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中科院学者发表Cell文章：新型CRISPR-Cas系统C2c2-RNA复合物结构
2017年1月12日，Cell 杂志发表了中科院生物物理研究所王艳丽课题组关于Ⅵ型CRISPR-Cas系统的效应蛋白C2c2的结构研究。标题为“Two Distant Catalytic Sites Are Responsible for C2c2 RNase Activities”。该研究解析了Leptotrichia shahii（Lsh）细菌中C2c2与crRNA (CRISPR-RNA) 的二元复合物以及C2c2在自由状态下的晶体结构，揭示了LshC2c2通过两个独立的活性结构域来发挥其两种不同的RNA酶切活性，这为研究C2c2发挥RNA酶活性的分子机制提供了重要的结构生物学基础。CR
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研究人员首次对“CRISPR基因组编辑如何工作”进行全原子模拟
生物通报道：在过去的十年里，谈论最多的生物学突破就是，基因组编辑工具CRISPR/Cas9的发现，它能够修改DNA，并可能在根本上消除许多遗传性疾病的根源。延伸阅读：Nature Methods：2016年值得关注的技术——用CRISPR技术来编辑RNA。CRISPR相关蛋白9（CAS9），最初发现是作为化脓性链球菌细菌免疫系统的一部分，在其原生状态，可识别外源DNA序列和抑制它们。在细菌中，该系统被用于靶定来自噬菌体的外源病毒DNA——这些DNA在其进化历史中已被公认为是敌人，并将一个记录整合到自己的DNA中。CRISPR表示包含短重复碱基序列的DNA片段，重复序列后面是来自以前暴
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Nature新闻：美国第一例CRISPR人体临床实验
生物通报道：美国第一例基于CRISPR-Cas9基因编辑系统的人体临床实验将会由学术机构，而不是与这一技术联系最紧密的生物技术公司来完成，来自Nature Biotechnology的消息，宾州大学与加州大学旧金山分校，德州大学安德森癌症中心合作，计划在今年一季度开展基于T细胞癌症免疫治疗的I期试验。此前国内四川大学卢铀教授领导的一个研究组2016年完成了世界首列CRISPR-Cas9人体临床实验，这表明基于CRISPR-Cas9治疗的竞争格局已经开始变得越来越复杂。此外，多家公司也在摩拳擦掌，计划着CRISPR的相关治疗研发，比如Editas Medicine，Intellia Therap
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中国农大PNAS：体内传递CRISPR文库的一种有效新载体
生物通报道：全基因组CRISPR/Cas9文库大多数是用慢病毒载体构建的，由于传递的效率低下，所以，直接的体内筛选一直是难以实现的。1月6日在《PNAS》杂志上发表的一项研究中，来自中国农业大学、德克萨斯大学健康科学中心和犹他大学等处的研究人员，研究了piggyBac (PB)转座子作为传递向导RNA（gRNA）文库的另一种载体，用于体内筛选。本文通讯作者是中国农业大学生物学院的吴森教授和犹他大学医学院的Mario R. Capecchi教授。吴森教授早年毕业于北京农业大学，主要研究方向为动物遗传工程及干细胞。点击阅读该课题组相关研究成果：吴森：无外源因子iPS诱导 实现高效率生殖传
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同济大学教授利用CRISPR系统发现：一种具有双重作用的卵细胞成熟因子
生物通报道：来自同济大学生命科学与技术学院，北京生命科学研究所等处的研究人员利用CRISPR/Cas9基因修饰系统构建了Sall4基因条件性敲除小鼠，从而发现SALL4能作为重要的转录因子和表观遗传调控因子参与卵母细胞成熟的调控机制。这一研究成果公布在Journal of Biological Chemistry杂志上，研究人员应用CRISPR/Cas9基因编辑系统成功得到了条件性基因敲除的小鼠（Sall4loxP/loxP）和基因荧光标记小鼠（Sall4-mCherry），为在卵母细胞中研究Sall4基因的功能创造了有利条件。领导这一研究的是同济大学高绍荣教授，陈嘉瑜助理教授为共同通讯作者，
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CRISPR之父张锋最新综述：全文精彩内容
摘要：宿主-病原体之间的军备竞赛，是生命进化中的普遍且核心的一面。大多数生物在进化中发展出了多重不同但相互作用的抗病原体防御策略，包括对寄生生物侵袭的抵御，先天和适应性免疫以及程序性细胞死亡（PCD）。 PCD是对付感染的最后的手段——当抵抗和免疫失败时被激活的自杀反应。受感染的细胞要在两个选择之间做出决定：是主动防御还是利他主义的自杀/或是休眠诱导，这取决于免疫是否“被认为”能够防止寄生生物繁殖和随后感染其他细胞。在细菌和古细菌中，免疫基因通常与PCD模块共定位，类似毒素-抗毒素，提示免疫-PCD偶联可能由共享蛋白质介导，这类共享蛋白质可能感测损伤和“预测”感染的结果。在VI型CRISPR-
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一个新软件让CRISPR方法更加容易
生物通报道：最近，瑞典卡罗林斯卡学院和哥德堡大学的科学家，研发出了一个基于网络的软件——Green Listed，可以方便CRISPR方法的使用。该软件发表在《Bioinformatics》，可以通过greenlisted.cmm.ki.se网站免费获取。延伸阅读：Cell最新公布CRISPR技术新发现：更多的Anti-CRISPR蛋白；张锋2017年开年综述：CRISPR-Cas系统——细胞的生死抉择。细胞是非常小的，并构成了一个生物体。人类身体中的细胞数量，大约相当于地球上人类数量的100倍。在绝大多数的这些细胞中是DNA长链。这些DNA链使得不同类型细胞的外观和行为产生了差异。CRISP
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张锋2017年开年综述：CRISPR-Cas系统——细胞的生死抉择
生物通报道：几乎所有的细胞生命形式都有多种抗击寄生生物的防御系统，比如改变自身遗传组成，阻挡寄生生物入侵，天然免疫系统，获得性免疫系统，还有就是程序性死亡（programmed cell death，PCD）。CRISPR页方式一种细菌的防御系统，这一全称为规律成簇的间隔短回文重复（Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats）的结构与内切酶Cas9一道，帮助细菌组成防御系统对抗外来侵略者，也就是说CRISPR-Cas9能够在引导RNA的指引下，靶标并切割入侵者的遗传物质。近期Broad研究员的CRISPR技术先锋张锋，与美
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Nature Methods：2016年值得关注的技术——用CRISPR技术来编辑RNA
生物通报道：2017年开年第一期《Nature Methods》杂志评出了2016年度技术。其中就有将革命性的CRISPR基因编辑技术用来靶向RNA。延伸阅读：中山大学等开发RNA编辑新工具；曹雪涛院士亮点推荐Science文章：重要的RNA编辑；Nature发布CRISPR重大突破：可编程的RNA编辑工具。使CRISPR细菌免疫系统适应于真核生物基因组，可让我们以前所未有的能力来修改DNA，例如敲除、交换或标记基因、引入特定的点突变、增强或抑制选择基因的活性和开展全基因组功能筛选。在CRISPR系统中，一个短的引导性RNA（gRNA）分子可把一种核酸酶引向与gRNA互补的靶序列，并位于附近的
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Cell最新公布CRISPR技术新发现：更多的Anti-CRISPR蛋白
生物通报道：随着CRISPR技术在基础研究和临床上有了越来越多的应用，控制好这种技术也变得越来越紧迫。继上月科学家们发现了几种能阻断人类细胞中CRISPR-Cas9活性的蛋白质之后，来自加州大学旧金山分校的研究人员又再次发文，报告了更多的抗CRISPRs（anti-CRISPRs）。这一研究成果公布在12月29日的Cell杂志上，加州大学旧金山分校的Joseph Bondy-Denomy等人发现了两种这样的抑制剂如何通过阻碍化脓性链球菌（Streptococcus pyogenes）中的Cas9酶，来阻止细菌和人类细胞中的CRISPR基因编辑活性。早在2012年的Nature杂志上，多伦多大学
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2016年的年度技术是什么？Nature Methods最新公布
生物通报道：在今年的最后一个工作日，Nature Methods赶着发布了2017年的新刊，并在其中公布了2016年度技术，你们肯定会猜年度技术就是CRISPR系统，然并卵，对于前瞻性的每年盘点的年度技术来说，一个并不常见的名词：Epitranscriptome analysis（表观转录组学分析，生物通译）才是正解。2006年，Andrew Fire和Craig Mello因发现RNA干扰而荣获诺贝尔生理学和医学奖。他们的发现引发了针对非编码RNA功能的狂潮，而这一直持续到今天。关于RNA分子本身是如何调节的一个新出现的问题就是：具体来说，在所有RNA种类中发现的转录后修饰的功能是什么？近年
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赖良学教授课题组用CRISPR制备外胚层发育不良猪模型
生物通报道：脱发和头发稀疏给许多患者造成了很大困扰。外胚层发育不良-9（ED-9）是一种先天性疾病，其特征是头发和指甲营养不良，而无其他疾病，HOXC13是ED-9的一个致病基因。然而，携带Hoxc13突变的小鼠也发展出其他严重的疾病，如骨骼缺陷、逐渐消瘦、存活力低。但是，小鼠模型并不能忠实地模拟人类ED-9。现在，来自中科院广州生物医药与健康研究院和南方医科大学南方医院的研究人员，通过单链寡核苷酸结合CRISPR/Cas9和体细胞核移植，制备了一个ED-9猪模型。相关研究结果发表在12月22日的《Human Molecular Genetics》杂志。中科院广州生物医药与健康研究院的赖良学（
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12月王牌聚焦：从CRISPR到癌症免疫疗法，多项研究年底冲刺
生物通报道：2016年的最后一页即将被撕去，在年底的这最后一个月里，科学研究没有停下脚步，反而还有了年度冲刺之态，比如基因编辑技术，比如结构生物学成果，比如癌症免疫疗法。在最后的这三周，几乎每周都会有CRISPR技术的突破性机制公布，首先Broad研究所和Wageningen大学的研究人员在CRISPR–Cpf1的基础上打造了一个多重化基因编辑系统。过去用Cas9靶标多个基因组位点需要构建多个或者很大的表达载体，使这种基因组编辑技术受到一定的局限。研究人员发现，Cpf1能够加工自己的CRISPR RNA (crRNA)。而且Cpf1介导的pre-crRNA加工是独立于DNA剪切的。这种能力可以
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《自然》预测2017年科学热点领域
气候变化如果美国新当选总统唐纳德·特朗普像他承诺的那样取消该国的气候承诺，那么中国将带头缓解全球气候变化。中国限制温室气体排放的国家限额交易系统将在2017年推出。过去3年里，全球碳排放已经达到平衡，得益于经济停滞以及绿色技术激增，一些科学家甚至希望在2017年能够出现碳排放量下降。政治遗留2016年的选举将在2017年产生影响。随着特朗普在1月20日就职美国总统，研究人员将能够更好地了解他的政府是否会真的砍掉美国宇航局（NASA）的气候和地球科学计划，或是撤销对人类胚胎干细胞研究的许可。2017年3月，英国将就该国退出欧盟开始正式谈判，从而对科学研究产生潜在的巨大影响。4月初，先是法国，接下
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2016年生命科学四大好戏：看看今年最具争议的事件
生物通报道：再过一周我们就要迎来2017年了，过去的一年生命科学学术界并不平静，充斥着各种各样的争议事件，比如国际年度大戏CRISPR专利争夺案，三亲婴儿从理论到实际，国内的河北科技大学韩春雨的NgAgo技术之争，血液检测新方法作假等等。 年度大戏CRISPR专利争夺案谁应该拥有CRISPR这一热门技术的专利所有权？是2014年4月获得首个CRISPR专利的Broad研究院张锋？还是第一个申请CRISPR基因编辑临时专利，描述其在原核细胞与体外作用机制的加州大学伯克利分校Jennifer Doudna？或者说，法院也许会裁定，他们共同拥有这一专利？2016年这一出大戏吸引了科学界和社会其它各界
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Nature重磅！CRISPR先驱Doudna发现新的CRISPR-Cas系统
生物通报道：微生物将CRISPR-Cas系统用于免疫，但是它的2型系统——通常利用核酸酶Cas9，已被改造用于基因组编辑。最近，研究人员通过对美国科罗拉多一个酸性矿山排水处和犹他州一处喷泉的土壤、地下水样品进行宏基因组分析，发现了另一种2型CRISPR-Cas程序，包括在古菌中发现的一种Cas9和在细菌中发现的两种小Cas酶。相关研究结果发表在12月22日的《Nature》杂志。延伸阅读：CRISPR专利的两家争夺者在美国对簿公堂 张锋占上风；张锋发表CRISPR新突破 实现简单的多重基因编辑；Cell公布年度最佳论文 多项CRISPR成果上榜。Rodolphe
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盘点2016年令人印象最深刻的技术：两项重要的CRISPR突破
生物通报道：去年“把前浪拍死在沙滩上的那些新技术”引发了不少关注，今年依然有不少新技术吸引我们的眼球，The Scientist杂志总结了几个令人印象深刻的新技术。前文：盘点2016年令人印象最深刻的五大技术（一） 线粒体替代疗法2016年迎来了首例所谓“三亲”婴儿的诞生，同时发表的两篇论文也提出去除母亲线粒体DNA中受损突变的新改良方法。其中英国纽卡斯尔大学的研究人员提出了一种更加有效的线粒体替代疗法（mitochondrial replacement therapy, MRT），这将能降低将线粒体DNA（mitochondria DNA, mtDNA）疾病传递给后代的风险。一般MRT方法是
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科学家开发新的CRISPR系统——可调、可逆的一步式基因表达控制
生物通报道：控制基因表达水平的能力，是生物学中的一个主要任务。一种广泛使用的方法是删除一个感兴趣的非必须基因（Knockout），或者多步重组让一个感兴趣的基因表达减少（Knockdown）。然而，这些遗传学方法是费时费力的，并且对于定量研究来说是有限的。12月20日，在Nature子刊《Scientific Reports》发表的一项研究中，来自加州大学圣地亚哥分校的研究人员，报道了一种可调的CRISPR-cas系统——tCRISPRi，用于基因表达的精确和连续的滴定测量。延伸阅读：Science采用改进CRISPR技术 发现近500个新的lncRNAs；PNAS：科学家制备双重核
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青年学者发表Cell新文章：两种新型CRISPR-Cas系统
生物通报道：来自中科院生物物理所，美国Sloan研究所的研究人员发表了题为“PAM-Dependent Target DNA Recognition and Cleavage by C2c1 CRISPR-Cas Endonuclease”的文章，介绍了近年来新发现的CRISPR-Cas系统：CRISPR-C2c1，他们解析了C2c1-sgRNA二元复合物及C2c1-sgRNA-DNA多种三元复合物结构，并明确了C2c1对双链DNA的切割会产生7nt的粘性末端，这是目前所有用于基因组编辑的CRISPR-Cas系统所能产生的最长粘性末端。这一研究成果公布在12月15日的Cell杂志上，研究人员包
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Cell公布年度最佳论文 多项CRISPR成果上榜
生物通报道：Cell杂志创刊于1976年，现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一，并陆续发行了十几种姊妹刊，在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。近期Cell杂志盘点了2016年度最佳文章，包括论文（10篇），综述（4篇），和SnapShots（8篇），包含了多项令人激动的研究新成果，比如CRISPR/Cas基因组编辑技术，类器官疾病模型，阿兹海默症发病的各个细胞阶段，以及突破性的冷冻电镜新成果。Cell发布突破性CRISPR新技术High-Throughput, High-Resolution Mapping of Protein Localization in Mammalian
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