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基于多数据库整合的分子分型与预后特征预测胃癌患者生存及免疫状态
背景胃癌(GC)作为全球第五大常见恶性肿瘤,其高死亡率与肿瘤异质性和治疗耐药性密切相关。研究旨在通过整合多组学数据,挖掘可预测生存和免疫特征的分子标志物,为精准治疗提供依据。方法研究整合TCGA和GEO数据库的转录组与临床数据,通过limma包筛选263个差异表达基因(DEGs),并利用WGCNA分析鉴定与临床特征显著相关的棕色模块(R=0.65,p1,p<0.05)。通过CIBERSORT和ESTIMATE算法评估免疫浸润,并结合qRT-PCR和免疫组化(IHC)验证基因表达。结果预后模型效能风险模型在训练和验证队列中均显示高风险组总生存期(OS)显著缩短(p<0.001),1年、3年和5年
来源:Frontiers in Oncology
时间:2025-09-06
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大别班达病毒Gn和Gc蛋白的原核表达与免疫原性验证及其在SFTS诊断中的应用研究
1 引言大别班达病毒(DBV)作为新发蜱传病原体,是严重发热伴血小板减少综合征(SFTS)的致病源,病死率高达30%。该病毒通过长角血蜱在野生动物-家畜-人间传播,其基因组M片段编码的囊膜蛋白Gn和Gc是介导病毒入侵的关键靶点。研究表明Gn蛋白受体结合域(RBD)存在保守线性表位,但原核表达系统的免疫原性评价尚未系统开展。2 材料与方法采用浙江分离株(KJ597824.1)构建pET15b-Gn/pET15b-Gc重组质粒,在BL21(DE3)菌株中经IPTG诱导表达。通过Ni-NTA亲和层析纯化蛋白,免疫新西兰大白兔制备多克隆抗体。采用间接ELISA和Western blot评估抗体效价,使
来源:Frontiers in Microbiology
时间:2025-09-06
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心肌缺血再灌注损伤中多种细胞死亡模式的时序调控机制及其治疗意义
心肌缺血再灌注损伤中的细胞死亡时序图谱冠状动脉疾病(CAD)是全球发病率和死亡率的主要原因,及时再灌注虽能挽救缺血心肌,却会引发心肌缺血再灌注损伤(I/R)。这种损伤涉及复杂的细胞死亡网络,但不同死亡模式在再灌注过程中的时序规律尚未阐明。本研究通过多组学整合分析,首次绘制了I/R损伤中七种细胞死亡模式的动态演变图谱。材料与方法采用8-10周龄C57BL/6小鼠建立I/R模型,通过左前降支冠状动脉(LAD)结扎30分钟模拟缺血,分别设置6h/12h/24h再灌注组。体外实验采用H9c2心肌细胞系进行缺氧/复氧(H/R)处理。综合运用Western blot、RT-qPCR、TUNEL染色等技术,
来源:Frontiers in Genetics
时间:2025-09-06
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游离腓骨瓣移植中拇长屈肌切除与保留对功能结局及生活质量影响的对比研究
背景与方法自1975年Taylor首创游离腓骨瓣(FFF)技术以来,该术式已成为颌面重建的金标准。研究团队通过回顾性分析2020-2023年93例FFF重建病例,对比分析切除与保留拇长屈肌(FHL)对供区功能的影响。所有手术由固定团队完成,严格保留远端6cm腓骨以维持踝关节稳定。采用欧洲癌症研究治疗组织生活质量问卷(EORTC QLQ-C30)和美国足踝外科协会(AOFAS)评分作为主要评估工具,结合等速肌力测试(30°/s-90°/s)和步态分析等客观指标,在术前、术后3月及6月进行系统评估。核心发现生活质量维度:FHL切除组术后3个月全球QoL评分显著下降(68.2→62.1,p=0.04
来源:Frontiers in Oncology
时间:2025-09-06
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上消化道穿孔预后风险因素:体成分参数的关键作用及临床预测模型构建
1 引言上消化道穿孔作为外科急腹症,其预后受多重因素影响。尽管手术技术不断进步,患者死亡率仍高达10-50%,主要归因于继发的脓毒性休克和多器官功能障碍。传统营养指标如血清白蛋白和预后营养指数(PNI)在急诊场景中难以快速获取,而通过CT扫描可即时获得的体成分参数(骨骼肌质量、脂肪分布)成为替代评估工具。既往研究证实这些参数与癌症预后显著相关,但其在上消化道穿孔领域的应用尚未深入探索。2 材料与方法研究纳入温州医科大学附属第一医院2021-2023年200例手术患者,排除恶性肿瘤穿孔及基础疾病严重影响预后者。采用第三腰椎(L3)水平CT图像分析体成分:骨骼肌指数(SMI)通过肌肉横截面积/身高
来源:Frontiers in Nutrition
时间:2025-09-06
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消化外科患者肠道屏障功能与炎症及营养状态的关键关联:一项真实世界研究
肠道屏障功能作为消化外科患者炎症与营养状态的关键决定因素2 材料与方法20 U/L)水平评估肠道屏障功能,同时分析营养指标(PNI=ALB+5×LYM)和炎症因子(IL-6/CRP)。3 重要发现3.1 手术类型差异胰腺手术患者呈现最严重的屏障损伤,DAO(23.7 U/L)和LPS(28.4 U/L)水平显著高于胃肠手术组(p<0.01),印证肝胆胰手术对肠道微循环的破坏性更强。3.2 屏障损伤三阶段75.97%患者存在黏膜损伤(DAO+),58.26%出现通透性增加(D-lac+),20%发生细菌移位(LPS+)。值得注意的是,LPS升高者100%伴随DAO/D-lac异常,符合"黏膜损伤
来源:Frontiers in Nutrition
时间:2025-09-06
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基于机器学习的单侧甲状腺乳头状癌对侧隐匿癌及中央区淋巴结转移预测模型构建
背景甲状腺癌(TC)作为内分泌系统高发恶性肿瘤,其中乳头状癌(PTC)占比达85-90%。尽管多数PTC预后良好,但手术范围争议持续存在——全甲状腺切除术(TT)可降低复发风险但伴随永久性甲减等并发症,而甲状腺叶切除术(TL)虽保留功能却可能遗漏对侧隐匿癌(OTC)或中央区淋巴结转移(CLNM)。当前指南依赖术后病理指标(如血管侵犯、淋巴结转移≥5枚)决策,但术前精准预测仍是临床难点。方法研究纳入华中科技大学同济医学院附属协和医院2020-2025年2012例术前超声提示单侧恶性结节(Bethesda V-VI级)并行TT+中央区清扫(CLND)的PTC患者。通过7种算法(决策树DT、弹性网络
来源:Frontiers in Oncology
时间:2025-09-06
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地衣芽孢杆菌KNP在六价铬胁迫下的生存策略:解毒与趋化响应的协同机制研究
引言铬污染是严峻的环境问题,其中六价铬[Cr(VI)]因其高毒性和强迁移性成为治理难点。地衣芽孢杆菌KNP菌株从印度坎普尔制革厂废水中分离,展现出卓越的Cr(VI)耐受性(耐受1,000 ppm K2Cr2O7)和还原能力。研究首次系统解析其解毒与趋化行为的协同机制,为微生物应对重金属胁迫提供新见解。材料与方法菌株在含250-1,000 ppm Cr(VI)的培养基中培养,通过分光光度法监测生长曲线。Cr(VI)还原效率采用二苯卡巴肼(DPC)法测定,SEM-EDX观察细胞形态变化及表面铬沉积,FTIR分析功能基团相互作用。趋化行为通过滴板法和化学栓实验验证,基因组注释筛选趋化相关基因。生长与
来源:Frontiers in Microbiology
时间:2025-09-06
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基于多专家分组引导的轻量化框架解决温室番茄栽培周期长尾识别挑战
引言:温室番茄栽培周期识别面临的长尾挑战温室番茄作为全球最具经济价值的蔬菜之一,其工厂化生产涉及从基质放置到种苗拔除的9个关键阶段。由于不同栽培周期持续时间差异巨大(如"生产中后期"持续数月而"基质浸泡"仅需数小时),导致数据呈现典型长尾分布,传统机器学习方法在尾类识别上表现欠佳。研究方法:多专家分组与轻量化框架创新研究团队提出三阶段解决方案:1.数据分组策略:按样本量将数据集划分为Head(空闲期、生产中后期)、Balance(生产后期、种苗拔除、定植)和Tail(基质放置、开孔、基质浸泡、生产前期)三组2.专家模型训练:采用MobileViT-s作为基础架构,每组训练独立专家模型,并增设"
来源:Frontiers in Plant Science
时间:2025-09-06
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黄花苜蓿线粒体基因组解析:系统发育分类与遗传适应性研究
黄花苜蓿线粒体基因组的结构与功能解析基因组特征黄花苜蓿线粒体基因组呈现典型的环状结构,全长354,988 bp,GC含量45.13%。其基因组成包含34个独特蛋白编码基因(PCGs)、18个tRNA和3个rRNA基因。值得注意的是,nad5(2,010 bp)、matR(1,986 bp)和ccmFn(1,737 bp)是长度最长的基因,而atp9仅225 bp。基因组中检测到148个分散重复序列,其中53%为回文重复,47%为正向重复,但未发现反向重复,这种结构特征可能与其基因组稳定性相关。重复序列与SSR分布基因组中72个SSR标记显示明显的A/T偏好性(98.61%),其中二核苷酸(33
来源:Frontiers in Plant Science
时间:2025-09-06
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硒代蛋氨酸通过调节肠道菌群及其代谢缓解猪δ冠状病毒感染所致小鼠肠道损伤的机制研究
硒代蛋氨酸调控肠道菌群代谢的机制探索引言猪δ冠状病毒(PDCoV)作为新型肠道致病性冠状病毒,不仅造成畜牧业经济损失,更在人类健康领域拉响警报——海地已报告3例儿童感染病例。硒元素因其显著的抗氧化和抗病毒特性备受关注,其中硒代蛋氨酸(SeMet)被证实可减轻PDCoV感染导致的肠道损伤,但其对肠道菌群及代谢产物的影响尚属未知。研究方法实验将C57BL/6小鼠分为对照组、PDCoV感染组和SeMet干预组(0.3 mg/kg Se)。通过16S rRNA测序分析结肠内容物菌群组成,结合LC-MS/MS代谢组学技术检测代谢物变化,并运用生物信息学方法建立菌群-代谢物关联网络。菌群调控效应PDCoV
来源:Frontiers in Microbiology
时间:2025-09-06
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基于多中心MRI影像组学的肝门部胆管癌纵向浸润范围无创预测模型研究
引言肝门部胆管癌(HCCA)作为胆道系统最常见的恶性肿瘤,其解剖位置特殊且侵袭性强,手术切除是唯一有效治疗手段。Bismuth-Corlette分型中IV型肿瘤因累及双侧二级胆管汇合部,需扩大肝切除术才能实现R0切除。传统MRI依赖主观判读,难以识别沿胆管壁纵向浸润的微观病灶。影像组学通过深度挖掘图像特征,为量化评估肿瘤浸润提供了新思路。材料与方法154例HCCA患者的多中心数据被纳入分析(Bismuth IV型38例,I-III型116例)。采用Deepwise平台从T2WI、DWI和e-THRIVE序列提取2158个特征,经L1正则化筛选后保留18-19个关键特征。SHAP分析显示:DWI
来源:Frontiers in Oncology
时间:2025-09-06
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砧木特异性微生物组与代谢组重塑增强甘氨酸替代硝酸铵在西瓜栽培中的功效
引言:氮源优化与砧木选择对西瓜可持续生产至关重要。本研究探讨甘氨酸作为有机氮源是否通过砧木介导效应调控根系相关细菌群落以促进西瓜生长。西瓜作为重要葫芦科作物易受连作障碍和氮肥过量影响,而嫁接技术能改善矿物质吸收和微生物群落稳定性。研究假设甘氨酸应用能通过优化根际微生物动态提升植物适应性。材料与方法:实验在西北农林科技大学园艺场进行,采用'8424'西瓜接穗与四种砧木(自嫁接西瓜CK、野生西瓜T1、葫芦T2、南瓜T3)嫁接,设置8 mmol/L甘氨酸和硝酸铵处理。通过测定生物量、叶绿素荧光参数(Fv/Fm)、土壤脲酶(S-UE)、蔗糖酶(S-SC)和酸性磷酸酶(S-AP)活性,结合16S rRN
来源:Frontiers in Plant Science
时间:2025-09-06
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SPI1调控的巨噬细胞极化在溃疡性结肠炎中的整合分析:单细胞与微阵列数据揭示关键调控特征
单细胞测序揭示UC巨噬细胞组成重塑通过整合GSE214695和GSE231993两个单细胞数据集,研究发现溃疡性结肠炎(UC)患者肠道组织中巨噬细胞比例显著增加(从2.1%升至3.8%),同时伴随结构性细胞如成纤维细胞(从9.2%降至2.9%)和上皮细胞(从8.3%降至1.6%)的减少。UMAP聚类分析将细胞分为14个亚群,其中免疫细胞在UC组呈现明显扩张趋势。这种细胞组成的变化通过PCA分析得到进一步验证,提示巨噬细胞是区分UC与健康对照组的关键差异细胞类型。SPI1调控网络的拓扑学特征利用pySCENIC算法构建的基因调控网络(GRN)中,从401个调控子(regulon)中鉴定出SPI1
来源:Frontiers in Genetics
时间:2025-09-06
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基于离散元法的压缩颗粒秸秆机械化条施工艺优化研究
Highlight差速对辊式秸秆破碎装置结构将压缩秸秆条施入土可加速分解。颗粒化秸秆制备过程中存在长度不均问题,过长的秸秆会延缓腐烂并影响播种出苗。为此,本研究设计了差速对辊式秸秆破碎装置(图1a),通过上下辊齿差速剪切实现高效破碎。秸秆破碎条施单因素试验结果模拟试验显示,秸秆在0.1–0.2秒接触上辊后被导向下辊,在0.2–0.9秒内受差速作用断裂。当上辊转速100–200 r·min−1、下辊300–400 r·min−1时,破碎效果最佳,秸秆从长颗粒变为短颗粒,更利于后续快速腐解。Conclusion基于异质双向粘结秸秆离散元模型优化条施装置参数,可降低研发成本。田间验证显示:优化参数下
来源:Biosystems Engineering
时间:2025-09-06
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活细胞质膜长程粘度的剪切驱动流测量揭示其与短程粘度的四个数量级差异
细胞膜作为生命的边界,其物理特性直接影响着细胞的功能和行为。在微观尺度上,膜分子如1,2-二油酰-sn-甘油-3-磷酸胆碱(DOPC)的布朗运动决定了短程粘度(short-range viscosity),这种纳米级的粘滞特性已被证实仅比人工膜高10倍以内。然而,当细胞需要完成迁移、分裂等宏观行为时,质膜必须发生微米级的协同流动——这种长程粘度(long-range viscosity)的调控机制却始终成谜。传统观点认为,细胞骨架尤其是肌动蛋白网络可能参与其中,但缺乏直接实验证据。日本东北大学的研究团队在《Biophysical Journal》发表的研究中,创新性地采用剪切驱动流方法,首次定
来源:Biophysical Journal
时间:2025-09-06
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微塑料暴露通过免疫抑制、代谢紊乱与结构损伤诱导草鱼鳃组织增生机制研究
Highlight本研究通过多维证据系统阐明微塑料(MPs)对草鱼鳃组织的毒性机制。MPs暴露诱导鳃组织增生图1显示不同浓度聚苯乙烯微塑料(MPs)暴露30天后的鳃组织切片(H&E染色)。对照组鳃丝结构清晰完整,而暴露组呈现典型病理特征:400 μg/L组出现鳃丝弯曲、上皮细胞坏死脱落,基底细胞异常增生伴随胶原纤维沉积(Masson/Sirius Red染色证实),100 μg/L组损伤程度较轻但已出现炎性浸润。讨论转录组分析揭示MPs通过激活补体与凝血级联反应、JAK-STAT通路促进炎症损伤。NF-κB通路触发氧化应激,经细胞粘附分子(CAMs)和TNF信号通路引发鳃部炎症。MPs
来源:Aquatic Toxicology
时间:2025-09-06
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太平洋白对虾新型胰岛素样肽(LvIns)的鉴定及其在葡萄糖代谢与生长调控中的作用机制研究
研究亮点• 首次在凡纳滨对虾中鉴定出胰岛素型ILP(LvIns)• 揭示LvIns通过PI3K/AKT通路调控葡萄糖代谢• 证实LvIns缺失导致生长迟缓和血糖清除障碍LvIns的发现填补了甲壳动物ILPs研究空白胰岛素样肽(ILPs)作为重要的多肽激素家族,在节肢动物中已形成四类明确亚型(IAG型、松弛素型、胰岛素型和性腺素型)。本研究首次在甲壳动物中系统解析了胰岛素型ILP的生理功能,其与果蝇DILP1-6同源,相比其他亚型具有更基础的代谢调控功能。通过RNA干扰实验发现,敲除LvIns会导致对虾出现"三低"表型:生长速率降低30%、血糖清除效率下降40%、肝糖原储备减少25%,这些表型与
来源:Aquaculture
时间:2025-09-06
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清水养殖向生物絮团系统过渡提升凡纳滨对虾生长性能、抗氧化响应及基因表达的研究
Highlight从清水(CW)向生物絮团(BFT)系统的过渡显著改善了凡纳滨对虾的养殖表现。与单一清水系统(SCW)相比,过渡系统(TBI)在50天实验中展现出更稳定的水质(氨氮和亚硝酸盐浓度降低),且虾体存活率(96.5%)和产量(2.79 kg/m3)显著提升(P < 0.05)。抗氧化与代谢增强TBI组虾体抗氧化状态明显改善,丙二醛(MDA)水平低于SCW组(P < 0.05)。转录组分析表明,生物絮团可能通过刺激虾体免疫相关基因(如DDOST和HSP60),提升环境适应力。能量代谢相关指标(Na+-K+-ATPase和总ATP酶活性)也显著升高,同时ATP合成和糖原生物合成基因表达上
来源:Aquaculture
时间:2025-09-06
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亚麻籽油卵黄注射调控尼罗罗非鱼幼鱼脂质代谢及脂肪酸组成的长期效应
在全球水产养殖业快速发展的背景下,鱼类作为优质蛋白质和健康脂肪酸的重要来源,其营养价值备受关注。然而,传统依赖海洋鱼油作为n-3长链多不饱和脂肪酸(LC-PUFA)主要供给的方式面临资源枯竭的困境。与此同时,淡水鱼如尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)虽具高产特性,但其体内n-3 LC-PUFA含量较低,难以满足人类健康需求。如何通过营养干预提升淡水鱼的脂肪酸组成,成为水产养殖领域亟待解决的科学问题。营养编程(Nutritional Programming, NP)作为一种新兴策略,指在生物早期发育关键阶段通过特定营养干预,永久性改变其代谢模式。这一概念在哺乳动物中已有广泛