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基于深度学习的同源重组缺陷检测在韩国卵巢高级别浆液性癌患者中的诊断性能与临床意义:一项探索性研究
Highlight病例选择本研究纳入2013年8月至2023年12月期间在韩国康南圣母医院接受根治性手术的63例卵巢癌(OC)患者福尔马林固定石蜡包埋组织样本。排除复发病例,收集包括年龄、FIGO分期、组织学类型、淋巴血管侵犯(LVI)等临床病理数据。GII计算在50例(79.4%)质量评估(QA)达标的样本中成功计算出基因组完整性指数(GII),而13例(20.6%)因低质量被判定为"GI拒绝/不确定"。HGSC亚组中41例(77.4%)获得有效GII值。BRCA1/2与BRCAness状态评估53例HGSC患者中28.3%检出BRCA1/2突变(BRCA1突变13例,BRCA2突变2例)。
来源:Cancer Genetics
时间:2025-09-09
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花生脱脂饼催化共热解可持续生产富含腈类、芳烃及烃类热解油的研究
Highlight• 非催化条件下GNOC热解仅获得28wt%热解油,而催化体系使产率提升至40wt%并显著富集腈类、酰胺及烃类• 70:30的GNOC-LDPE/HDPE配比产生含95%芳烃和85%烃类的热解油,展现协同降解效应• 碳数分析显示LDPE倾向生成C6-C10烃,HDPE延伸至C20C20的重组分Results and discussion拉曼光谱分析GNOC衍生炭及其与塑料共热解产物的拉曼谱图显示(图5),所有样品均呈现特征D峰(~1350cm-1)和G峰(~1580cm-1)。ID/IG比值从纯GNOC的0.87升至共热解样品的0.91-0.94,表明塑料添加促进了碳材料的结
来源:Bioresource Technology Reports
时间:2025-09-09
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淡水养殖虹鳟鱼(Oncorhynchus mykiss)海水适应机制研究:肠道菌群与组织基因表达谱解析
Highlight【实验动物】实验选用体长12±2 cm、体重17.58±6.5 g的健康三倍体虹鳟幼鱼(购自辽宁本溪某公司),在13-17°C淡水圆柱缸中驯养2天后,开展9个盐度梯度(淡水至32‰海水)的累积暴露试验。【肠道菌群多样性及组成变化】基于81尾鱼39,362个ASVs的分析显示:• 分类注释覆盖90%菌群(34门1064属)• α多样性指数呈现"先骤降后趋稳"的盐度响应模式• 海水组形成独特的简化共现网络,具有更强的细胞结构生物合成能力和漂变主导的组装特征【讨论】• 盐度改变通过"菌群-宿主"互作影响代谢(如发酵能力)和肠屏障功能• 海水环境特异性富集Psychrobacter
来源:Aquaculture
时间:2025-09-09
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社会信任信念对虾类养殖生产效率与风险的影响机制研究
研究亮点• 首次量化分析社会信任对虾类养殖效率-风险的双重影响• 正式制度信任使产量波动降低18.7%(p<0.01)• 邻里信任提升效率但增加34.2%疾病传播风险• 建立包含三类社会网络的新型分析框架理论框架为同时捕捉生产函数的异方差性和技术无效性,本研究采用Kumbhakar(2002)改进的随机前沿分析(SFA)模型,该模型融合了Just and Pope(1978,1979)和Battese et al.(1997)的方法。核心生产模型表示为:yi = f(xiβ) + g(xiψ)vi - q(xi,zi)ui其中yi为观测产量,f(·)代表前沿产出函数,g(·)控制生产风险,q(
来源:Aquaculture
时间:2025-09-09
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2,4-表油菜素内酯(EBR)通过"代谢分配-酶活性-基因表达"多级调控网络动态平衡辣椒素合成与降解的机制研究
HighlightEBR对辣椒果实和胎座生长指标的影响如图1所示,外源2,4-表油菜素内酯(EBR)通过"低促高抑"的浓度效应调控辣椒果实不同发育阶段的生长,其中绿熟期(36 DPA)和转色期(48 DPA)差异最显著。在绿熟期,与对照(CK)相比,0.05 mg/L EBR处理(E1)使单果重、果长、果肩宽和干物质含量分别显著增加12.3%、9.8%、15.6%和8.4%,而0.5 mg/L处理(E5)则表现出抑制效应。特别值得注意的是,EBR对胎座生长的促进作用(最大增幅30.8%)显著高于果肉组织,这为辣椒素合成提供了更有利的空间基础。EBR和BRZ处理对辣椒果实生长及辣椒素含量的影响S
来源:Plant Phenomics
时间:2025-09-09
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综述:XTHs在细胞壁固定金属离子中的作用
金属离子胁迫与植物防御机制金属离子污染已成为全球性环境挑战,非必需金属(如Cd2+、Al3+)和过量必需金属(如Cu2+、Zn2+)通过破坏酶活性、干扰代谢通路威胁植物生存。作为第一道防线,植物细胞壁通过动态重构实现金属离子固定化——其纤维素-木葡聚糖-果胶网络通过负电荷基团直接吸附金属离子,同时分泌有机酸等物质改变离子形态。XTH家族的功能多样性木葡聚糖内转糖基酶/水解酶(XTHs)是植物特有的细胞壁修饰酶,具有双重催化活性:XET(木葡聚糖内转糖基酶)介导非水解性链重组,XEH(木葡聚糖内水解酶)催化不可逆链水解。系统发育分析显示,271个XTH蛋白可分为三大亚家族:祖先亚家族(含AtXT
来源:Plant Phenomics
时间:2025-09-09
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α-硫辛酸调控酚类与细胞壁代谢通路缓解桃果实冷害机制研究
Highlightα-硫辛酸(α-LA)处理通过调控酚类和细胞壁代谢缓解桃果实冷害实验材料与方法在中国安徽省果园精选"黄金蜜1号"桃果(Prunus persica 'Huangjinmi No.1'),初始L、a、b*值分别为59.63、8.42和44.02。采用0.25/0.5/1 g/L α-LA处理后在4°C下贮藏28天,以未处理组为对照。α-LA处理对桃果实冷害的影响对照组第7天即出现冷害(CI)症状,31天时褐变指数(BI)达2.50,CI指数达79.17%。0.5 g/L α-LA处理组显著延缓症状,21天才出现轻微软化褐变,31天时BI和CI指数分别降低42%和53%(P<
来源:Plant Science
时间:2025-09-09
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骆驼蓬WRKY转录因子全基因组分析及ZxWRKY4在高温响应中的调控机制研究
亮点骆驼蓬作为极端环境适应型旱生植物,其WRKY转录因子家族在高温响应中展现出独特调控网络。本研究首次系统解析该家族进化特征与功能机制,为挖掘作物耐热基因资源提供新视角。讨论WRKY家族作为植物特异性转录因子,在热胁迫响应中发挥核心作用。本研究通过比较基因组学揭示:骆驼蓬ZxWRKY家族(100个成员)的扩张主要受全基因组复制(WGD)事件驱动,强纯化选择压力维持了功能保守性。值得注意的是,ZxWRKY4通过激活HSFA2、HSP70、DREB2C等热激蛋白编码基因的表达层级网络,在酵母和拟南芥模型中均显著提升耐热表型。该发现突破了传统作物(如水稻、小麦)WRKY基因研究的局限,为利用野生植物
来源:Plant Phenomics
时间:2025-09-09
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新型microRNA miRP81调控水稻和大麦株高并提高产量的分子机制研究
Highlight本研究揭示了大麦中一个具有双向调控功能的新型microRNA——miRP81,它像"分子开关"一样既能激活水稻OsREM4.1基因(通过5'非翻译区结合),又能上调大麦HORVU.MOREX.r3.4HG0389160(通过编码区结合),实现"一石二鸟"的调控效果。Section snippetsmiRP81:大麦中发现的新型microRNA大麦品种Bowman及其突变体GSHO 1990在分蘖数(图1A)、株高(图1B-C)、节间长度(图1D-F)等关键农艺性状上存在显著差异。通过small RNA测序,我们在大麦分蘖节中鉴定出一个长度21nt的新型microRNA,命名为
来源:Plant Phenomics
时间:2025-09-09
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杨树根系响应硝酸盐胁迫的关键表达网络:时间序列转录组解析与分子调控机制
Highlight硝酸盐作为植物获取氮素的关键形式,其调控根系发育的分子机制在木本植物中尚不明确。本研究通过整合多组学技术,首次绘制了杨树根系响应硝酸盐的时空动态调控图谱。关键发现1.生理响应层级:硝酸盐处理显著促进杨树根系伸长(图1A),伴随NO3-吸收峰值(6 h)、硝酸还原酶(NR)活性峰值(12 h)及组织氮积累峰值(36 h)的时序特征。2.转录调控网络:TO-GCNs分析揭示8层级联调控模块,早期bHLH/MYB/NAC转录因子抑制黄酮合成,而ERFs/LBDs/Nin-likes(如核心模块ERF2B–NRT2.1C)驱动氮代谢重编程。3.代谢通路协同:ERF64A/B激活糖酵解
来源:Plant Phenomics
时间:2025-09-09
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光强调控水稻磷素适应策略:光合碳分配驱动耐磷性差异的分子机制
Highlight光强与磷供应协同调控水稻碳分配策略在磷充足条件下,植物通常优先将同化物分配至地上部。而缺磷会诱导碳分配向根系转移,导致地上部生长受抑和根冠比升高(Lopez et al., 2023)。这种现象在多种植物中均有报道,包括水曲柳(促进侧根形成;Huang et al., 2019)、大豆(根系广泛扩展;Bello, 2021)和玉米等。Conclusions我们的研究确立了光强作为磷胁迫响应的关键调节因子,建议育种项目应重点关注根系可塑性和碳分配特性。在磷缺乏研究中,必须优先考虑基因型选择和种质资源筛选以适应品种特异性适应。观察到的根系形态调整仅在单一发育阶段评估。追踪整个植物
来源:Plant Phenomics
时间:2025-09-09
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糖肾新靶点:从糖胶树中发现的九种新型生物碱Alstoniaschines A-I通过JAK2/STAT3通路改善糖尿病肾病足细胞损伤
Highlight九种结构新颖的生物碱Alstoniaschines A-I(1-9)从糖胶树叶片中被成功分离,这些化合物展现出五种不同的分子骨架。通过核磁共振(NMR)、高分辨质谱(HRESIMS)、X射线晶体衍射以及理论计算圆二色谱(ECD)等技术,研究人员精确解析了它们的立体构型。其中,化合物1、2、3和9表现出显著的细胞保护作用——它们能像"抗氧化卫士"一样提升足细胞中的超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)和谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)的活性,同时将氧化损伤标志物丙二醛(MDA)、一氧化氮(NO)和乳酸脱氢酶(LDH)的水平有效降低。更有趣的是,这些生物碱可能是通过充当
来源:Phytochemistry
时间:2025-09-09
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钌(II)多吡啶配合物的光动力免疫治疗:开启结直肠癌治疗新纪元
Highlight本研究合成的Ru1a复合物在光照条件下对HCT116细胞展现出显著毒性。Ru1a及其光激活形式Ru1a(light)通过调控Cyclin A2和CDK2表达抑制S期细胞增殖,并提升细胞内活性氧(ROS)水平。Chemistry配体IPIP采用Steck和Day改进法合成,与顺式-[Ru(phen)₂Cl₂]·2H2O在乙二醇中反应获得Ru1a。经高分辨质谱(HRMS)、核磁共振(NMR)和紫外-可见光谱(UV-Vis)表征证实结构。ConclusionsRu1a通过诱导线粒体功能障碍和细胞色素C释放激活凋亡通路,同时引发铁死亡——表现为丙二醛(MDA)水平升高和GPX4表达抑
来源:Journal of Inorganic Biochemistry
时间:2025-09-09
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中国德氏鼩鼱复合体(Eulipotyphla: Soricidae)的谱系分化:揭示隐存物种形成的证据
物种形成是进化研究的核心命题,而处于分化初期的物种为理解这一过程提供了绝佳模型。科研团队对缺第四上单尖牙的鼩鼱属(Chodsigoa)物种——德氏鼩鼱复合体展开深入研究。通过主成分分析和判别分析处理140个样本的颅骨测量数据,结合分子钟推算,发现该复合体在2.82-7.08百万年前开始分化。更新世气候剧变迫使三个谱系退避至横断山脉避难所,复杂地形促成遗传隔离与形态分化。末次盛冰期气候稳定期则出现种群扩张和基因交流。值得注意的是,C. h. hypsibia与C. h. larvarum在遗传和形态上均无显著差异,建议废除后者亚种地位。这项研究揭示了横断山脉这一生物多样性热点区域蕴藏的隐存多样性
来源:Zoologica Scripta
时间:2025-09-09
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状态焦虑对冲突控制的动态调控机制:基于行为与事件相关电位(ERP)的多情境研究
当大脑遭遇认知冲突时,状态焦虑就像个喜怒无常的"调控开关",其作用效果完全取决于当前认知控制的情境模式。科学家们采用会"电击警告"的威胁范式(threat of shock paradigm),让受试者在安全与焦虑状态间切换完成Stroop色词测验,同时用脑电帽捕捉神经电活动的蛛丝马迹。在势均力敌的平衡情境中(实验1),焦虑反而成了"助力剂"——面对颜色与词义打架的冲突试次(incongruent trials),被试反应更快,大脑后部的持续电位(Sustained Potential, SP)振幅也明显降低,活像焦虑给认知引擎加了涡轮增压。但当实验2把试次比例调成"游击战"式的反应性控制情境
来源:Psychophysiology
时间:2025-09-09
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表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)的肝脏短期作用机制:降糖效应与潜在肝毒性的分子解析
表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)作为绿茶中最丰富的儿茶素,近年来因其潜在的抗糖尿病和抗肥胖效应备受关注。这项研究通过离体大鼠肝脏灌注实验,结合亚细胞组分分析,系统揭示了EGCG对肝脏代谢的短期调控机制及其潜在毒性。代谢调控的多面手在糖代谢方面,EGCG展现出显著的剂量依赖性抑制作用。当以乳酸为底物时,500 μM EGCG可使糖异生抑制率达52%,对甘油和丙氨酸的抑制率分别为33%和47%。这种抑制作用与关键酶活性改变密切相关:葡萄糖-6-磷酸酶(G6Pase)活性被抑制83%,丙酮酸羧化酶(PC)也受到显著抑制。值得注意的是,磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEPCK)反而被激活,但由于其在糖异
来源:FEBS Open Bio
时间:2025-09-09
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单克隆抗体5F1通过调控甲酰肽受体1构象实现跨膜信号传导的机制研究
单克隆抗体5F1特异性识别FPR1的ECL2表位研究团队通过流式细胞术和竞争性结合实验证实,5F1对FPR1具有高度选择性(Kd=3.79×10−9 M),其结合主要依赖于FPR1胞外第二环(ECL2)的表位结构。合成肽竞争实验显示,ECL2肽段可剂量依赖性抑制5F1结合(10 μM时抑制率达60%)。通过丙氨酸扫描突变发现,ECL2中的P168、K170、T173和P182残基对5F1结合至关重要,其中K170A和T173A突变几乎完全消除抗体结合能力,表明该表位具有精细的空间构象要求。5F1诱导FPR1构象变化与内化借助NanoBRET技术构建的FPR1-ICL1-NanoLuc生物传感器
来源:FASEB BioAdvances
时间:2025-09-09
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幽门螺杆菌通过胃-肝轴微生物-代谢互作加剧MASLD进展的多组学机制研究
这项研究揭示了幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, Hp)感染与代谢功能障碍相关脂肪性肝病(Metabolic Dysfunction-Associated Steatotic Liver Disease, MASLD)进展之间的潜在机制。通过高脂饮食(HFD)诱导的肥胖小鼠模型,科研人员观察到Hp感染组出现更严重的肝脏脂肪变性。多组学分析显示,Hp感染引发胃部菌群失调——不仅使幽门螺杆菌属成为优势菌群,还显著增加肠球菌(Enterococcus)、链球菌(Streptococcus)和葡萄球菌(Staphylococcus)等致病菌丰度,同时降低双歧杆菌(Bifidobact
来源:Helicobacter
时间:2025-09-09
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埃布罗河谷杏仁园中Monilinia laxa引起的花枯病流行病学研究:病原体动态与气象因子的互作机制
Monilinia laxa在杏仁园中的侵染动态与防控启示1 引言杏仁(Prunus dulcis)作为全球重要经济作物,其栽培集约化导致真菌病害加剧。本研究聚焦埃布罗河谷杏仁园,系统解析了由子囊菌Monilinia laxa引起的花枯病流行规律。该病原体通过多循环侵染模式(polycyclic)和死体营养(necrotrophic)特性,可侵染花器、枝条和果实,其中花期感染可造成50-100%的器官染病率,显著影响产量。2 材料与方法在2019-2023年间,对西班牙莱里达地区两个代表性果园(Borges和Vilagrassa)进行定点监测。采用分级系统量化僵果侵染源
来源:Pest Management Science
时间:2025-09-09
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基于机器学习的甲状腺癌骨/肺转移预测模型:提升风险分层的精准度
背景:分化型甲状腺癌(DTC)发病率在全球范围内快速上升,虽然多数患者预后良好,但约1.98%会发生骨或肺转移,显著恶化生存结局。现有预测模型依赖基础临床因素,准确性有限。这项研究创新性地应用机器学习技术,通过SEER数据库(2018-2021年)13,296例患者数据,构建了首个同步预测骨/肺转移的智能模型。方法:研究采用六种机器学习算法(XGBoost、随机森林等),通过LASSO回归筛选出9个核心变量:肿瘤大小(≥2cm影响最显著)、放疗、手术方式、组织学类型、T/N分期等。针对数据不平衡问题,采用SMOTE过采样技术处理。外部验证队列来自中国南昌大学第一附属医院等机构的255例患者。关
来源:Frontiers in Endocrinology
时间:2025-09-09