,共同隶属于Gryllini族的Brachytrupina亚族。通过重建17个物种(包括6个新发现物种)的系统发育关系,研究者将哑蟋蟀属划分为两个明确的物种群。最令人惊讶的是翅型进化分析:虽然该属大多数成员具有无翅(apterous)、微翅(micropterous)

    来源:Insect Systematics and Diversity

    时间:2025-08-23

  • 烟草生长调节剂氟节胺(Flumetralin)的免疫毒性及细胞损伤机制研究

    烟草长达10个月的生产周期中,作为最常用的合成植物生长调节剂,氟节胺(Flumetralin)的毒性机制亟待阐明。研究团队采用RAW 264.7(巨噬细胞)和3T3(成纤维细胞)双模型,通过MTT法和中性红摄取实验证实其24小时暴露即可引发显著细胞毒性。有趣的是,该化合物在两类细胞中展现出截然不同的线粒体效应:巨噬细胞出现线粒体膜电位升高,而成纤维细胞则表现为线粒体去极化。但两者均出现活性氧(ROS)爆发,伴随促炎因子TNF-α显著升高,而抗炎因子IL-10则被抑制。更令人警惕的是,彗星实验(Comet assay)在所有测试浓度下均检测到3T3细胞DNA明显断裂。这些发现不仅揭示了氟节胺作为

    来源:Toxicology Research

    时间:2025-08-23

  • 妊娠期、哺乳期及断奶后初产母猪对玉米、大麦和麦麸标准回肠氨基酸消化率的评估

    这项创新研究揭示了初产母猪在不同生理状态下对饲料原料的消化特性差异。通过T型瘘管植入术,科研人员对比分析了妊娠限饲期、哺乳自由采食期以及断奶后自由采食/限饲两阶段中,玉米、大麦和麦麸的粗蛋白(CP)与氨基酸(AA)消化规律。实验采用精巧的8×3尤登方设计,8头安装回肠瘘管的初产母猪轮流接受四种日粮(玉米、大麦、麦麸及无氮日粮)处理。无氮日粮帮助测定基础内源性蛋白质和氨基酸损失。有趣的是:大麦组数据显示,妊娠母猪对组氨酸(His)、异亮氨酸(Ile)、赖氨酸(Lys)和苏氨酸(Thr)的表观回肠消化率(AID)显著高于断奶后限饲组(P<0.05)。而标准回肠消化率(SID)分析发现,妊娠期

    来源:Journal of Animal Science

    时间:2025-08-23

  • 气候变化下北美短叶松(Pinus banksiana)的水分利用效率与生长限制:干旱环境中的生理权衡与生态临界点

    在全球气候变化加剧的背景下, boreal 森林作为地球最大的陆地碳汇正面临严峻挑战。北美短叶松(Pinus banksiana)作为加拿大 boreal 区最具生态和经济价值的树种之一,其适应性机制直接关系到森林碳循环的稳定性。然而,日益升高的气温和蒸气压亏缺(VPD)正在改变树木的水分利用策略,特别是在排水迅速的砂质土壤上,树木如何平衡碳获取与水分消耗成为亟待破解的科学谜题。Oloruntobi Gideon Olugbadieye团队在《Tree Physiology》发表的这项研究,创新性地将树轮宽度测量与双稳定同位素技术相结合,沿着加拿大魁北克西部由黏土到砂质 esker 地形的土壤

    来源:Tree Physiology

    时间:2025-08-23

  • 石墨层间螺旋扭转最小化实现超高面外热导率的突破

    石墨作为散热材料的"双面性"令人又爱又恨——其面内热导率(in-plane thermal conductivity)高达2000 W m−1 K−1,但面外热导率却长期被低估在5-9 W m−1 K−1范围。最新研究像拆解俄罗斯套娃般揭开了这个谜团:石墨层间存在的螺旋扭曲(helical twist)就像打结的耳机线,会使碳原子偏离势能最低点,导致层间范德华相互作用(van der Waals interaction)减弱十倍。这种"分子级打结"现象对声子(phonon)来说犹如遭遇减速带,尤其阻碍其垂直方向传输,使得面外热导率骤降。研究团队通过精密调控晶体取向,将石墨面外热导率推升至13.

    来源:Matter

    时间:2025-08-23

  • 电动汽车温室气体减排效益研究:基于电网排放分配与充电调度的多维度分析

    随着全球碳中和进程加速,电动汽车(BEV)被视为交通领域减排的关键技术。然而关于BEV真实减排效益的争议持续存在——当考虑电网边际发电机组的排放特性时,BEV是否仍优于高效混合动力汽车(HEV)?这个问题的答案直接影响消费者选择和政策制定。现有研究多采用电网平均排放率(AER)评估,但美国国家科学院建议应采用边际排放率(MER)更准确反映电力需求变化带来的实际排放。这种评估方法的差异,加上充电行为的时空变异性,使得BEV环境效益评估充满不确定性。发表在《Cell Reports Sustainability》的这项研究通过创新性地整合多维度分析框架,为这场争议提供了系统性解答。研究团队开发了考

    来源:Cell Reports Sustainability

    时间:2025-08-23

  • 儿科真实世界数据中多时间变化暴露因素对生存分析的影响研究

    在医学研究中,生存分析是评估暴露因素与健康结局关系的核心方法。然而,当遇到时间变化暴露(TVE)这种"善变"的因素时,传统分析方法就会陷入困境——就像试图用静态照片记录舞蹈动作一样失真。特别是当多个TVE同时存在时,这种挑战更为突出。E.Gonzato等人在《Scientific Reports》发表的研究,就以儿科流感疫苗接种和抗生素使用这对"动态组合"为案例,揭示了正确处理多TVE的重要性。研究团队从意大利全国性儿科数据库Pedianet获取了56,069名6个月至14岁儿童的数据,跟踪观察2017-2018流感季节(10月1日至次年5月31日)。他们创新性地比较了六种不同建模方法:从简单

    来源:Scientific Reports

    时间:2025-08-23

  • 多民族队列中SARS-CoV-2感染的miRNA生物标志物:预后与治疗监测新策略

    在全球COVID-19大流行的背景下,SARS-CoV-2感染导致的临床表现存在显著异质性,从无症状到多器官衰竭不等。尽管核酸检测仍是诊断金标准,但缺乏能够预测疾病进展和预后的可靠生物标志物。更棘手的是,不同种族、性别和基础疾病患者的免疫应答差异,使得单一生物标志物的开发面临巨大挑战。正是在这样的背景下,Farah Mustafa和Waqar Ahmad等研究者将目光投向了microRNA(miRNA)——这类长约22个核苷酸的非编码RNA分子,因其组织特异性表达和在体液中的稳定性,已成为疾病诊断的新宠。特别值得注意的是,虽然血液miRNA研究较多,但作为SARS-CoV-2主要感染部位的呼吸

    来源:Scientific Reports

    时间:2025-08-23


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