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  • HIV-seq揭示病毒血症期与抑制期HIV感染者中HIV转录细胞间的基因表达差异

    本研究针对ART(抗逆转录病毒疗法)抑制的HIV感染者中,低丰度、非多聚腺苷酸化的HIV转录细胞难以通过常规单细胞RNA测序(scRNA-seq)检测的难题,开发了名为“HIV-seq”的新方法。通过在scRNA-seq中引入靶向HIV保守区的捕获序列,研究人员成功提升了HIV RNA+细胞的检出率与转录本读数,并首次系统比较了病毒血症期与ART抑制期HIV转录细胞的转录组特征。研究发现,两时期的HIV RNA+细胞均富集于效应记忆T细胞(Tem),但病毒血症期细胞呈现细胞毒性特征,而抑制期细胞则表现出独特的抗炎特征,涉及TGF-β信号上调与IFN信号减弱。该研究证明了HIV-seq是深入理解ART期间HIV转录细胞持续存在机制的有效工具,为靶向“活跃病毒库”的治愈策略提供了新见解。

    来源:Nature Communications

    时间:2026-03-04

  • 腺相关病毒衣壳T细胞表位的免疫工程优化:基于计算与实验整合的免疫原性降低策略

    腺相关病毒(AAV)载体广泛用于基因治疗,但其免疫原性是限制长期疗效和重复给药可行性的重大挑战。本研究结合计算预测与实验验证,旨在改造AAV9衣壳以降低其免疫原性。研究人员开发了表位修饰与MHC预测(EMMP)流程,用于系统评估氨基酸替换对主要组织相容性复合体(MHC)呈递性的预测影响。以此为指导,他们对AAV9衣壳上一个被鉴定出的CD4⁺ T细胞表位进行了改造。体外和体内评估显示,突变体R312Q显著降低了T细胞活化和抗AAV9抗体产生,虽然低感染复数(MOI)下转导效率略有下降。这项研究为理性优化AAV载体设计、提升基因治疗安全性与有效性提供了新思路。

    来源:Nature Communications

    时间:2026-03-04

  • 单细胞巯基分析新策略揭示铁死亡代谢异质性

    为了解决单细胞层面多种巯基(硫醇)难以高覆盖、高灵敏度全面检测的挑战,研究人员整合了活细胞标记与有机质谱流式技术,开发了一种集成分析新方法。该策略实现了对单个细胞内27种标记巯基与355种其他代谢物的同时定量,并成功应用于铁死亡研究,揭示了RSL3通过NRF2-GSH轴抑制谷胱甘肽合成导致代谢异质性。

    来源:Nature Communications

    时间:2026-03-04

  • 融合血浆与尿液游离DNA多模态分析:提升新诊断前列腺癌风险分层的新策略

    本研究致力于解决前列腺癌(PCa)异质性强、早期检测与风险分层困难的问题。研究人员开展了一项关于融合血浆和尿液基因组与表观基因组cfDNA多模态分析的主题研究。结果表明,该互补性方法在新诊断PCa中实现了45%的ctDNA检出率,并能区分局限性与晚期PCa,在PSA<10 ng/mL的患者中检出率达46%,展现了在诊断早期识别侵袭性疾病的潜力。此研究凸显了多模态液体活检(LBx)对原发性PCa早期表征及个性化诊疗决策支持的重要意义。

    来源:npj Precision Oncology

    时间:2026-03-04

  • 虚拟现实干预治疗注意力缺陷/多动障碍:一项系统性回顾

    本研究系统性回顾了虚拟现实(VR)干预在儿童及青少年注意力缺陷/多动障碍(ADHD)治疗中的应用。通过纳入2001-2025年间的相关研究,分析了VR干预的可行性、单用或联合药物的有效性、不同训练模式的相对效能及剂量效应。结果表明VR干预可显著改善ADHD核心症状、执行功能、情绪调节及社交技能,具有良好应用前景。

    来源:npj Digital Medicine

    时间:2026-03-04

  • 基于同源基因信息与生成式建模的跨物种基因重设计:超越密码子优化的新型AI工具

    为了克服传统密码子优化方法(仅能进行同义替换)的局限性,研究人员开发了基于Transformer的深度学习模型“OrthologTransformer”,利用大规模同源基因对数据进行训练,实现了从DNA序列层面将基因“翻译”为适应目标物种的版本,并允许引入有生物学依据的非同义突变和插入/缺失。实验证明,该模型设计的PETase酶基因在枯草芽孢杆菌中实现了更高的表达量和约10倍的产物生成,为异源基因表达和合成生物学提供了更强大的工具。

    来源:Nature Communications

    时间:2026-03-04

  • 一种以新型sRNA CsrN为中心的信号通路调控硝酸盐呼吸并增强阪崎克罗诺杆菌体内致病性的机制研究

    阪崎克罗诺杆菌是一种重要的新生儿病原体。本研究揭示了其如何利用宿主炎症反应产生的硝酸盐,在缺氧环境下通过ArcAB-CsrN-narGHJI信号通路激活硝酸盐呼吸,从而增强其在胃肠道定植、巨噬细胞内存活及全身性播散能力。这项发表于《自然-通讯》的研究不仅阐明了其适应宿主环境的致病新机制,也为治疗此类感染(如通过特异性抑制剂钨酸盐)提供了新靶点。

    来源:Nature Communications

    时间:2026-03-04

  • 基于界面-分子内电子高速公路的氧耐受甲酸脱氢酶加速电催化CO2还原

    为解决生物电催化CO2还原中界面与分子内电子传递缓慢及酶对氧敏感这两大瓶颈,研究人员针对来源于Shewanella oneidensis MR-1的甲酸脱氢酶(SoFdhAB)开展了研究。该研究通过冷冻电镜揭示了酶内独特的五[4Fe-4S]簇电子高速公路、促进界面电子转移的面-面接触结构,以及不同于“失活-再激活”的氧耐受新机制。利用获得的优势变体SoFdhAB-Y94S构建的直接生物电催化体系,能以93.1±5.2%的法拉第效率稳定产甲酸,速率达45.3±0.5 µmol h−1cm−2。这项研究为设计高效、稳定的生物电催化CO2还原系统提供了新思路。

    来源:Nature Communications

    时间:2026-03-04

  • 基于超广角光学相干断层扫描构建近视虚拟全眼模型的研究及临床应用

    本文针对磁共振成像(MRI)评估眼部形态的不便,研究人员开展了基于超广角扫频源光学相干断层成像构建三维虚拟全眼模型(CET-1)的研究。该模型在40人80只不同近视程度的眼中,经MRI模型验证,在不同眼轴长度(22.19至32.56 mm)下均显示出高度一致性(平均点到表面距离为0.0183 ± 0.0025标准化单位,即439.57 ± 59.87 μm)。研究发现,与正视组相比,近视组的后节高斯曲率和前节参数均发生显著改变(P < 0.05)。该模型为近视发展与进展的监测、定量分析及优化治疗方案提供了简便有效的工具,支持个性化医疗的进展。

    来源:npj Digital Medicine

    时间:2026-03-04

  • 基于可解释AI的供者年龄与HLA因素层次模型:优化单倍体相合造血干细胞移植预后的新策略

    在单倍体相合造血干细胞移植(HCT)中,如何精准评估预后并进行供者选择是临床核心难题。本研究利用可解释人工智能(AI)技术,基于668例患者的队列,构建了预后模型。研究揭示了供者年龄的非线性“U”型影响(最佳为20s末至40s初),并明确了HLA-DPB1非允许性错配为关键风险因素。模型可有效分层患者风险,模拟分析证实优化供者选择可显著提升生存率,为个体化移植策略提供了数据驱动框架。

    来源:npj Digital Medicine

    时间:2026-03-04

  • 整合表观基因组图谱揭示阿尔茨海默病脑中少突胶质细胞基因的分子扰动与tau蛋白相关

    这项研究旨在阐明阿尔茨海默病(AD)病理异质性背后的表观遗传机制。研究者对472例AD大脑进行了针对DNA甲基化(DNAm)的表观基因组全关联研究(EWAS),并结合神经病理学和生化蛋白水平分析。他们开发了一种基于染色质状态的区域性甲基化(rCpGm)新方法,发现了5478个显著关联,其中99.7%与tau蛋白生化指标相关。通过整合转录组与甲基化组数据,研究揭示这些扰动富集于少突胶质细胞相关基因,包括已知的AD风险基因BIN1、与髓鞘形成相关的MYRF、MBP、MAG以及新基因LDB3等。研究进一步在独立的AD和原发性tau病数据集中验证了这些与tau相关的扰动的一致性,表明tau相关的少突胶质细胞基因扰动是跨tau病的共同潜在病理机制。相关成果发表在《自然·通讯》(Nature Communications)。

    来源:Nature Communications

    时间:2026-03-04

  • TIGAR通过抑制G6PD/6PGD的乳酸化修饰调控溃疡性结肠炎肠道黏液屏障完整性

    溃疡性结肠炎(UC)中,氧化应激和代谢紊乱是关键。本研究揭示了TIGAR如何通过抑制NADPH合成酶G6PD/6PGD的乳酸化,维持酶活性,保障NADPH和还原力供应,从而缓解氧化应激。该机制最终保护了黏液蛋白MUC2成熟和肠道黏液屏障,为UC治疗提供了新的靶点。

    来源:Nature Communications

    时间:2026-03-04

  • 染色体碎裂合成(Chromoanasynthesis)的成因揭秘:有丝分裂中微同源介导的断裂诱导复制(Mitotic MM-BIR)驱动复杂的基因组重排

    染色体碎裂合成(Chromoanasynthesis)是癌症和先天性疾病中常见的复杂染色体重排(CCR),其形成机制不明。为解决此问题,研究者探究了人类细胞中端粒缩短和亚端粒DNA双链断裂处发生的超复杂突变事件。结果表明,染色体碎裂合成由特异性发生于有丝分裂中的微同源介导的断裂诱导复制(MM-BIR)驱动。该通路是微同源末端连接(MMEJ)与BIR的协作,由MMEJ蛋白启动,受PIF1、POLD3和PCNA调控,极易发生模板转换,可导致基因组位点的剧烈扩增。该发现解释了染色体碎裂合成的极端致突变性,确立有丝分裂MM-BIR为CCR的关键驱动因素,对理解癌症和先天性疾病起源有重要意义。

    来源:Nature Communications

    时间:2026-03-04

  • 英国国家医疗服务体系大规模数字化转型举措的系统性评价:来自三项国家级评估的启示

    为探讨大规模、系统级健康与照护数字化转型项目面临的共同挑战与成功经验,研究人员对英格兰国家医疗服务体系内三项总价值达130亿英镑的国家级项目开展了独立评估。该研究通过大量访谈、现场观察和文件分析,历时15年,揭示了项目推进中普遍存在的技术集成、治理不稳定、目标漂移等社会技术性难题,并提出了分阶段实施模型,为未来的系统级数字转型提供了关键洞见。

    来源:npj Digital Medicine

    时间:2026-03-04

  • 帕博利珠单抗联合化疗新辅助治疗在老年早期三阴性乳腺癌患者中的真实世界研究:疗效、安全性及个体化治疗启示

    本研究针对KEYNOTE-522方案在老年早期三阴性乳腺癌患者中真实世界数据匮乏的问题,由Neo-Real/GBECAM-0123多中心研究团队开展。研究发现,≥65岁患者病理完全缓解(pCR)率为54.9%,虽略低于年轻患者,但与年龄无独立相关性。然而,老年患者治疗相关毒性显著增加,包括更高的治疗中止、剂量调整、≥3级中性粒细胞减少等发生率。该研究揭示了老年TNBC患者独特的生物学和临床特征,并强调了在这一人群中进行个体化治疗的必要性。

    来源:npj Breast Cancer

    时间:2026-03-04

  • 贝叶斯机器学习助力发现与血吸虫病相关的肝脾多病共存的危险因素

    为了探索慢性感染背景下肝脾多病共存的危险因素,研究者们在肠血吸虫病流行的乌干达农村,利用新型贝叶斯多任务学习框架,对3155名个体进行了便携式B超评估,发现了肝脾多病共存及其45种具体病症的不同和共享的风险因素,为监测、分诊和随访提供了风险因子汇编,并有望推广至其他解剖系统的多病研究。

    来源:Nature Communications

    时间:2026-03-04

  • 脂肪组织GPR146介导脂肪-肝脏对话驱动小鼠肝脏脂肪变性的机制研究

    代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)治疗选择有限,亟需新的治疗靶点。本研究针对脂肪组织中孤儿受体GPR146如何调控肝脏脂肪变性这一科学问题展开。研究发现,脂肪组织中GPR146通过Gαq-PKC-AKT信号促进脂肪生成,并通过ERK激活增强脂肪分解,从而增加游离脂肪酸(FFA)向肝脏输送,最终导致肝脏脂肪堆积。这揭示了GPR146是脂肪组织生物学的重要多效性调控因子,为MASLD提供了潜在治疗靶点。

    来源:Nature Communications

    时间:2026-03-04

  • 亚细胞蛋白质组学解析锥虫共生整合蓝图:以Angomonas deanei为例

    为了揭示内共生体整合机制,研究者针对锥虫Angomonas deanei开展了亚细胞蛋白质组学分析,通过定位宿主与细菌蛋白质揭示了二者间的代谢互作,发现了新的靶向细菌的宿主蛋白,并解析了共生体与糖体、酸钙体的关联,为理解共生进化提供了关键数据集。

    来源:Nature Communications

    时间:2026-03-04

  • 评估分布偏移下ICU脓毒症深度学习预测模型的泛化性能:一项多中心回顾性队列研究

    ICU脓毒症预测模型常因数据分布偏移导致外推性不佳。本研究系统性比较了泛化、微调/重训练、目标训练、监督域适应(DA)和融合训练五种部署策略在不同目标数据规模下的表现。结果发现常规微调表现不佳,而重训练、融合训练及DA分别在特定数据规模下表现最优,为临床实践中依据目标数据量选择部署策略提供了关键证据。

    来源:npj Digital Medicine

    时间:2026-03-04

  • 异质性探索与免疫微环境解析:揭示早期浸润性雌激素受体阳性乳腺癌中的富免疫亚型

    编者推荐针对ER+乳腺癌作为“免疫冷”肿瘤的固有认知及其治疗后的远期复发难题,本研究利用GeoMx DSP空间组学技术和NanoString BC360 panel,在蛋白质组与转录组水平系统描绘了早期ER+乳腺癌及其肿瘤微环境的异质性格局。研究揭示其存在一个富免疫的亚型,打破了传统分类,为理解ER+乳腺癌的免疫特性、指导个体化治疗(包括潜在免疫治疗)策略提供了关键的分子依据。

    来源:npj Breast Cancer

    时间:2026-03-04


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