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  • 古菌酪氨酸酶Tyr-CNK:木质素衍生芳香化合物高效生物催化的结构基础与机制创新

    木质素作为地球上最丰富的芳香生物聚合物,其高效转化是生物质资源利用的关键瓶颈。传统化学降解依赖高温强酸条件,而现有木质素修饰酶(如漆酶、过氧化物酶)种类有限且催化效率不足。尤其对于木质素中占比60%的β-O-4醚键,微生物酶系常需辅因子或氧化还原介质,制约工业化应用。韩国国立研究团队从海洋古菌Candidatus nitrosopumilus koreensis中发现的新型酪氨酸酶Tyr-CNK,为解决这一难题带来曙光。研究团队采用多学科技术手段:通过基因优化构建pET-23b表达载体获得Tyr-CNK及其成熟形式mTyr-CNK;利用X射线晶体学解析2.1Å分辨率酶结构;结合分子对接模拟分析

    来源:International Journal of Biological Macromolecules

    时间:2025-05-27

  • 明胶修饰不饱和聚氨酯的创新合成:通过增强细胞相容性与基因表达促进心脏再生

    心血管疾病占全球死亡原因的30%以上,心肌梗死(MI)后不可逆的心肌细胞死亡和有限的自愈能力使心脏组织修复成为重大挑战。传统治疗方法如心脏移植受限于供体短缺,而现有合成材料难以同时满足机械支撑与生物活性的双重需求。聚氨酯(PU)因其优异的弹性和生物相容性被视为潜在解决方案,但如何通过分子设计赋予其促进心肌再生的功能仍是未解难题。伊朗国家科学基金会支持的研究团队在《International Journal of Biological Macromolecules》发表创新成果,通过Baylis-Hillman反应合成含双键的链延伸剂(BH diol),将其引入PU骨架构建可修饰的硬段域,再利用

    来源:International Journal of Biological Macromolecules

    时间:2025-05-27

  • 通过整合纳米孔和Illumina测序技术解析山羊骨骼肌生长发育的关键调控因子LUC7L - 201

    论文解读在生命科学领域,山羊骨骼肌的生长和发育一直是研究的热点之一。然而,目前对于山羊转录组景观中的可变剪接(AS)及其与骨骼肌相关的关键异构体的研究,相较于猪等其他家畜物种还比较有限。为深入了解山羊骨骼肌生长的调控机制,国内的研究人员开展了此项研究。研究人员选取了马城黑山羊和波尔山羊的背最长肌作为样本,运用牛津纳米孔技术(ONT)全长测序和Illumina RNA - seq技术进行分析。通过对测序数据的深入挖掘,他们取得了一系列重要发现。在研究过程中,研究人员主要运用了两种关键技术方法。一是Oxford Nanopore Technologies全基因组测序,该技术能够对长链DNA分子进行

    来源:Genomics

    时间:2025-05-27

  • 基于长读长测序技术的FLG基因突变与拷贝数变异综合分析新策略

    皮肤作为人体第一道防线,其屏障功能的核心元件——聚丝蛋白(Filaggrin, FLG)的遗传变异与特应性皮炎、鱼鳞病等疾病密切相关。然而,FLG基因外显子3区域存在10-12个高度同源的重复序列,传统短读长测序技术难以准确解析其复杂变异。更棘手的是,不同人种中FLG拷贝数变异(CNV)的分布差异显著,东亚人群特有的12重复等位基因频率超50%,但现有检测方法对罕见CNV(如7/20重复)的识别能力不足,制约了皮肤疾病的精准风险评估。为突破这一技术瓶颈,日本国立儿童健康与发展中心等机构的研究团队创新性地开发了"单重PCR-长读长测序"整合方案。研究人员从东京儿童健康队列(T-Child Stu

    来源:Genomics

    时间:2025-05-27

  • 人工智能驱动的智能手机海绵传感器:基于His@Co-NC纳米酶的高灵敏度肌氨酸检测新技术

    研究背景与意义前列腺癌(PCa)早期诊断面临的核心挑战在于生物标志物肌氨酸(Sar)的尿液中浓度极低(0.5-5 μM),传统检测技术如质谱、ELISA等存在设备昂贵、操作复杂等问题。尽管纳米酶因其稳定性成为天然酶替代品,但其催化活性和信号输出强度仍难以满足临床需求。更棘手的是,低浓度检测时显色微弱,人工判读易产生主观误差。这些瓶颈促使研究者探索将纳米酶工程与人工智能相结合的创新解决方案。研究方法与技术路线国家自然科学基金资助的研究团队通过三步策略突破技术壁垒:1)设计组氨酸(His)修饰的单原子钴纳米酶(His@Co-NC),模仿天然酶活性中心的微环境;2)构建分级多孔海绵载体,负载TMB显

    来源:Biosensors and Bioelectronics

    时间:2025-05-27

  • 优化微藻Chlamydomonas reinhardtii中ATP与多聚磷酸盐同步定量方法揭示其能量代谢调控新机制

    在生命起源与细胞能量调控研究中,多聚磷酸盐(polyP)作为古老的无机聚合物,从细菌到人类细胞中均扮演着磷酸盐储存、应激响应等多重角色。然而,其与能量货币ATP的动态关系始终是未解之谜。尤其在模式微藻Chlamydomonas reinhardtii中,前期研究发现缺失polyP合成酶VTC的突变体会积累过量ATP,暗示polyP可能通过"缓冲"ATP浓度参与能量稳态调控。但传统方法因ATP半衰期极短(秒级)、polyP提取效率低等问题,难以准确测定两者生理比值,严重阻碍相关机制研究。针对这一技术瓶颈,来自中国科学院和索邦大学的研究团队在《BMC Methods》发表创新成果。他们开发了一种基

    来源:BMC Methods

    时间:2025-05-27

  • 创新胃吸虫鉴定方法:Micro-CT成像与分子工具整合的分类学突破

    在生物多样性快速丧失的背景下,寄生虫作为生态系统调节者正以惊人速度消失,其中胃吸虫(amphistomes)这类感染脊椎动物的吸虫面临严重分类学危机。目前254种已知胃吸虫中,仅37种有基因参考数据,传统依赖破坏性切片和扫描电镜(SEM)的方法阻碍了标本的重复利用。更棘手的是,这类寄生虫的宿主范围、生命周期等基础信息存在巨大空白,而治疗胃吸虫病(amphistomiasis)的有效手段至今缺失。比利时皇家中非博物馆等机构的研究团队在《International Journal for Parasitology》发表研究,首次系统评估微计算机断层扫描(micro-CT)在胃吸虫分类中的应用价值。

    来源:International Journal for Parasitology

    时间:2025-05-27

  • 抗病毒药物奥司他韦靶向消除石质文物地衣病害的创新保护策略

    论文解读石质文物承载着人类文明的印记,但岩生地衣(saxicolous lichens)的滋生正悄然侵蚀这些无价之宝。地衣作为真菌与藻类的共生体,通过分泌有机酸和物理扩张加速石材风化,而传统杀菌剂易引发耐药性且损伤文物表面。更棘手的是,地衣内潜伏的病毒可能通过旅游活动跨区域传播,威胁生态安全。如何在不破坏文物前提下实现长效保护?这一难题亟待创新解决方案。中国的研究团队在《International Biodeterioration》发表的研究中,首次揭示了地衣中广泛存在的双链RNA病毒Pyxine petricola partitivirus 1(PpPV1),并开创性利用抗流感药物奥司他韦靶

    来源:International Biodeterioration & Biodegradation

    时间:2025-05-27

  • 微生物驱动甲酸生成与固定化PdNPs生物合成的卤代有机污染物脱氯创新策略

    卤代有机污染物(HOPs)如同潜伏在环境中的"化学定时炸弹",其碳-卤键(C-X)高达222-456 kJ/mol的离解能使其在自然界顽固累积。以2,4,6-三氯苯酚(2,4,6-TCP)为例,这种被列为优先控制污染物的物质在工业废水中浓度可达mg/L级,仅0.36 μg/L的长期暴露就会引发人体内分泌紊乱。传统微生物修复面临降解速率低、催化剂易流失等瓶颈,而化学合成的钯纳米颗粒(PdNPs)虽具优异氢化活性,却存在环境风险与回收难题。安徽大学的研究团队在《International Biodeterioration》发表的研究中,巧妙融合合成生物学与纳米技术,构建了"微生物工厂+纳米催化剂"

    来源:International Biodeterioration & Biodegradation

    时间:2025-05-27

  • 利用生物信息学方法解析扁形动物端粒酶逆转录酶的结构特征及其进化意义

    论文解读端粒缩短是真核细胞分裂过程中常见的问题,可能导致基因失活和染色体异常融合。为应对这一问题,大多数真核生物进化出一种称为端粒酶的酶防御机制,其中端粒酶逆转录酶(TERT)起着核心作用。扁形动物(Platyhelminthes)是一类具有强大再生能力的扁形动物,其体细胞中的TERT活性显著升高,因此成为研究TERT在非胚胎发育中生物学意义的理想模型。然而,目前对扁形动物TERT蛋白的了解主要局限于少数物种,限制了对其功能和进化的全面认识。为填补这一空白,韩国国家研究基金会支持的研究团队对扁形动物TERT蛋白及其编码基因进行了系统分析。研究人员从公共数据库中收集了扁形动物的TERT基因序列,

    来源:Gene

    时间:2025-05-27

  • 基于非对称协方差自然向量(ACNV)的生物序列分类新方法及其在微生物基因组分析中的应用

    论文解读生物序列如同生命的密码本,而基因组数据的爆炸式增长让解读这些密码面临巨大挑战。传统序列比对方法如MUSCLE、ClustalW虽精确但计算效率低下,尤其面对长度差异显著的序列时,犹如用显微镜比对整本百科全书。更棘手的是,现有"无比对"(alignment-free)方法中,基于统计描述符的自然向量(Natural Vector)虽计算高效,却难以捕捉序列片段(k-mer)间的分布关联;而引入协方差的方法又因维度爆炸问题,无法与k-mer有效结合。这种"信息孤岛"现象严重制约了基因组比较研究的深度。清华大学团队在《Gene》发表的研究中,提出非对称协方差自然向量(Asymmetric C

    来源:Gene

    时间:2025-05-27

  • 利用Se-纳米粒子@热带假丝酵母生物杂合体系高效生产二羧酸及选择性产物分离方法学进展

    论文解读在全球化工产业向绿色可持续转型的大背景下,传统石油基二羧酸(DCAs)生产工艺因依赖不可再生资源、产生大量温室气体(如一氧化二氮N₂O排放占人为总量的近10%[3])而面临严峻挑战。此外,现有催化技术存在选择性差、易过氧化等问题,亟需开发新型生物转化路径。针对这一现状,中国科研团队以热带假丝酵母(Candida tropicalis)为宿主,通过负载硒纳米粒子(SeNP)构建生物杂合体系,攻克了粗十二烷(C₁₂H₂₆)在含硫、镍、砷等工业污染物的复杂环境下的定向转化难题,并优化了下游分离工艺。研究团队采用高分辨透射电镜(HRTEM)与X射线衍射(XRD)验证了SeNP在酵母表面的均匀沉

    来源:Enzyme and Microbial Technology

    时间:2025-05-27

  • 基于液相色谱串联质谱前体离子扫描法的硝噻吩类新精神活性物质快速筛查方法研究

    翻译一种利用液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)前体离子扫描(PIS)采集模式筛查硝噻吩类类似物的新型筛选流程被提出。研究评估了四种目标离子(m/z 72.1、98.0、100.1和112.1)及一种氘代内标物(metodesnitazene-D4,m/z 104.1)的性能。通过全血液-液萃取技术,该方法验证显示检测限(limit of detection)达0.5 ng/mL,行政截断值为1.0 ng/mL。实验未观察到基质效应干扰检测限,亦无残留(carryover)或交叉干扰现象。作为概念验证,该方法成功识别了全部已知硝噻吩类物质(n = 3)及盲测加标样本(n = 20),并推测出若

    来源:Journal of Analytical Toxicology

    时间:2025-05-27

  • 基于异质协方差分析(HetCA)技术从Artemisia umbelliformis subsp. eriantha中发现抗利什曼原虫活性成分

    利什曼病是由利什曼原虫(Leishmania)引起的寄生虫病,全球约12亿人面临感染风险。当前治疗药物存在毒性大、耐药性等问题,亟需开发新型抗利什曼药物。Artemisia属植物因含有抗疟疾明星分子青蒿素而备受关注,但Artemisia umbelliformis subsp. eriantha的抗利什曼活性尚未系统研究。为解决这一难题,国外研究团队在《Bioorganic Chemistry》发表论文,采用离心分配色谱(CPC)结合异质协方差分析(HetCA)的创新策略,从该植物中高效筛选活性成分。研究首先通过CPC建立人工浓度梯度,利用核磁共振(NMR)获取48个馏分的光谱数据,并与抗利什

    来源:Bioorganic Chemistry

    时间:2025-05-27

  • 一种基于Mg²⁺依赖的高效提取单只涡虫高分子量基因组DNA的方法

    论文解读研究背景与挑战在基因组学研究中,完整的高分子量基因组DNA(HMW gDNA)提取是实现高质量基因组组装的关键。然而,对于像涡虫(Dugesia japonica)这样的模式生物,由于其体内富含多糖和核酸酶(如DNase II),传统提取方法常导致DNA降解,难以满足长读长测序平台(如PacBio HiFi和Oxford Nanopore)的需求。特别是涡虫具有显著的染色体多态性和高AT含量,使得单个体基因组测序尤为重要。研究方法山东理工大学的李奥团队开发了一种基于Mg²⁺依赖的裂解缓冲液优化方法。通过调整Mg²⁺浓度梯度(0-50 mM),结合Tris-SDS-蛋白酶K经典方案,筛选

    来源:BMC Genomics

    时间:2025-05-27

  • CRISP:基于像素间相关性的图像分割方法在密集组织细胞掩膜中的应用研究

    细胞是生命活动的基本单位,对细胞活动的精准观测是解开生命奥秘的关键钥匙。在生物学研究中,钙成像技术如同一位 “实时摄影师”,能够捕捉细胞内钙离子浓度的动态变化,从而揭示细胞活动的规律。这一技术在神经科学、糖尿病研究等领域大显身手,例如在胰腺胰岛研究中,众多 β 细胞通过电信号协同分泌胰岛素,钙成像可帮助科学家解析这些细胞的活动协调性。然而,当面对像胰腺胰岛、心肌细胞这样细胞密集排列的组织时,传统的基于强度阈值的自动图像分割方法就像 “近视眼的画家”,难以准确勾勒出单个细胞的边界。此时,研究人员不得不化身 “手工画师”,通过肉眼观察手动绘制细胞掩膜(Cell Mask),即划定每个细胞在图像中的

    来源:BMC Bioinformatics

    时间:2025-05-27

  • TaxaCal:基于机器学习的16S rRNA扩增子数据物种水平校准技术提升微生物组分析精度

    微生物组研究近年来揭示了人体微生物与癌症、糖尿病等疾病的密切关联,但不同测序技术产生的数据差异阻碍了研究结论的可比性。16S rRNA扩增子测序虽成本低廉,但其物种分辨率不足导致与全基因组测序(WGS)结果存在显著偏差,尤其在物种水平上重叠率可低至70%。这种"技术鸿沟"使得16S数据难以直接应用于高精度的疾病诊断模型,成为制约微生物组临床转化的关键瓶颈。针对这一挑战,青岛大学计算机科学与技术学院的研究团队开发了TaxaCal算法,通过创新的两阶段机器学习策略实现16S数据的精准校准。该研究首先通过171对配对样本的系统比较,证实16S与WGS在属水平一致性达99%,但物种水平差异显著(如拟杆

    来源:BMC Bioinformatics

    时间:2025-05-27

  • 非病毒蛋白笼:解密病毒威胁机制与抗病毒策略的创新工具

    病毒研究的新范式:非病毒蛋白笼的革命性应用人畜共患病毒的频繁暴发与全球化传播正持续威胁公共卫生安全。传统病毒学研究面临两大困境:高致病性病毒的操作受生物安全等级限制,而病毒复杂的多步骤入侵机制(如多受体介导的内吞、内体逃逸)难以拆解研究。更棘手的是,病毒通过多碱基切割位点(PCSs)和糖基化修饰等策略逃避免疫监视,但直接改造活病毒可能引发功能获得风险。这些挑战呼唤能精确模拟病毒特征且无复制能力的替代系统。苏黎世联邦理工学院Mikail D. Levasseur在《npj Viruses》发表综述,系统阐述了非病毒蛋白笼(Nonviral Protein Cages, NVPCs)如何突破上述限

    来源:npj Viruses

    时间:2025-05-27

  • 亚洲长角血蜱有性生殖与孤雌生殖种群鉴别新方法:COI 条形码与 SNP 分析的应用

    亚洲长角血蜱(Haemaphysalis longicornis)是一种 “臭名昭著” 的疾病传播媒介,它能携带多种病原体,像引发严重发热伴血小板减少综合征(SFTS)的病毒,以及导致日本斑点热的日本立克次氏体(Rickettsia japonica)等,给人类健康和动物养殖带来极大威胁。这种蜱虫还有个独特之处,存在二倍体有性生殖和三倍体孤雌生殖(雌性无需交配即可繁殖)两种生殖形式。然而,如何精准鉴别这两种形式一直是个难题。以往的方法,如观察种群中是否有雄性、核型分析、流式细胞术等,要么依赖主观判断,要么需要专业设备和技术,操作复杂且效率不高。形态测量法虽发现孤雌生殖个体体型稍大,但数据重叠明

    来源:International Journal for Parasitology: Parasites and Wildlife

    时间:2025-05-27

  • 基于GBS技术的金针菜高密度遗传图谱揭示园艺重要性状的QTL

    论文解读在园艺学领域,金针菜(Hemerocallis),俗称黄花菜或金针花,是一种兼具观赏和食用价值的植物。金针菜的花朵色彩斑斓,形态各异,深受消费者喜爱。然而,尽管其在园艺上的重要性,关于其花色、大小及芽相关性状的遗传机制却鲜为人知。这些性状对于提高金针菜的观赏价值和经济效益至关重要,但其遗传基础尚未得到充分研究。为了解决这一问题,山西农业大学的研究人员利用基因分型测序(GBS)技术,对金针菜进行了高密度遗传图谱的构建。GBS技术是一种高通量的基因分型方法,能够快速识别大量单核苷酸多态性(SNP)标记,从而为遗传图谱的构建提供丰富的遗传信息。通过这种方法,研究人员能够在较短时间内获得大量的

    来源:Horticultural Plant Journal

    时间:2025-05-27


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