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基因组测序,解开猫的神秘面纱
生物通报道:每一个全基因组测序图谱就像是自己生命的天书,在我们还无法人人拥有自己的天书的时候,2003年一只叫Shadow的狮子狗有幸成为第一个拥有自己生命天书的犬类。随后的2004年一只叫Tasha的?shy;师犬成为第二个拥有基因组测序图谱的犬类。 今年2月科学家们把苗头对准了我们另一种常见的宠物--家猫,一直叫Cinnamon的猫非常幸运的提供她的血液样本,成为第一只可以拥有自己生命天书的猫。Cinnamon不是一只普通的猫,她是密苏里(Missouri)大学?shy;过精心挑选的可以把族系追踪上几十年的历史悠久的猫。 科学家希望在今年年底,甚至是这个夏天就可以拿到猫
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《自然》文章运用到Ambion的RNAi
生物通报道:讲起提供RNA产品的公司我们一定会想到Ambion,连它自己都称自己是RNA公司,它自2001年就开始提供RNAi及相关产品,最近它更被Scientist评为领先的RNAi技术公司。在7月7号发表的Nature杂志上,刊登了两篇来自德国Saxony邦首府德累斯顿的分子生物学和遗传学Max Planck研究机构(MPI)利用Ambion公司提供的先进的RNAi产品对人类激酶群在细胞内吞中所起到的作用进行了详细研究。 MPI利用的是Ambion公司的Silencer® Kinase siRNA文库产品进行研究的。通过筛选,文章作者确定了210种不同的涉及内吞作用的人类
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Science:生态走廊
生物通报道:生态廊道是指将不连续区块(栖地或中继站)以长条形信道相连接,使得特定的生物得以迁移(见下图)。一项南卡罗来纳州(S.C.)户外实验研究发现比起在没有生态廊道的栖居地来说,北美蓝知更鸟(主食是浆果)在有生态廊道的地方会传递更多的植物的种子。这一发现出版在这周的Science杂志上,而且倍受关注,主要是由于它提出了城市与郊区之间绿色通道的存在不仅可以帮助动物,而且对于植物也是很有利的。 国家科学基金会环境生物学分会的项目负责人Alan Tessier说, “这一项工作说明鸟类行为学基础研究如何给于陆地城市建设以意见。这篇文章作者,佛罗里达大学动物学家 Doug Levey,说
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基因决定你胆固醇的动向
生物通报道:为什么有些人怎么吃都不会胖,可是偏偏有些人好像喝水都在长肉?最近研究表明这和他们的饮食习惯无关,要怪就要怪那个控制着对胆固醇进行处理的基因。最近由来自劳伦斯柏克莱(Lawrence Berkeley)国家实验室能量部和Oakland儿童医院研究中心的研究人员把他们的研究成果发表在7月8号的美国临床营养杂志上。低密度脂蛋白(low-density lipoprotein, LDL)胆固醇是动脉粥样硬化发生发展的主要指标和危险因素。研究人员对28对男性双胞胎的低密度脂蛋白胆固醇进行了分析,这些双胞胎无论是胖还是瘦都有一个共同特征,就是其中一个喜欢运动,而另一个是典型的懒鬼。实验之所以会
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HIV融合肽的两大罪行
生物通报道:一项新的研究发现HIV能够避过寄主的免疫系统从而导致感染的发生,而且HIV能够下调CD4+免疫T细胞的功能,即降低这种T细胞的活性——这将有助于病毒的感染。但是,一直以来,人们并不清楚这个现象之下隐藏的机理。来自Weizmann研究所的Yechiel Shai和同事分析了HIV的融合肽(FP)。他们的研究结果公布在8月1日的Journal of Clinical Investigation上,目前已经可以在7月7日的网络版上获得。研究人员证明FP在HIV感染中起到双重的作用:它与其他的区域合作介导病毒与细胞膜的融合,并且还下调正常情况下负责抑制感染的T细胞反应。研究人员发现HIV
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PNAS:双胞胎的表观基因组差异
生物通报道:双胞胎一般都会长的非常相象,甚至有时连亲生的父母都会分不清楚。但是他们随着成长可能其相似性会越来越小,如长相和行事方式。这些变化可能使双胞胎中的一个对癌症等疾病很敏感,而另外一个幸运儿则很健康。现在,研究人员在发表在本周的Proceedings of the National Academy of Sciences上的研究中指出这些差异可能源自表观基因组的变化。表观基因组是指不直接影响一个基因的DNA但会导致基因表达变化的基因化学修饰。研究人员认为化学物质接触、饮食习惯和环境因子都可能影响表观遗传。大多数表观遗传变化是正常的,并且可能解释为什么双胞胎随着年龄的增长会失去他们的一些共
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抗癌食物如何起作用
生物通报道:有报道说人类食用的一些蔬菜、水果等食物中含有一些能够起到抗癌作用的天然物质。最近,芝加哥伊利诺斯大学的研究人员确定出了这种功能性食物抵御癌症的生化机制。像椰菜中的萝卜硫素(sulforaphane)和葡萄酒中的白藜芦醇都具有预防癌症的作用。它们通过向身体发出增加能够预防DNA破坏的蛋白质生产的信号起作用。现在,研究人员对这种信号的工作方式有了新的了解。这些发现公布在Proceedings of the National Academy of Sciences的网络版上。Aimee Eggler指出,有两种关键的蛋白质Keapl和Nrf2与人们摄入抵御疾病的食物时刺激抗癌的过程有关。
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新的遗传化验研究启动
生物通报道:人类疾病的遗传化验目前已经逐渐从实验室转移到了临床应用上。Pew Charitable Trusts在7月6日宣布他们对Genetics and Public Policy Center提供了一笔大的资金用于改善遗传化验的总体效率、安全和可靠性。遗传检验能为想成为父母的夫妻提供有关是否其后代会发生遗传病、什么时候发生遗传病等信息。在一个家庭考虑这些重要的事情时,这种化验的安全、精确和可靠性就需要保证。尽管有了一个有关一种新遗传检测的新闻报道以及它在改善和促进健康方面的前景,但是人们对这些新化验方法的有效性、或者它们的确切的作用原理还知之甚少。而Pew Charitable Trus
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Sigma-Aldrich组织染色竞赛
生物通报道:Sigma-Aldrich是世界领先的生命科学和高新技术公司。现在,这个公司邀请来自世界各地的研究人员参加它组织的染色竞赛。 设立这个染色竞赛的意图是促进研究人员对病理学领域和染色科学的兴趣。这项比赛将在2005年8月1日结束,并且容许任何人参加。参与者需提交承载在标准显微镜玻片并用盖玻片盖住且封好的染色标本。呈递的样本分为三类:苏木精和曙红染料、特殊染料和其他染料类别。想详细了解竞赛细节可登陆http://sigma-aldrich.com/handh。 无论组织学是你的专长或者只是兴趣,都可以将你自己制作的玻片递交给本次大赛来争夺大奖。比赛的获奖名单将在20
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利用荧光能量转移监测PCR过程
生物通报道:Nanogen公司作为一家诊断产品的领先开发者,于7月7号宣布它又申请了一项专利,专利号为6,911,310,它将发色基团耦连到杂交的多核苷酸上,通过荧光基团产生供体到供体的能量转移系统。这项专利利用了荧光共振能量转移技术(FRET)去监测核酸(DNA和RNA)的聚合酶链式反应(PCR)的扩增情况,这在分子诊断中是非常有用的。Nanogen公司目前已拥有131个专利,这项专利技术与之前申请的纳米制造技术和光分子结构自组装技术是紧密相关的。 目前荧光基团被应用在PCR中最好的例子恐怕就是荧光定量PCR技术了。它是1996年由美国Applied Biosystems公司推出的
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牧羊少年vs. 巨人:小microRNA大作用
生物通报道:从预言故事里的老鼠打败大象,到旧约圣经里牧羊少年大卫打败巨人哥利亚的故事,说明有时小东西其实可以起到大作用。洛克菲勒大学(Rockefeller University)的最新研究结果也可以证明这一点。Cell7月1日报道,Ulrike Gaul博士和他的同事们发现了microRNAs在果蝇早期发育过程中起到了非常重要和特殊的作用。MicroRNAs (miRNAs)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(双链)但是和siRNA密切相关。据推测,这些非编码小分子RNA(miR
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治疗子宫癌药物一期实验结果
生物通报道:癌症的发展与一些外在的变化是相联系在一起的,比如异常的组氨酸去乙酰化酶活动。最近研究报道丙戊酸是组氨酸去乙酰化酶的抑制剂,利用此药物可以使癌症细胞分化、调亡或者停止生长。这项研究结果发表在7月7号的分子癌症(Molecular Cancer)上。 研究中对12个通过肿瘤活组织切片和血样检测刚刚确诊为子宫癌的患者进行了丙戊酸镁治疗。治疗剂量分别是三个浓度:20 mg/kg、30 mg/kg和40 mg/kg,每个浓度有四名患者,通过口服方式进行了5天治疗,每天对肿瘤组织和血样样本进行采集直到服用药物结束。对肿瘤H3和H4组蛋白的乙酰化作用和组氨酸去乙酰化酶(HDAC)分别进
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跟随诺贝尔奖的脚步
生物通报道:在视、听、嗅、味及体觉五大特殊感觉当中,嗅觉是最不受重视的一项。如果让人选择可以割舍的感觉,嗅觉总是名列前茅,甚至还在味觉之前。但一般人却不一定知道,食物的香味有80%是由嗅觉所贡献,如果少了嗅觉,再美味的食物吃起来也将如同嚼蜡。嗅觉感觉系统生物体的感觉系统,属于神经系统的分支;任何感觉的产生,必须经过三个过程:(一)感觉接受器受到外来刺激兴奋而发出讯息;(二)讯息经传入神经送入大脑;(三)大脑对传入讯息进行整合及认知。除了幻觉以外,这三者缺一不可。一般而言,最难研究也最难了解的,要属脑中枢的处理过程,然而对嗅觉来说,多年来连第一关兴奋的过程都没有定论,而且争议不断。长久以来,嗅觉
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Science:水母的“红色陷阱”
生物通报道:加州的研究人员发现一种深海鱼靠吸管燃起红光来引诱它的猎物——这挑战了海洋生物学家的一种经典的理论。研究人员宣称水母的一种深海中的亲戚利用燃亮的触须来捕捉获得它的晚餐。 潜入到加州海岸2300米以下水域的研究人员Steven Haddock和同事收集到了一个新种的管水母目动物——与水母和珊瑚相近。他们在三个样本中的两个样本的肠道中发现了残存的鱼。由于在这种深度的海水中鱼类非常罕见,因此这意味着这个尚未命名的种具有一种钓鱼的技巧。这项研究的结果公布在7月8日的Science上。 来自Monterey Bay Aquarim Research Institute的生物
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PNAS:通过控制盐水平影响高血压的酶
生物通报道:美国德州大学西南医学中心的研究人员发现了一种已知能够造成高血压的酶升高血压的作用方式:刺激肾脏细胞中的微孔(或通道)以使水平增高的盐被血管吸收。这些发现揭示出了导致高血压背后的机制,并且可能有助于解释与盐摄入有关的高血压病人需要补充钾以控制血压的原因。这项研究公布在新一期的Proceedings of the National Academy of Sciences上。已经知道酶WNK1能够导致一种形式的高血压PHAⅡ,但是人们一直不清楚它影响血压的方式。通过研究培养的动物和人类细胞,德州大学西南医学中心的研究人员发现WNK1能够与另一种酶SGK1作用并活化这种酶,而SGK1能够导
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羽毛DNA讲述坚贞不愉的爱情
生物通报道:最近,羽毛的一个特征使普渡大学的研究人员证实来自中亚的鹰可能是最忠实的鸟类。通过分析筑巢时留下的羽毛的DNA,研究人员能够鉴别出Kazakhstan自然保护区中的牙雕(Eastern imperial eagles)。他们的分析表明任何一个成年牙雕都不会和它的配偶失散——这与鸟类王国一贯多伴侣的行为是不同的。研究的结果公布在7月1日的Molecular Ecology杂志上。这项研究不但首次证实了老鹰的一夫一妻制,更重要的是研究首次根据收集来的羽毛(非侵入性的方法)进行遗传分析。也就是说我们能够使用收集来的羽毛作为一种DNA来源。通过发展一种从羽毛提取DNA的方案,研究人员增加了另
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口腔癌的新标记因子
生物通报道:Forsyth研究所的研究人员发现三种细菌与最常见的口腔癌类型有关。研究人员希望这一发现将能够有助于开发出一种针对这种常见致死疾病的简单的诊断化验。这些发现还回答了“是否细菌在这种病中起到一定程度作用”的问题。这些发现公布在7月7日的Journal of Translational Medicine上。这项研究表明唾液中三种特殊细菌水平的升高意味着口腔鳞片状细胞癌(OSCC)的存在。这种类型的癌症是致死性的,因为通常在早期无法检测出来。因此,这些与OSCC有关的细菌的发现鼓励了研究人员发现这种疾病的一个早期诊断标记的想法。研究人员推测口腔癌可能改变口腔环境,因此使特定的细菌比其他种
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新模型预测“孤独的灵魂”
生物通报道:最新研制出的一种新型分类工具可能使治疗自闭症和泛自闭症的专家更加系统化地分析这类病的特征联合,并更好地预测改善自闭症儿童状况的方法。如果对这个模型进行更深入的研究,那么它还可能使研究人员评估不同自闭症疗法的效果。研究的结果公布在7月的Pediatrics上。发育儿科医生James Coplan博士报道了有关在费城儿童医院地方自闭症中心调查91名儿童(1997年到2002年间)的结果。研究中调查的儿童患有泛自闭症障碍(ASD)——损伤社交能力的神经发育疾病。这类疾病包括经典的自闭症。大多数患者是学龄前儿童,并且多数是男孩。这项研究公布在2005年7月的Pediatrics上。Copl
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成也p53,败也p53
生物通报道:p53基因是一种关键的癌症抑制基因,在很多癌症中的这种基因都受到了抑制。现在扮演调节角色的p53蛋白却成了HD蛋白破坏脑细胞的“杀手”。研究人员发现一种关键的调节因子p53蛋白的过度活跃造成了亨丁顿舞蹈症(HD)的主要病理特征。在HD中制造的异常的HD蛋白能够活化这种叫做p53的调节蛋白,它顺次开启一系列其他基因。这种异常的基因活化破坏了细胞的线粒体并杀死脑细胞。研究人员还推测p53的干扰可能与一些类型的帕金森症和肌萎缩性侧索硬化症有关。讽刺的是,p53同样是在大部分癌症中被灭火的同种调节蛋白。这种失活使得异常的癌细胞逃过细胞的保护性自杀程序-凋亡。研究人员推测HD病人发生癌症的几
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是什么使Glivec不再有用?
生物通报道:胃肠基质瘤(GIST,Gastro-Intesinal Stroma Tumor)是一种罕见形式的胃或小肠癌。到目前为止,治疗GIST的唯一有效的方法就是使用Glivec。但不幸的是,随着时间的推移,这种治疗已经对大多数病人失去了功效。Flanders校际生物技术研究所(VIB)的Peter Marynen领导的研究组分析了导致这种失效的背后的过程。此外,研究人员还证明一种实验性药物PKC412能够有效帮助这些病人。这种实验性药物替换Glivec的可能以及对Glivec抗性发展的遗传知识可能揭示出了针对这种癌症的一种新的高度靶向的疗法。GIST是一种罕见形式的胃肠癌。通常在这种病被