• 沙枣（Chosenia arbutifolia (Pall.) A. Skv.）中WUSCHEL相关同源盒基因家族的表征、结构、进化见解及表达谱的综合分析

  摘要背景WUSCHEL相关Homeobox（WOX）是调控植物分生组织的关键转录因子，在植物生长、发育和抗逆性调节中发挥重要作用。结果为分析沙柳Chosenia arbutifolia (Pall.) A. Skv. 中CaWOX基因家族的分子特征和功能潜力，本研究对C. arbutifolia进行了全基因组鉴定和生物信息学分析，共鉴定出14个CaWOX基因。14个CaWOX基因分布在11条染色体上，包含8对串联重复。系统发育分析将14个CaWOX蛋白分为4个保守亚组，同一亚组成员共享高度保守的基序和基因结构。CaWOX基因家族在杨柳科近缘种间具有高度的进化保守性，但与Arabidopsis

  来源：BMC Genomics

  时间：2026-09-09

• 小穗山羊草两个亚种划分的系统性形态学与遗传学比较

  摘要背景Aegilops tauschii（DD，2n = 2x = 14）是一种被广泛研究的野生物种，因为它是面包小麦的D基因组供体。形态中间型种质是一种特殊的类型，不同于亚种tauschii（圆柱形穗）和亚种strangulata（念珠状穗）。对中间型进化的认识非常有限。亚种结构在形态学和遗传学上的不一致长期以来一直是该物种的一个难题。本研究以小花指数作为客观标准来评定穗形态，解决了这一难题，随后采用荧光原位杂交（FISH）核型分析来分析亚种结构。结果在399份研究种质中，238份、56份和105份分别具有圆柱形穗、念珠状穗以及具有轻度念珠状小花的中间型穗。来自亚种tauschii（圆柱形

  来源：BMC Genomics

  时间：2026-09-09

• 微秒尺度分子动力学模拟观察到的C5aR2通过β-arrestin依赖性通路的信号转导机制

  # 摘要补体系统主要调节固有免疫，参与非特异性抗病原体防御，并与适应性免疫相关联。其组分之一C5转化酶启动补体级联反应的最后阶段，导致C5被切割为C5a和C5b，并形成膜攻击复合物，从而引起细胞溶解。此外，C5a作为促炎介质，通过调节白细胞趋化作用发挥作用。C5a与两种G蛋白偶联受体（GPCRs）结合：C5aR1和C5aR2。C5aR1的激活通过G蛋白和β-arrestin介导的信号传导参与炎症反应，而C5a结合C5aR2仅引发β-arrestin信号通路的效果尚不明确。C5aR2常被视为诱饵受体，在各种疾病模型中表现出促炎和抗炎双重作用。为阐明C5aR2信号传导的生理意义和治疗潜力，我们以活

  来源：The Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics

  时间：2026-09-09

• 突变型TP53通过物理隔离FOXP3破坏PD-L1的转录调控，从而驱动肺腺癌的免疫逃逸：支持潜在相互作用的跨尺度计算证据

  摘要背景针对PD-1/PD-L1的免疫检查点疗法（ICT）在近半数肺腺癌（LUAD）患者中治疗失败。肿瘤细胞内在的FOXP3直接调控CD274（PD-L1）的转录。我提出假说：功能获得型（GOF）突变p53（mutp53）物理隔离FOXP3，阻止其在CD274启动子区的占据，从而以谱系特异性方式导致PD-L1不受控表达。方法六层多尺度计算分析：（1）三个独立LUAD队列的临床生存荟萃分析（TCGA PanCancer Atlas n?=?510，OncoSG n?=?181，CPTAC n?=?110；N?=?670）；（2）基于JASPAR 2024 MA0850.1的FIMO转录因子占据分

  来源：BMC Bioinformatics

  时间：2026-09-09

• 估算脉搏波传导速度作为原发性血小板增多症和真性红细胞增多症主要不良心血管事件的标志物

  摘要：估算脉搏波传导速度（ePWV）作为一种简单的动脉僵硬度替代指标，在普通人群及肿瘤人群中可预测心血管事件，但其在骨髓增殖性肿瘤（MPN）中的相关性尚不明确。研究人员评估了664例原发性血小板增多症（n=477）或真性红细胞增多症（n=187）患者基线ePWV与主要不良心血管事件（MACE）及总生存期（OS）的相关性。ePWV中位数为11.1 m/s（四分位距[IQR]，9.2–12.9），72.1%的患者达到早期血管老化标准（≥9.4 m/s）。在中位随访67.4个月期间，共发生58例首次MACE（8.7%）和58例死亡（8.7%）。在多变量病因特异性Cox模型中，基线ePWV每升高1 m

  来源：British Journal of Haematology

  时间：2026-09-09

• 载抗生素PMMA骨水泥通过诱导膜形成促进糖尿病伤口愈合：一项转录组学与机制研究

  摘要糖尿病足溃疡（DFU）是糖尿病的一种常见并发症，会显著降低患者的生活质量。聚甲基丙烯酸甲酯（PMMA）诱导膜疗法最初因其支持骨再生的作用而被认可，该疗法通过植入PMMA引发生物活性膜的形成，近年来因其在伤口愈合中的潜力而受到越来越多的关注。在这项初步探索性研究中，我们调查了DFU组织中PMMA诱导膜疗法相关的转录组变化。我们对人类DFU组织样本进行了核糖核酸测序（RNA-seq）、加权基因共表达网络分析（WGCNA）和机器学习技术，以鉴定与诱导膜形成和功能相关的差异表达基因（DEGs），并分析其在愈合过程中的潜在作用。基因表达分析使我们构建了基因共表达网络，揭示了18个不同的模块，其中青绿

  来源：BMC Genomics

  时间：2026-09-09

• 第二组Mcr编码古菌在地热泉中表现出甲烷循环潜力

  摘要背景甲烷是一种强效温室气体，对气候变化具有深远影响，其全球排放量主要由生物产甲烷过程驱动——这一过程长期以来被认为仅限于广古菌域。然而，新近证据表明热原体（原TACK超级门）也具备这一能力。结果9）环境中，与甲烷代谢相关基因具有较高的转录活性。我们鉴定了3个深渊古菌门MAGs，其编码的通路可能与氢营养型产甲烷和异养代谢相关。进化分析提示含Mcr深渊古菌门与产甲烷热原体门之间可能存在水平基因转移事件，尽管转移方向无法确定。产甲烷相关蛋白的系统发育重建表明，甲基营养型产甲烷是目前所采样含Mcr热原体中的祖先状态，随后是各谱系特异性的氢营养型组分获取、丢失与修饰。结论本研究扩展了已知的含Mcr古

  来源：BMC Biology

  时间：2026-09-09

• 一种用于RNA-LNP优先级排序及机制驱动生物学一致性评估的模块化安全性设计框架

  摘要背景RNA 疗法的发展需要能够实现高效递送，同时限制不必要的免疫激活和脱靶效应的配方。计算工具可以在实验测试之前帮助探索这些相互竞争的目标，但机制解释、配方优先排序以及生物学一致性评估往往被分开处理。方法我们开发了一个模块化计算框架，包含两个互补的分析分支。候选优先排序分支结合了一个异质化的虚拟患者队列、一个包含 500 种配方的 RNA-脂质纳米颗粒（RNA-LNP）设计空间、五个与合成有效性和安全性相关的评价终点、一个综合"设计即安全"评分、一个随机森林代理模型，以及基于帕累托的多目标分析。在生物学一致性分支中，我们从此前发表的通用免疫系统模拟器（UISS）轨迹中提取描述符，将其浓缩为

  来源：BMC Bioinformatics

  时间：2026-09-09

• 遵循 EAT-Lancet 饮食及其代谢特征与较低的痛风风险相关

  摘要目的探讨EAT-Lancet饮食及其代谢特征与痛风风险之间的关联，同时考虑遗传易感性因素。方法研究对象为英国生物样本库（UK Biobank）中同时具备问卷数据和分子数据的91,479名参与者。使用Oxford WebQ膳食问卷计算EAT-Lancet饮食评分。采用弹性网络回归方法构建代谢特征。通过Cox比例风险模型评估EAT-Lancet饮食评分、其代谢特征与痛风发病率之间的关联。进行中介分析以评估代谢特征及单个代谢物的中介效应。计算痛风的遗传风险评分（GRS），并将其纳入分析，以评估遗传易感性与EAT-Lancet饮食评分或其代谢特征在痛风风险方面的联合关联及潜在交互作用。结果在11.

  来源：The Journal of Nutrition

  时间：2026-09-09

• 在Fe-O-Cu界面进行的自旋态调制实现了双铁光效应与铜光效应联用的癌症治疗方法

  摘要 调节过渡金属中心的自旋状态是一种尚未被充分探索但非常有效的策略，可用于调控纳米医学中的催化反应性和细胞死亡途径。在这里，我们采用了一种界面自旋状态调控方法：将基于Fe的MOFs（MIL-88B(Fe)）修饰上PtCu纳米颗粒，从而制备出FeMOF/PtCu杂化物。在这些杂化物中，Fe-O-Cu桥键在压电应变的作用下驱动配体场的重排，使Fe中心的自旋从低自旋的Fe3+状态转变为中等自旋的Fe2+状态。这种动态的自旋转换显著增强了电子转移，降低了H2O2分解的反应势能，并最大化了活性氧（ROS）的产生。重要的是，Fe和Cu之间的氧化还原相互作用同时激活了铁死亡（脂质过氧化/GS

  来源：Journal of Nanobiotechnology

  时间：2026-09-09

• 蝉与黑蝉的完整线粒体基因组及系统发育分析：为蝉科Periostracum的分子鉴定与潜在资源开发提供见解

  摘要背景Cryptotympana 属是保健品和传统医学中重要的生物资源。C. mandarina 和 C. recta 常被用作药用蝉蜕合法物种的地域性替代品。为了满足资源鉴定和多样化开发中对补充分子工具的需求，本研究首次比较分析了 C. mandarina 和 C. recta 的线粒体基因组结构。结果采用高通量测序技术，我们组装了完整的环状线粒体基因组，长度分别为 15,574 bp（C. mandarina）和 15,802 bp（C. recta），每个基因组均含有 37 个标准基因（13 个蛋白编码基因 [PCGs]、22 个 tRNAs、2 个 rRNAs）。两个线粒体基因组在

  来源：BMC Genomics

  时间：2026-09-09

• DeepPROTECTNeo：一种情境感知型个性化、反向疫苗学驱动的深度学习免疫原性预测框架

  摘要背景个性化癌症疫苗的开发依赖于准确识别能够引发强烈免疫反应的新表位。T 细胞受体 (TCR)-表位相互作用是癌症免疫治疗的基础。传统计算方法主要关注表位 - 主要组织相容性复合体 (MHC) 结合，往往忽视了 TCR 结合的关键贡献。此外，现有方法的临床适用性受到碎片化流程的限制，这些流程需要分别进行变异检测、HLA 分型以及独立的肽 -MHC (pMHC) 或肽 -TCR (pTCR) 评估阶段。结果我们提出了 DeepPROTECTNeo，这是一个统一的深度学习框架，整合了基因组变异检测、HLA 分型、高亲和力 pMHC 结合预测、变异驱动的 TCR 库挖掘，随后采用配备显式交叉注意力

  来源：BMC Biology

  时间：2026-09-09

• 用于协同mRNA介导癌症免疫治疗的生物激活型共轭纳米载体

  摘要信使核糖核酸（mRNA）免疫疗法在肿瘤学领域具有变革性潜力，然而单一药物策略在免疫抑制性肿瘤微环境（TME）中常常失效。将免疫原性化疗与mRNA进行生物激活型共递送具有机制上的协同优势，但将疏水性小分子前药与亲水性mRNA共配制于单一稳定纳米颗粒中仍是一个重大的未解决工程挑战。我们通过酰胺偶联反应将H2O2响应的硫缩酮-奥沙利铂偶联物共价连接到DLin-MC3-DMA上，合成了可激活脂质前药（ALP-1），并通过微流控纳米沉淀法配制了生物激活型偶联纳米载体（BCNs）。对四种制剂进行了全面表征和评价，包括mRNA表达、细胞摄取、内体逃逸、免疫激活、细胞毒性和体内抗肿瘤疗效、TME重塑、免疫

  来源：The Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics

  时间：2026-09-09

• 小窝仔数诱导的代谢印迹在高蔗糖饮食下维持肠道菌群多样性与短链脂肪酸（SCFA）输出

  高蔗糖饮食（high-sucrose diet, HSD）触发肠道菌群失调（dysbiosis，微生态失衡），降低菌群多样性并升高厚壁菌门（Firmicutes）与拟杆菌门（Bacteroidetes）的比值。小窝仔数（small litter size, SL）可防止HSD诱导的菌群失调，并在标准饮食（standard diet, STD）喂养的大鼠中富集解果胶拟杆菌群（Bacteroides pectinophilus group）。HSD增加大肠埃希菌–志贺菌属（Escherichia–Shigella）的丰度，且不受窝仔数大小影响。HSD-SL动物中短链脂肪酸（short-chain

  来源：The Journal of Nutritional Biochemistry

  时间：2026-09-09

• 自闭症与非自闭症患者紧张症的电休克治疗（ECT）：一项关于病程、疗效、攻击行为与自伤结局的观察性研究

  紧张症在自闭症个体中发生率不成比例地偏高，并可能对电休克治疗（ECT）有反应，但先前的报告提示该人群的治疗负担更重。研究人员比较了患有紧张症的自闭症与非自闭症患者在接受ECT时的纵向使用情况、安全性和临床结局。这项单中心观察性队列研究纳入了2022年5月至2026年4月期间接受治疗的110名患者，包括43名自闭症患者和67名非自闭症患者。在急性期和维持期治疗期间，记录了布什-弗朗西斯紧张症评定量表（BFCRS）、临床总体印象-改善（CGI-I）、临床总体印象-严重程度（CGI-S）以及坎纳紧张症严重程度与检查（Kanner Catatonia Severity and Examination）

  来源：Autism Research

  时间：2026-09-09

• 探索木虱科（半翅目：木虱总科）的线粒体基因组学：比较分析与系统发育基因组学

  **摘要****背景**木虱科（半翅目：木虱总科）是一类多样性的植食性昆虫。尽管该科具有重要的生态意义，但其线粒体基因组资源仍然匮乏，系统发育关系也尚未完全解析。本研究首次报告了甘薯木虱（*Bactericera gobica*）的完整线粒体基因组。通过将这一新测序的基因组与目前几乎所有可用的木虱科线粒体基因组整合在一起，我们建立了迄今为止该科最全面的数据库。这一扩展资源使得能够进行稳健的比较分析，以阐明线粒体基因组进化、明确属级系统发育地位，并重建木虱科的物种分化历史。**结果***B. gobica* 的线粒体基因组长度为14,865 bp，包含标准的37个基因，具有典型的昆虫基因排列方式

  来源：BMC Genomics

  时间：2026-09-09

• 天冬线粒体基因组分析及其药用特性的遗传基础研究

  摘要大百部（Asparagus cochinchinensis）是一种原产于东亚的知名药用植物，因其疗效、营养价值以及美白等功效而备受推崇。尽管该物种具有广泛的生态适应性和重要的经济价值，但其基因组学深入研究（尤其是细胞器基因组方面）仍然不足。本研究对大百部的线粒体基因组（mitogenome）进行了全面测序、从头组装及功能注释。该线粒体基因组由三个独立的环状染色体组成，长度分别为327,009 bp、175,491 bp和83,175 bp，总长585,675 bp，GC含量为45.83%。基因注释显示共包含61个基因，其中38个编码蛋白质，20个为转运RNA（tRNA），3个为核糖体RNA

  来源：BMC Genomics

  时间：2026-09-09

• 用于双重响应姜黄素递送与靶向化疗-光热治疗的锌基金属有机框架纳米平台

  研究人员开发了一种基于金属有机框架(MOF)的纳米平台，将化疗与光热治疗相结合。该平台以姜黄素(CUR)为模型药物，先构建载药ZIF-7，再以聚多巴胺(PDA)包覆并偶联叶酸(FA)，形成CUR-Z7@FA-PDA纳米平台。ZIF-7选用刚性苯并咪唑框架，较ZIF-8更具结构稳定性与缓释特性。PDA层具备近红外吸收与光热转换能力，可在808 nm近红外(NIR)照射下产热并促进药物释放；FA可识别叶酸受体过表达的肿瘤细胞，实现靶向摄取。研究人员通过紫外-可见光谱、X射线衍射(XRD)、傅里叶变换衰减全反射红外光谱(ATR-FTIR)、氮吸附-脱附、动态光散射(DLS)等证明材料成功合成与载药；

  来源：Journal of Photochemistry and Photobiology

  时间：2026-09-09

• multiHIVE：一种用于单细胞多组学的层次化多模态深度生成建模方法

  摘要 背景 单细胞多组学技术的最新进展使得通过在同一细胞内联合分析多种分子模式来全面表征细胞状态成为可能。要充分发挥这些数据的潜力，需要采用能够有效整合不同技术特性和噪声特征的异构模式的计算方法。 结果 为了解决这些挑战，我们提出了multiHIVE，这是一个分层的多模态深度生成模型，它通过分解共享信号和特定模态的信号来推断整合的细胞嵌入。multiHIVE利用分层堆叠的潜在变量以及特定模态的潜在变量来分别捕获共享信息和私有信息，从而促进集成、去噪和插补任务。在黄金标准真实数据集（双模态和三模态）上的广泛基准测试表明，multiHIVE在整合多组学数据集和插补缺失特

  来源：BMC Bioinformatics

  时间：2026-09-09

• 综合物理化学、结构及计算机模拟分析揭示了加工黍米（Panicum miliaceum）功能潜力的提升

  摘要黍粟（Panicum miliaceum）含有植酸、单宁和酶抑制剂等抗营养因子，限制了营养物质的生物利用率；然而，适当的加工技术可以有效降低这些限制。本研究评估了碾磨、浸泡、半煮和爆珠加工对黍粟理化性质、功能性和结构特性的影响，并对其生物活性化合物进行了计算机模拟分析。加工方式显著影响了功能性性质，吸水率在半煮加工中最高（41.31±0.03%），其次为浸泡（23.79±0.01%）、爆珠加工（22.02±0.08%）和碾磨（18.05±0.01%）。相比之下，吸油率以碾磨最高（18.21±0.08%），其次为爆珠加工（17.9±0.05%）、半煮（14.96±0.07%）和浸泡（14.0

  来源：The Journal of Nutrition

  时间：2026-09-09

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