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  • 硅藻的各向异性荧光发射改变了水下海洋光场

    本研究探讨了浮游植物中的硅藻如何通过特定的方向性荧光发射,对海洋光学环境产生影响。硅藻是海洋食物网的重要基础生物,其在地球碳循环中也占据着关键位置。这些微小的生物不仅在生态和生物地球化学过程中发挥重要作用,还可能通过其荧光特性,影响自身与其他生物的相互作用以及被卫星遥感技术所观测到的海洋颜色数据。研究重点聚焦于一种名为 *Pseudo-nitzschia fraudulenta* 的硅藻,其在单细胞层面表现出显著的荧光方向性,这种特性源于其细长的形态和细胞内叶绿体的排列方式。在单细胞层面,*P. fraudulenta* 的荧光发射呈现出明显的各向异性,即在不同方向上的强度差异显著。实验发现,

    来源:Proceedings of the National Academy of Sciences

    时间:2025-11-19

  • 狭小的空间会产生巨大的影响:微生境(microsites)决定了干旱地区植物残体(plant litter)的分解速率

    重要性预测死亡植物物质的分解速率对于全球碳模型至关重要。干旱生态系统对全球碳循环具有关键作用,因为它们覆盖了超过40%的陆地面积,但模型对干旱地区枯落物分解的预测往往与实际测量结果不符。我们认为,模型和测量中未能充分考虑到干旱地区的极端空间异质性。微生境的空间异质性主要是由植被分布不均造成的,这导致了微气候的高变异性以及枯落物分布的不均匀性。我们综合了现有的关于不同微生境中分解速率的数据,并说明了忽视微生境异质性会如何影响整个景观层面的分解估计。纳入来自多种微生境的数据应该能够显著提高干旱地区分解模型的准确性。摘要我们对全球范围内广阔且具有社会经济重要性的干旱生态系统中的碳和养分动态的理解仍然

    来源:Proceedings of the National Academy of Sciences

    时间:2025-11-19

  • 物理模型揭示了间接的阅读蛋白相互作用,这些相互作用促进了表观遗传学之间的相互作用(即表观遗传因素之间的相互作用)

    重要性表观遗传标记编码了染色质的三维结构,从而决定了基因的可访问性并实现了基因的物理调控。读取蛋白通过优先结合特定的表观遗传标记并与其他在空间上相邻的读取蛋白相互作用来促进染色质的折叠。表观遗传因子的失调可能导致染色质结构的异常,进而引发阿尔茨海默病和癌症等疾病。我们开发了一个物理模型来预测相互作用的表观遗传因素和环境因素如何影响染色质结构。我们研究了间接的读取蛋白相互作用,这些相互作用会改变染色质纤维的排列方式。我们的工作为表观遗传模式如何决定染色质结构提供了机制上的见解。通过研究驱动染色质结构的因素,我们的研究有助于识别未来表观遗传治疗的靶点。摘要染色质的空间结构受表观遗传因素的调控,包括

    来源:Proceedings of the National Academy of Sciences

    时间:2025-11-19

  • 盐单胞菌(Halomonas sp. MNB13)中的非蛋白质生成性β-丙氨酸代谢机制调控了深海铁锰结核中锰的还原过程

    在深海环境中,铁锰结核是一种广泛分布的沉积物,其不仅具有重要的地质意义,同时也是研究微生物介导的金属循环的理想材料。铁锰结核中含有丰富的锰氧化物,这些物质在特定的微生物作用下可以被还原为可溶性的锰(II)离子,进而释放到海水中,参与海洋生态系统的物质循环。尽管已有大量研究探讨了微生物如何参与锰氧化物的溶解过程,但关于非蛋白质氨基酸代谢在锰(II)释放中的作用,尤其是β-丙氨酸代谢,目前仍存在较大的研究空白。本研究聚焦于β-丙氨酸代谢对锰(IV)还原的潜在影响,以揭示其在深海铁锰结核锰释放过程中的生态功能。β-丙氨酸作为一种非蛋白质氨基酸,广泛存在于海洋环境中,其主要来源是细菌对天冬氨酸和谷氨酸

    来源:Applied and Environmental Microbiology

    时间:2025-11-19

  • 实时同步监测细菌培养物中的多种分析物

    细菌代谢物在多种生物过程中扮演着关键角色,对人类健康、生态系统以及工业应用具有深远影响。随着对微生物动态研究的深入,实时监测这些代谢物成为理解微生物行为、代谢通量和环境响应的重要手段。然而,当前的监测方法通常依赖于离线分析或单一代谢物的遗传工程改造,这些方法存在操作繁琐、易受污染或无法全面捕捉代谢变化等局限。为解决这些问题,研究团队开发了一种基于工程化膜外结合蛋白(periplasmic binding proteins, PBPs)与荧光标记物结合的新方法,实现了对多种代谢物的同步、实时监测。该方法不仅提高了监测的准确性和灵敏度,还为研究细菌代谢提供了更高效、非侵入性的工具。PBPs是一类广

    来源:Applied and Environmental Microbiology

    时间:2025-11-19

  • 亲乙醇的乳酸菌——果糖乳杆菌(Fructilactobacillus fructivorans),作为日本传统腌制食品“纳拉祖克”(Narazuke)发酵过程中的关键微生物

    这是一篇关于日本传统发酵食品“纳扎克”(Narazuke)中微生物群落与发酵机制的研究论文。纳扎克是一种利用酒糟(sake kasu)作为发酵媒介的腌制蔬菜食品,其历史可以追溯到公元8世纪。尽管纳扎克在传统上被广泛食用,并且具有独特的风味,但此前关于其发酵过程中微生物活动的机制仍不明确。本研究通过分析纳扎克的微生物群落变化,结合实验室规模的发酵实验,揭示了其主要发酵微生物是果糖乳杆菌(*Fructilactobacillus fructivorans*),并进一步探讨了其在高酒精环境中的适应性,为理解发酵微生物的生态适应性提供了新的视角。### 微生物群落的演变在纳扎克的制作过程中,微生物群落

    来源:Applied and Environmental Microbiology

    时间:2025-11-19

  • 利用基于细菌基因组学的负鼠排泄物调查方法,确定澳大利亚东南部城市地区新的布鲁里溃疡流行区

    邦鲁尔溃疡(Buruli ulcer, BU)是由布氏溃疡棒菌(*Mycobacterium ulcerans*)引起的慢性感染性皮肤病,其传播机制与野生动物宿主和媒介生物密切相关。本研究聚焦于澳大利亚维多利亚州墨尔本西北部与吉朗南方两个新兴疫区,通过整合野生动物宿主监测与病原体基因组学技术,揭示了布氏溃疡棒菌的传播路径与时空演变规律,为区域防控策略提供了科学依据。### 疫区发现的关键技术与证据链研究团队采用“环境-宿主-人类”三位一体的监测体系,首先通过高频次布袋鼠粪便样本检测锁定潜在疫区。2021至2022年间,在墨尔本西北部开展384份粪便样本筛查,阳性检出率达5.3%-13%,显著高

    来源:Applied and Environmental Microbiology

    时间:2025-11-19

  • GacA利用两种不同的调控机制来控制假单胞菌Pseudomonas protegens Pf-5中2,4-二乙酰荧光苷醇的生物合成过程

    植物有益细菌在植物病害控制中发挥着重要作用,其中许多菌株能够合成抗生素以抑制病原体。2,4-二乙酰基菲洛咕啉(DAPG)是一种由多种植物相关有益细菌属Pseudomonas产生的广谱抗菌物质,能够有效控制多种植物病原体,包括细菌、真菌和卵菌。DAPG的生物合成受到GacA/GacS双组分调控系统的激活,这一系统在调控抗生素生产方面具有重要作用。本文研究了Pseudomonas protegens Pf-5中ΔgacA突变株对豌豆根腐病的控制效果,发现即使缺乏GacA,该突变株仍能通过DAPG依赖的方式控制病害。这表明Gac-Rsm信号级联在调控DAPG生物合成方面存在复杂的机制。研究发现,Δg

    来源:Applied and Environmental Microbiology

    时间:2025-11-19

  • 通过废水追踪脊髓灰质炎病毒:来自海地的环境监测洞察(2020–2023年)

    在过去的四年里,海地的环境监测(Environmental Surveillance, ES)系统为全球根除脊髓灰质炎(Poliovirus, PV)做出了重要贡献。ES作为一种关键工具,能够检测脊髓灰质炎病毒在社区中的传播情况,即使在没有急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis, AFP)病例的情况下也能实现。这一监测体系最初于2016年在海地的两个城市——太子港(Port-au-Prince)和戈纳伊夫(Gonaïves)建立,随后在2023年扩展至五个城市,新增了圣马克(Saint Marc)、卡普-海地(Cap Haïtien)和波尔-帕克斯(Port-de-Pa

    来源:Applied and Environmental Microbiology

    时间:2025-11-19

  • 对共域分布的Beauveria bassiana分离株进行的基因组分析和交配试验表明,该物种存在一个由多种隐秘物种组成的复杂群落

    在本研究中,科学家们对澳大利亚昆士兰地区土壤中采集的14株*Beauveria bassiana* s.l.(广义的*Beauveria bassiana*)进行了基因组测序与组装,并在它们的交配类型基因座(mating type locus)上进行了基因分型。通过对这些基因组数据的分析,研究者们构建了核基因组和线粒体基因组的系统发育树,并进一步评估了这些菌株之间的重组现象。研究的主要目的是探究这些菌株是否在自然环境中存在基因流动,并判断是否存在隐秘的物种(cryptic species)。研究结果显示,昆士兰的这14株*Beauveria bassiana*形成了一个与其他国家菌株明显不同的

    来源:Mycologia

    时间:2025-11-19

  • 对来自肠细菌的γ-碳酸酐酶EcoCAγ进行计算机模拟分析:评估其72个残基组成的N端延伸部分的作用

    摘要γ-类碳酸酐酶EcoCAγ于2022年在大肠杆菌中被发现,其N端具有72个残基的延伸结构,而典型的YrdA异构体则没有这一结构。基因组分析证实,全长EcoCAγ在多种大肠杆菌和志贺菌菌株中保持保守(同源性为95–100%),但在实验室菌株K-12中不存在。利用AlphaFold-Multimer软件构建了全长三聚体模型,并对其在水相和膜环境中的分子动力学行为进行了模拟。在膜环境中,N端片段保持伸展的α-螺旋构象;而在水溶液中,该片段发生压缩并发生自组装。在所有模拟过程中,三聚体的组装结构以及催化位点的几何形态均得以保持,且活性位点的结构未受到任何破坏。这些模拟结果提供了关于N端区域环境依赖

    来源:Journal of Biomolecular Structure and Dynamics

    时间:2025-11-19

  • 孢子丝菌病还是诺卡菌病?一例免疫功能正常宿主感染巴西诺卡菌(Nocardia brasiliensis)引起的皮下组织感染的病例报告

    摘要背景诺卡氏菌属(Nocardia spp.)是一种革兰氏阳性、抗酸、需氧的细菌,通常感染免疫功能低下的个体,主要影响呼吸道和中枢神经系统,但也可通过皮肤扩散。皮肤诺卡菌病较为罕见,且经常被误诊。病例介绍我们报告了一例57岁的巴西男性患者,其免疫系统正常,表现为右腿出现脓疱性病变、蜂窝织炎和淋巴管炎。由于他的工作涉及植物栽培和公共卫生,因此可能存在环境暴露。最初怀疑为孢子丝菌病(sporotrichosis),并开始使用伊曲康唑(itraconazole)和头孢呋辛(cefuroxime)进行经验性治疗。细菌培养结果为阴性,但真菌培养发现一种抗酸菌,通过MALDI-TOF技术鉴定为巴西诺卡氏

    来源:Future Microbiology

    时间:2025-11-19

  • 西班牙语人群中虚拟现实功能能力评估工具(VRFCAT)的心理测量学特性验证及其在精神病患者中的应用

    功能损害是精神病性障碍的核心特征,也是影响患者生活质量的主要决定因素。在精神病学研究和临床实践中,准确评估患者的功能能力——即个体在标准化条件下执行日常任务的能力——对于评估治疗效果和预测功能恢复具有重要意义。然而,传统的基于自我报告或知情者评定的评估方法容易受到患者自知力、环境因素或支持系统的影响,限制了其客观性和准确性。近年来,基于表现的评估工具因其能够提供更生态有效和客观的功能潜力评估而受到越来越多的关注。虚拟现实功能能力评估工具(VRFCAT)作为一种计算机化的评估工具,通过模拟日常活动(如膳食准备、使用交通工具、购物和处理金钱)来评估个体的功能能力。与传统的角色扮演任务或纸质工具不同

    来源:European Psychiatry

    时间:2025-11-19

  • 监测繁殖温室中的叶片温度和环境动态

    在植物繁殖温室中,准确测量叶片温度对于合理安排喷雾灌溉、维持光合作用和根系发育的最佳温度范围至关重要。目前,商业繁殖温室普遍采用“人工叶”热敏电阻,这些传感器暴露于光照下,以模拟叶片温度。然而,其在喷雾灌溉条件下的性能表现却缺乏系统研究。本研究通过对比两种非接触式红外(IR)辐射计(Apogee SI/SIF-111-ss 和 Omega OS151-LT/OS211-LT)与接触式热电偶、细丝热敏电阻以及人工叶传感器,评估了在繁殖条件下叶片温度测量的准确性,并探讨了叶片与空气温度差(LAD)的环境决定因素。研究数据采集于一个大学温室,时间为七天,涵盖阳光下的繁殖材料,并通过SAS进行分析。此

    来源:Smart Agricultural Technology

    时间:2025-11-19

  • 零样本学习在多种环境下对玉米棒几何特征进行表型分析的应用

    本研究探讨了一种零样本学习(Zero-Shot Learning, ZSL)框架,旨在解决传统玉米穗表型分析方法在数据依赖性、高成本和模型泛化能力方面的局限性。玉米穗的几何特征,如长度、直径和面积,对于育种计划和产量估算具有重要意义。然而,传统的表型分析方法通常需要大量人工操作,成本高昂且难以扩展到大规模的田间应用。为了克服这些障碍,本研究结合了Grounding DINO和一个轻量级形状校正的Segment Anything Model(SAM),构建了一个用于玉米穗分割和几何特征估算的零样本学习框架。这一方法无需重新训练或微调模型参数,即可实现对不同基因型和背景条件下的玉米穗的高效识别。通

    来源:Smart Agricultural Technology

    时间:2025-11-19

  • 糖尿病合并肛周脓肿患者术后伤口菌群特征及其对愈合影响的16S rRNA测序研究

    在肛肠外科领域,肛周脓肿是最常见的感染性疾病之一,手术引流后伤口护理质量直接决定愈合效果。而对于合并糖尿病的患者,高血糖状态会通过损害中性粒细胞趋化、降低巨噬细胞清除能力、破坏细胞因子平衡等多重机制,导致伤口愈合过程严重受阻。更值得关注的是,糖尿病引起的微血管病变会导致组织缺氧和血管生成受损,进一步限制伤口修复所需的营养和氧气供应。这种全身性病理改变同时会塑造特殊的伤口微环境,使得机会性病原菌易于定植,而有益共生菌被抑制,形成菌群失调的恶性循环。糖尿病患者不仅肛周脓肿发生率更高,其术后伤口愈合时间也显著延长,容易发展为慢性难愈性伤口。虽然现有研究已提示糖尿病伤口存在微生物组成改变,但对肛周脓肿

    来源:BMC Microbiology

    时间:2025-11-19

  • 海洋微藻小球藻(Chlorella sorokiniana)对单壁碳纳米管和Fe₂O₃纳米颗粒单独作用以及联合处理的生物响应

    本研究聚焦于纳米材料对海洋微藻的影响,特别是多壁碳纳米管(MWCNTs)与α-Fe₂O₃纳米颗粒(NPs)的单一与混合暴露对微藻生长及生理生化反应的潜在毒性。随着纳米技术的快速发展,纳米材料因其独特的物理化学特性被广泛应用于工业、医疗和商业领域,例如传感器、催化、太阳能电池以及废水处理等。然而,这些纳米材料在生产、运输、使用和处置过程中不可避免地进入自然生态系统,最终可能积累在水体中,对水生生物和整个生态环境产生影响。因此,研究纳米材料对水生生物的毒性机制,特别是对作为生态系统基础生产者的微藻的影响,具有重要的生态和环境意义。微藻在海洋生态系统中扮演着关键角色,它们不仅是初级生产者,还构成了食

    来源:Plant Physiology and Biochemistry

    时间:2025-11-19

  • 综述:青藏高原:气候变化、人类活动与植物多样性

    ### 植物基因组学在保护与适应性研究中的应用:以Oreocharis mileensis为例在生态系统中,喀斯特生态系统因其独特的地貌特征和生物多样性而具有重要地位。然而,这些生态系统中的植物物种,尤其是那些受到威胁的野生种群,其基因组研究仍然较为有限。本研究以Oreocharis mileensis这一濒危的喀斯特特有复活植物为对象,通过高质量的基因组组装与注释,分析其遗传结构、种群历史以及适应潜力,从而为保护策略提供科学依据。#### 基因组特征与适应性机制Oreocharis mileensis的基因组大小约为3.99 Gb,包含两个单倍型(haplotypes),其contig N5

    来源:Plant Diversity

    时间:2025-11-19

  • 中国严寒地区冬季年轻人在校园屋顶空间中的垂直热响应

    在极端寒冷地区,冬季的严酷气候条件对人类的生理状态构成了显著挑战。这种环境不仅考验着人体的温度调节能力,也限制了人们在户外活动的时间与空间利用。本文通过深入研究垂直分层的热环境对年轻人在校园屋顶上的生理和感知反应的影响,揭示了在寒冷环境中,人类如何适应不同高度的热条件。研究结合了微气候监测和热感知评估,对不同高度上的热适应机制进行了系统分析,为极端寒冷地区的垂直空间设计提供了重要的生理依据。研究结果显示,冬季的热调节主要受到温度与风速相互作用的影响,这种影响与夏季以辐射为主导的热环境有着显著差异。这意味着,在寒冷的冬季,风速对热感知的影响可能比夏季更加重要。此外,研究发现,普遍热气候指数(UT

    来源:Journal of Thermal Biology

    时间:2025-11-19

  • 工业污染河口沉积物中的砷形态及其分布,以及对细菌群落的影响

    工业废水是沿海地区污染的重要来源之一,尤其在工业活动密集的区域,其对生态环境的影响尤为显著。重金属污染不仅破坏生态系统的完整性,还可能通过改变微生物群落的结构和功能,进一步加剧环境问题。以砷(As)为例,其作为一类有毒金属,具有较强的环境持久性,能够通过多种生物地球化学过程影响生态系统的健康。特别是在工业污染严重的河口和海湾区域,砷污染对微生物群落的组成、多样性以及功能潜力的影响,已成为环境科学研究中的热点问题。本研究聚焦于工业污染导致的河口地区砷污染问题,系统分析了表层与沉积物剖面中总砷(T-As)和生物可利用砷(B-As)的分布情况,以及砷污染对微生物群落结构和功能的影响。研究结果表明,不

    来源:Frontiers in Microbiology

    时间:2025-11-19


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