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  • IFFO1-IFFO2-Lamin A/C核骨架网络通过促进NHEJ修复和抑制染色体易位维护基因组完整性

    当细胞遭遇内外源威胁时,DNA双链断裂(Double-Strand Break, DSB)的发生犹如基因组中突然出现的"交通事故"。若多个DSB同时存在,断裂末端可能发生错误连接,导致染色体易位(Chromosomal Translocation, CT)——这种基因组重排是多种白血病、淋巴瘤和实体瘤的典型驱动因素。虽然经典非同源末端连接(c-NHEJ)和同源重组(HR)是修复DSB的主要途径,但断裂末端的空间动态及其与核内结构的相互作用如何影响修复精准度,仍是领域内亟待破解的科学谜题。以往研究表明,核骨架蛋白Lamin A/C通过稳定损伤位点和限制染色质动力学来抑制CT,而中间丝孤儿蛋白1(

    来源:Nucleic Acids Research

    时间:2025-12-09

  • 国家基因组科学数据中心2026年度资源更新:多组学大数据与人工智能驱动的生物信息学新范式

    随着高通量测序技术的飞速发展,生物学已全面进入多组学时代。单细胞测序和空间组学技术进一步提升了数据的维度和分辨率,全球范围内的大型科学计划如"All of Us"、人类细胞图谱(Human Cell Atlas)和地球生物基因组计划(Earth BioGenome Project)产生了涵盖不同物种、组织和人群的海量多模态数据。与此同时,人工智能(AI)技术正在催化研究范式的变革,AlphaFold、Geneformer和scGPT等里程碑式模型的出现,对标准化、可互操作和可重用(FAIR原则)的"AI就绪"数据基础提出了更高要求。在这一背景下,中国国家生物信息中心-国家基因组科学数据中心(C

    来源:Nucleic Acids Research

    时间:2025-12-09

  • 光敏色素与赤霉素协同调控草莓腋生分生组织成熟及匍匐茎命运决定的整合机制

    草莓作为一种重要的经济作物,其独特的繁殖方式一直吸引着植物学家的关注。与大多数植物不同,草莓可以通过两种不同的结构进行无性繁殖:一种是产生果实的分支冠(branch crown),另一种是用于营养繁殖的匍匐茎(stolon,俗称runner)。这种腋生分生组织(axillary meristem, AXM)命运的可塑性决定了草莓的植株架构、繁殖效率和果实产量,然而其分子调控机制长期以来并不清楚。在草莓生长发育过程中,随着植株从幼年向成年阶段转变,腋生分生组织的命运会发生明显变化:幼年期的腋生分生组织通常发育为分支冠,而成年期的则形成匍匐茎。这种发育阶段依赖的命运转换暗示着存在精细的调控网络。此

    来源:Molecular Plant

    时间:2025-12-09

  • 综述:被忽视的子宫因素:解锁早发性卵巢功能不全中子宫内膜的潜力

    超越卵巢:子宫内膜功能障碍作为早发性卵巢功能不全的关键前沿卵巢是女性整合生殖与内分泌功能的关键器官。早发性卵巢功能不全(POI)指女性在40岁前出现卵巢功能衰退,其特征为卵泡耗竭和雌激素缺乏。传统研究多集中于卵巢本身,然而,子宫与卵巢通过“子宫-卵巢轴”构成一个功能整体。POI不仅导致卵巢储备减少,其相关的子宫内膜病变同样对生育能力构成重大挑战,这解释了为何即使使用捐赠卵子进行辅助生殖,POI患者的成功率依然显著偏低。POI中激素失调在子宫内膜功能障碍中的作用POI导致显著的激素失调,特别是低雌激素状态,直接损害子宫内膜功能。雌激素缺乏直接抑制子宫内膜腺体和基质细胞的增殖,并促进细胞凋亡,导致

    来源:TRENDS IN Molecular Medicine

    时间:2025-12-09

  • 局部吉西他滨联合索凡替尼和卡瑞利珠单抗治疗FGFR2未突变肝内胆管癌:一项前景广阔的II期临床试验

    在原发性肝癌的家族中,肝内胆管癌(ICC)是一种相对罕见但恶性程度极高的亚型,以其侵袭性强、易转移和预后极差而令医生和患者倍感棘手。近年来,全球范围内ICC的发病率和死亡率均呈现令人担忧的上升趋势。尽管手术切除联合辅助治疗能带来显著的生存获益,但大多数患者初诊时已是局部晚期或发生转移,失去了手术机会。对于晚期胆道癌(BTC),当前的标准一线治疗方案是吉西他滨联合顺铂(GC)的系统化疗,但其疗效有限,客观缓解率(ORR)仅为26.1%。一项长达20年的意大利全国多中心队列研究更是揭示,尽管化疗手段有所进步,患者的1年总生存(OS)率依然低至49.5%,这凸显了临床治疗的迫切需求。近年来,免疫检查

    来源:Cell Reports Medicine

    时间:2025-12-09

  • Tegileridine(SHR8554)治疗腹部手术后中重度急性疼痛的III期临床试验:一种G蛋白偏向性μ阿片受体激动剂的疗效与安全性评估

    疼痛,尤其是手术后急性疼痛,是临床最常见的症状之一。据统计,约75%的患者在术后会经历中重度疼痛,其中半数患者无法获得充分缓解。阿片类药物如吗啡一直是术后镇痛的基石,但它们属于平衡型μ阿片受体(MOR)激动剂,同时激活G蛋白和β-arrestin-2信号通路。G蛋白通路主要负责快速有效的镇痛,而β-arrestin-2通路的激活则与一系列令人困扰的副作用密切相关,如恶心、呕吐、便秘、呼吸抑制等。这些副作用不仅增加患者痛苦,还可能延长住院时间,增加医疗成本,甚至影响患者预后。因此,研发一种能够保留强效镇痛作用,同时减少副作用的阿片类药物,成为疼痛治疗领域迫切的需求。基于对MOR信号通路的深入理解

    来源:Cell Reports Medicine

    时间:2025-12-09

  • ANKLE1作为DNA张力传感器通过切割机械应力下的DNA解析染色质桥的新机制

    在细胞分裂的最后阶段,经常可以看到一种被称为"染色质桥"的微观结构连接着两个即将分离的子细胞。这些由未完全分离的染色体形成的桥梁,正经历着纺锤丝牵引和细胞迁移产生的巨大张力。如果这些桥梁在肌动蛋白-肌球蛋白收缩力的作用下随机断裂,将会导致灾难性后果——微核形成、复杂基因组重排(如断裂-融合-桥循环、染色体碎裂和癌基因扩增)以及cGAS-STING通路的异常激活。长期以来,科学界一直在探索细胞是否进化出了专门的机制来处理这些染色质桥,防止其灾难性破裂。尽管先前的研究发现线虫的LEM-3及其人类同源蛋白ANKLE1是中体锚定的核酸酶,与染色质桥处理有关,但ANKLE1在人类细胞中的具体作用机制仍不

    来源:Nature Communications

    时间:2025-12-09

  • 发现β-抑制蛋白偏向性CCKBR激动剂MF-8:揭示长时程增强的信号通路机制并阻断恐惧记忆形成

    在大脑复杂的信息处理网络中,G蛋白偶联受体(GPCR)如同精密的信号转换器,调控着从情绪到记忆的多种高级神经功能。其中,胆囊收缩素B受体(CCKBR)作为神经肽胆囊收缩素的重要受体,被发现能够诱导大脑新皮层的兴奋性突触传递长时程增强(LTP),从而增强记忆形成。有趣的是,CCKBR的拮抗剂不仅能够减弱杏仁核中的这种增强效应,还能缓解抑郁样行为。然而,驱动CCKBR依赖性LTP的具体分子机制一直是个未解之谜,更缺乏能够特异性调控这一过程信号通路偏向性的CCKBR配体。传统观点认为GPCR主要通过G蛋白传递信号,但随着研究深入,科学家发现β-抑制蛋白同样在GPCR信号转导中扮演关键角色。更复杂的是

    来源:Nature Communications

    时间:2025-12-09

  • 监测NANOG快速降解揭示UTP15通过调控新生转录本维持多能性

    在生命科学领域,胚胎干细胞(ESC)的多能性维持机制一直是研究的核心课题。多能性是指细胞能够分化为机体所有细胞类型的特殊状态,这一过程受到转录因子、表观遗传修饰、信号通路等多层次精密调控。其中,主转录因子(MTF)如NANOG、SOX2和OCT4被认为是维持多能性核心转录网络的关键调控者。然而,传统研究方法难以区分MTF的直接转录靶点与间接效应,也无法系统揭示新生转录本如何通过与RNA结合蛋白(RBP)的相互作用来执行基因表达调控功能。针对这一科学瓶颈,广州生物医药与健康研究院等单位的研究团队在《Nature Communications》上发表了最新研究成果。研究人员创新性地结合蛋白质快速降

    来源:Nature Communications

    时间:2025-12-09

  • 多智能体强化学习揭示迭代与进化博弈中的记忆-2双边互惠策略优势

    在人类社会演化过程中,合作行为的涌现始终是进化生物学和社会科学的核心谜题。尽管"以牙还牙"(Tit-for-Tat, TFT)、"赢保持输转移"(Win-Stay-Lose-Shift, WSLS)等经典策略为理解直接互惠提供了重要视角,但这些基于人类直觉的策略仅能覆盖有限的行为模式。尤其当策略记忆长度超越一步时,策略空间的维度会呈指数级增长,使得传统数学分析方法难以应对。更关键的是,现有策略往往无法在提升个体收益的同时协调群体达到更高合作水平,这种双重挑战促使研究者寻求新的方法论突破。近日,苏琦、王宏宇等人在《Nature Communications》发表研究,通过构建多智能体强化学习框架

    来源:Nature Communications

    时间:2025-12-09

  • 代谢支持通过抑制铁死亡防治放射性口腔黏膜炎:成纤维细胞来源的多胺发挥关键保护作用

    放射治疗是头颈部肿瘤的重要治疗手段,但其在杀伤肿瘤细胞的同时,常导致正常组织损伤,其中放射性口腔黏膜炎(Radiation-Induced Oral Mucositis, RIOM)是最常见的并发症之一。患者表现为口腔黏膜萎缩、溃烂,伴剧烈疼痛和屏障功能受损,严重影响生活质量和治疗效果。目前认为电离辐射可直接引起DNA双链断裂并产生活性氧(Reactive Oxygen Species, ROS),进而激活细胞死亡通路。然而,针对细胞凋亡的抑制剂在临床应用中效果有限,提示可能存在其他细胞死亡形式参与RIOM的发病过程。因此,深入探究辐射诱导上皮细胞死亡的具体机制,对于开发有效的放射防护策略具有

    来源:Nature Communications

    时间:2025-12-09

  • 炎症特异性DNA折纸纳米器件递送siRNAs治疗溃疡性结肠炎

    在医学研究的前沿领域,溃疡性结肠炎(Ulcerative Colitis, UC)作为一种慢性、复发性炎症性肠病,始终是困扰患者和医生的难题。传统的治疗方法往往效果有限,且可能伴随显著副作用。近年来,基于RNA干扰(RNAi)技术的小干扰RNA(siRNA)疗法展现出巨大潜力,它能够精准地沉默特定的致病基因。然而,如何将脆弱的siRNA安全、高效地递送到肠道炎症部位,并仅在病变细胞中智能释放,同时避免对健康组织造成影响,是横亘在科学家面前的重大挑战。现有的递送载体,如脂质或聚合物纳米颗粒,往往在肝脏或肾脏中富集,难以有效靶向肠道,且存在脱靶风险,可能引发不必要的免疫反应。面对这一困境,DNA纳

    来源:Nature Communications

    时间:2025-12-09

  • 小鼠烟雾诱导T细胞全景图谱揭示克隆性γδT17细胞作为COPD的新型生物标志物

    当我们谈论慢性阻塞性肺疾病(COPD)时,这不仅仅是一个医学名词,更是全球第三大死亡原因,影响着数百万人的生活质量。这种高度异质性的肺部疾病,以慢性呼吸道症状为特征,其背后隐藏着气道和肺泡的异常变化。尽管烟草烟雾被确认为主要致病因素,但其引发的慢性炎症反应机制,尤其是免疫系统中T细胞的具体作用,仍有许多未解之谜。为了揭开这一谜团,广州医科大学附属第一医院呼吸疾病国家重点实验室的梅新月、王俊祥、王媛等研究人员在《Nature Communications》上发表了最新研究成果。他们通过构建烟草烟雾诱导的小鼠COPD模型,结合单细胞多组学技术,首次绘制了烟雾暴露下T细胞的动态变化图谱,并发现了一类

    来源:Nature Communications

    时间:2025-12-09

  • 基于机器学习的MASHRisk评分系统开发与验证:多队列研究揭示其在代谢相关脂肪性肝炎诊断和预后评估中的价值

    在当代肝病领域,代谢相关脂肪性肝病(MASLD)已成为全球最常见的慢性肝病,而其中代谢相关脂肪性肝炎(MASH)更是导致肝纤维化、肝硬化和肝癌的关键进展阶段。令人担忧的是,MASH患者的肝相关死亡率比单纯脂肪肝患者高出十倍以上。然而,目前临床上诊断MASH的"金标准"——肝活检,却因其有创性、成本高、患者接受度低以及存在出血风险等局限性,难以在人群筛查和长期随访中广泛应用。尽管近年来出现了一些无创诊断工具,如FIB-4、APRI等评分系统,但它们主要针对肝纤维化评估,对MASH的诊断效能有限。更复杂的检测方法如FAST评分和NIS4®虽性能较好,但需要瞬时弹性成像或特殊生物标志物检测,在基层医

    来源:npj Digital Medicine

    时间:2025-12-09

  • Prefoldin 3通过调控WRKY70和FHY3的蛋白周转以调节拟南芥UV-B诱导的下胚轴生长抑制

    阳光是植物生长不可或缺的能量来源,但其中包含的紫外线-B (UV-B, 280-315 nm) 却是一把双刃剑。适量的UV-B能调控植物的光形态建成(如抑制下胚轴伸长)、气孔关闭、开花时间以及次生代谢物的积累等重要生理过程,而不引起损伤。然而,过量的UV-B则会对植物造成胁迫,甚至损伤DNA。为了应对这种复杂的光环境,植物进化出了精细的感知和信号转导系统。其中,UV-B光受体UVR8 (UV RESISTANCE LOCUS 8) 及其下游的关键调控因子,如E3泛素连接酶COP1 (CONSTITUTIVE PHOTOMORPHOGENIC 1) 和转录因子HY5 (ELONGATED HYP

    来源:Plant Communications

    时间:2025-12-09

  • 转录因子OsMADS61通过调控硝酸盐代谢与根系发育协同提高水稻氮肥利用效率

    氮素是限制农作物产量的主要矿质营养元素,然而现代作物的氮肥利用效率普遍低下,高产严重依赖过量施肥,这不仅增加生产成本,更导致环境污染、气候波动和生物多样性下降等一系列生态问题。提高作物尤其是低氮条件下的氮肥利用效率,是应对这些挑战的有效策略。水稻作为全球主要粮食作物,其根系形态可塑性对氮素吸收至关重要,但调控根系形态适应性响应与氮素吸收协同作用的分子机制尚不清楚。在这项发表于《Plant Communications》的研究中,南京农业大学张亚丽团队发现水稻在硝酸盐(NO3-)供应下比铵盐(NH4+)更能促进根系伸长,尤其在低氮条件下更为显著。通过转录组分析,研究人员鉴定到一个MADS-box

    来源:Plant Communications

    时间:2025-12-09

  • 综述:植物-病原体前沿战场中的液-液相分离

    在植物与病原体之间永无休止的军备竞赛中,一场发生在分子层面的新型“阵地战”日益受到关注,其核心是一种称为液-液相分离(LLPS)的物理化学过程。LLPS驱动生物分子凝聚体的形成,这些无膜结构的动态隔室通过浓缩特定蛋白质和RNA,在植物免疫防御和病原体致病过程中扮演着双重角色。病原体效应蛋白的相分离病原体在入侵宿主细胞后,会巧妙地利用LLPS来构建其“作战指挥部”。许多植物RNA病毒,如大麦黄条点花叶病毒(BYSMV)和番茄丛矮病毒(TBSV),其复制酶蛋白(如RdRp)通过LLPS形成病毒复制工厂(VRFs)或包含体(IBs)。这些液态凝聚体不仅浓缩了病毒复制所需的“弹药”——病毒RNA和宿主

    来源:Plant Communications

    时间:2025-12-09

  • 基于植物介导RNAi靶向MafA基因增强水稻对白背飞虱的抗性研究

    在稻田生态系统中,白背飞虱(Sogatella furcifera)如同隐形的"吸血鬼",通过刺吸水稻汁液和传播病毒病,每年造成数十亿元的经济损失。传统化学农药不仅导致害虫抗药性增强,更对生态环境和食品安全构成威胁。面对这一绿色防控难题,科学家将目光投向了一种精准的基因"沉默术"——RNA干扰(RNAi)技术。该技术通过特异性双链RNA(dsRNA)靶向昆虫必需基因,有望实现"只杀害虫、不伤益虫"的理想效果。然而,如何筛选高效靶点并实现植物内源表达dsRNA,一直是制约RNAi技术应用的瓶颈。前期研究表明,昆虫的生殖发育相关基因是理想靶标,其中Cap"n"collar isoform C(Cn

    来源:Plant Communications

    时间:2025-12-09

  • VRN1在温带禾本科植物叶片开花调控网络中位于FT1上游的关键作用

    对于温带禾本科植物如小麦、大麦和二穗短柄草而言,适时开花是保证繁殖成功和适应环境的关键。开花过程由florigen(开花素)的积累驱动,其中FLOWERING LOCUS T(FT)基因编码的FT蛋白是核心的开花素。在拟南芥中,FT蛋白在茎顶端分生组织(SAM)与FD转录因子形成开花激活复合物(FAC),激活APETALA1(AP1)表达,从而启动花分生组织发育。然而,在温带禾本科植物中,AP1的同源基因VERNALIZATION 1(VRN1)不仅表达于SAM,也在叶片中检测到表达,这与拟南芥中AP1仅特异性表达于SAM不同,暗示VRN1可能具有功能分化。更为关键的是,虽然传统观点认为VRN

    来源:Plant Communications

    时间:2025-12-09

  • RIFinder揭示禾本科植物基因组中广泛存在的适应性远程渐渗现象

    在生命演化的长河中,基因交流一直是推动生物多样性和适应性进化的重要力量。传统研究主要关注两类基因转移模式:近缘物种间的基因组渐渗(如杂交育种)和跨界的水平基因转移(HGT),例如细菌向植物的基因转移。然而,在亲缘关系较远但尚未达到跨界水平的物种之间,是否存在大规模的基因交流?这种被称为“远程渐渗”(Remote Introgression, RI)的现象,其普遍性和进化意义在植物中仍知之甚少。禾本科(Poaceae)作为地球上最重要的植物家族之一,包含了水稻、小麦、玉米等主要粮食作物,其物种间分化时间可追溯至数百万年前,为研究深层次基因交流提供了理想模型。此前,尽管有零星报道暗示禾本科不同亚科

    来源:Plant Communications

    时间:2025-12-09


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