生物通技术盛宴之芯片技术服务篇[选购宝典]

【字体: 时间:2008年03月04日 来源:生物通

编辑推荐:

  每位做过生物芯片实验(或称为微阵列实验,microarray)的研究人员都知道,这个实验并不是仅仅将你的样品和芯片放进微阵列点样仪(spotter),然后点击“Start”键那么简单。根据Slide上覆盖的介质和样品的特性来优化探针的进近速度(approach speed)和扫描时间(dwell times)……

2007年刚过,各种年终汇总琳琅满目,生物通网站也将于未来一个多月里大摆生物技术饕餮盛宴,为读者带来前沿技术和最新信息的思维享受和满足--每日密集精选各厂家及经销商过去一年在中国大陆地区着力推广的重点产品文章或者最新上市的新产品新技术文章,将2007年当中生物通网站倍受瞩目的产品和技术一一呈递,打造精彩纷呈的生物技术产品“视觉盛宴”。

 生物技术盛宴6:蛋白纯化层析柱
 2007技术盛宴5:蛋白样品制备中各类杂质/杂蛋白的去除
 生物通技术盛宴4:蛋白酶抑制剂的选择
 生物通技术盛宴3:磷酸化蛋白和糖基化蛋白的样本制备
 生物通技术盛宴2:蛋白样本制备产品大PK
 蛋白技术篇之蛋白样品制备

每位做过生物芯片实验(或称为微阵列实验,microarray)的研究人员都知道,这个实验并不是仅仅将你的样品和芯片放进微阵列点样仪(spotter),然后点击“Start”键那么简单。根据Slide上覆盖的介质和样品的特性来优化探针的进近速度(approach speed)和扫描时间(dwell times)等等方面都是需要考虑的方面,还有比如说点样仪的错误设置会导致不均匀、渗漏和环状的点样,这些都需要实验人员注意。

完成Slide点样,对靶标进行标记,使其与微阵列探针杂交,检测杂交的程度和数据的处理,这些步骤必不可少。总的来说要练就成能得到可靠和可重复的微阵列结果的这个专门技术需要时间和精力上的巨大投资,而且这还不包括点样和扫描仪器上耗费的成本。

因此假如你的研究计划需要芯片分析来推进实验进程,但又觉得没有时间和必要成为一个这方面的专家的话,那么可以“雇佣”一个来代替自己。以下列出了一些提供微阵列技术服务的公司,服务包括从蛋白的阵列点样到执行基因表达实验来实现microRNA (miRNA)的表达分型,也许能节省你大量的时间和精力。

 

厂家:上海生物芯片有限公司

简介:上海生物芯片有限公司(简称SBC)是由国家发改委批准建立的生物芯片国家工程研究中心之一,通过六年的建设,已建立了基因表达谱芯片,基因分型, 蛋白与抗体,组织库与组织芯片和生物信息学等技术平台,是国家“863”计划生物芯片专项的主要承担者之一。上海生物芯片公司是中国首家通过Affymetrix认证的技术服务供应商,也是第一个用Agilent芯片为用户提供服务,经过Agilent认证的,有资质的技术服务供应商。

SBC凭借高标准的技术平台和多样性的产品等竞争优势,向同行业和相关单位提供系统的生物学研究全面解决方案,国内用户单位超过500家,地域遍及全国20多个省市,广泛应用于功能基因组、疾病基因组、药物基因组、中药现代化、农业生物技术、生态环境等各个领域,促进生物芯片对传统产业的渗透,加速生物芯片产业化发展。同时,公司还积极开拓国际市场,为全球各大药物研发机构提供技术服务,已与默克等六家大的药厂签订了合作协议。

提供的服务:

人基因组表达谱芯片
(1) Human Genome U133 Plus 2.0 Array
(2) Human Genome U133A 2.0 Array
(3) Human Genome Focus Array
(4) Human X3P Array

小鼠基因组表达谱芯片
(1) Mouse Genome 430 2.0 Array
(2) Mouse Genome 430A 2.0 Array

大鼠基因组表达谱芯片
(1) Rat Genome 230 2.0 Array
(2) Rat Expression Set 230

其他物种基因组表达谱芯片
拟南芥ATH1基因组芯片、枯草芽孢杆菌反义基因组芯片、大麦基因组芯片、牛基因组芯片、犬基因组芯片、线虫基因组芯片、鸡基因组芯片、果蝇基因组芯片、大肠杆菌基因组芯片、玉米基因组芯片、苜蓿基因组芯片、绿脓杆菌基因组芯片、恶性疟原虫/按蚊基因组芯片、白杨基因组芯片、猪基因组芯片、恒河猴基因组芯片、水稻基因组芯片、金黄色葡萄球菌基因组芯片、大豆基因组芯片、甘蔗基因组芯片、西红柿基因组芯片、葡萄基因组芯片、小麦基因组芯片、爪蟾基因组芯片、酵母基因组芯片、斑马鱼基因组芯片

外显子研究芯片——Affymetrix GeneChip® Human Exon 1.0 ST (sense target) Array

SNP分析芯片—Affymetrix Mapping Array
(1) Mapping 500K Array Set
(2) Mapping 100K Set
(3) Mapping 10K 2.0 Array

厂家:博奥生物有限公司

简介:博奥生物有限公司暨生物芯片北京国家工程研究中心(以下简称“博奥生物”)成立于2000年9月30日,注册资金现为3.765亿元人民币。博奥生物着重以市场为导向、产业化为目标,依靠自主创新,秉持信诺重礼,现已迅速发展成为国际领先的生物高技术公司。
成立以来,以清华大学、中国医学科学院等科研单位为技术依托,博奥生物致力于为集成医疗(包括预测、预防和个体化医疗)领域开发和提供创新性产品和服务,研制开发出了生物芯片(包括基因、蛋白、细胞芯片和芯片实验室等)及相关仪器设备、试剂耗材、软件数据库等四个系列数十项具有自主知识产权,可以在国际舞台上与其他厂家竟争的产品和服务,多款产品获得了中国食品药品监督管理局(SFDA)《医疗器械注册证》、欧盟CE认证和美国食品药品监督管理局(FDA)安全通关备案等证书,其中激光共焦扫描仪、杂交仪、点样仪、生物芯片基片等多项产品已进入美国、欧洲、澳大利亚、日本和韩国等生命科学主要市场。2005年,美国权威的《时代》周刊连续两次对博奥生物进行了积极报道,指出“博奥生物是一个具有自主研发能力,并能够研制生产出兼具创新性和高性价比产品的公司”。

提供的服务:

微阵列服务
cDNA微阵列的制作
蛋白质芯片的制作

基因筛选服务

基因表达分析

具体内容:
PCR服务:根据客户提供模板及引物进行扩增并纯化
芯片制作:按照客户设计制作芯片
杂交检测:客户提供mRNA,进行荧光标记和杂交检测
数据分析:对实验数据进行分析,给出分析结果
--以上各项可以单独服务,也可以全部或部分提供服务


寡核苷酸芯片的设计和制作
--本公司可以根据客户所提要求,设计不同目的的寡核苷酸芯片,包括用于检测遗传基因突变的芯片、用于研究基因表达的芯片、并制作相应的芯片提供给客户。

cDNA微阵列芯片的设计和制作
--采用cDNA作为固定探针,通常长度为0.4~2kb。本公司可提供各种人类基因的cDNA探针,种类超过40,000种。可以根据客户所要求的cDNA芯片的设计,以本公司提供的cDNA探针制作芯片。也可以由客户提供基因,制作客户所要求的芯片,并提供PCR和纯化PCR产物的服务。

酵母全基因芯片
--包含酵母的全部基因,可用于药物筛选等领域的研究。

用于PCR、RNA提取、荧光标记以及杂交检测等试剂盒

厂家:先进通量生物技术有限公司

简介:先进通量公司的总部位于加利福尼亚州美丽的旧金山湾畔,由一些经验丰富的生物技术方面的专家创立。先进通量公司向全球提供高质量的基因芯片技术服务。

先进通量公司致力于建立和完善基因芯片微阵列分析、数据处理和数据管理过程中的质量标准和技术规范。公司已建立起一整套严格的标准化操作流程( SOP's )技术规范来减少实验误差。所建立的标准化操作流程符合 21CFR part 58 (GLP) 和 21CFR part 11(Electronic Records and Signatures) 。

先进通量公司位于中国的先进通量分公司设立在中国科学院生命科学园区内。目前,先进通量公司已经同复旦大学联合建立了实验室 —— 复旦 — 先进通量研究中心。同时,公司也正在和国家药监局( SDA )共商合作事宜。先进通量公司正计划在中国发展一个基于基因芯片检测结果的基因表达数据库,并期望这个数据库有利于加速药物的开发和检测手段的发展。

提供的服务:

提供Affymetrix,Illumina,Combimatrix平台的芯片服务,可用于基因表达的研究、对比基因组杂交(CGH)、SNP的分析和检测,再测序,染色质免疫共沉淀技术(ChIP-on-chip)等方面。

先进通量公司技术服务所采用的方法技术都是业内十分可靠的技术。从Affymetrix到Febit定制芯片,先进通量公司采用那些先进的,且在业内权威认可的技术作为我们服务的核心技术。公司已建立起一整套严格的标准化操作流程(SOP’s)技术规范来减少实验误差。所建立的标准化操作流程符合21CFRpart58(GLP)和21CFRpart11标准。先进通量公司在中国境内精心选择复旦大学作为合作伙伴,建立联合的高通量筛选中心。

 

这几家公司都是国内芯片服务行业数一数二的企业,都拥有一定数量的顾客群,首先在基因芯片服务方面,都是通过Affymetrix认证的技术服务供应商,能提供包括表达谱芯片,SNP芯片,外显子芯片等多方面,多物种选择。Affymetrix这家公司但凡接触过芯片的研究人员都知道,这是最早开发和研制基因芯片的著名公司,拥有对GeneChip的注册专利,在国际上享有很高的声誉,这家公司云集了世界资深生物学家、生物信息学家、数学家,在基因芯片行业中始终处于领先地位。

但除了能提供Affymetrix的芯片之外,各家公司也另有自己的“各家之长”,像上海生物芯片还提供SBC系列基因芯片服务,Agilent系列基因芯片服务,Illumina SNP平台服务基因分型,以及NimbleGen系列基因芯片,其中Nimblegen公司提供的NimbleGen系列基因芯片服务通过计算机软件控制的微镜片进行芯片探针的光化学原位合成。这一技术具有极高的灵活性,可以将探针聚束成不同大小的探针面积和寡核苷酸长度-从24mer到85mer。NimbleGen系统显著降低定制芯片设计和制作时间,从原先的半年缩短到1-2个月,同时也免除了定制高密度芯片的高额预付款。NimbleGen除了高度灵活的定制芯片服务外,还可以提供ChIP chip芯片,CGH芯片和多种微生物芯片。

另外Agilent公司的Agilent系列基因芯片服务则利用高度灵活的工业级喷墨打印技术,发明了无需昂贵光掩罩的DNA微阵列生产方法(SurePrint技术),生产的60-mer寡核苷酸阵列比短寡核苷酸阵列检测灵敏度高八倍。Agilent公司生产的基因芯片,包括表达谱芯片(如人,大鼠,小鼠,果蝇,拟南芥,酵母和大肠杆菌等多个物种),ChIP-on-chip芯片和aCGH芯片。这些产品可以用于研究机构和生物制药公司。

而先进通量在表达谱芯片,SNP芯片服务方面另外提供了Iluminna芯片服务,Illumina激光共聚焦光纤微珠芯片是新一代的芯片技术,利用独特的微珠阵列BeadArray™技术生产的芯片有着非常高的灵敏度、精确性和信息含量,并大幅度降低了成本,其性能包括:

1.高密度-目前最高密度的芯片。

2.低上样量:每个芯片在一轮反转录(IVT)的情况下仅需50-100ngRNA。

3.高重复性:批间重复性平均为99.6%。

4.高特异性探针-专利动力学扫描。

5.高数据准确性-qPCR验证,特定基因组研究芯片和qPCR相关系数R2=0.97。

6.高灵敏度及宽动力学范围-滴度实验。

7.实验过程全程监控-内参微珠。

8.芯片生产100%QC质控。

9.高性价比-有效降低芯片成本,Illumina的表达芯片价格是传统商品化芯片的1/2-1/3。

博奥生物则“自家生产”了晶芯® 基因表达谱等系列微阵列服务,这一服务基于的微阵列芯片平台技术在美国食品药品监督管理局(FDA)组织实施的全球芯片平台技术质控分析实验中,所获得的结果表明其主要参数和稳定性远优于国际同类芯片平台技术,文章发表在2006年9月刊的《自然生物技术》上。晶芯® 基因表达谱微阵列服务可为客户提供各类预点制芯片服务(包括人、大鼠、小鼠、家蚕等全基因组70mer Oligo系列表达谱芯片和其他cDNA系统表达谱芯片),也可以根据客户自有序列、cDNA克隆或其他已发布序列,按照客户个性化要求,设计制作任何物种的微阵列表达谱芯片。

除了基因芯片服务之外,博奥生物还提供蛋白检测服务,主要包括ChIP-GLAS启动子芯片技术服务、晶芯®转录因子活性谱芯片技术服务和ChIP-on-Chip 技术服务。其中ChIP-GLAS启动子芯片技术服务是美国ASB公司开发出的世界领先的GREMATM(Gene Regulatory Elements Mapping and Analysis)技术,在染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation, ChIP)的应用中处于领先地位。

看了这些比较,您会选择哪家公司完成您的芯片实验呢,有兴趣的可以参加以下的小调查。

上海生物芯片有限公司  博奥生物有限公司  先进通量生物技术有限公司 其它,请填写公司名称

 

 

我来说两句
0  条评论    0 人次参与
登录 注册发布
最新评论刷新
查看更多评论 > >

订阅生物通快讯

订阅快讯:

最新文章

限时促销

会展信息

关注订阅号/掌握最新资讯

生物通首页 | 今日动态 | 生物通商城 | 人才市场 | 核心刊物 | 特价专栏 | 仪器龙虎榜

版权所有 生物通

Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

联系信箱:

粤ICP备09063491号